BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-259P19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,450,016 - 90,607,261
singlet/doubletdoublet
Overlap geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3
Upstream geneAnks1b, LOC544719
Downstream geneTmpo, LOC100041769, LOC100041799
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-259P19.bB6Ng01-259P19.g
ACCGA065028GA065029
length1,148810
definitionB6Ng01-259P19.b B6Ng01-259P19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,450,016 - 90,451,157)(90,606,454 - 90,607,261)
sequence
gaattcttggtgcttgtgaggaaactccaagacaacaagaaaggatcctg
tgacctcggttccctcaaactccaaaattgttctttaaatgtgctctcgt
gcccctcccaggtgtatcggataggaccgagtttactacagattagtcac
tacaactagctattggcatctgttcacgtgcctcctgttcttgcgacatg
tggcttatccatgtgacctttcttaccccccatagtataaactgtcagat
gctctgaataaagttatctagtacatgagacttcagcctgcctcatttac
tggctccactctcccaggtaccacctttagatcagtgacacagcctcact
agccatcagagaaagaacatttttaagttacaatgacattctgtctcgtc
ccagtcagaataaggattattaagaaaatctaaacaacacaccaggtgtg
atggtgcatgcttttaattccagcatttggtaatgaggcaggtaaatctt
tgtgagttcaagatcagcttagaccacacagggagttccagggcaacata
gcgagagcctttagtctcaaataaaacaaaacaaaacaacaaattctgct
gagaatgtgagcaaaagggaactttatacacagctggaggggatctaaac
taaaccaaccaatatggaaaattctcaaaaaactaaaatagtaggtagct
tatggatcaaacctagatgtccaaaaacgaagtagataaagaaaatgtgg
ctatgtataaacacaatggaattcttcactgtgccaaagaaggaaactat
gtttatagaaaaatcaatgcacctggaaataatcacactaagtgaattaa
gtcagtcttgggacaattatgttatctctcattgtggtacctatatttta
tatagaaagatattatatatgtaggtatatagatagtaaatatacttaac
gtgctatatatttacacatatatgtaggataccacacatatatataaaaa
gacagatggatctaaaatcgtttatatagcaaaatccataaatggcatgg
aaggtcttagaggaaaatctcataagaagaattgagggatcaacatggag
aagaaacagaggtggtgaagggaagggccagggtcttgcagtgatgct
gaattcataggatccaagctgagcttaccaaagatccgactgaacggtgt
gactagtagataacatcatgggatgaagccaggtgttgagggctgtgcct
ttagtcaggaggaaaggcaggcctgatccacatagcaagttctaggccaa
tgtagtgaaaccctgtttgaaaatagtcaaaagaagccgggcgtggtggt
gcactcctttaatcccagcactcaggaggcagagacaggcggatctctga
ggccagcctggtctacaaagtgagttccagggctatacagagaaaccctg
tcttgaaaaaccaaaagaaaacaaaactatttttgtttttgtagtcaaat
atattcaaaccaaaaggttaagtggaaacacaggctgatgaatgagcaca
caagaatacacactcgaagcgcaacacttttagccccagaggcaggcaga
tctctgaattcaaggccagtctggcctgtagagggagttccaggacagcc
agggctacacagagaaacctatctccaaaaatcaaatactctaggcccat
attcagtctctactctccacacgcaacaaaaatttcagtgtaacatcaca
cgagagaaaggtgcgtttggttcccacttaactgcattaaaatctagtct
tgaggtgagactgtccctaacagccatcaatcctgtttgaagttagaatt
caattatatcactggctgagaaccccaccaccaagtacacacacgtgcgt
gcacacgcacacaggaaaagcagataggaagctgcctgggattaggcaaa
ggagatggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90450016_90451157
seq2: B6Ng01-259P19.b_47_1194

seq1  GAATTCTTGGTGCTTGTGAGGAAACTCCAAGACAACAAGAAAGGATCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGTGCTTGTGAGGAAACTCCAAGACAACAAGAAAGGATCCTG  50

seq1  TGACCTCGGTTCCCTCAAACTCCAAAATTGTTCTTTAAATGTGCTCTCGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTCGGTTCCCTCAAACTCCAAAATTGTTCTTTAAATGTGCTCTCGT  100

seq1  GCCCCTCCCAGGTGTATCGGATAGGACCGAGTTTACTACAGATTAGTCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCCCAGGTGTATCGGATAGGACCGAGTTTACTACAGATTAGTCAC  150

seq1  TACAACTAGCTATTGGCATCTGTTCACGTGCCTCCTGTTCTTGCGACATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAACTAGCTATTGGCATCTGTTCACGTGCCTCCTGTTCTTGCGACATG  200

seq1  TGGCTTATCCATGTGACCTTTCTTACCCCCCATAGTATAAACTGTCAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTATCCATGTGACCTTTCTTACCCCCCATAGTATAAACTGTCAGAT  250

seq1  GCTCTGAATAAAGTTATCTAGTACATGAGACTTCAGCCTGCCTCATTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGAATAAAGTTATCTAGTACATGAGACTTCAGCCTGCCTCATTTAC  300

seq1  TGGCTCCACTCTCCCAGGTACCACCTTTAGATCAGTGACACAGCCTCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCACTCTCCCAGGTACCACCTTTAGATCAGTGACACAGCCTCACT  350

seq1  AGCCATCAGAGAAAGAACATTTTTAAGTTACAATGACATTCTGTCTCGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCAGAGAAAGAACATTTTTAAGTTACAATGACATTCTGTCTCGTC  400

seq1  CCAGTCAGAATAAGGATTATTAAGAAAATCTAAACAACACACCAGGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCAGAATAAGGATTATTAAGAAAATCTAAACAACACACCAGGTGTG  450

seq1  ATGGTGCATGCTTTTAATTCCAGCATTTGGTAATGAGGCAGGTAAATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGCATGCTTTTAATTCCAGCATTTGGTAATGAGGCAGGTAAATCTT  500

seq1  TGTGAGTTCAAGATCAGCTTAGACCACACAGGGAGTTCCAGGGCAACATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTTCAAGATCAGCTTAGACCACACAGGGAGTTCCAGGGCAACATA  550

seq1  GCGAGAGCCTTTAGTCTCAAATAAAACAAAACAAAACAACAAATTCTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAGAGCCTTTAGTCTCAAATAAAACAAAACAAAACAACAAATTCTGCT  600

seq1  GAGAATGTGAGCAAAAGGGAACTTTATACACAGCTGGAGGGGATCTAAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGTGAGCAAAAGGGAACTTTATACACAGCTGGAGGGGATCTAAAC  650

seq1  TAAACCAACCAATATGGAAAATTCTCAAAAAACTAAAATAGTAGGTAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCAACCAATATGGAAAATTCTCAAAAAACTAAAATAGTAGGTAGCT  700

seq1  TATGGATCAAACCTAGATGTCCAAAAACGAAGTAGATAAAGAAAATGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATCAAACCTAGATGTCCAAAAACGAAGTAGATAAAGAAAATGTGG  750

seq1  CTATGTATAAACACAATGGAATTCTTCACTGTGCCAAAGAAGGAAACTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTATAAACACAATGGAATTCTTCACTGTGCCAAAGAAGGAAACTAT  800

seq1  GTTTATAGAAAAATCAATGCACCTGGAAATAATCACACTAAGTGAATTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATAGAAAAATCAATGCACCTGGAAATAATCACACTAAGTGAATTAA  850

seq1  GTCAGTCTTGGGACAATTATGTTATCTCTCATTGTGGTACCTATATTTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTCTTGGGACAATTATGTTATCTCTCATTGTGGTACCTATATTTTA  900

seq1  TATAGAAAGATATTATATATGTAGGTATATAGATAGTAAATATACTTAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAAAGATATTATATATGTAGGTATATAGATAGTAAATATACTTAAC  950

seq1  GTGCTATATATTTACACATATATGTA-GATA-CACACATATATATAAAAA  998
      |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATATATTTACACATATATGTAGGATACCACACATATATATAAAAA  1000

seq1  GACAGATGGATCTAAAATCGTTTATATAGC-AAATCCATAAATGGCATGG  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GACAGATGGATCTAAAATCGTTTATATAGCAAAATCCATAAATGGCATGG  1050

seq1  AAGTTCTAGAAGGAAAATCTCATAAG-AGAATGAAGGGGACCAACAT-GA  1095
      ||| |||   |||||||||||||||| |||||  | |||| |||||| ||
seq2  AAGGTCTTAGAGGAAAATCTCATAAGAAGAATTGA-GGGATCAACATGGA  1099

seq1  GA--GAACAGAGGTGGTGAAGGGAA-GGCCAGGGGTCTGCAGTGAATGCT  1142
      ||   |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||
seq2  GAAGAAACAGAGGTGGTGAAGGGAAGGGCCAGGGTCTTGCAGTG-ATGCT  1148

seq1: chr10_90606454_90607261
seq2: B6Ng01-259P19.g_68_877 (reverse)

seq1  AACCATCTCC-TTGCCTAAT-CCAGGCAGCTTCCTATCTGCTTTTCCTGT  48
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCTCCTTTGCCTAATCCCAGGCAGCTTCCTATCTGCTTTTCCTGT  50

seq1  GTGCGTGTGCACGCACGTGTGTGTACTTGGTGGTGGGGTTCTCAGCCAGT  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTGTGCACGCACGTGTGTGTACTTGGTGGTGGGGTTCTCAGCCAGT  100

seq1  GATATAATTGAATTCTAACTTCAAACAGGATTGATGGCTGTTAGGGACAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAATTGAATTCTAACTTCAAACAGGATTGATGGCTGTTAGGGACAG  150

seq1  TCTCACCTCAAGACTAGATTTTAATGCAGTTAAGTGGGAACCAAACGCAC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCTCAAGACTAGATTTTAATGCAGTTAAGTGGGAACCAAACGCAC  200

seq1  CTTTCTCTCGTGTGATGTTACACTGAAATTTTTGTTGCGTGTGGAGAGTA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTCGTGTGATGTTACACTGAAATTTTTGTTGCGTGTGGAGAGTA  250

seq1  GAGACTGAATATGGGCCTAGAGTATTTGATTTTTGGAGATAGGTTTCTCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTGAATATGGGCCTAGAGTATTTGATTTTTGGAGATAGGTTTCTCT  300

seq1  GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCCCTCTACAGGCCAGACTGGCCTTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCCCTCTACAGGCCAGACTGGCCTTG  350

seq1  AATTCAGAGATCTGCCTGCCTCTGGGGCTAAAAGTGTTGCGCTTCGAGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAGAGATCTGCCTGCCTCTGGGGCTAAAAGTGTTGCGCTTCGAGTG  400

seq1  TGTATTCTTGTGTGCTCATTCATCAGCCTGTGTTTCCACTTAACCTTTTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCTTGTGTGCTCATTCATCAGCCTGTGTTTCCACTTAACCTTTTG  450

seq1  GTTTGAATATATTTGACTACAAAAACAAAAATAGTTTTGTTTTCTTTTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAATATATTTGACTACAAAAACAAAAATAGTTTTGTTTTCTTTTGG  500

seq1  TTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGAACTCACTTTGTAGAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGAACTCACTTTGTAGAC  550

seq1  CAGGCTGGCCTCAGAGATCCGCCTGTCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCCTCAGAGATCCGCCTGTCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATT  600

seq1  AAAGGAGTGCACCACCACGCCCGGCTTCTTTTGACTATTTTCAAACAGGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGTGCACCACCACGCCCGGCTTCTTTTGACTATTTTCAAACAGGG  650

seq1  TTTCACTACATTGGCCTAGAACTTGCTATGTGGATCAGGCCTGCCTTTCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACTACATTGGCCTAGAACTTGCTATGTGGATCAGGCCTGCCTTTCC  700

seq1  TCCTGACTAAAGGCACAGCCCTCAACACCTGGCTTCATCCCATGATGTTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGACTAAAGGCACAGCCCTCAACACCTGGCTTCATCCCATGATGTTA  750

seq1  TCTACTAGTCACACCGTTCAGTCGGATCTTTGGTAAGCTCAGCTTGGATC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTAGTCACACCGTTCAGTCGGATCTTTGGTAAGCTCAGCTTGGATC  800

seq1  CTATGAATTC  808
      ||||||||||
seq2  CTATGAATTC  810