BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262E02
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,930,855 - 25,066,010
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAkap7, LOC665800
Upstream geneMoxd1, LOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399
Downstream geneEpb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352, Samd3, L3mbtl3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262E02.bB6Ng01-262E02.g
ACCGA066719GA066720
length1,1671,088
definitionB6Ng01-262E02.b B6Ng01-262E02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,930,855 - 24,932,042)(25,064,911 - 25,066,010)
sequence
gaattcccacttagtgttgcctctttaatccatgcctcccaaaatgtcta
ataaaccacaaggtgtgaccacacaccagcagatggatggattttcagac
tagcctagaccacaactgccactttgtgccagtatccagattaacatctg
ataggccagttaaaatactgtgagccactccagggttaatcttctcagtt
acatatcttaaagctttgtctgaatcacacaaatataaataaatgaccca
agaattccaattttaggttgctcttcatctgggtaaggggcatgtaaaaa
tgaaatttcaaatttcttcttggaaaacaagtgttttatcaaaaaagtat
atgaaaactgagtttaaattcaatttatatatatattaatttatatataa
tcaatcaataaatcaattaatatataatatttagcatatcaaaagctcaa
ctttttcaacaatattatacttgttaaataaggccatgtgaggcaatggc
caagccagaagagtcttggttttctttttatcacagcacagcagtaaata
gatccttctttccatttacataatacaccatgcagatggcaaactatagt
caaccaatttaagttacaaaggaaacaaccaagtatctcgtattgtgttg
tcattaaactatgtgatacttttaaacaaacaaacaaaaatgtccagtta
actgaagttgtcaagcaagaaatggaacatagttcccttggatgataacc
tgatctccctcctaacatgcttaagatggattcattgagatcagcctaaa
atgtgaaacgttcttaaccatttccccattggcctctgcaaaagaaacaa
aagcttctcaacttcgctccatcacaaaacagacattgttagatcacaga
atctagatttcggaagatggttactttagagctctgtccctgagagactg
ccgtattttggcagttgttacattttacctcggactttcaatggaagtta
atggggagatggggagacgaaaagtagacagagaataactagtttgtatt
taatacaagttacagtaccattaaactagtctatggaggtaatatgccaa
aattctgaaagcaaatcatgacctccttagatccatcatgcagcaagctt
tggagtctttccttaag
gaattcagtaaaaagttattttgcactttgatttagactgactttgtaaa
caagagctatagggatttaagatgtctcaaaatttctcaaggagagttca
gaaggcaaaggagaagagtttagttagactcactcaaagaccaaaagaac
ccaaggcaaagggactacagaacgtgcattatgaacatgggtaccagttt
tgcttggatcaaacagatatctgtctatggggagagactaagatagaaca
ctgtattttaataagatgggaatggcctctgattgtctctccccactcag
ccacactgccagcctgtctctactgttctaagctctttcccaggctgtac
tgagaagagggtttgatcagattatagagaaacaatgtccttctcatacc
cttttaactagatatgggagttgggaggcaaaatgaccttcaagccttgg
cattggactttatttctcacacagatctaccaccacaattccatggacca
attttctcacaagtactaatgaggcctgtcttagggttttactactgtga
acagacaccatgaccaggacaactcttaataaaagacagcatttaatttg
gactggcttacaggttcaaaggttcagtccattatcatcaaggtaggagc
atggcagcatgcaggcagacttggggctggagttgctgagagttctacat
cttattctgaagagctaggagaagattgcttctaggcagctaagtcttaa
agcccacaatgacacatctactccaacaaggccacacctcctaatagtgc
cactccctgggccaagtatactcaaaccatcacaagggctgactctgctt
agcttcagaaatctagtgtgtttggggtgacatgtccaaagcctatcata
gacaacttctgatgatgtgtgatcctgaatgtcaaaagttttgaacatgc
tatgagggatcttgcctgtgagtataatttgtgactggcctcagcactgg
tgatataaaactagcagcatgattttatatcaatgggacagctagagatt
gtgaatcagagaaagtagaagagtagaccctcattatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24930855_24932042
seq2: B6Ng01-262E02.b_43_1209

seq1  GAATTCCCACTTAGTGTTGCCTCTTTAATCCATGCCTCCCAAAATGTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCACTTAGTGTTGCCTCTTTAATCCATGCCTCCCAAAATGTCTA  50

seq1  ATAAACCACAAGGTGTGACCACACACCAGCAGATGGATGGATTTTCAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACCACAAGGTGTGACCACACACCAGCAGATGGATGGATTTTCAGAC  100

seq1  TAGCCTAGACCACAACTGCCACTTTGTGCCAGTATCCAGATTAACATCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTAGACCACAACTGCCACTTTGTGCCAGTATCCAGATTAACATCTG  150

seq1  ATAGGCCAGTTAAAATACTGTGAGCCACTCCAGGGTTAATCTTCTCAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCCAGTTAAAATACTGTGAGCCACTCCAGGGTTAATCTTCTCAGTT  200

seq1  ACATATCTTAAAGCTTTGTCTGAATCACACAAATATAAATAAATGACCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATCTTAAAGCTTTGTCTGAATCACACAAATATAAATAAATGACCCA  250

seq1  AGAATTCCAATTTTAGGTTGCTCTTCATCTGGGTAAGGGGCATGTAAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCCAATTTTAGGTTGCTCTTCATCTGGGTAAGGGGCATGTAAAAA  300

seq1  TGAAATTTCAAATTTCTTCTTGGAAAACAAGTGTTTTATCAAAAAAGTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATTTCAAATTTCTTCTTGGAAAACAAGTGTTTTATCAAAAAAGTAT  350

seq1  ATGAAAACTGAGTTTAAATTCAATTTATATATATATTAATTTATATATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAACTGAGTTTAAATTCAATTTATATATATATTAATTTATATATAA  400

seq1  TCAATCAATAAATCAATTAATATATAATATTTAGCATATCAAAAGCTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCAATAAATCAATTAATATATAATATTTAGCATATCAAAAGCTCAA  450

seq1  CTTTTTCAACAATATTATACTTGTTAAATAAGGCCATGTGAGGCAATGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCAACAATATTATACTTGTTAAATAAGGCCATGTGAGGCAATGGC  500

seq1  CAAGCCAGAAGAGTCTTGGTTTTCTTTTTATCACAGCACAGCAGTAAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAGAAGAGTCTTGGTTTTCTTTTTATCACAGCACAGCAGTAAATA  550

seq1  GATCCTTCTTTCCATTTACATAATACACCATGCAGATGGCAAACTATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTTCTTTCCATTTACATAATACACCATGCAGATGGCAAACTATAGT  600

seq1  CAACCAATTTAAGTTACAAAGGAAACAACCAAGTATCTCGTATTGTGTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAATTTAAGTTACAAAGGAAACAACCAAGTATCTCGTATTGTGTTG  650

seq1  TCATTAAACTATGTGATACTTTTAAACAAACAAACAAAAATGTCCAGTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAAACTATGTGATACTTTTAAACAAACAAACAAAAATGTCCAGTTA  700

seq1  ACTGAAGTTGTCAAGCAAGAAATGGAACATAGTTCCCTTGGATGATAACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGTTGTCAAGCAAGAAATGGAACATAGTTCCCTTGGATGATAACC  750

seq1  TGATCTCCCTCCTAACATGCTTAAGATGGATTCATTGAGATCAGCCTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTCCCTCCTAACATGCTTAAGATGGATTCATTGAGATCAGCCTAAA  800

seq1  ATGTGAAACGTTCTTAACCATTTCCCCATTGGCCTCTGCAAAAGAAACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAAACGTTCTTAACCATTTCCCCATTGGCCTCTGCAAAAGAAACAA  850

seq1  AAGCTTCTCAACTTCGCTCCATCACAAAACAGACATTGTTAGATCACAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTCTCAACTTCGCTCCATCACAAAACAGACATTGTTAGATCACAGA  900

seq1  ATCTAGATTTCGGAAGATGGTTACTTTAGAGCTCTGTCCCTGAGAGACTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAGATTTCGGAAGATGGTTACTTTAGAGCTCTGTCCCTGAGAGACTG  950

seq1  CCGTATTTTGGCAGTTGTTACATTTTTACCTCGGGACTTTCAAATGGAAG  1000
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||
seq2  CCGTATTTTGGCAGTTGTTACA-TTTTACCTC-GGACTTTC-AATGGAAG  997

seq1  TTAAATGGGGAGATGGGGAGACGGAAAAAGTAAGACAGAGAATTAAACTA  1050
      || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||
seq2  TT-AATGGGGAGATGGGGAGACG--AAAAGT-AGACAGAGAAT--AACTA  1041

seq1  GTTTGTATTTTAATACAGAGTAACAAGTACCATTAAAACTAGTCTATGGA  1100
      ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTTTGTA-TTTAATACA-AGTTAC-AGTACCATT-AAACTAGTCTATGGA  1087

seq1  AGTAATATTGGCCAAAATTCTGAAAGCCAAAATCCATGA-CTTCTTAGAC  1149
       |||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||| 
seq2  GGTAATAT--GCCAAAATTCTGAAAGC--AAAT-CATGACCTCCTTAGAT  1132

seq1  CCATTCATTGCAGCAGGCTTTGGAATGTTTTTCCTTAAG  1188
      ||| ||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||
seq2  CCA-TCA-TGCAGCAAGCTTTGGA--GTCTTTCCTTAAG  1167

seq1: chr10_25064911_25066010
seq2: B6Ng01-262E02.g_66_1153 (reverse)

seq1  AATAATTGAGGGTCTAACTCTTCTAACTTTTCTCTTGATTCAACAATCTC  50
      ||||| ||||||||| |||||||||   |||||| |||||| ||||||||
seq2  AATAA-TGAGGGTCT-ACTCTTCTA--CTTTCTC-TGATTC-ACAATCTC  44

seq1  TTAGCTGTTCCCATTGATATAAAATCACTGCTGCTAGGTTTTATATCACC  100
       |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  -TAGCTG-TCCCATTGATATAAAATCA-TGCTGCTA-GTTTTATATCACC  90

seq1  AGTTGCTGAGGCCAGTCACAAATTATACTCCACAGGCAAGATCCCTCATA  150
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AG-TGCTGAGGCCAGTCACAAATTATACT-CACAGGCAAGATCCCTCATA  138

seq1  GCATGTTCAAAACCTTTGACATTCAGGATCACACATCATCAGAAGTTGTC  200
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTTCAAAACTTTTGACATTCAGGATCACACATCATCAGAAGTTGTC  188

seq1  TATGATAGGCTTTGGACATGTCACCCCAAACACACTAGATTTCTGAAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAGGCTTTGGACATGTCACCCCAAACACACTAGATTTCTGAAGCT  238

seq1  AAGCAGAGTCAGCCCTTGTGATGGTTTGAGTATACTTGGCCCAGGGAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGTCAGCCCTTGTGATGGTTTGAGTATACTTGGCCCAGGGAGTG  288

seq1  GCACTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGTAGATGTGTCATTGTGGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGTAGATGTGTCATTGTGGGCT  338

seq1  TTAAGACTTAGCTGCCTAGAAGCAATCTTCTCCTAGCTCTTCAGAATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGACTTAGCTGCCTAGAAGCAATCTTCTCCTAGCTCTTCAGAATAAG  388

seq1  ATGTAGAACTCTCAGCAACTCCAGCCCCAAGTCTGCCTGCATGCTGCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAACTCTCAGCAACTCCAGCCCCAAGTCTGCCTGCATGCTGCCAT  438

seq1  GCTCCTACCTTGATGATAATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGCCAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTACCTTGATGATAATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGCCAGTC  488

seq1  CAAATTAAATGCTGTCTTTTATTAAGAGTTGTCCTGGTCATGGTGTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAAATGCTGTCTTTTATTAAGAGTTGTCCTGGTCATGGTGTCTGT  538

seq1  TCACAGTAGTAAAACCCTAAGACAGGCCTCATTAGTACTTGTGAGAAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTAGTAAAACCCTAAGACAGGCCTCATTAGTACTTGTGAGAAAAT  588

seq1  TGGTCCATGGAATTGTGGTGGTAGATCTGTGTGAGAAATAAAGTCCAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCATGGAATTGTGGTGGTAGATCTGTGTGAGAAATAAAGTCCAATG  638

seq1  CCAAGGCTTGAAGGTCATTTTGCCTCCCAACTCCCATATCTAGTTAAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCTTGAAGGTCATTTTGCCTCCCAACTCCCATATCTAGTTAAAAG  688

seq1  GGTATGAGAAGGACATTGTTTCTCTATAATCTGATCAAACCCTCTTCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGAGAAGGACATTGTTTCTCTATAATCTGATCAAACCCTCTTCTCA  738

seq1  GTACAGCCTGGGAAAGAGCTTAGAACAGTAGAGACAGGCTGGCAGTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGCCTGGGAAAGAGCTTAGAACAGTAGAGACAGGCTGGCAGTGTGG  788

seq1  CTGAGTGGGGAGAGACAATCAGAGGCCATTCCCATCTTATTAAAATACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGGGGAGAGACAATCAGAGGCCATTCCCATCTTATTAAAATACAG  838

seq1  TGTTCTATCTTAGTCTCTCCCCATAGACAGATATCTGTTTGATCCAAGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTATCTTAGTCTCTCCCCATAGACAGATATCTGTTTGATCCAAGCA  888

seq1  AAACTGGTACCCATGTTCATAATGCACGTTCTGTAGTCCCTTTGCCTTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGTACCCATGTTCATAATGCACGTTCTGTAGTCCCTTTGCCTTGG  938

seq1  GTTCTTTTGGTCTTTGAGTGAGTCTAACTAAACTCTTCTCCTTTGCCTTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTTGGTCTTTGAGTGAGTCTAACTAAACTCTTCTCCTTTGCCTTC  988

seq1  TGAACTCTCCTTGAGAAATTTTGAGACATCTTAAATCCCTATAGCTCTTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTCTCCTTGAGAAATTTTGAGACATCTTAAATCCCTATAGCTCTTG  1038

seq1  TTTACAAAGTCAGTCTAAATCAAAGTGCAAAATAACTTTTTACTGAATTC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAAGTCAGTCTAAATCAAAGTGCAAAATAACTTTTTACTGAATTC  1088