BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263L07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 106,859,978 - 107,022,383
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLin7a, Myf5, Myf6, Ptprq
Upstream genePpfia2, Olfr1556-ps1, 8430416H19Rik
Downstream geneEG628870, Ppp1r12a, Pawr, EG667814, Syt1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263L07.bB6Ng01-263L07.g
ACCGA067804GA067805
length1,1301,147
definitionB6Ng01-263L07.b B6Ng01-263L07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,021,245 - 107,022,383)(106,859,978 - 106,861,135)
sequence
gaattcattatgtaaagctgttggtaatttagggatagaaaattgttgcc
aacattgagagaattccttgccttatccagctttaagcctaatccacaat
ttacagaaacacattctacaaataaaaggataaagttcttaagtaatgta
aatgtgtaaaagcaagtggaaaaaatgtttaacccaaactaagctttatt
ttacttataaaactttctacttaacatggggtgttttgcaaaatgctgta
attgtctgcttgtcatatatatatataaactcacaattatatatccaaat
ttaagaggtgctctgagattctatctgccaagaagggtgaagttaacaaa
gcttgagagtctgcaccatgaggccgcatctcaagttttcctcactgaaa
attttgattgaaaagggaactttcccatatcattctgatcacaagaatgt
acaaattcatttcatggtgtgatgtaaagaacagtaactctatgccctcc
aaatgatgttttctcatagatcattttattttataatttgctacaactag
tgacacacaaagtgggtggtctgttttgttttaataagggaatattttgt
cagcacagagtattaattcattgtacagaagaataatttcattgtgacaa
ttgcccacgtgcacatactctgatcataggcaacttctttaacgccacct
tccagattgccctcttttcttaaatagtcttctaaaagaaaaaaatactt
ttccttccttaagaattccatacaatgagttttgatcttctttacctcca
gtgccccagctcttcttatgtataccccgttcccttcttaccacagtttt
ctacctccatcctatcaaggacaatttgtgttgcccaagtattattgggt
gtgtgaccttctactgcattgcactcaacttatcatgacccacaatttaa
gaaaaaaactgaccttcttgccagaagctaactgttgccatagctcttgg
ataggggtagacttcgtgccagctctctcttcgtgttgtactttggtctg
acttgggctttcacagtgtttacatgctacacactagcatagtccacgtg
tgcaatgtctggctgtgttttttattttgg
gaattcctgagtcttttcactggagcatttacatttcgattctgtagcca
ttcgcaacagaacatctgcaggaagataatgagcttaaattacaattgac
tttggaagaataacagactctcctgttcctcaatcatgtaatcaataggg
aattctccagcaatgagagccacagccatctttcaagacaatgttaagat
ctaaataaaaaaaaaaattctagcattcagggccttgttaagaaggaagt
ttttctctaaagaacttggctagagacaaatcacacccatttacaaatgc
ggttctcaaacgtgacatcaagccaatcttgtttccttttacagggctgt
acattcaggattccaaagatggcacacctctttcaacatctagtactatt
tgtgggtgtgtgaataagtccccaggtttctcacctttcagctgggtttt
gcttgtaagcacttctaacccagacttaagcttcaaacaagatggagata
cagataccgagcattctctggggattcagggacccccttgagtaagactt
tccatagcatcctatccttcctcagaccccagactccatcagaccaagtc
atgtgactgtggtcctgcaaatgtgctggtgcactctgggcactcaatga
ggatttgttgaatgggtgaattattgaagaggaggctaaattaattattt
ttgacttctgactaacatatattaatgggcattataattttgcatgccat
agccaaagccagaatttcttccaagatacatcctggaatcaaattaaaca
tctcaaaggttcaaggacctttaagtcagaagcaatgattgagaattcat
atatatatatgaaatctctctagttctttacaaaaatacatggataattt
ggcatggaggcttcaaaagtagaactttattttgtaaagttacagaacac
aatgcattagttttttttaagctgtgacatcatattagattaccttacaa
tacaaaggacccacagtcattgaaagcacatttctaaacgtccgcttcaa
tgcctcttctttcatcttgactctagaatataaccgagaataaaatactc
aacgaacatctgctccggaacattctacatgtatttattataacaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_107021245_107022383
seq2: B6Ng01-263L07.b_45_1174 (reverse)

seq1  CCAAAAT-AAAAACACAGCAGGACATTTGCACACGTGGACTTATGCTAGT  49
      ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| 
seq2  CCAAAATAAAAAACACAGCCAGACA-TTGCACACGTGGAC-TATGCTAG-  47

seq1  TGTGGTAGCATGTAAACACCTGTGAAAGCCCAAGTCAGACCAAAGTACAA  99
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGT-GTAGCATGTAAACA-CTGTGAAAGCCCAAGTCAGACCAAAGTACAA  95

seq1  CACGAAGAGGAGAGCTGGGCACGAAGTTCTACCCCTATCCAAGGAGCTAT  149
      |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| 
seq2  CACGAAGA-GAGAGCT-GGCACGAAG-TCTACCCCTATCCAA-GAGCTA-  140

seq1  TGGCAACAGTTAGCTTCTGGCAAGAAGGTCAGTTTTTTTCTTAAATTGTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAACAGTTAGCTTCTGGCAAGAAGGTCAGTTTTTTTCTTAAATTGTG  190

seq1  GGTCATGATAAGTTGAGTGCAATGCAGTAGAAGGTCACACACCCAATAAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATGATAAGTTGAGTGCAATGCAGTAGAAGGTCACACACCCAATAAT  240

seq1  ACTTGGGCAACACAAATTGTCCTTGATAGGATGGAGGTAGAAAACTGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGCAACACAAATTGTCCTTGATAGGATGGAGGTAGAAAACTGTGG  290

seq1  TAAGAAGGGAACGGGGTATACATAAGAAGAGCTGGGGCACTGGAGGTAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGGGAACGGGGTATACATAAGAAGAGCTGGGGCACTGGAGGTAAA  340

seq1  GAAGATCAAAACTCATTGTATGGAATTCTTAAGGAAGGAAAAGTATTTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATCAAAACTCATTGTATGGAATTCTTAAGGAAGGAAAAGTATTTTT  390

seq1  TTCTTTTAGAAGACTATTTAAGAAAAGAGGGCAATCTGGAAGGTGGCGTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTAGAAGACTATTTAAGAAAAGAGGGCAATCTGGAAGGTGGCGTT  440

seq1  AAAGAAGTTGCCTATGATCAGAGTATGTGCACGTGGGCAATTGTCACAAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGTTGCCTATGATCAGAGTATGTGCACGTGGGCAATTGTCACAAT  490

seq1  GAAATTATTCTTCTGTACAATGAATTAATACTCTGTGCTGACAAAATATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTATTCTTCTGTACAATGAATTAATACTCTGTGCTGACAAAATATT  540

seq1  CCCTTATTAAAACAAAACAGACCACCCACTTTGTGTGTCACTAGTTGTAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTATTAAAACAAAACAGACCACCCACTTTGTGTGTCACTAGTTGTAG  590

seq1  CAAATTATAAAATAAAATGATCTATGAGAAAACATCATTTGGAGGGCATA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTATAAAATAAAATGATCTATGAGAAAACATCATTTGGAGGGCATA  640

seq1  GAGTTACTGTTCTTTACATCACACCATGAAATGAATTTGTACATTCTTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTACTGTTCTTTACATCACACCATGAAATGAATTTGTACATTCTTGT  690

seq1  GATCAGAATGATATGGGAAAGTTCCCTTTTCAATCAAAATTTTCAGTGAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGAATGATATGGGAAAGTTCCCTTTTCAATCAAAATTTTCAGTGAG  740

seq1  GAAAACTTGAGATGCGGCCTCATGGTGCAGACTCTCAAGCTTTGTTAACT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACTTGAGATGCGGCCTCATGGTGCAGACTCTCAAGCTTTGTTAACT  790

seq1  TCACCCTTCTTGGCAGATAGAATCTCAGAGCACCTCTTAAATTTGGATAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCTTCTTGGCAGATAGAATCTCAGAGCACCTCTTAAATTTGGATAT  840

seq1  ATAATTGTGAGTTTATATATATATATGACAAGCAGACAATTACAGCATTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGTGAGTTTATATATATATATGACAAGCAGACAATTACAGCATTT  890

seq1  TGCAAAACACCCCATGTTAAGTAGAAAGTTTTATAAGTAAAATAAAGCTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAACACCCCATGTTAAGTAGAAAGTTTTATAAGTAAAATAAAGCTT  940

seq1  AGTTTGGGTTAAACATTTTTTCCACTTGCTTTTACACATTTACATTACTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGGTTAAACATTTTTTCCACTTGCTTTTACACATTTACATTACTT  990

seq1  AAGAACTTTATCCTTTTATTTGTAGAATGTGTTTCTGTAAATTGTGGATT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACTTTATCCTTTTATTTGTAGAATGTGTTTCTGTAAATTGTGGATT  1040

seq1  AGGCTTAAAGCTGGATAAGGCAAGGAATTCTCTCAATGTTGGCAACAATT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTAAAGCTGGATAAGGCAAGGAATTCTCTCAATGTTGGCAACAATT  1090

seq1  TTCTATCCCTAAATTACCAACAGCTTTACATAATGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATCCCTAAATTACCAACAGCTTTACATAATGAATTC  1130

seq1: chr10_106859978_106861135
seq2: B6Ng01-263L07.g_67_1213

seq1  GAATTCCTGAGTCTTTTCACTGGAGCATTTACATTTCGATTCTGTAGCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAGTCTTTTCACTGGAGCATTTACATTTCGATTCTGTAGCCA  50

seq1  TTCGCAACAGAACATCTGCAGGAAGATAATGAGCTTAAATTACAATTGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCAACAGAACATCTGCAGGAAGATAATGAGCTTAAATTACAATTGAC  100

seq1  TTTGGAAGAATAACAGACTCTCCTGTTCCTCAATCATGTAATCAATAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAAGAATAACAGACTCTCCTGTTCCTCAATCATGTAATCAATAGGG  150

seq1  AATTCTCCAGCAATGAGAGCCACAGCCATCTTTCAAGACAATGTTAAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTCCAGCAATGAGAGCCACAGCCATCTTTCAAGACAATGTTAAGAT  200

seq1  CTAAATAAAAAAAAAAATTCTAGCATTCAGGGCCTTGTTAAGAAGGAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATAAAAAAAAAAATTCTAGCATTCAGGGCCTTGTTAAGAAGGAAGT  250

seq1  TTTTCTCTAAAGAACTTGGCTAGAGACAAATCACACCCATTTACAAATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTAAAGAACTTGGCTAGAGACAAATCACACCCATTTACAAATGC  300

seq1  GGTTCTCAAACGTGACATCAAGCCAATCTTGTTTCCTTTTACAGGGCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTCAAACGTGACATCAAGCCAATCTTGTTTCCTTTTACAGGGCTGT  350

seq1  ACATTCAGGATTCCAAAGATGGCACACCTCTTTCAACATCTAGTACTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCAGGATTCCAAAGATGGCACACCTCTTTCAACATCTAGTACTATT  400

seq1  TGTGGGTGTGTGAATAAGTCCCCAGGTTTCTCACCTTTCAGCTGGGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTGTGTGAATAAGTCCCCAGGTTTCTCACCTTTCAGCTGGGTTTT  450

seq1  GCTTGTAAGCACTTCTAACCCAGACTTAAGCTTCAAACAAGATGGAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTAAGCACTTCTAACCCAGACTTAAGCTTCAAACAAGATGGAGATA  500

seq1  CAGATACCGAGCATTCTCTGGGGATTCAGGGACCCCCTTGAGTAAGACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACCGAGCATTCTCTGGGGATTCAGGGACCCCCTTGAGTAAGACTT  550

seq1  TCCATAGCATCCTATCCTTCCTCAGACCCCAGACTCCATCAGACCAAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAGCATCCTATCCTTCCTCAGACCCCAGACTCCATCAGACCAAGTC  600

seq1  ATGTGACTGTGGTCCTGCAAATGTGCTGGTGCACTCTGGGCACTCAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACTGTGGTCCTGCAAATGTGCTGGTGCACTCTGGGCACTCAATGA  650

seq1  GGATTTGTTGAATGGGTGAATTATTGAAGAGGAGGCTAAATTAATTATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGTTGAATGGGTGAATTATTGAAGAGGAGGCTAAATTAATTATTT  700

seq1  TTGACTTCTGACTAACATATATTAATGGGCATTATAATTTTGCATGCCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTCTGACTAACATATATTAATGGGCATTATAATTTTGCATGCCAT  750

seq1  AGCCAAAGCCAGAATTTCTTCCAAGATACATCCTGGAATCAAATTAAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAAGCCAGAATTTCTTCCAAGATACATCCTGGAATCAAATTAAACA  800

seq1  TCTCAAAGGTTCAAGGACCTTTAAGTCAGAAGCAATGATTGAGAATTCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAAGGTTCAAGGACCTTTAAGTCAGAAGCAATGATTGAGAATTCAT  850

seq1  ATATATATATGAAATCTCTCTAGTTCTTTACAAAAATACATGGATAATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATGAAATCTCTCTAGTTCTTTACAAAAATACATGGATAATTT  900

seq1  GGCATGGAGGCTTCAAAAGTAGAACTTTA-TTTGTAAAGTTTACAGAACA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  GGCATGGAGGCTTCAAAAGTAGAACTTTATTTTGTAAAG-TTACAGAACA  949

seq1  CAATGCATTAGGTTTTTTTTAAGCTGTGACATCATATTAGATTACCTTAC  999
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCATTA-GTTTTTTTTAAGCTGTGACATCATATTAGATTACCTTAC  998

seq1  AATACAAAGGACCCACAAGTCATTGAAAGCACCATTTCTAAACGTCGGCT  1049
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  AATACAAAGGACCCAC-AGTCATTGAAAGCA-CATTTCTAAACGTCCGCT  1046

seq1  TTCAAATGCCTCTTCTTTCATCTTTGACTCCTAGAATATACCCGAGATAA  1099
      |   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | 
seq2  T--CAATGCCTCTTCTTTCATC-TTGACT-CTAGAATATAACCGAGA-AT  1091

seq1  AAATTACTCACACG-ACATCTCCCTCCCGAACA-TCTACATGTATTTATT  1147
      ||| |||||| ||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| 
seq2  AAAATACTCA-ACGAACATCT-GCTCCGGAACATTCTACATGTATTTAT-  1138

seq1  TATTTAACAGA  1158
        | |||||||
seq2  --TATAACAGA  1147