BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271H20
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,157,206 - 67,158,357
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2, Egr2, Gm237, LOC100040081
Downstream geneLOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136, 1700040L02Rik, EG665342
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271H20.b
ACCGA073558
length1,152
definitionB6Ng01-271H20.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcattgtagagtattggggtctttttatctttattgacatcagcat
atacatttgggagagaagtaaacaacttatctggaagatgtgttctctaa
cagtaaagtttctggcttgttgagacgagattgtttttttctttcttgtg
cctgtttctcctacttggtgaccacgaataatgcctatgcccaagcacga
cacatatacccaggtcaccactgttcaaccctaggaagaagagggcatct
ttcaccaggcttaacaggttgttttggttcagtgcacacttcactgttta
aaagcattactcaataaatttagtgcggtgctgtctttgcccctggatca
agatctttagcatctcccagccctacccagacccagtctgagaaggaata
acatggaaactggagtaatatggggtaactttacaatttattaagcttta
cagatgcatcaaaggaccaaatagccaaaggccctgcagagatggagctg
gaaactagaaatggtttatgttgcttctgtttatctttagaaagcagaac
tgggacctgtgggcagcagacccaggaaagcatatttctgttcccatgtg
acatacaaccaaatatggaatgctcgagagcaccctttccctgcaggaac
tgcatccggatctgcatttgtgcaattgcgtggatgcttgctgcagaaga
tacatgcatgggactggacccgatctgttgctctctgttactctttatag
caacaggcacagcctttcaaaccaaagtaaaatctcatgtgctcttcaat
ctagaaagaaatggagtttctacagccagagggggaattgtcttacatca
tccctccaaaccctggatacccacaacacctggataaagttaccaagaag
tttcctcccatccaagtgtcatccaggtctgtcactaagcaggatagcaa
aggctatccccagattcgcctccttcctctcctcctatcttttcccatga
catagtctagatagtgctctcaactttcctaatgctgcaaccctataata
tagttcttcatgtgatgacccactaagcacaaaacgattttgttcctact
tcacagctgttactttggctactgctatgaattgtaaaatatctgatatg
tg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67157206_67158357
seq2: B6Ng01-271H20.b_47_1198 (reverse)

seq1  CACATATCAGATA-TTTACAATTCATAGCAGTAG-CAAAATTACAGCTGT  48
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||
seq2  CACATATCAGATATTTTACAATTCATAGCAGTAGCCAAAGTAACAGCTGT  50

seq1  GAAGTAGGAACAAAAATCGTTTTGTGCTTAGTGGGTCATCACATGAAGAA  98
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGGAAC-AAAATCGTTTTGTGCTTAGTGGGTCATCACATGAAGAA  99

seq1  CTATATTATAGGGTTGCAGCATTAGGAAAGTTGAGAGCCACTATCTAGAC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTATATTATAGGGTTGCAGCATTAGGAAAGTTGAGAG-CACTATCTAGAC  148

seq1  TATGTCATGGGAAAAGATAGGAGGAGAGGAAGGAGGCGAATCTGGGGATA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCATGGGAAAAGATAGGAGGAGAGGAAGGAGGCGAATCTGGGGATA  198

seq1  GCCTTTGCTATCCTGCTTAGTGACAGACCTGGATGACACTTGGATGGGAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGCTATCCTGCTTAGTGACAGACCTGGATGACACTTGGATGGGAG  248

seq1  GAAACTTCTTGGTAACTTTATCCAGGTGTTGTGGGTATCCAGGGTTTGGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTTCTTGGTAACTTTATCCAGGTGTTGTGGGTATCCAGGGTTTGGA  298

seq1  GGGATGATGTAAGACAATTCCCCCTCTGGCTGTAGAAACTCCATTTCTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGATGTAAGACAATTCCCCCTCTGGCTGTAGAAACTCCATTTCTTT  348

seq1  CTAGATTGAAGAGCACATGAGATTTTACTTTGGTTTGAAAGGCTGTGCCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTGAAGAGCACATGAGATTTTACTTTGGTTTGAAAGGCTGTGCCT  398

seq1  GTTGCTATAAAGAGTAACAGAGAGCAACAGATCGGGTCCAGTCCCATGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTATAAAGAGTAACAGAGAGCAACAGATCGGGTCCAGTCCCATGCA  448

seq1  TGTATCTTCTGCAGCAAGCATCCACGCAATTGCACAAATGCAGATCCGGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCTTCTGCAGCAAGCATCCACGCAATTGCACAAATGCAGATCCGGA  498

seq1  TGCAGTTCCTGCAGGGAAAGGGTGCTCTCGAGCATTCCATATTTGGTTGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTTCCTGCAGGGAAAGGGTGCTCTCGAGCATTCCATATTTGGTTGT  548

seq1  ATGTCACATGGGAACAGAAATATGCTTTCCTGGGTCTGCTGCCCACAGGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACATGGGAACAGAAATATGCTTTCCTGGGTCTGCTGCCCACAGGT  598

seq1  CCCAGTTCTGCTTTCTAAAGATAAACAGAAGCAACATAAACCATTTCTAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTTCTGCTTTCTAAAGATAAACAGAAGCAACATAAACCATTTCTAG  648

seq1  TTTCCAGCTCCATCTCTGCAGGGCCTTTGGCTATTTGGTCCTTTGATGCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGCTCCATCTCTGCAGGGCCTTTGGCTATTTGGTCCTTTGATGCA  698

seq1  TCTGTAAAGCTTAATAAATTGTAAAGTTACCCCATATTACTCCAGTTTCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAAAGCTTAATAAATTGTAAAGTTACCCCATATTACTCCAGTTTCC  748

seq1  ATGTTATTCCTTCTCAGACTGGGTCTGGGTAGGGCTGGGAGATGCTAAAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTATTCCTTCTCAGACTGGGTCTGGGTAGGGCTGGGAGATGCTAAAG  798

seq1  ATCTTGATCCAGGGGCAAAGACAGCACCGCACTAAATTTATTGAGTAATG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGATCCAGGGGCAAAGACAGCACCGCACTAAATTTATTGAGTAATG  848

seq1  CTTTTAAACAGTGAAGTGTGCACTGAACCAAAACAACCTGTTAAGCCTGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAACAGTGAAGTGTGCACTGAACCAAAACAACCTGTTAAGCCTGG  898

seq1  TGAAAGATGCCCTCTTCTTCCTAGGGTTGAACAGTGGTGACCTGGGTATA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGATGCCCTCTTCTTCCTAGGGTTGAACAGTGGTGACCTGGGTATA  948

seq1  TGTGTCGTGCTTGGGCATAGGCATTATTCGTGGTCACCAAGTAGGAGAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCGTGCTTGGGCATAGGCATTATTCGTGGTCACCAAGTAGGAGAAA  998

seq1  CAGGCACAAGAAAGAAAAAAACAATCTCGTCTCAACAAGCCAGAAACTTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCACAAGAAAGAAAAAAACAATCTCGTCTCAACAAGCCAGAAACTTT  1048

seq1  ACTGTTAGAGAACACATCTTCCAGATAAGTTGTTTACTTCTCTCCCAAAT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTAGAGAACACATCTTCCAGATAAGTTGTTTACTTCTCTCCCAAAT  1098

seq1  GTATATGCTGATGTCAATAAAGATAAAAAGACCCCAATACTCTACAATGA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGCTGATGTCAATAAAGATAAAAAGACCCCAATACTCTACAATGA  1148

seq1  ATTC  1152
      ||||
seq2  ATTC  1152