BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-275B12
Chromosome10 (Build37)
Map Location 70,483,879 - 70,485,046
singlet/doubletsinglet
Overlap geneBicc1
Upstream geneAnk3, Ccdc6, 2310015B20Rik, Slc16a9, LOC632955, 1200015N20Rik, LOC665398, Phyhipl, EG665429
Downstream geneLOC622551, C730027H18Rik, Tfam, Ube2d1, LOC665472, Zcd1, Ipmk, LOC100039860, LOC216081, EG216082, LOC622812, EG327767, 1700049L16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-275B12.b
ACCGA076224
length1,178
definitionB6Ng01-275B12.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcaaacttaatcacaaggaggcttctaaaacacactgttcgtgcaa
tataaaatatatgaacttcagaaacttctcaccatgagcaagctgcatcc
tctctcacatcagttattagtatacacacacaaacatacacacatgcata
tcaacaacttacacatacatacacagatacacaatcatacacatacactc
acacacatatgcatacatatacatacatacacacacacatgcatgcacca
tacctatacacacatgaatacacacccaaacatgcacatacacagacatg
cacacacacatatatacacaacatgcatatatatatatatatatatatat
atatatatgtatatgtatatatacattcatacacatatactcaaatacac
atacatatgcatatacacaccaacatgaacacacatatacatacatacac
acacacatgcacacatgcacatatacaaccatacttacacacacatgcat
gcacacacagactcacacacacacacacacagtggcactagtaatattct
gtcatgcaggttctttaaggaaaccaaaatatccttcttagggaatactg
cacagttctaacaagaaattgggtactcaatccacgagaggacaccgagg
aacacctataggcaccctgctaagtaggggacaatcagtgaaatgaaatg
cagtggatgagtggcggatatgcctcagtactttaaaagccacaaaagcc
cacggagggcacataagtgtatattaccaagaaaaggaagtctttcaaga
ctggctctcatttagtcatgtgcatttgaagtttctcagctgctttggtg
cttaggatctcgtgtctttttagctgccagctccacggtgcatggctata
tccatccagtcacctcttggaggatatcttggttgctaagttttgagaac
catgaacaaagtccccataaatatgtatgtggtgggtttctctggacaat
ggaggttttatttattgattgattgactcagttggccaacactagaaagt
gtgatctctgaatcattttggaaaggcttcttgttttagcatgaaacttg
tcttccaaaggtgtccttacccattctgtaagcccaccacctatgccatc
aaagtcagtgctacactgatatcagcat
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_70483879_70485046
seq2: B6Ng01-275B12.b_45_1222

seq1  GAATTCAAACTTAATCACAAGGAGGCTTCTAAAACACACTGTTCGTGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACATATATACACAACATGCATATATATATATATATATATATAT  350

seq1  ATATATATGTATATGTATATATACATTCATACACATATACTCAAATACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATGTATATGTATATATACATTCATACACATATACTCAAATACAC  400

seq1  ATACATATGCATATACACACCAACATGAACACACATATACATACATACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATGCATATACACACCAACATGAACACACATATACATACATACAC  450

seq1  ACACACATGCACACATGCACATATACAACCATACTTACACACACATGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GCACACACAGACTCACACACACACACACACAGTGGCACTAGTAATATTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTCTAACAAGAAATTGGGTACTCAATCCACGAGAGGACACCGAGG  650

seq1  AACACCTATAGGCACCCTGCTAAGTAGGGGACAATCAGTGAAATGAAATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCTATAGGCACCCTGCTAAGTAGGGGACAATCAGTGAAATGAAATG  700

seq1  CAGTGGATGAGTGGCGGATATGCCTCAGTACTTTAAAAGCCACAAAAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGATGAGTGGCGGATATGCCTCAGTACTTTAAAAGCCACAAAAGCC  750

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGAGGGCACATAAGTGTATATTACCAAGAAAAGGAAGTCTTTCAAGA  800

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCTCATTTAGTCATGTGCATTTGAAGTTTCTCAGCTGCTTTGGTG  850

seq1  CTTAGGATCTCGTGTCTTTTTAGCTGCCAGCTCCACGGTGCATGGCTATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGATCTCGTGTCTTTTTAGCTGCCAGCTCCACGGTGCATGGCTATA  900

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      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCCATCCAGTCACCTCTTGGAGGATATCTTGGTTGCTAAGTTTTGAGAAC  950

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      |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  
seq2  CATGAACAAAGTCCCCATAAATATGTATGTGGTGGGTTTCTCTGGACAAT  1000

seq1  TGAGGTTTTATTTATTGATTGATTGACTCAGTTGGCC-ACACTAGAAAGT  1046
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGAGGTTTTATTTATTGATTGATTGACTCAGTTGGCCAACACTAGAAAGT  1050

seq1  GTGATCTCTGAATCATTTTGGAAAGGC-TCT--GTTTAGCATGAAAC-TG  1092
      ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| ||
seq2  GTGATCTCTGAATCATTTTGGAAAGGCTTCTTGTTTTAGCATGAAACTTG  1100

seq1  TCTTCCAAA-GTGTCCTTA-CCATCCTGT-AGCCCACCACCTATG-CATC  1138
      ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||
seq2  TCTTCCAAAGGTGTCCTTACCCATTCTGTAAGCCCACCACCTATGCCATC  1150

seq1  AGAGTTCCAGTTGCTACACTG-TATCAGCAT  1168
      | |||  ||| |||||||||| |||||||||
seq2  AAAGT--CAG-TGCTACACTGATATCAGCAT  1178