BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291H07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 21,792,137 - 21,924,498
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039992, E030030I06Rik, LOC665543, Ube2q2l, Raet1e
Upstream geneAhi1, Myb, LOC100039870, Hbs1l, Aldh8a1, LOC100039906, 1700020N01Rik, EG432436, LOC100039936, LOC628133, Sgk, LOC667254, LOC665523, 4930444G20Rik
Downstream geneLOC100040023, LOC100038830, LOC667280, EG667281, LOC432438, Raet1d, LOC667299, LOC667303, LOC100040072, LOC100040078, Slc2a12, Tbpl1, Tcf21, Eya4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291H07.bB6Ng01-291H07.g
ACCGA088335GA088336
length1,135668
definitionB6Ng01-291H07.b B6Ng01-291H07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,792,137 - 21,793,275)(21,923,832 - 21,924,498)
sequence
gaattcaaggtggctatgtccaacatatatacatgtataaaattgtcaaa
aataaattctttgtagagaggagattactgctaataaatgtctagaaatt
ggattttttgatccttggatgggagaaccagagccacatattgagcatag
gacttaaagaagtacacactctttttatgtcagccaactcctattaatgt
ggatgccagcctcaggcaccagtgcttttccacggaggaagggccccctg
caaggatggaatataccagagagcagacagagtgtcttcgtgtccgagaa
gtgtagctgttcagtgtgacctactagagtggcacatgagcttatcagta
ttgccattgtgatttctgaccataagtttgtcctaggcagcttgtggacg
agtaagccactttatttctgtgtcaagtgctgaatttgagctcctaagat
gctgagtaaggttcacacctttagtgcaggccctgcctgaatccattacc
tcctctcttcagaactaataaaatgatttctgcttccatttcttcaataa
ggtacacagggctatgcactcagaaatggaacaaggagccccctactggc
ggcttggcaaagagatgaccaaagatttgcagggcctgggtagttggtaa
tgcacttattcttggataaaacagtgatgctggctggaagtttgtctccg
agggctttccagtaggtgctttaactggcaggtactctgtagtgtttgag
gaatgttggccatatcctgtgtccttagtcagtagcaatgtaaggtgtta
gcagaggacctttagcactggccagttgctgttcccatgcttcagtgagc
cttactcatgtgcacctgcccagtgtgtgcctccctggtgtgcacttgtt
catttgtatacctgctccaggacacaccagctgctggtgtctgtgatcta
ttaacatgtgtggaattctatcattcctgtgcaaagaagtataaacaaag
gccttcatgtctgtagcagcctttactgaaagaggtggagattaacattg
gcttatattagcaaaatgcaacactacaacagacatgtaagatctatagt
taaataaagtgtgatcattctactgcctggctctg
gaattctttagtgtctaataagtgtttggcaaatgaaggccatgatcatc
atattcttttgaaactaaaatatattttcatctttggaaaactaagataa
ttttttaaagaaaagaaagaaagaaaggaaagaaggaaggaaggaaggaa
ggaaggagaggaaggagggaaggaaggaaggaaagaaaaaagacaaaaaa
gaaaatctgacctactagtcatcaactgagtatctgatgcagaggcacag
ataatatacttcccaatttgaaattattcctgttttacagaaaaacagac
ttctgtctaaatgaaccccactatctgatctgcctccaggggaaggggtc
tacataggcccaggtgcaggggcagaagcatccatatgcccaactaagga
ccacttaagcctgttgtcaccctgtgaaggaaggaagggattaaagtcct
tttctgagtggaatagtgaggcatattataataggcagggaagggagatg
agctgggtgagttctgcatacaacaagtgggttataaatcttggtgtggt
ggcacaggcccttaatttttatatttgggtccaaaattctagttcaaagg
ctagcctgggctacagagtgaactctttcagcaaaagtcccagactttgg
ggggaggggtgcgaatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_21792137_21793275
seq2: B6Ng01-291H07.b_49_1183

seq1  GAATTCAAGGTGGCTATGTCCAACATATATACATGTATAAAATTGTCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGTGGCTATGTCCAACATATATACATGTATAAAATTGTCAAA  50

seq1  AATAAATTCTTTGTAGAGAGGAGATTACTGCTAATAAATGTCTAGAAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATTCTTTGTAGAGAGGAGATTACTGCTAATAAATGTCTAGAAATT  100

seq1  GGATTTTTTGATCCTTGGATGGGAGAACCAGAGCCACATATTGAGCATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTTTGATCCTTGGATGGGAGAACCAGAGCCACATATTGAGCATAG  150

seq1  GACTTAAAGAAGTACACACTCTTTTTATGTCAGCCAACTCCTATTAATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTAAAGAAGTACACACTCTTTTTATGTCAGCCAACTCCTATTAATGT  200

seq1  GGATGCCAGCCTCAGGCACCAGTGCTTTTCCACGGAGGAAGGGCCCCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCCAGCCTCAGGCACCAGTGCTTTTCCACGGAGGAAGGGCCCCCTG  250

seq1  CAAGGATGGAATATACCAGAGAGCAGACAGAGTGTCTTCGTGTCCGAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGATGGAATATACCAGAGAGCAGACAGAGTGTCTTCGTGTCCGAGAA  300

seq1  GTGTAGCTGTTCAGTGTGACCTACTAGAGTGGCACATGAGCTTATCAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGCTGTTCAGTGTGACCTACTAGAGTGGCACATGAGCTTATCAGTA  350

seq1  TTGCCATTGTGATTTCTGACCATAAGTTTGTCCTAGGCAGCTTGTGGACG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATTGTGATTTCTGACCATAAGTTTGTCCTAGGCAGCTTGTGGACG  400

seq1  AGTAAGCCACTTTATTTCTGTGTCAAGTGCTGAATTTGAGCTCCTAAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGCCACTTTATTTCTGTGTCAAGTGCTGAATTTGAGCTCCTAAGAT  450

seq1  GCTGAGTAAGGTTCACACCTTTAGTGCAGGCCCTGCCTGAATCCATTACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTAAGGTTCACACCTTTAGTGCAGGCCCTGCCTGAATCCATTACC  500

seq1  TCCTCTCTTCAGAACTAATAAAATGATTTCTGCTTCCATTTCTTCAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTCTTCAGAACTAATAAAATGATTTCTGCTTCCATTTCTTCAATAA  550

seq1  GGTACACAGGGCTATGCACTCAGAAATGGAACAAGGAGCCCCCTACTGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACACAGGGCTATGCACTCAGAAATGGAACAAGGAGCCCCCTACTGGC  600

seq1  GGCTTGGCAAAGAGATGACCAAAGATTTGCAGGGCCTGGGTAGTTGGTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGGCAAAGAGATGACCAAAGATTTGCAGGGCCTGGGTAGTTGGTAA  650

seq1  TGCACTTATTCTTGGATAAAACAGTGATGCTGGCTGGAAGTTTGTCTCCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTTATTCTTGGATAAAACAGTGATGCTGGCTGGAAGTTTGTCTCCG  700

seq1  AGGGCTTTCCAGTAGGTGCTTTAACTGGCAGGTACTCTGTAGTGTTTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTTTCCAGTAGGTGCTTTAACTGGCAGGTACTCTGTAGTGTTTGAG  750

seq1  GAATGTTGGCCATATCCTGTGTCCTTAGTCAGTAGCAATGTAAGGTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTTGGCCATATCCTGTGTCCTTAGTCAGTAGCAATGTAAGGTGTTA  800

seq1  GCAGAGGACCTTTAGCACTGGCCAGTTGCTGTTCCCATGCTTCAGTGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGACCTTTAGCACTGGCCAGTTGCTGTTCCCATGCTTCAGTGAGC  850

seq1  CTTACTCATGTGCACCTGCCCAGTGTGTGCCTCCCTGGTGTGCACTTGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTCATGTGCACCTGCCCAGTGTGTGCCTCCCTGGTGTGCACTTGTT  900

seq1  CATTTGTATACCTGCTCCAGGACACACCAGCTGCTGGTGTCTGTGATCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTATACCTGCTCCAGGACACACCAGCTGCTGGTGTCTGTGATCTA  950

seq1  TTAACATGTGTGGAATTCTATCATTCCTGTGCAAAGAAGTATACACAAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTAACATGTGTGGAATTCTATCATTCCTGTGCAAAGAAGTATAAACAAAG  1000

seq1  GCCTTCATGTCTGTAGCAGCCTTTACTGAAAGAGGGTGAGATT-ACATTG  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||
seq2  GCCTTCATGTCTGTAGCAGCCTTTACTGAAAGAGGTGGAGATTAACATTG  1050

seq1  GCTTATA-TAGCAAAAATGCAACACTACAACAGACATGTAAGATCTATTA  1098
      ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  GCTTATATTAGC-AAAATGCAACACTACAACAGACATGTAAGATCTAT--  1097

seq1  AGTAAATAAAAAGTGTGATCAATTCTACTGCTTGGGCTCTG  1139
      ||| || | ||||||||||| |||||||||| | |||||||
seq2  AGTTAA-ATAAAGTGTGATC-ATTCTACTGCCT-GGCTCTG  1135

seq1: chr10_21923832_21924498
seq2: B6Ng01-291H07.g_67_734 (reverse)

seq1  ACATTCGCACCCCTCCCCCCAAAGTCTGGGACTTTTGCTGAAAGAGTTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCGCACCCCTCCCCCCAAAGTCTGGGACTTTTGCTGAAAGAGTTCA  50

seq1  CTCTGTAGCCCAGGCTAGCC-TTGAACTAGAATTTTGGACCCAAATATAA  99
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTAGCCCAGGCTAGCCTTTGAACTAGAATTTTGGACCCAAATATAA  100

seq1  AAATTAAGGGCCTGTGCCACCACACCAAGATTTATAACCCACTTGTTGTA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAGGGCCTGTGCCACCACACCAAGATTTATAACCCACTTGTTGTA  150

seq1  TGCAGAACTCACCCAGCTCATCTCCCTTCCCTGCCTATTATAATATGCCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAACTCACCCAGCTCATCTCCCTTCCCTGCCTATTATAATATGCCT  200

seq1  CACTATTCCACTCAGAAAAGGACTTTAATCCCTTCCTTCCTTCACAGGGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTCCACTCAGAAAAGGACTTTAATCCCTTCCTTCCTTCACAGGGT  250

seq1  GACAACAGGCTTAAGTGGTCCTTAGTTGGGCATATGGATGCTTCTGCCCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACAGGCTTAAGTGGTCCTTAGTTGGGCATATGGATGCTTCTGCCCC  300

seq1  TGCACCTGGGCCTATGTAGACCCCTTCCCCTGGAGGCAGATCAGATAGTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCTGGGCCTATGTAGACCCCTTCCCCTGGAGGCAGATCAGATAGTG  350

seq1  GGGTTCATTTAGACAGAAGTCTGTTTTTCTGTAAAACAGGAATAATTTCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTCATTTAGACAGAAGTCTGTTTTTCTGTAAAACAGGAATAATTTCA  400

seq1  AATTGGGAAGTATATTATCTGTGCCTCTGCATCAGATACTCAGTTGATGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGGAAGTATATTATCTGTGCCTCTGCATCAGATACTCAGTTGATGA  450

seq1  CTAGTAGGTCAGATTTTCTTTTTTGTCTTTTTTCTTTCCTTCCTTCCTTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTAGGTCAGATTTTCTTTTTTGTCTTTTTTCTTTCCTTCCTTCCTTC  500

seq1  CCTCCTTCCTCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTTTCTTTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTCCTCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTTTCTTTC  550

seq1  TTTCTTTTCTTTAAAAAATTATCTTAGTTTTCCAAAGATGAAAATATATT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTTCTTTAAAAAATTATCTTAGTTTTCCAAAGATGAAAATATATT  600

seq1  TTAGTTTCAAAAGAATATGATGATCATGGCCTTCATTTGCCAAACACTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTCAAAAGAATATGATGATCATGGCCTTCATTTGCCAAACACTTA  650

seq1  TTAGACACTAAAGAATTC  667
      ||||||||||||||||||
seq2  TTAGACACTAAAGAATTC  668