BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-292O06
Chromosome10 (Build37)
Map Location 117,884,403 - 117,988,844
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668149, Kifc5c, Cpm, Mdm2, Slc35e3, Nup107, Rap1b, Mdm1, Il22, LOC672934, LOC668180, LOC668186, LOC668187, LOC668191, EG668193, Iltifb, LOC668198, EG668203, EG668205, EG668209, EG668213, LOC668216, Ifng
Downstream geneLOC100043478, LOC100042850, Dyrk2, LOC668223, LOC100042861, LOC674417, Cand1, Grip1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-292O06.bB6Ng01-292O06.g
ACCGA089410GA089411
length998428
definitionB6Ng01-292O06.b B6Ng01-292O06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,884,403 - 117,885,326)(117,988,411 - 117,988,844)
sequence
gaattcaagactcttggagttgtcaaaagatggtcttacaatgtacatgt
gaatgtgctatgaacttggacttatgatcgcttatgtgagcaagaataat
ggatgtgatgagatgattttggctggcttcaggacacacacagggtgaca
agagcagggatgtgaggggacacaggttagttgtcgggagcttccttctc
agtgttttgactttgccttcctacaatgacgggaccactcaaaacaggtt
gtgtcaaggggtcattttagtccttggccataatcagtggttactgtaat
cattattgggtaactaggcaacagtggatgcaacctgactgcaaaacttt
aaagtcttagatgagggaagaatgaaaaactgtaggccagtgttggcatg
cctatgaatgacatgggatgctgctggctgctgtatatgagtcaggggcc
tcatatcagctggtgtatgctccgtggctagtggctcagtcagtgtctga
gagatctcagggctccaggttagttgagactgctggtcttcctatggggt
tgccctcctcctcctcagctttttccagcctttccctaattcaatcacag
gggtccctgacttcagtccattggttgggtgtaaatatctgcatctctct
cagtcagctgcttgttgggcctcttggaggacagccatgctaggctcctg
tctgtaagtacaccatagtaatagtaacagtgtcaggccctggagcctcc
ccttgggatggatcccaagttaggcgggtcaatggaccttctttctctca
gtctcttctccatttttgtccctgcagttctttctataaagggacaattc
tgggtcagagtttttgactgtgggttggcaaccccatctctccacttgat
gccatgtctttcaactggaggtggactctgcaagtttcctctccctagtg
ttgggcatttcatctaaagtccttcccctttaagttcttagagtctct
agttaaatcttcatagagtggtgacaatctccttaacctcccttcagaaa
agagccctgggccccaggagaggaagctctaaaagatgatgagctaactg
aatgctttcttatccagtgtgggtatagtgcaaatccgtcccaaagcacc
aggctcattaacatccatcgaagcatcattacactcatctcagaagctca
acaagaagagcagtaggtggatgacaacacaggtcttctccccctattga
actcttattacatctgttagaatcagaaccaaaaatgtattgattggatc
aaaacatctagagtgcatgtgtgcatatagatatgtacatacgtatatat
acatgtatatgtgagtttacatatatacgtgtatttatgtatgtgtatgt
atgtatatatatatatatgtatgtatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_117884403_117885326
seq2: B6Ng01-292O06.b_44_967

seq1  GAATTCAAGACTCTTGGAGTTGTCAAAAGATGGTCTTACAATGTACATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACTCTTGGAGTTGTCAAAAGATGGTCTTACAATGTACATGT  50

seq1  GAATGTGCTATGAACTTGGACTTATGATCGCTTATGTGAGCAAGAATAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGCTATGAACTTGGACTTATGATCGCTTATGTGAGCAAGAATAAT  100

seq1  GGATGTGATGAGATGATTTTGGCTGGCTTCAGGACACACACAGGGTGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGATGAGATGATTTTGGCTGGCTTCAGGACACACACAGGGTGACA  150

seq1  AGAGCAGGGATGTGAGGGGACACAGGTTAGTTGTCGGGAGCTTCCTTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGGGATGTGAGGGGACACAGGTTAGTTGTCGGGAGCTTCCTTCTC  200

seq1  AGTGTTTTGACTTTGCCTTCCTACAATGACGGGACCACTCAAAACAGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTTGACTTTGCCTTCCTACAATGACGGGACCACTCAAAACAGGTT  250

seq1  GTGTCAAGGGGTCATTTTAGTCCTTGGCCATAATCAGTGGTTACTGTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAAGGGGTCATTTTAGTCCTTGGCCATAATCAGTGGTTACTGTAAT  300

seq1  CATTATTGGGTAACTAGGCAACAGTGGATGCAACCTGACTGCAAAACTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTGGGTAACTAGGCAACAGTGGATGCAACCTGACTGCAAAACTTT  350

seq1  AAAGTCTTAGATGAGGGAAGAATGAAAAACTGTAGGCCAGTGTTGGCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTTAGATGAGGGAAGAATGAAAAACTGTAGGCCAGTGTTGGCATG  400

seq1  CCTATGAATGACATGGGATGCTGCTGGCTGCTGTATATGAGTCAGGGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGAATGACATGGGATGCTGCTGGCTGCTGTATATGAGTCAGGGGCC  450

seq1  TCATATCAGCTGGTGTATGCTCCGTGGCTAGTGGCTCAGTCAGTGTCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCAGCTGGTGTATGCTCCGTGGCTAGTGGCTCAGTCAGTGTCTGA  500

seq1  GAGATCTCAGGGCTCCAGGTTAGTTGAGACTGCTGGTCTTCCTATGGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTCAGGGCTCCAGGTTAGTTGAGACTGCTGGTCTTCCTATGGGGT  550

seq1  TGCCCTCCTCCTCCTCAGCTTTTTCCAGCCTTTCCCTAATTCAATCACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCCTCCTCCTCAGCTTTTTCCAGCCTTTCCCTAATTCAATCACAG  600

seq1  GGGTCCCTGACTTCAGTCCATTGGTTGGGTGTAAATATCTGCATCTCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCCTGACTTCAGTCCATTGGTTGGGTGTAAATATCTGCATCTCTCT  650

seq1  CAGTCAGCTGCTTGTTGGGCCTCTTGGAGGACAGCCATGCTAGGCTCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGCTGCTTGTTGGGCCTCTTGGAGGACAGCCATGCTAGGCTCCTG  700

seq1  TCTGTAAGTACACCATAGTAATAGTAACAGTGTCAGGCCCTGGAGCCTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAAGTACACCATAGTAATAGTAACAGTGTCAGGCCCTGGAGCCTCC  750

seq1  CCTTGGGATGGATCCCAAGTTAGGCGGGTCAATGGACCTTCTTTCTCTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGGATGGATCCCAAGTTAGGCGGGTCAATGGACCTTCTTTCTCTCA  800

seq1  GTCTCTTCTCCATTTTTGTCCCTGCAGTTCTTTCTATAAAGGGACAATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTCTCCATTTTTGTCCCTGCAGTTCTTTCTATAAAGGGACAATTC  850

seq1  TGGGTCAGAGTTTTTGACTGTGGGTTGGCAACCCCATCTCTCCACTTGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCAGAGTTTTTGACTGTGGGTTGGCAACCCCATCTCTCCACTTGAT  900

seq1  GCCATGTCTTTCAACTGGAGGTGG  924
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGTCTTTCAACTGGAGGTGG  924

seq1: chr10_117988411_117988844
seq2: B6Ng01-292O06.g_63_496 (reverse)

seq1  ACATACATACATATATATATATATACATACATACACATACATAAATACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATACATATATATATATATACATACATACACATACATAAATACAC  50

seq1  GTATATATGTAAACTCACATATACATGTATATATACGTATGTACATATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATGTAAACTCACATATACATGTATATATACGTATGTACATATCT  100

seq1  ATATGCACACATGCACTCTAGATGTTTTGATCCAATCAATACATTTTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCACACATGCACTCTAGATGTTTTGATCCAATCAATACATTTTTGG  150

seq1  TTCTGATTCTAACAGATGTAATAAGAGTTCAATAGGGGGAGAAGACCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATTCTAACAGATGTAATAAGAGTTCAATAGGGGGAGAAGACCTGT  200

seq1  GTTGTCATCCACCTACTGCTCTTCTTGTTGAGCTTCTGAGATGAGTGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCATCCACCTACTGCTCTTCTTGTTGAGCTTCTGAGATGAGTGTAA  250

seq1  TGATGCTTCGATGGATGTTAATGAGCCTGGTGCTTTGGGACGGATTTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCTTCGATGGATGTTAATGAGCCTGGTGCTTTGGGACGGATTTGCA  300

seq1  CTATACCCACACTGGATAAGAAAGCATTCAGTTAGCTCATCATCTTTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACCCACACTGGATAAGAAAGCATTCAGTTAGCTCATCATCTTTTAG  350

seq1  AGCTTCCTCTCCTGGGGCCCAGGGCTCTTTTCTGAAGGGAGGTTAAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTCTCCTGGGGCCCAGGGCTCTTTTCTGAAGGGAGGTTAAGGAG  400

seq1  ATTGTCACCACTCTATGAAGATTTAACTGAATTC  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCACCACTCTATGAAGATTTAACTGAATTC  434