BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-293A18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 114,579,061 - 114,714,376
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTph2, Tbc1d15, LOC668041
Upstream geneTrhde, 4930473D10Rik
Downstream geneRab21, Tmem19, Thap2, Ccdc131, Lgr5, A930009A15Rik, LOC668071, EG668073, Tspan8, Ptprr, 4933416C03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-293A18.bB6Ng01-293A18.g
ACCGA089525GA089526
length1,096792
definitionB6Ng01-293A18.b B6Ng01-293A18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,579,061 - 114,580,152)(114,713,590 - 114,714,376)
sequence
gaattcactgtttaagcacaccctttgatttccaagccctgtatgtgcat
cagttttttatgagataataactttaaacaaataaatattattaaaatta
aaggagatggcataatccctaaagccttgccacacaaacattaggatcct
aaggtagataacacctaatacagaataacactcaaggtcacccttatcac
ggatacacctacacataattacaaacatacatgcatacatacatacatac
atacatatatatatacatacatacatacatacatacatacatagagagag
actacacaatcaaaaacggagctgataagaacagatttgtgaatctcaca
tttctctactgtgactcagtacatgtgtccacaggagtcatgtgatactc
ctgtacatgtgtccacaggagtcatgtgatactcctgtaatttaaaagga
aggttctccaaaagtcaggaaagacagaagtgaaatagcatcttctggac
atgccagaagagctgcacacatgagctcacagcaactgtggttatgggca
caaaggcaagccaatcagcatcctcacattgagggagaaagagttcatga
atcatcttcagtgatgggtcagggagacactgttgtctttaagggtgtat
cattcatgctctgggggacagccaccagacctaggaatatctgggcagca
ccaattggacttaataggttataaagacagagaagaaacaaagttagggt
agcagaggggtgggaatggatttggggaaaaatatgggggcaaatcaagg
ggatatgatcaaagtacattgaatgaaatcctcaaatcataaatagttca
agttctcaatttctttataatacaacctttcaaattcactcctgaactac
agagctaaggtcttcttcatgggggaaatccaatctggacaccggaaggc
agcatattcaacctaggtcttcttctcgtttcttcgtttccccaatcact
aggaaacaacaaagtcagttactttctcaataaaagctttaccagctgga
cgaggggcacacgactttaatccaagcggctcgggaaggagaggca
gaattcattagtcagaactccaaatttcagttatctgtccttcatgagtt
ggttttaatcttcaaaatagtgcattttggaaatgtgtgcctcttttaag
agtagaaagtgaggctgggcatggtggcacacgcccttaatcctagcact
gggaggtaggcagaactctgtgggtttgaggtcagcctggtctacaacat
gagttccagaataggcagagccgtcacacagagaagccctatcttgataa
aaccaaacaagcaaacaagacatggaggtggcacacggtcagtgtggcgt
tcgaggactctaagggacagggcagaatgacttgctgaagttataaaagg
acatgcgcagctaaagtggctctgcaggatggcgttgcacagggtgggga
ggttggtgagggccgaatccaccacagcgctagctgtttttctagacact
ttggacagctgcctcctgtctgtgttcccttgagcattcagcttttactc
ctcttctgaaagacgtgtagctgttagcattttgatgacatttgaaaatg
acatggaagatgagcacttgattcatcaaagtagaacttgggattttatt
taggtttttttttttttttaaagatggatgccttaagtctggttataggt
ctagaagcaactgttggtgggcccgtgaggcatctcctttagagaaagtc
actgctcatttagcaagacaatgaaaggattagtttccttaattcaaagg
tgggaaaagcaatatttcaggggggtaggagtgggagtatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_114579061_114580152
seq2: B6Ng01-293A18.b_44_1139

seq1  GAATTCACTGTTTAAGCACACCCTTTGATTTCCAAGCCCTGTATGTGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGTTTAAGCACACCCTTTGATTTCCAAGCCCTGTATGTGCAT  50

seq1  CAGTTTTTTATGAGATAATAACTTTAAACAAATAAATATTATTAAAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTTTTATGAGATAATAACTTTAAACAAATAAATATTATTAAAATTA  100

seq1  AAGGAGATGGCATAATCCCTAAAGCCTTGCCACACAAACATTAGGATCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGATGGCATAATCCCTAAAGCCTTGCCACACAAACATTAGGATCCT  150

seq1  AAGGTAGATAACACCTAATACAGAATAACACTCAAGGTCACCCTTATCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGATAACACCTAATACAGAATAACACTCAAGGTCACCCTTATCAC  200

seq1  GGATACACCTACACATAATTACAAACATACATGCATACATACATACATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACACCTACACATAATTACAAACATACATGCATACATACATACATAC  250

seq1  ATACATATATATATACATACATACATACATACATACATACATAGAGAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATATATATACATACATACATACATACATACATACATAGAGAGAG  300

seq1  ACTACACAATCAAAAACGGAGCTGATAAGAACAGATTTGTGAATCTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACACAATCAAAAACGGAGCTGATAAGAACAGATTTGTGAATCTCACA  350

seq1  TTTCTCTACTGTGACTCAGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTACTGTGACTCAGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTC  400

seq1  CTGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTCCTGTAATTTAAAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTCCTGTAATTTAAAAGGA  450

seq1  AGGTTCTCCAAAAGTCAGGAAAGACAGAAGTGAAATAGCATCTTCTGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTCCAAAAGTCAGGAAAGACAGAAGTGAAATAGCATCTTCTGGAC  500

seq1  ATGCCAGAAGAGCTGCACACATGAGCTCACAGCAACTGTGGTTATGGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGAAGAGCTGCACACATGAGCTCACAGCAACTGTGGTTATGGGCA  550

seq1  CAAAGGCAAGCCAATCAGCATCCTCACATTGAGGGAGAAAGAGTTCATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGCAAGCCAATCAGCATCCTCACATTGAGGGAGAAAGAGTTCATGA  600

seq1  ATCATCTTCAGTGATGGGTCAGGGAGACACTGTTGTCTTTAAGGGTGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTTCAGTGATGGGTCAGGGAGACACTGTTGTCTTTAAGGGTGTAT  650

seq1  CATTCATGCTCTGGGGGACAGCCACCAGACCTAGGAATATCTGGGCAGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATGCTCTGGGGGACAGCCACCAGACCTAGGAATATCTGGGCAGCA  700

seq1  CCAATTGGACTTAATAGGTTATAAAGACAGAGAAGAAACAAAGTTAGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTGGACTTAATAGGTTATAAAGACAGAGAAGAAACAAAGTTAGGGT  750

seq1  AGCAGAGGGGTGGGAATGGATTTGGGGAAAAATATGGGGGCAAATC-AGG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGCAGAGGGGTGGGAATGGATTTGGGGAAAAATATGGGGGCAAATCAAGG  800

seq1  GGATATGATCAAAGTACATTGAATGAAATCCTCAAATCATAAAATAG-TC  848
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  GGATATGATCAAAGTACATTGAATGAAATCCTCAAATCAT-AAATAGTTC  849

seq1  AAGTTCTCAA-TTCTTTATAATACAACC-TTCAAATTCACTCCTGAACTA  896
      |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTCAATTTCTTTATAATACAACCTTTCAAATTCACTCCTGAACTA  899

seq1  CAGAGCTAAGGTCTTCTTCATGGGGAAATCCCAATCTTGAACACCCGAAG  946
      ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||
seq2  CAGAGCTAAGGTCTTCTTCATGGGGGAAATCCAATC-TGGACACCGGAAG  948

seq1  GCAGCATATTCAACCTAAGTCCTCTTCCTCGTTTCCTCGTTTCCCCAATC  996
      ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  GCAGCATATTCAACCTAGGTCTTCTT-CTCGTTTCTTCGTTTCCCCAATC  997

seq1  ACTA-GAAACAAC-AAGTCATTTACTTTCTCAATAAAAGCTTTACCAGCC  1044
      |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACTAGGAAACAACAAAGTCAGTTACTTTCTCAATAAAAGCTTTACCAGCT  1047

seq1  GGACGAGGTGGCACACGCCTTTAATCCCAGC-GCTCGGG-AGGAGAGGCA  1092
      |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||
seq2  GGACGAGG-GGCACACGACTTTAATCCAAGCGGCTCGGGAAGGAGAGGCA  1096

seq1: chr10_114713590_114714376
seq2: B6Ng01-293A18.g_66_857 (reverse)

seq1  ACATACTCCCACTCCTA-CCCCCTGAAATATTGCTTTTCCCACCTTTG-A  48
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACATACTCCCACTCCTACCCCCCTGAAATATTGCTTTTCCCACCTTTGAA  50

seq1  TTAAGGAAACTAATCC-TTCATTGTC-TGCTAAATGAGCAGTGACTTTCT  96
      |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGAAACTAATCCTTTCATTGTCTTGCTAAATGAGCAGTGACTTTCT  100

seq1  CTAAAGGAGATGCCTCAC-GGCCCACCAACAGTTGCTTCTAGACCTATAA  145
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGAGATGCCTCACGGGCCCACCAACAGTTGCTTCTAGACCTATAA  150

seq1  CCAGACTTAAGGCATCCATCTTTAAAAAAAAAAAAAAACCTAAATAAAAT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACTTAAGGCATCCATCTTTAAAAAAAAAAAAAAACCTAAATAAAAT  200

seq1  CCCAAGTTCTACTTTGATGAATCAAGTGCTCATCTTCCATGTCATTTTCA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGTTCTACTTTGATGAATCAAGTGCTCATCTTCCATGTCATTTTCA  250

seq1  AATGTCATCAAAATGCTAACAGCTACACGTCTTTCAGAAGAGGAGTAAAA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCATCAAAATGCTAACAGCTACACGTCTTTCAGAAGAGGAGTAAAA  300

seq1  GCTGAATGCTCAAGGGAACACAGACAGGAGGCAGCTGTCCAAAGTGTCTA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATGCTCAAGGGAACACAGACAGGAGGCAGCTGTCCAAAGTGTCTA  350

seq1  GAAAAACAGCTAGCGCTGTGGTGGATTCGGCCCTCACCAACCTCCCCACC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACAGCTAGCGCTGTGGTGGATTCGGCCCTCACCAACCTCCCCACC  400

seq1  CTGTGCAACGCCATCCTGCAGAGCCACTTTAGCTGCGCATGTCCTTTTAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAACGCCATCCTGCAGAGCCACTTTAGCTGCGCATGTCCTTTTAT  450

seq1  AACTTCAGCAAGTCATTCTGCCCTGTCCCTTAGAGTCCTCGAACGCCACA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAGCAAGTCATTCTGCCCTGTCCCTTAGAGTCCTCGAACGCCACA  500

seq1  CTGACCGTGTGCCACCTCCATGTCTTGTTTGCTTGTTTGGTTTTATCAAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCGTGTGCCACCTCCATGTCTTGTTTGCTTGTTTGGTTTTATCAAG  550

seq1  ATAGGGCTTCTCTGTGTGACGGCTCTGCCTATTCTGGAACTCATGTTGTA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGCTTCTCTGTGTGACGGCTCTGCCTATTCTGGAACTCATGTTGTA  600

seq1  GACCAGGCTGACCTCAAACCCACAGAGTTCTGCCTACCTCCCAGTGCTAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGGCTGACCTCAAACCCACAGAGTTCTGCCTACCTCCCAGTGCTAG  650

seq1  GATTAAGGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCCTCACTTTCTACTCTTAAAAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAGGGCGTGTGCCACCATGCCCAGCCTCACTTTCTACTCTTAAAAG  700

seq1  AGGCACACATTTCCAAAATGCACTATTTTGAAGATTAAAACCAACTCATG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACACATTTCCAAAATGCACTATTTTGAAGATTAAAACCAACTCATG  750

seq1  AAGGACAGATAACTGAAATTTGGAGTTCTGACTAATGAATTC  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACAGATAACTGAAATTTGGAGTTCTGACTAATGAATTC  792