BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-293P08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 91,643,837 - 91,644,682
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041769, LOC100041799
Downstream geneLOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1, Gm872, 4930485B16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-293P08.bB6Ng01-293P08.g
ACCGA090212GA090213
length1,012996
definitionB6Ng01-293P08.b B6Ng01-293P08.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcatctgaaaaaatg
ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaatattcaggtgacagc
agatgctggcaaggatgtggagaaagaggaacactcctccattgttggtg
ggattgcaagcttgtacaaccactctggaaatcagtctggtggttcctta
gaaaattggacatagtactaccggaggatccagcgatacctctcctgggc
atatatccagaagatgccccaactggtaagaaggacatatgctccactat
gttcatagcagccttatttataatagccagaagctggaaagaacccagat
gcccctcaacagaggaatagatacagaaaatgtggtacatttacacaatg
gagtactactcagctattaaaaagaatgaatttatgaaattcctaggcaa
aatggatggacctggagggcatcatcctgagtgaggtaacacaatcacaa
aggaactcacacaatatgtactcactgataagtggatattagcccaaaac
ttaggatacccaagatataagatacaatttgctaaacgcatgaaactcaa
gaaaaatgaagaccaaagtgtggacactgtgccccttcttagaattggga
acaaaatacccatggaaagagttacagagacaaagtttggagctgtgacg
aaaggatggaccatctagagactgccatatccagggatccaccccataat
cagcttccaaatgctgacaccattgcatacactagcaagattttgctgaa
aggacgcagatatagtttgtctcttgtgagactatgcaggagctaagcaa
acacagaagtggatgctcacagtcagcttattggatggatcacagggctc
ccaatggaggagctagagaaagtacccaaagagctaagggatctgcaccc
tatagtggaaca
gaattcagtgtttaattttgacatgtcttttctattcataataaaatcaa
taaaacaagtagggacatagtacaaatggcctgtctatactcaatgaccc
tgcttagtctctcagtttattagtcaaaaaatatttgttgctacataaga
tgaccacatggttagaggaccactggaaatgcatgaaattcaaggagtcc
acagcttgctccattttgcttgggactctatgtatgattggaagtgatta
gaagactttgactaaaagccctactgtaagtcaggaatctataaaggaac
agaactgatagaatatataacataatatacaatatataattgtacatttt
atgtatagtattatatatataatttataattatataaatatatcatatat
catacagcataagcatatatcatatcatatatcacacatattatatgtca
catatcacatacatgtcataccacatatatcagatatgtcatatgtcata
tatcaaatatcacatattatatacattatataattctatattatttgtaa
attatataatataagtatgtattatataacatatataatatatgatatgt
aaaatatggtatatgatgtatatcacatattatctaaggtctgtgatcta
tgatatagaatgtagaaatagaaagtaagatatagaataatgaatatatt
ttaatatatactataccatagtattatgattatagtattatgatacatag
aatatttaatatacaatatgctatgttattatattatatcttatatatca
tatggtatataaatatatcttaacgtaatatatcataacatatattacat
atacaatgtatacatctttgttactttatatttctactttaggatactgt
gggccaaggtaatttatatagggatgtattttattttgggggcttaatag
gtttcaggaggggtaacattttatgaccattcatagcaggaagcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_91643837_91644682
seq2: B6Ng01-293P08.g_68_914 (reverse)

seq1  TAATATATGTTATGATATATTACGTTAAGATATA-TTATATACCATATGA  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAATATATGTTATGATATATTACGTTAAGATATATTTATATACCATATGA  50

seq1  TATATAAGATATAATATAATAACATAGCATATTGTATATTAAATATTCTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAAGATATAATATAATAACATAGCATATTGTATATTAAATATTCTA  100

seq1  TGTATCATAATACTATAATCATAATACTATGGTATAGTATATATTAAAAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCATAATACTATAATCATAATACTATGGTATAGTATATATTAAAAT  150

seq1  ATATTCATTATTCTATATCTTACTTTCTATTTCTACATTCTATATCATAG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCATTATTCTATATCTTACTTTCTATTTCTACATTCTATATCATAG  200

seq1  ATCACAGACCTTAGATAATATGTGATATACATCATATACCATATTTTACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGACCTTAGATAATATGTGATATACATCATATACCATATTTTACA  250

seq1  TATCATATATTATATATGTTATATAATACATACTTATATTATATAATTTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATATATTATATATGTTATATAATACATACTTATATTATATAATTTA  300

seq1  CAAATAATATAGAATTATATAATGTATATAATATGTGATATTTGATATAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATATAGAATTATATAATGTATATAATATGTGATATTTGATATAT  350

seq1  GACATATGACATATCTGATATATGTGGTATGACATGTATGTGATATGTGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATGACATATCTGATATATGTGGTATGACATGTATGTGATATGTGA  400

seq1  CATATAATATGTGTGATATATGATATGATATATGCTTATGCTGTATGATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATAATATGTGTGATATATGATATGATATATGCTTATGCTGTATGATA  450

seq1  TATGATATATTTATATAATTATAAATTATATATATAATACTATACATAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATATATTTATATAATTATAAATTATATATATAATACTATACATAAA  500

seq1  ATGTACAATTATATATTGTATATTATGTTATATATTCTATCAGTTCTGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACAATTATATATTGTATATTATGTTATATATTCTATCAGTTCTGTT  550

seq1  CCTTTATAGATTCCTGACTTACAGTAGGGCTTTTAGTCAAAGTCTTCTAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATAGATTCCTGACTTACAGTAGGGCTTTTAGTCAAAGTCTTCTAA  600

seq1  TCACTTCCAATCATACATAGAGTCCCAAGCAAAATGGAGCAAGCTGTGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTCCAATCATACATAGAGTCCCAAGCAAAATGGAGCAAGCTGTGGA  650

seq1  CTCCTTGAATTTCATGCATTTCCAGTGGTCCTCTAACCATGTGGTCATCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTGAATTTCATGCATTTCCAGTGGTCCTCTAACCATGTGGTCATCT  700

seq1  TATGTAGCAACAAATATTTTTTGACTAATAAACTGAGAGACTAAGCAGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGCAACAAATATTTTTTGACTAATAAACTGAGAGACTAAGCAGGG  750

seq1  TCATTGAGTATAGACAGGCCATTTGTACTATGTCCCTACTTGTTTTATTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGAGTATAGACAGGCCATTTGTACTATGTCCCTACTTGTTTTATTG  800

seq1  ATTTTATTATGAATAGAAAAGACATGTCAAAATTAAACACTGAATTC  846
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATTATGAATAGAAAAGACATGTCAAAATTAAACACTGAATTC  847