BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-297I03
Chromosome10 (Build37)
Map Location 95,220,283 - 95,310,874
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4921537D05Rik, Plxnc1, Cradd, Socs2, LOC100042004, D10Ertd322e, Ube2n, Nudt4, EG628119
Downstream geneEea1, EG432491, LOC667380, Btg1, LOC628256
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-297I03.bB6Ng01-297I03.g
ACCGA092848GA092849
length1,2161,097
definitionB6Ng01-297I03.b B6Ng01-297I03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,309,663 - 95,310,874)(95,220,283 - 95,221,373)
sequence
gaattcctagactatccttgttgagtttgttgatttcttgttgctactac
taagtggctcctcccaacaagaagctggtgactgatggagctcagggaat
actgtctcaggtcacatgtagcccaagcagaagaatatacacaagggttg
aagatgatctgtgtgaaagaacaaacagataatgtgaatagaggcacaga
gccactgatcatgatgtctactggattattttaggaacatccaaaggcaa
tgaacgttgtttacaactaaaccaagtaatactaacaagctatggctgtg
taaagaggacagcagactttgttttctgctacaactaatgaagacgccaa
ctggagggaagggggccattggtgcacagtgtccaccactcctccttcac
caagctgtgacaagctgtcagatgccacacttgcaaatgatccagtattt
tttgttgagttgaaggtaagaatcctagctccatcaatgagtctaagtca
ttgtaacctattgcccttcccacttccattttctagtcttctatcatctg
attaagttgaggggcttcttttgtttgttcaaagaagtaccataccttct
ggaagatagaaggaataataactaataataacgactattattatatattt
tatcttgttaaaattattaagtattttatttttaaaaagaaaaaataaaa
caaaaatgcctaatttaactccattgttgttttgaaatacattggtagcc
caggcttgcctcaaactcactatgtagctgaggatgactttaaactccaa
attctgatgtctctatttcccaaatgctgaagctacaaaaggcacagcac
catgccaagccatccaaaccattctgaagtttacaatgcggtggcaagcc
ccgtgcagctcactcttgtgcaagcatcaccagtatcaagctccttaaag
tctgccatcctccacagaaacagtaaaccatagctctccatgacttcctt
ccaccagccctcacaacacccttctgagttctttctaatatggagttggc
tattccaggcacctcaataagaaggtggagatttacccagacttgtcttt
gtgtggcttggccttgttccactagcaggtgtttcagacctttcacggtt
gcagcctggttcggtttctttcttccaagttgaatgccattctattggcg
tgccataaacccacac
gaattccttgaagatgtggggagcagccaacatcttggcctccgtttctt
tttgctggatcactggtgttccaggagccattttagatctaacgctatgt
gtcgaagatcaggattctgaggagtcataggagccggtggtgtctccctc
tccatccacttcttcatcccccacagcataggaccctgggaatgggcaca
cagctgtagaggtaaggcgctggaccgaggcatgcaaaatcacaaggcac
aggaaggagtctggatggaggaatgactggacaaatggacaacgatttga
gtgtgccatgttaagcaatgagacccaagaatagctgaagccttggggac
agtgggaagttctctgcctgtctctcccatgatgaacacactgacaacag
gctggtacagtcattcctaccacagtcaccgtgtttgtcaggtttgtgtt
cttgggccaatttatttttggtatgattttaatacaccacgtgctcctgt
gtgccccagttcactttgataagcttattggtggcacctgcccactttta
gggaggttgtttatcaaacttggcgtcgtgggcggtgctgggcaggtggt
ggtggttctgcgcatgctgagatggaaaagcattctgtcttttctgcctg
tgctccgaatgaagccaggagctacttgtaaagtggagtcatccagggcc
aggcaaatgtgaaagcgattgcttcacatgataccggggtgacttagggc
aaggagcagctctgttggtaaaggggacaacagtacatcgtagttttgtg
gtttcccactagctcaggccatgccaatgtccaaatccctagtaagaaat
ggtgtactatgggtatataaccctaatcacatccttccacatactctagc
ccatctctaaattacttataaatacttaaggtacatgcaattatagtata
taaaaaacataaggaacaatgcaaaccattaacaagcactctatattctt
ctagggaggcatcagagctaaagtcttaacacatacacacaaccagctct
cactctacacacttcatcactcatcaccaccagagtttaccagtggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_95309663_95310874
seq2: B6Ng01-297I03.b_47_1262 (reverse)

seq1  GTGTGGGTGTAT-GCACG-CAATAGAAT-GCATTCAAACTTTGGAAGAAA  47
      |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||
seq2  GTGTGGGTTTATGGCACGCCAATAGAATGGCATTCAA--CTTGGAAG-AA  47

seq1  AGAAACCGACACAGGCTGCAA-CGTGAAAGGTCCTTGGAAACACCCTGCT  96
      |||||||||  |||||||||| |||||||||||    |||||| ||||||
seq2  AGAAACCGAACCAGGCTGCAACCGTGAAAGGTC---TGAAACA-CCTGCT  93

seq1  AAGTGAAACAAG--CCAGC--CACAAAGACAAGTCCTGTGT-AATCT-CA  140
       |||| ||||||  | |||  ||||||||||||| ||| || ||||| ||
seq2  -AGTGGAACAAGGCCAAGCCACACAAAGACAAGT-CTGGGTAAATCTCCA  141

seq1  CC-TCT--ATGAGGTGCCTGGAATAGCCAACTCCATA-TAGAAAGAACTC  186
      || |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCTTCTTATTGAGGTGCCTGGAATAGCCAACTCCATATTAGAAAGAACTC  191

seq1  AGAAGGGTGGTGTGAGGGCTGGTGGAAGGAAGTCATGGAGAGCTATGGTT  236
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGGTGTTGTGAGGGCTGGTGGAAGGAAGTCATGGAGAGCTATGGTT  241

seq1  TACTGTTTCTGTGGAGGATGGCAGACTTTAAGGAGCTTGATACTGGTGAT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTTCTGTGGAGGATGGCAGACTTTAAGGAGCTTGATACTGGTGAT  291

seq1  GCTTGCACAAGAGTGAGCCTGCACGGGGCTTGCCACCGCATTGTAAACTT  336
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCACAAGAGTGAG-CTGCACGGGGCTTGCCACCGCATTGTAAACTT  340

seq1  CAGAATGGTTTGGATGGCTTGGCATGGTGCTGTGCCTTTTGTAGCTTCAG  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGGTTTGGATGGCTTGGCATGGTGCTGTGCCTTTTGTAGCTTCAG  390

seq1  CATTTGGGAAATAGAGACATCAGAATTTGGAGTTTAAAGTCATCCTCAGC  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGGAAATAGAGACATCAGAATTTGGAGTTTAAAGTCATCCTCAGC  440

seq1  TACATAGTGAGTTTGAGGCAAGCCTGGGCTACCAATGTATTTCAAAACAA  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGTGAGTTTGAGGCAAGCCTGGGCTACCAATGTATTTCAAAACAA  490

seq1  CAATGGAGTTAAATTAGGCATTTTTGTTTTATTTTTTCTTTTTAAAAATA  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGAGTTAAATTAGGCATTTTTGTTTTATTTTTTCTTTTTAAAAATA  540

seq1  AAATACTTAATAATTTTAACAAGATAAAATATATAATAATAGTCGTTATT  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACTTAATAATTTTAACAAGATAAAATATATAATAATAGTCGTTATT  590

seq1  ATTAGTTATTATTCCTTCTATCTTCCAGAAGGTATGGTACTTCTTTGAAC  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTATTATTCCTTCTATCTTCCAGAAGGTATGGTACTTCTTTGAAC  640

seq1  AAACAAAAGAAGCCCCTCAACTTAATCAGATGATAGAAGACTAGAAAATG  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAAGAAGCCCCTCAACTTAATCAGATGATAGAAGACTAGAAAATG  690

seq1  GAAGTGGGAAGGGCAATAGGTTACAATGACTTAGACTCATTGATGGAGCT  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGGGAAGGGCAATAGGTTACAATGACTTAGACTCATTGATGGAGCT  740

seq1  AGGATTCTTACCTTCAACTCAACAAAAAATACTGGATCATTTGCAAGTGT  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTCTTACCTTCAACTCAACAAAAAATACTGGATCATTTGCAAGTGT  790

seq1  GGCATCTGACAGCTTGTCACAGCTTGGTGAAGGAGGAGTGGTGGACACTG  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCTGACAGCTTGTCACAGCTTGGTGAAGGAGGAGTGGTGGACACTG  840

seq1  TGCACCAATGGCCCCCTTCCCTCCAGTTGGCGTCTTCATTAGTTGTAGCA  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCAATGGCCCCCTTCCCTCCAGTTGGCGTCTTCATTAGTTGTAGCA  890

seq1  GAAAACAAAGTCTGCTGTCCTCTTTACACAGCCATAGCTTGTTAGTATTA  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACAAAGTCTGCTGTCCTCTTTACACAGCCATAGCTTGTTAGTATTA  940

seq1  CTTGGTTTAGTTGTAAACAACGTTCATTGCCTTTGGATGTTCCTAAAATA  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTTAGTTGTAAACAACGTTCATTGCCTTTGGATGTTCCTAAAATA  990

seq1  ATCCAGTAGACATCATGATCAGTGGCTCTGTGCCTCTATTCACATTATCT  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTAGACATCATGATCAGTGGCTCTGTGCCTCTATTCACATTATCT  1040

seq1  GTTTGTTCTTTCACACAGATCATCTTCAACCCTTGTGTATATTCTTCTGC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTCTTTCACACAGATCATCTTCAACCCTTGTGTATATTCTTCTGC  1090

seq1  TTGGGCTACATGTGACCTGAGACAGTATTCCCTGAGCTCCATCAGTCACC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTACATGTGACCTGAGACAGTATTCCCTGAGCTCCATCAGTCACC  1140

seq1  AGCTTCTTGTTGGGAGGAGCCACTTAGTAGTAGCAACAAGAAATCAACAA  1186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTTGTTGGGAGGAGCCACTTAGTAGTAGCAACAAGAAATCAACAA  1190

seq1  ACTCAACAAGGATAGTCTAGGAATTC  1212
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAACAAGGATAGTCTAGGAATTC  1216

seq1: chr10_95220283_95221373
seq2: B6Ng01-297I03.g_70_1166

seq1  GAATTCCTTGAAGATGTGGGGAGCAGCCAACATCTTGGCCTCCGTTTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGAAGATGTGGGGAGCAGCCAACATCTTGGCCTCCGTTTCTT  50

seq1  TTTGCTGGATCACTGGTGTTCCAGGAGCCATTTTAGATCTAACGCTATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTGGATCACTGGTGTTCCAGGAGCCATTTTAGATCTAACGCTATGT  100

seq1  GTCGAAGATCAGGATTCTGAGGAGTCATAGGAGCCGGTGGTGTCTCCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCGAAGATCAGGATTCTGAGGAGTCATAGGAGCCGGTGGTGTCTCCCTC  150

seq1  TCCATCCACTTCTTCATCCCCCACAGCATAGGACCCTGGGAATGGGCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCCACTTCTTCATCCCCCACAGCATAGGACCCTGGGAATGGGCACA  200

seq1  CAGCTGTAGAGGTAAGGCGCTGGACCGAGGCATGCAAAATCACAAGGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTAGAGGTAAGGCGCTGGACCGAGGCATGCAAAATCACAAGGCAC  250

seq1  AGGAAGGAGTCTGGATGGAGGAATGACTGGACAAATGGACAACGATTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAGTCTGGATGGAGGAATGACTGGACAAATGGACAACGATTTGA  300

seq1  GTGTGCCATGTTAAGCAATGAGACCCAAGAATAGCTGAAGCCTTGGGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCATGTTAAGCAATGAGACCCAAGAATAGCTGAAGCCTTGGGGAC  350

seq1  AGTGGGAAGTTCTCTGCCTGTCTCTCCCATGATGAACACACTGACAACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAAGTTCTCTGCCTGTCTCTCCCATGATGAACACACTGACAACAG  400

seq1  GCTGGTACAGTCATTCCTACCACAGTCACCGTGTTTGTCAGGTTTGTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTACAGTCATTCCTACCACAGTCACCGTGTTTGTCAGGTTTGTGTT  450

seq1  CTTGGGCCAATTTATTTTTGGTATGATTTTAATACACCACGTGCTCCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGCCAATTTATTTTTGGTATGATTTTAATACACCACGTGCTCCTGT  500

seq1  GTGCCCCAGTTCACTTTGATAAGCTTATTGGTGGCACCTGCCCACTTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCAGTTCACTTTGATAAGCTTATTGGTGGCACCTGCCCACTTTTA  550

seq1  GGGAGGTTGTTTATCAAACTTGGCGTCGTGGGCGGTGCTGGGCAGGTGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGTTGTTTATCAAACTTGGCGTCGTGGGCGGTGCTGGGCAGGTGGT  600

seq1  GGTGGTTCTGCGCATGCTGAGATGGAAAAGCATTCTGTCTTTTCTGCCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTTCTGCGCATGCTGAGATGGAAAAGCATTCTGTCTTTTCTGCCTG  650

seq1  TGCTCCGAATGAAGCCAGGAGCTACTTGTAAAGTGGAGTCATCCAGGGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCGAATGAAGCCAGGAGCTACTTGTAAAGTGGAGTCATCCAGGGCC  700

seq1  AGGCAAATGTGAAAGCGATTGCTTCACATGATACCGGGGTGACTTAGGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAATGTGAAAGCGATTGCTTCACATGATACCGGGGTGACTTAGGGC  750

seq1  AAGGAGCAGCTCTGTTGGTAAAGGGGACAACAGTACATCGTAGTTTTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGCAGCTCTGTTGGTAAAGGGGACAACAGTACATCGTAGTTTTGTG  800

seq1  GTTTCCCACTAGCTCAGGCCATGCCAATGTCCAAATCCCTAGTAAGAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCCACTAGCTCAGGCCATGCCAATGTCCAAATCCCTAGTAAGAAAT  850

seq1  GGTGTACTATGGGTATATAA-CCTAATCACATCCTTCCACATACTCTAGC  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTACTATGGGTATATAACCCTAATCACATCCTTCCACATACTCTAGC  900

seq1  CCATCTCTAAATTACTTAT-AATACTTAA-GTACATGCAA-TATAGTATA  946
      ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  CCATCTCTAAATTACTTATAAATACTTAAGGTACATGCAATTATAGTATA  950

seq1  T-AAAAACATAAG--ACAATGC-AACCATT-ACAAGCACTTCTTATATTT  991
      | |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||   |||||| 
seq2  TAAAAAACATAAGGAACAATGCAAACCATTAACAAGCACT--CTATATTC  998

seq1  TTTTCTTTAGGGAGCAACAAGAGCAAAAGGTCTAACACACACACACACAC  1041
      |    | |||||||  |  ||||| ||||   ||||||| |||||||  |
seq2  T----TCTAGGGAGGCATCAGAGCTAAAGTCTTAACACATACACACAACC  1044

seq1  A-CACACACAC-ACACAC-ACA-CACACA-CACACACACAGAGTTTACCA  1086
      | | | ||| | ||||||  || ||| || ||| ||| ||||||||||||
seq2  AGCTCTCACTCTACACACTTCATCACTCATCAC-CAC-CAGAGTTTACCA  1092

seq1  GTGGC  1091
      |||||
seq2  GTGGC  1097