BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298K07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,796,244 - 67,971,878
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700040L02Rik
Upstream geneEgr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136
Downstream geneEG665342, Tmem26, A930033H14Rik, Rhobtb1, LOC100040182, Cdc2a, LOC100039696, EG382371
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298K07.bB6Ng01-298K07.g
ACCGA093698GA093699
length1,0331,033
definitionB6Ng01-298K07.b B6Ng01-298K07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,970,855 - 67,971,878)(67,796,244 - 67,797,272)
sequence
gaattcctcccgtgtctcctgtgggttcatatagtcaagcagctcaacgg
gaatgttcccccaaggaggaggtcacatgctgcttttccctaacatgtga
cagtccgtagtgtcacacaggacagggaccttctgaaattaaccctaaag
aaccatttgggtgacaaatggaagaagggaggttttacagtgaacagtct
atggcaagacaggaagtgttctcagataagtcacgcaagtgcagtattgg
gaatgaggatccatctcaatgagatgaggatgctccagacagtgctccag
acagtgctccctcttcctaagcagctcctctgcctcctagaaggacaagt
gacaggcattgtcattaatggtgaagagggagccccaccctccatccacc
tttcctcagatgaagcacgaggcagacctaaccctgtaccatctacctag
ggaggcttgggttgtgacagtgcttccagatcggcagagacagatgtgta
ggtacaggaagaacatgtcacagcatttgtctcctactgtgtgcctctgc
actgcaaggcccaggtctgatggcatcctcgagcatggaaaagtcacacg
gacgaggtggacagggaccaacttgtttactgtctgtggtgcttgcccca
agctggtcagagtgacaaagtgtgcttaatggaaggacgctgggtcttcc
agagctgaactggaaaggaccaccaaaagctgctaccgtgtactttgtgg
tattgtggaagtctctgatgacttctggggcaaatacctggtcgataatt
aatagagagagcaggagtctgggccactactacctgactgcttatgctgg
tcccagagctctgggctcaaatgagagatgctggtagtcatgggcatgtt
tcagattcaacaagctaaacatctatgataaacctgagtttcttttctta
actgttgatagaggatttgagagaaatacatttatgcctcctattcccag
atattatcccggatcattaaatgtgaaaaattg
gaattcacacgttttcctggaacatgaagtatggcgtgcaaggcttcctg
aaagcccacagctcaatccatggtcatgtgagataaggtctatactgaac
agctgagacctgcaggagatgaccttgaatacagtgcatgatggaaagag
attgtgagtacagtagatagtgagaaacatgaatgaatccatgaatacag
tggatgatggggaaagaccatgtggatgaggtgacagatgtattctgggg
ctcttcaaaggctcagaaatcatttgagggtgactttcttcccctttgga
gctatcttgatgcaaactggtctatcttgagcaagatggggctcttctgg
gttttggtcaggtatgcttgcaccacctctccacccccaaagccaaacat
gagccatgtggcaacagacactgtccaccatgtcctgccagctctagagc
ctgcttagttccctagcttccagctaattacctctttaaactcatcacat
ttctctggtaaacaaattcaataaaatggttcctctcaggcaaacatcat
tgataataccctcgtgtatgttatcctaaaactacaaacacacagaaacc
tccaaatttgtctactgacatttgagagtcatgagattcgcttcatctat
gcaagtctattttcaaagaacacatggaaatacaaggctgtcagaattgc
cagggatttaaatggtcttttggtttagcgccatctgatacttcaatcct
ttctataatatctctgccaagtgggtgttcaatctgtgttagagtatatt
cagtgctagcaagcacccccccccccccagcccagagaaggatagttcca
gcattgagtctatggagtacgggacgggcaggctctaagattactgccaa
tgctactaattactagctctgtgttgttggaaataataaaaaagcctcta
gatgttgcttccccccttgctcttcaaagtagagggaataatgttccttg
gtgtcatttggggtgtagccaatctttgggttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67970855_67971878
seq2: B6Ng01-298K07.b_49_1081 (reverse)

seq1  CAATTTTTCA---TTTATGAT-CTGGAT-ATATCTGTGAATA-GAGGCAT  44
      ||||||||||   || ||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||
seq2  CAATTTTTCACATTTAATGATCCGGGATAATATCTGGGAATAGGAGGCAT  50

seq1  --ATGTATTTCTCTCAAATCCTCTATCAACAGTTAAG-AAAGAAACTCAG  91
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATGTATTTCTCTCAAATCCTCTATCAACAGTTAAGAAAAGAAACTCAG  100

seq1  GTTTATCATAGATGTTTAGCTTGTTGAATCTGAAACATGCCCATGACTAC  141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCATAGATGTTTAGCTTGTTGAATCTGAAACATGCCCATGACTAC  150

seq1  CAGCATCTCTCATTTGAGCCCAGAGCTCTGGGACCAGCATAAGCAGTCAG  191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCTCTCATTTGAGCCCAGAGCTCTGGGACCAGCATAAGCAGTCAG  200

seq1  GTAGTAGTGGCCCAGACTCCTGCTCTCTCTATTAATTATCGACCAGGTAT  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTAGTGGCCCAGACTCCTGCTCTCTCTATTAATTATCGACCAGGTAT  250

seq1  TTGCCCCAGAAGTCATCAGAGACTTCCACAATACCACAAAGTACACGGTA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCCAGAAGTCATCAGAGACTTCCACAATACCACAAAGTACACGGTA  300

seq1  GCAGCTTTTGGTGGTCCTTTCCAGTTCAGCTCTGGAAGACCCAGCGTCCT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTTTTGGTGGTCCTTTCCAGTTCAGCTCTGGAAGACCCAGCGTCCT  350

seq1  TCCATTAAGCACACTTTGTCACTCTGACCAGCTTGGGGCAAGCACCACAG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTAAGCACACTTTGTCACTCTGACCAGCTTGGGGCAAGCACCACAG  400

seq1  ACAGTAAACAAGTTGGTCCCTGTCCACCTCGTCCGTGTGACTTTTCCATG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAAACAAGTTGGTCCCTGTCCACCTCGTCCGTGTGACTTTTCCATG  450

seq1  CTCGAGGATGCCATCAGACCTGGGCCTTGCAGTGCAGAGGCACACAGTAG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGAGGATGCCATCAGACCTGGGCCTTGCAGTGCAGAGGCACACAGTAG  500

seq1  GAGACAAATGCTGTGACATGTTCTTCCTGTACCTACACATCTGTCTCTGC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAAATGCTGTGACATGTTCTTCCTGTACCTACACATCTGTCTCTGC  550

seq1  CGATCTGGAAGCACTGTCACAACCCAAGCCTCCCTAGGTAGATGGTACAG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCTGGAAGCACTGTCACAACCCAAGCCTCCCTAGGTAGATGGTACAG  600

seq1  GGTTAGGTCTGCCTCGTGCTTCATCTGAGGAAAGGTGGATGGAGGGTGGG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGGTCTGCCTCGTGCTTCATCTGAGGAAAGGTGGATGGAGGGTGGG  650

seq1  GCTCCCTCTTCACCATTAATGACAATGCCTGTCACTTGTCCTTCTAGGAG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTCTTCACCATTAATGACAATGCCTGTCACTTGTCCTTCTAGGAG  700

seq1  GCAGAGGAGCTGCTTAGGAAGAGGGAGCACTGTCTGGAGCACTGTCTGGA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGAGCTGCTTAGGAAGAGGGAGCACTGTCTGGAGCACTGTCTGGA  750

seq1  GCATCCTCATCTCATTGAGATGGATCCTCACTCCCAATACTGCACTTGCG  791
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCATCCTCATCTCATTGAGATGGATCCTCATTCCCAATACTGCACTTGCG  800

seq1  TGACTTATCTGAGAACACTTCCTGTCTTGCCATAGACTGTTCACTGTAAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTATCTGAGAACACTTCCTGTCTTGCCATAGACTGTTCACTGTAAA  850

seq1  ACCTCCCTTCTTCCATTTGTCACCCAAATGGTTCTTTAGGGTTAATTTCA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCCTTCTTCCATTTGTCACCCAAATGGTTCTTTAGGGTTAATTTCA  900

seq1  GAAGGTCCCTGTCCTGTGTGACACTACGGACTGTCACATGTTAGGGAAAA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTCCCTGTCCTGTGTGACACTACGGACTGTCACATGTTAGGGAAAA  950

seq1  GCAGCATGTGACCTCCTCCTTGGGGGAACATTCCCGTTGAGCTGCTTGAC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCATGTGACCTCCTCCTTGGGGGAACATTCCCGTTGAGCTGCTTGAC  1000

seq1  TATATGAACCCACAGGAGACACGGGAGGAATTC  1024
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGAACCCACAGGAGACACGGGAGGAATTC  1033

seq1: chr10_67796244_67797272
seq2: B6Ng01-298K07.g_68_1100

seq1  GAATTCACACGTTTTCCTGGAACATGAAGTATGGCGTGCAAGGCTTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACGTTTTCCTGGAACATGAAGTATGGCGTGCAAGGCTTCCTG  50

seq1  AAAGCCCACAGCTCAATCCATGGTCATGTGAGATAAGGTCTATACTGAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCCACAGCTCAATCCATGGTCATGTGAGATAAGGTCTATACTGAAC  100

seq1  AGCTGAGACCTGCAGGAGATGACCTTGAATACAGTGCATGATGGAAAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGACCTGCAGGAGATGACCTTGAATACAGTGCATGATGGAAAGAG  150

seq1  ATTGTGAGTACAGTAGATAGTGAGAAACATGAATGAATCCATGAATACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGAGTACAGTAGATAGTGAGAAACATGAATGAATCCATGAATACAG  200

seq1  TGGATGATGGGGAAAGACCATGTGGATGAGGTGACAGATGTATTCTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGATGGGGAAAGACCATGTGGATGAGGTGACAGATGTATTCTGGGG  250

seq1  CTCTTCAAAGGCTCAGAAATCATTTGAGGGTGACTTTCTTCCCCTTTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCAAAGGCTCAGAAATCATTTGAGGGTGACTTTCTTCCCCTTTGGA  300

seq1  GCTATCTTGATGCAAACTGGTCTATCTTGAGCAAGATGGGGCTCTTCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCTTGATGCAAACTGGTCTATCTTGAGCAAGATGGGGCTCTTCTGG  350

seq1  GTTTTGGTCAGGTATGCTTGCACCACCTCTCCACCCCCAAAGCCAAACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGGTCAGGTATGCTTGCACCACCTCTCCACCCCCAAAGCCAAACAT  400

seq1  GAGCCATGTGGCAACAGACACTGTCCACCATGTCCTGCCAGCTCTAGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATGTGGCAACAGACACTGTCCACCATGTCCTGCCAGCTCTAGAGC  450

seq1  CTGCTTAGTTCCCTAGCTTCCAGCTAATTACCTCTTTAAACTCATCACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTAGTTCCCTAGCTTCCAGCTAATTACCTCTTTAAACTCATCACAT  500

seq1  TTCTCTGGTAAACAAATTCAATAAAATGGTTCCTCTCAGGCAAACATCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTGGTAAACAAATTCAATAAAATGGTTCCTCTCAGGCAAACATCAT  550

seq1  TGATAATACCCTCGTGTATGTTATCCTAAAACTACAAACACACAGAAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATACCCTCGTGTATGTTATCCTAAAACTACAAACACACAGAAACC  600

seq1  TCCAAATTTGTCTACTGACATTTGAGAGTCATGAGATTCGCTTCATCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAATTTGTCTACTGACATTTGAGAGTCATGAGATTCGCTTCATCTAT  650

seq1  GCAAGTCTATTTTCAAAGAACACATGGAAATACAAGGCTGTCAGAATTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTCTATTTTCAAAGAACACATGGAAATACAAGGCTGTCAGAATTGC  700

seq1  CAGGGATTTAAATGGTCTTTTGGTTTAGCGCCATCTGATACTTCAATCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGATTTAAATGGTCTTTTGGTTTAGCGCCATCTGATACTTCAATCCT  750

seq1  TTCTATAATATCTCTGCCAAGTGGGTGTTCAATCTGTGTTAGAGTATATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATAATATCTCTGCCAAGTGGGTGTTCAATCTGTGTTAGAGTATATT  800

seq1  CAGTGCTAGCAAGCA-CCCCCCCCCCCCAGCCCAGAGAAGGATAGTT-CA  848
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CAGTGCTAGCAAGCACCCCCCCCCCCCCAGCCCAGAGAAGGATAGTTCCA  850

seq1  GCATTGAGTCTATGGAGTACGGGACGGGCAGGCTCTAAGATTTACTGCCA  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCATTGAGTCTATGGAGTACGGGACGGGCAGGCTCTAAGA-TTACTGCCA  899

seq1  ATGCTACTAATTACTAGCTCTGTGTTGTTTGGAAATAATAAAAAAGCCTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTACTAATTACTAGCTCTGTGTTG-TTGGAAATAATAAAAAAGCCTC  948

seq1  TAGATGTTGCTTCCCCCCTTGCTCTTCAAAGTAGAGGGAATAATGTTCCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGTTGCTTCCCCCCTTGCTCTTCAAAGTAGAGGGAATAATGTTCCT  998

seq1  T-GTGTCA-TTGGGTGGTAGCCAATCTT--GGTTG  1029
      | |||||| |||||  ||||||||||||  |||||
seq2  TGGTGTCATTTGGGGTGTAGCCAATCTTTGGGTTG  1033