BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-299K21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 92,221,925 - 92,390,508
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm872, 4930485B16Rik
Upstream geneLOC100041799, LOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1
Downstream geneEG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, Ntn4, LOC667338, LOC100041907, Usp44, Metap2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-299K21.bB6Ng01-299K21.g
ACCGA094453GA094454
length939966
definitionB6Ng01-299K21.b B6Ng01-299K21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,389,866 - 92,390,508)(92,221,925 - 92,222,766)
sequence
gaattctcaaggtatgtatatgacagatttttaatacttttgacatgctt
tatcttttaagagtactgttttgccttcatttgattctaatacttattaa
taagctgttaagaacatggtatcatattgatgtaaaaataatgtactggg
aagatggctcaggagctaaaagtacttaccactcttccagagaacccaag
ttcagttcccaggacccactttgggcagctcacaaccacctgtagttcta
gtttcagaggctcaacaatgtcctctcctggctttcatgggcacaatata
cacatatttttgttgctactccataacggtagctttgctaccattatgaa
tcatgatgtaaacatctggacttgctgatggtcttaagcaatccctttga
aagtgttgttccacccacaaggggtgtcacaacccacaggttgagaatct
ctgtttgagacaatgctgtgcttgggccatggtaaaataaggaacatttc
cacttgggaacaagatttacccagcatgatttctgagttcgaggccagcc
tggtctacagagtgagtttcattacagccagggctacacagagaaaccct
gtctcgaaaaactaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaag
aaaagaaaaagaaaaaagatttacctagcacaagacaacctggaagttcc
tattgagagactggcttcctgctgttgaacagtgttttgacttctgaaac
tattcataagagcatctgtgtatgtcatggaataagcaatgtttctttgt
tctgataattgatttaacgagagcagacagccacttctgtaagccagtct
gcttcagagattcatgtactcttggcctgacctctgtatagatgggaccc
taaggatctcagggtgctgccttcttccctagtgcccat
gaattcacagtaatactcttgcttcaaatccccaactcttggtatattat
ttggctataataaggcatcagaagctttggtctatttacatctaatataa
ttagtgacatgcttgaatattaatctggtttgagttatctagactagtca
gctgatttattgacttattggatatatatccaatataaagtgggtgcaca
cataccatggtgcataagtgaggtcagaggaaaactttgtgaagtccatt
ctctctgttcaccttgacataggcccatgggatccacctaactcaggcta
tcaggcttgaacagcaagtgtttttatccacacttttaagaaaactcact
atcatttagctttgaatgtttccgatgagaagttggctttcattcttatt
gttcttattcttggagttttgtaatgagtcctttcttgctgagcccagca
cagtcatgtaagggacaacatgacatagttcttccctgtggaacagagcc
agcagggaatgtgcctctacaagtattgatggttgctgtgggtgcaagac
ttgtgtgtataatagtgtacgtattttcacattcacctttcaagggttgt
tctctgtgccaaggttaatcactctgtgataatcagagactgcatgagtc
tgagaaatgagggtgtgtctatgtctcagccagatggcaaatgctaagtc
cttcaggacagcccttaaagctgtgggaaagaatgctgagaacatgagtt
caaaaatatgtaattcctcaactatgcaaaacataagcatacaatatgaa
ttgaataaggagcttaacagatctaaaggaacagaggcagctgcactata
agccagcttgtcagaaagagactatgggaagggagataaagaaatttagg
gagttgtgatcacaaggccagatcccacccctgctagtttttttttgttt
atacttacaaggcagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_92389866_92390508
seq2: B6Ng01-299K21.b_49_691 (reverse)

seq1  TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTCGAGACAGGGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTCGAGACAGGGTTT  50

seq1  CTCTGTGTAGCCCTGGCTGTAATGAAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGTAGCCCTGGCTGTAATGAAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGC  100

seq1  CTCGAACTCAGAAATCATGCTGGGTAAATCTTGTTCCCAAGTGGAAATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGAACTCAGAAATCATGCTGGGTAAATCTTGTTCCCAAGTGGAAATGT  150

seq1  TCCTTATTTTACCATGGCCCAAGCACAGCATTGTCTCAAACAGAGATTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATTTTACCATGGCCCAAGCACAGCATTGTCTCAAACAGAGATTCT  200

seq1  CAACCTGTGGGTTGTGACACCCCTTGTGGGTGGAACAACACTTTCAAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTGTGGGTTGTGACACCCCTTGTGGGTGGAACAACACTTTCAAAGG  250

seq1  GATTGCTTAAGACCATCAGCAAGTCCAGATGTTTACATCATGATTCATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCTTAAGACCATCAGCAAGTCCAGATGTTTACATCATGATTCATAA  300

seq1  TGGTAGCAAAGCTACCGTTATGGAGTAGCAACAAAAATATGTGTATATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGCAAAGCTACCGTTATGGAGTAGCAACAAAAATATGTGTATATTG  350

seq1  TGCCCATGAAAGCCAGGAGAGGACATTGTTGAGCCTCTGAAACTAGAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCATGAAAGCCAGGAGAGGACATTGTTGAGCCTCTGAAACTAGAACT  400

seq1  ACAGGTGGTTGTGAGCTGCCCAAAGTGGGTCCTGGGAACTGAACTTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTGGTTGTGAGCTGCCCAAAGTGGGTCCTGGGAACTGAACTTGGGT  450

seq1  TCTCTGGAAGAGTGGTAAGTACTTTTAGCTCCTGAGCCATCTTCCCAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGAAGAGTGGTAAGTACTTTTAGCTCCTGAGCCATCTTCCCAGTA  500

seq1  CATTATTTTTACATCAATATGATACCATGTTCTTAACAGCTTATTAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTTTTACATCAATATGATACCATGTTCTTAACAGCTTATTAATAA  550

seq1  GTATTAGAATCAAATGAAGGCAAAACAGTACTCTTAAAAGATAAAGCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAGAATCAAATGAAGGCAAAACAGTACTCTTAAAAGATAAAGCATG  600

seq1  TCAAAAGTATTAAAAATCTGTCATATACATACCTTGAGAATTC  643
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGTATTAAAAATCTGTCATATACATACCTTGAGAATTC  643

seq1: chr10_92221925_92222766
seq2: B6Ng01-299K21.g_68_909

seq1  GAATTCACAGTAATACTCTTGCTTCAAATCCCCAACTCTTGGTATATTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGTAATACTCTTGCTTCAAATCCCCAACTCTTGGTATATTAT  50

seq1  TTGGCTATAATAAGGCATCAGAAGCTTTGGTCTATTTACATCTAATATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTATAATAAGGCATCAGAAGCTTTGGTCTATTTACATCTAATATAA  100

seq1  TTAGTGACATGCTTGAATATTAATCTGGTTTGAGTTATCTAGACTAGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGACATGCTTGAATATTAATCTGGTTTGAGTTATCTAGACTAGTCA  150

seq1  GCTGATTTATTGACTTATTGGATATATATCCAATATAAAGTGGGTGCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTTATTGACTTATTGGATATATATCCAATATAAAGTGGGTGCACA  200

seq1  CATACCATGGTGCATAAGTGAGGTCAGAGGAAAACTTTGTGAAGTCCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCATGGTGCATAAGTGAGGTCAGAGGAAAACTTTGTGAAGTCCATT  250

seq1  CTCTCTGTTCACCTTGACATAGGCCCATGGGATCCACCTAACTCAGGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGTTCACCTTGACATAGGCCCATGGGATCCACCTAACTCAGGCTA  300

seq1  TCAGGCTTGAACAGCAAGTGTTTTTATCCACACTTTTAAGAAAACTCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCTTGAACAGCAAGTGTTTTTATCCACACTTTTAAGAAAACTCACT  350

seq1  ATCATTTAGCTTTGAATGTTTCCGATGAGAAGTTGGCTTTCATTCTTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTAGCTTTGAATGTTTCCGATGAGAAGTTGGCTTTCATTCTTATT  400

seq1  GTTCTTATTCTTGGAGTTTTGTAATGAGTCCTTTCTTGCTGAGCCCAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTATTCTTGGAGTTTTGTAATGAGTCCTTTCTTGCTGAGCCCAGCA  450

seq1  CAGTCATGTAAGGGACAACATGACATAGTTCTTCCCTGTGGAACAGAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATGTAAGGGACAACATGACATAGTTCTTCCCTGTGGAACAGAGCC  500

seq1  AGCAGGGAATGTGCCTCTACAAGTATTGATGGTTGCTGTGGGTGCAAGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGGAATGTGCCTCTACAAGTATTGATGGTTGCTGTGGGTGCAAGAC  550

seq1  TTGTGTGTATAATAGTGTACGTATTTTCACATTCACCTTTCAAGGGTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGTATAATAGTGTACGTATTTTCACATTCACCTTTCAAGGGTTGT  600

seq1  TCTCTGTGCCAAGGTTAATCACTCTGTGATAATCAGAGACTGCATGAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTGCCAAGGTTAATCACTCTGTGATAATCAGAGACTGCATGAGTC  650

seq1  TGAGAAATGAGGGTGTGTCTATGTCTCAGCCAGATGGCAAATGCTAAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATGAGGGTGTGTCTATGTCTCAGCCAGATGGCAAATGCTAAGTC  700

seq1  CTTCAGGACAGCCCTTAAAGCTGTGGGAAAGAATGCTGAGAACATGAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGGACAGCCCTTAAAGCTGTGGGAAAGAATGCTGAGAACATGAGTT  750

seq1  CAAAAATATGTAATTCCTCAACTATGCAAAACATAAGCATACAATATGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATATGTAATTCCTCAACTATGCAAAACATAAGCATACAATATGAA  800

seq1  TTGAATAAGGAGCTTAACAGATCTAAAGGAACAGAGGCAGCT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAAGGAGCTTAACAGATCTAAAGGAACAGAGGCAGCT  842