BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-314B17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 81,051,130 - 81,158,919
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTle2, Tle6, BC025920, Sirt6, Ankrd24, LOC100040916, EG666448
Upstream geneD10Bwg1364e, Scamp4, Csnk1g2, Btbd2, Mknk2, Mobkl2a, 9030607L17Rik, Ap3d1, Dot1l, Plekhj1, Sf3a2, Amh, Jsrp1, Oaz1, BC072620, Lsm7, 3110056O03Rik, Tmprss9, Timm13, Lmnb2, Gadd45b, Gng7, LOC100042403, Diras1, Slc39a3, Sgta, Thop1, Creb3l3, Map2k2, Zbtb7a, Pias4, Eef2, Dapk3, Itgb1bp3, Atcay, 9130206N08Rik, Matk, Mrpl54, Apba3, Tjp3, Pip5k1c, 2510012J08Rik, Tbxa2r, Gipc3, Hmg20b, F630110N24Rik, 4930404N11Rik, Fzr1, Dohh, 2210404O07Rik, Nfic, Brunol5, Ncln, Edg6, Gna15, Gna11, Aes
Downstream geneEG666458, LOC666711, LOC382388, LOC100040944, EG210583, EG666738, EG666501, 1700123A16Rik, LOC666753, EG666537, BC062127, EG666542, EG666548, EG666790, LOC666571, AL117821, BC062115, 4933439G19Rik, BC024063, AU041133, LOC100042712, B230315N10Rik, LOC100042718, EG237412, LOC666611, Gm1553, LOC544716, 1190007I07Rik, Tdg, Glt8d2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-314B17.bB6Ng01-314B17.g
ACCGA105139GA105140
length1,1581,156
definitionB6Ng01-314B17.b B6Ng01-314B17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,157,761 - 81,158,919)(81,051,130 - 81,052,245)
sequence
gaattccacacggcattgcaagagagatgactattaacagacgatacaga
gagacactcaaacagatcagcactattgagtatacattagcaaaattgta
tcaaaatccctaacttcaaaaaaggatagacaaaatgtttaatatgctca
gtagatactggccattaaacctgtctgagatctgctgagtatggcattta
agaagtttaaaactatcatgacagagactcttaggtcctagcaatgaccc
tcaaggtctccaaaaagacaactgacacagcaacaaaggactccacctgg
attgtggtaacattaactggtaatggccatgcatcatctgcagggtacgc
atttgattgcttcgctgatgggccgtttctgtggcaaggcccatggaaaa
cgcttcccacttggcaaggacatgtggtgaattttgatggcccactgctt
attacctaggtcatatatgctacaaggtctctttgcttttgctatgctgt
ttatactcatagcaatatttagtttcactttgtgggtcatggacaaagcc
aagattatgcagactgaaagccctgtggatgattctatgtttttctaaat
actcattctagaggcaaaaccctcctctcctctctctatcacgcttctac
ttgtgaccattaatcctgagtattttgggacatataattgtgtcactaga
gatactgctacagtcacactgaggaagtctgtggcaaccccaggcttgtg
aagaagagtatgtcctgcttgcataactgttctgaggaagatatgtctga
acaagagacttaaaatgggtaagctgtctggtcaactgagacttaaaaga
taaggaagctctgtctgatcaatagaaaattaaaatatgattcccggaaa
gattgatagtatcagaaattgataggtgcacatgagggaagaaggtgact
tagtaaaatgagcacatcttgtcttcagtttaaaagtatttttgacagag
ggggtggtatctgatgactggacttataattcaggagtgtttcatctgtc
tatcacctgcataactgtgtatgcattgctaccagctggattggtgctca
atatccaacagtcatgcctggctagacatttatttttgccctttcctgaa
ttgtgctt
gaattcaggacctttcttcagcccaggacatgtctttaattccagcaatg
ggaggcagagcaggtggatctctgtgagtcccagggtggtcagagctgca
tagtgagacagtctcaacccacccccaaatacaaatacaaataaaaaacc
actgctagactaagagtgactgcagcttctacccctgatcctgactcccc
atcagtcagaagcaggacacagtcaaggctcagccctggaccttgagcca
cctgtagagccagctccctctgcccagaatctcaaggtgctgtgttcctc
tgatgaatgctaaggtgtgacacctgtcactggccaccttcttgtcccca
tttggggcacccctgggccttcttccagcatcatgtgtgaccccagggtc
tcagcactctctctcttgacctagattttctcattgggccactgtcccaa
tcaggactggttggctgtggggatggagagcagccacgtggaggtcctgc
atgtgcgcaagcctgagaagtaccagctccgcctccatgagagctgcgtg
ctgtcactcaagttcgcttcctgtggtacaagcctgggagaccccttggc
acagcagagggagggtggatggatgggggtgaagccttaaattagataac
gaattacccaggcctgcccacccagctgcttattcaggtcaaagccagtt
tagataaatgcacagacacatttaaaaaaaaaaaagatggaccaggcgag
gtgacttgcatgccttttaaattccagtactcgggaggcagagacaggta
gatctgagttcaaggctagccttgacctgtagagccagttcatgacagcc
aggtccacacagaaaaactgtctcaaaaaaaaaaaaaagaccagctatca
agtgacactccatgtttgccctggcaatctcttcagactttgtaatactt
gccatagttaaggcggctttcagggagggagtgaattttctaaaggtttt
cctaacccctggtgggtccactcccattctcccttctggccacctgcccc
ttccatctcaggaacgctgggtttgtggagcccaggacagggacaacctt
gccataatgcctgtagagacacctcatatgggggcccagctcaattttac
aggtac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_81157761_81158919
seq2: B6Ng01-314B17.b_49_1206 (reverse)

seq1  AAGCACAATTTCAGAAA-GCCAAAAATAAATGTCTAGCCAGGCATGACCT  49
      ||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  AAGCACAATTCAGGAAAGGGCAAAAATAAATGTCTAGCCAGGCATGACTG  50

seq1  GTGGATA-TGAGCACAAACCAAGCTGGTAGCAAATGCCATTACACAGTTA  98
       |||||| ||||||| || | |||||||||| |||||   ||||||||||
seq2  TTGGATATTGAGCACCAATCCAGCTGGTAGC-AATGC--ATACACAGTTA  97

seq1  TGCAAGGTGATAGACAGATTAAACACTCCTG-ATTATAAGTCCAGTCATC  147
      ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGC-AGGTGATAGACAGATGAAACACTCCTGAATTATAAGTCCAGTCATC  146

seq1  AGATACCA-CCCCTCTGTC-AAAATACTTTTTAAACTGAAGACAAAGATG  195
      |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  AGATACCACCCCCTCTGTCAAAAATAC-TTTTAAACTGAAGAC-AAGATG  194

seq1  TGCTCATTTTACTAAGTCACCTTCTTCCCTCATGTGCACCTATCAATTTC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCATTTTACTAAGTCACCTTCTTCCCTCATGTGCACCTATCAATTTC  244

seq1  TGATACTATCAATCTTTCCGGGAATCATATTTTAATTTTCTATTGATCAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACTATCAATCTTTCCGGGAATCATATTTTAATTTTCTATTGATCAG  294

seq1  ACAGAGCTTCCTTATCTTTTAAGTCTCAGTTGACCAGACAGCTTACCCAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCTTCCTTATCTTTTAAGTCTCAGTTGACCAGACAGCTTACCCAT  344

seq1  TTTAAGTCTCTTGTTCAGACATATCTTCCTCAGAACAGTTATGCAAGCAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTCTCTTGTTCAGACATATCTTCCTCAGAACAGTTATGCAAGCAG  394

seq1  GACATACTCTTCTTCACAAGCCTGGGGTTGCCACAGACTTCCTCAGTGTG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATACTCTTCTTCACAAGCCTGGGGTTGCCACAGACTTCCTCAGTGTG  444

seq1  ACTGTAGCAGTATCTCTAGTGACACAATTATATGTCCCAAAATACTCAGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGCAGTATCTCTAGTGACACAATTATATGTCCCAAAATACTCAGG  494

seq1  ATTAATGGTCACAAGTAGAAGCGTGATAGAGAGAGGAGAGGAGGGTTTTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGGTCACAAGTAGAAGCGTGATAGAGAGAGGAGAGGAGGGTTTTG  544

seq1  CCTCTAGAATGAGTATTTAGAAAAACATAGAATCATCCACAGGGCTTTCA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAGAATGAGTATTTAGAAAAACATAGAATCATCCACAGGGCTTTCA  594

seq1  GTCTGCATAATCTTGGCTTTGTCCATGACCCACAAAGTGAAACTAAATAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCATAATCTTGGCTTTGTCCATGACCCACAAAGTGAAACTAAATAT  644

seq1  TGCTATGAGTATAAACAGCATAGCAAAAGCAAAGAGACCTTGTAGCATAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATGAGTATAAACAGCATAGCAAAAGCAAAGAGACCTTGTAGCATAT  694

seq1  ATGACCTAGGTAATAAGCAGTGGGCCATCAAAATTCACCACATGTCCTTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTAGGTAATAAGCAGTGGGCCATCAAAATTCACCACATGTCCTTG  744

seq1  CCAAGTGGGAAGCGTTTTCCATGGGCCTTGCCACAGAAACGGCCCATCAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGGGAAGCGTTTTCCATGGGCCTTGCCACAGAAACGGCCCATCAG  794

seq1  CGAAGCAATCAAATGCGTACCCTGCAGATGATGCATGGCCATTACCAGTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGCAATCAAATGCGTACCCTGCAGATGATGCATGGCCATTACCAGTT  844

seq1  AATGTTACCACAATCCAGGTGGAGTCCTTTGTTGCTGTGTCAGTTGTCTT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTACCACAATCCAGGTGGAGTCCTTTGTTGCTGTGTCAGTTGTCTT  894

seq1  TTTGGAGACCTTGAGGGTCATTGCTAGGACCTAAGAGTCTCTGTCATGAT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGACCTTGAGGGTCATTGCTAGGACCTAAGAGTCTCTGTCATGAT  944

seq1  AGTTTTAAACTTCTTAAATGCCATACTCAGCAGATCTCAGACAGGTTTAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTAAACTTCTTAAATGCCATACTCAGCAGATCTCAGACAGGTTTAA  994

seq1  TGGCCAGTATCTACTGAGCATATTAAACATTTTGTCTATCCTTTTTTGAA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAGTATCTACTGAGCATATTAAACATTTTGTCTATCCTTTTTTGAA  1044

seq1  GTTAGGGATTTTGATACAATTTTGCTAATGTATACTCAATAGTGCTGATC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGGATTTTGATACAATTTTGCTAATGTATACTCAATAGTGCTGATC  1094

seq1  TGTTTGAGTGTCTCTCTGTATCGTCTGTTAATAGTCATCTCTCTTGCAAT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGAGTGTCTCTCTGTATCGTCTGTTAATAGTCATCTCTCTTGCAAT  1144

seq1  GCCGTGTGGAATTC  1159
      ||||||||||||||
seq2  GCCGTGTGGAATTC  1158

seq1: chr10_81051130_81052245
seq2: B6Ng01-314B17.g_65_1220

seq1  GAATTCAGGACCTTTCTTCAGCCCAGGACATGTCTTTAATTCCAGCAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGACCTTTCTTCAGCCCAGGACATGTCTTTAATTCCAGCAATG  50

seq1  GGAGGCAGAGCAGGTGGATCTCTGTGAGTCCCAGGGTGGTCAGAGCTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGAGCAGGTGGATCTCTGTGAGTCCCAGGGTGGTCAGAGCTGCA  100

seq1  TAGTGAGACAGTCTCAACCCACCCCCAAATACAAATACAAATAAAAAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAGACAGTCTCAACCCACCCCCAAATACAAATACAAATAAAAAACC  150

seq1  ACTGCTAGACTAAGAGTGACTGCAGCTTCTACCCCTGATCCTGACTCCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTAGACTAAGAGTGACTGCAGCTTCTACCCCTGATCCTGACTCCCC  200

seq1  ATCAGTCAGAAGCAGGACACAGTCAAGGCTCAGCCCTGGACCTTGAGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTCAGAAGCAGGACACAGTCAAGGCTCAGCCCTGGACCTTGAGCCA  250

seq1  CCTGTAGAGCCAGCTCCCTCTGCCCAGAATCTCAAGGTGCTGTGTTCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAGAGCCAGCTCCCTCTGCCCAGAATCTCAAGGTGCTGTGTTCCTC  300

seq1  TGATGAATGCTAAGGTGTGACACCTGTCACTGGCCACCTTCTTGTCCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAATGCTAAGGTGTGACACCTGTCACTGGCCACCTTCTTGTCCCCA  350

seq1  TTTGGGGCACCCCTGGGCCTTCTTCCAGCATCATGTGTGACCCCAGGGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGCACCCCTGGGCCTTCTTCCAGCATCATGTGTGACCCCAGGGTC  400

seq1  TCAGCACTCTCTCTCTTGACCTAGATTTTCTCATTGGGCCACTGTCCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCACTCTCTCTCTTGACCTAGATTTTCTCATTGGGCCACTGTCCCAA  450

seq1  TCAGGACTGGTTGGCTGTGGGGATGGAGAGCAGCCACGTGGAGGTCCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGACTGGTTGGCTGTGGGGATGGAGAGCAGCCACGTGGAGGTCCTGC  500

seq1  ATGTGCGCAAGCCTGAGAAGTACCAGCTCCGCCTCCATGAGAGCTGCGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCGCAAGCCTGAGAAGTACCAGCTCCGCCTCCATGAGAGCTGCGTG  550

seq1  CTGTCACTCAAGTTCGCTTCCTGTGGTACAAGCCTGGGAGACCCCTTGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCACTCAAGTTCGCTTCCTGTGGTACAAGCCTGGGAGACCCCTTGGC  600

seq1  ACAGCAGAGGGAGGGTGGATGGATGGGGGTGAAGCCTTAAATTAGATAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGAGGGAGGGTGGATGGATGGGGGTGAAGCCTTAAATTAGATAAC  650

seq1  GAATTACCCAGGCCTGCCCACCCAGCTGCTTATTCAGGTCAAAGCCAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTACCCAGGCCTGCCCACCCAGCTGCTTATTCAGGTCAAAGCCAGTT  700

seq1  TAGATAAATGCACAGACACATTT-AAAAAAAAAAAGATGGACCAGGCGAG  749
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAATGCACAGACACATTTAAAAAAAAAAAAGATGGACCAGGCGAG  750

seq1  GTGACTTGCATGCCTTT--AATTCCAGTACTCGGGAGGCAGAGACAGGTA  797
      |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTGCATGCCTTTTAAATTCCAGTACTCGGGAGGCAGAGACAGGTA  800

seq1  GATCTGAGTTCAAGGCTAGCC-TGGCCTGTAGAGCCAGTTCAGGACAGCC  846
      ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||
seq2  GATCTGAGTTCAAGGCTAGCCTTGACCTGTAGAGCCAGTTCATGACAGCC  850

seq1  AGGTCCACACAGAAAAACTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAGA-CAGCTATCA  894
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGGTCCACACAGAAAAACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGACCAGCTATCA  900

seq1  AG-GACACTCCATGTT--GCCTGGC-AGCTC-TCAG-CTTTTTGATACT-  937
      || |||||||||||||   |||||| | ||| |||| |||| | ||||| 
seq2  AGTGACACTCCATGTTTGCCCTGGCAATCTCTTCAGACTTTGTAATACTT  950

seq1  -GCATAGT--AGGCGGC-TTCA-GGAAGGAGTGAA-TTTCTAA--GGTTT  979
        ||||||  ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  | |||
seq2  GCCATAGTTAAGGCGGCTTTCAGGGAGGGAGTGAATTTTCTAAAGGTTTT  1000

seq1  CCTA--CCCTGGTGG--TCACTCCCATCCTCCCCTCT-GCCCCCTCCCCT  1024
      ||||  |||||||||   ||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||| 
seq2  CCTAACCCCTGGTGGGTCCACTCCCATTCTCCCTTCTGGCCACCTGCCCC  1050

seq1  TCCCATCTCAGG-ACGCT-GGTTTGT-GAGCACAGG-CAAGGACAACCT-  1069
      | |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||| 
seq2  TTCCATCTCAGGAACGCTGGGTTTGTGGAGCCCAGGACAGGGACAACCTT  1100

seq1  -GCTCAATGCCTGGAG-GACAC--CCTATGGGG--CCAGC---ATTTTTC  1110
        |  |||||||| || |||||  | |||||||  |||||   ||||| |
seq2  GCCATAATGCCTGTAGAGACACCTCATATGGGGGCCCAGCTCAATTTTAC  1150

seq1  AGGTAC  1116
      ||||||
seq2  AGGTAC  1156