BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322D23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 25,046,610 - 25,066,010
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800
Downstream geneEpb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352, Samd3, L3mbtl3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322D23.bB6Ng01-322D23.g
ACCGA111139GA111140
length5261,185
definitionB6Ng01-322D23.b B6Ng01-322D23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,046,610 - 25,047,139)(25,064,816 - 25,066,010)
sequence
taccttatttgtgatggtttgaatgagaatcacccctcataggcccatga
acttgaacacttgctacccacttagtggtgctctttgggggtggccatag
tctagctggaggaagcaggtcagtggggtaagctttgcgtgtttaaacct
tgccccgttcatgtgctctctgcttcctctgtgtgtacatttgataaact
ctggatcctgcctccctgccataccgtccatgaggatgcttccactctga
aatagcaagataaaatcaaaacttggttccttaagttacctttggccacg
ttatgtattttatcacggcaacagaaaagtaactaataccttatttaaag
atataatattccttgaaaacacatgtgctagtgatgttataagaactgaa
cgggttgtatttatatatttagggtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagacaattcaaaag
attgcttttgtatttgagagatagca
gaattcagtaaaaagttattttgcactttgatttagactgactttgtaaa
caagagctatagggatttaagatgtctcaaaatttctcaaggagagttca
gaaggcaaaggagaagagtttagttagactcactcaaagaccaaaagaac
ccaaggcaaagggactacagaacgtgcattatgaacatgggtaccagttt
tgcttggatcaaacagatatctgtctatggggagagactaagatagaaca
ctgtattttaataagatgggaatggcctctgattgtctctccccactcag
ccacactgccagcctgtctctactgttctaagctctttcccaggctgtac
tgagaagagggtttgatcagattatagagaaacaatgtccttctcatacc
cttttaactagatatgggagttgggaggcaaaatgaccttcaagccttgg
cattggactttatttctcacacagatctaccaccacaattccatggacca
attttctcacaagtactaatgaggcctgtcttagggttttactactgtga
acagacaccatgaccaggacaactcttaataaaagacagcatttaatttg
gactggcttacaggttcaaaggttcagtccattatcatcaaggtaggagc
atggcagcatgcaggcagacttggggctggagttgctgagagttctacat
cttattctgaagagctaggagaagattgcttctaggcagctaagtcttaa
agcccacaatgacacatctactccaacaaggccacacctcctaatagtgc
cactccctgggccaagtatactcaaaccatcacaagggctgactctgctt
agcttcagaaatctagtgtgtttggggtgacatgtccaaagcctatcata
gacaacttctgatgatgtgtgatcctgaatgtcaaagttttgaacatgct
atgagggatcttgcctgtgagtataatttgtgactggcctcagcactggt
gattataaaacctagcagcagtgattttatatcaatggaacagctagaag
attgttgatcagagaaaagttagaagagtagaccctccattatttgaagt
cgcacttgaatattgtgttagcccagtctgatgctcatgtttcaatgcct
gtagaattagcagtgaacgaggacacctgaaacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_25046610_25047139
seq2: B6Ng01-322D23.b_44_575

seq1  GAATTCTACCTTATTTGTGATGGTTTGAATGAGAATCACCCCTCATAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACCTTATTTGTGATGGTTTGAATGAGAATCACCCCTCATAGGC  50

seq1  CCATGAACTTGAACACTTGCTACCCACTTAGTGGTGCTCTTTGGGGGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAACTTGAACACTTGCTACCCACTTAGTGGTGCTCTTTGGGGGTGG  100

seq1  CCATAGTCTAGCTGGAGGAAGCAGGTCAGTGGGGTAAGCTTTGCGTGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGTCTAGCTGGAGGAAGCAGGTCAGTGGGGTAAGCTTTGCGTGTTT  150

seq1  AAACCTTGCCCCGTTCATGTGCTCTCTGCTTCCTCTGTGTGTACATTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTTGCCCCGTTCATGTGCTCTCTGCTTCCTCTGTGTGTACATTTGA  200

seq1  TAAACTCTGGATCCTGCCTCCCTGCCATACCGTCCATGAGGATGCTTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTCTGGATCCTGCCTCCCTGCCATACCGTCCATGAGGATGCTTCCA  250

seq1  CTCTGAAATAGCAAGATAAAATCAAAACTTGGTTCCTTAAGTTACCTTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAATAGCAAGATAAAATCAAAACTTGGTTCCTTAAGTTACCTTTG  300

seq1  GCCACGTTATGTATTTTATCACGGCAACAGAAAAGTAACTAATACCTTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACGTTATGTATTTTATCACGGCAACAGAAAAGTAACTAATACCTTAT  350

seq1  TTAAAGATATAATATTCCTTGAAAACACATGTGCTAGTGATGTTATAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGATATAATATTCCTTGAAAACACATGTGCTAGTGATGTTATAAGA  400

seq1  ACTGAACGGGTTGTATTTATATATTTAGGGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACGGGTTGTATTTATATATTTAGGGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTG  450

seq1  TGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAATT  500

seq1  AAAAAGAAGCC--ATGAATTTGAGAGAGAGCA  530
       ||||||   |   || |||||||||| ||||
seq2  CAAAAGATTGCTTTTGTATTTGAGAGATAGCA  532

seq1: chr10_25064816_25066010
seq2: B6Ng01-322D23.g_67_1251 (reverse)

seq1  CTGTTTCA-GTGT-CTCTGTCACTGCTATTTCTACAGGCCATTAAAAACA  48
      |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| ||   |
seq2  CTGTTTCAGGTGTCCTCGTTCACTGCTAATTCTACAGG-CATTGAA---A  46

seq1  AATGAGCCCATCAAGACTGGGCT-ACACAATA-TCCAGTGCCAACTTCAA  96
       |||||  |||| |||||||||| |||||||| || |||| | |||||||
seq2  CATGAG--CATC-AGACTGGGCTAACACAATATTCAAGTG-CGACTTCAA  92

seq1  ATAATTGAGGGTCTAACTCTTCTAACTTTTCTCTTGATTCAACAATCTCT  146
      ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  
seq2  ATAATGGAGGGTCT-ACTCTTCTAACTTTTCTC-TGA-TCAACAATCTTC  139

seq1  TAGCTGTTCCCATTGATATAAAATCACTGCTGCTAGGTTTTAT-ATCACC  195
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAGCTGTT-CCATTGATATAAAATCACTGCTGCTAGGTTTTATAATCACC  188

seq1  AGTTGCTGAGGCCAGTCACAAATTATACTCCACAGGCAAGATCCCTCATA  245
      || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AG-TGCTGAGGCCAGTCACAAATTATACT-CACAGGCAAGATCCCTCATA  236

seq1  GCATGTTCAAAACCTTTGACATTCAGGATCACACATCATCAGAAGTTGTC  295
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTTCAAAA-CTTTGACATTCAGGATCACACATCATCAGAAGTTGTC  285

seq1  TATGATAGGCTTTGGACATGTCACCCCAAACACACTAGATTTCTGAAGCT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAGGCTTTGGACATGTCACCCCAAACACACTAGATTTCTGAAGCT  335

seq1  AAGCAGAGTCAGCCCTTGTGATGGTTTGAGTATACTTGGCCCAGGGAGTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGTCAGCCCTTGTGATGGTTTGAGTATACTTGGCCCAGGGAGTG  385

seq1  GCACTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGTAGATGTGTCATTGTGGGCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAGTAGATGTGTCATTGTGGGCT  435

seq1  TTAAGACTTAGCTGCCTAGAAGCAATCTTCTCCTAGCTCTTCAGAATAAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGACTTAGCTGCCTAGAAGCAATCTTCTCCTAGCTCTTCAGAATAAG  485

seq1  ATGTAGAACTCTCAGCAACTCCAGCCCCAAGTCTGCCTGCATGCTGCCAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAACTCTCAGCAACTCCAGCCCCAAGTCTGCCTGCATGCTGCCAT  535

seq1  GCTCCTACCTTGATGATAATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGCCAGTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTACCTTGATGATAATGGACTGAACCTTTGAACCTGTAAGCCAGTC  585

seq1  CAAATTAAATGCTGTCTTTTATTAAGAGTTGTCCTGGTCATGGTGTCTGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAAATGCTGTCTTTTATTAAGAGTTGTCCTGGTCATGGTGTCTGT  635

seq1  TCACAGTAGTAAAACCCTAAGACAGGCCTCATTAGTACTTGTGAGAAAAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTAGTAAAACCCTAAGACAGGCCTCATTAGTACTTGTGAGAAAAT  685

seq1  TGGTCCATGGAATTGTGGTGGTAGATCTGTGTGAGAAATAAAGTCCAATG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCATGGAATTGTGGTGGTAGATCTGTGTGAGAAATAAAGTCCAATG  735

seq1  CCAAGGCTTGAAGGTCATTTTGCCTCCCAACTCCCATATCTAGTTAAAAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCTTGAAGGTCATTTTGCCTCCCAACTCCCATATCTAGTTAAAAG  785

seq1  GGTATGAGAAGGACATTGTTTCTCTATAATCTGATCAAACCCTCTTCTCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGAGAAGGACATTGTTTCTCTATAATCTGATCAAACCCTCTTCTCA  835

seq1  GTACAGCCTGGGAAAGAGCTTAGAACAGTAGAGACAGGCTGGCAGTGTGG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGCCTGGGAAAGAGCTTAGAACAGTAGAGACAGGCTGGCAGTGTGG  885

seq1  CTGAGTGGGGAGAGACAATCAGAGGCCATTCCCATCTTATTAAAATACAG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGGGGAGAGACAATCAGAGGCCATTCCCATCTTATTAAAATACAG  935

seq1  TGTTCTATCTTAGTCTCTCCCCATAGACAGATATCTGTTTGATCCAAGCA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTATCTTAGTCTCTCCCCATAGACAGATATCTGTTTGATCCAAGCA  985

seq1  AAACTGGTACCCATGTTCATAATGCACGTTCTGTAGTCCCTTTGCCTTGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGTACCCATGTTCATAATGCACGTTCTGTAGTCCCTTTGCCTTGG  1035

seq1  GTTCTTTTGGTCTTTGAGTGAGTCTAACTAAACTCTTCTCCTTTGCCTTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTTTGGTCTTTGAGTGAGTCTAACTAAACTCTTCTCCTTTGCCTTC  1085

seq1  TGAACTCTCCTTGAGAAATTTTGAGACATCTTAAATCCCTATAGCTCTTG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTCTCCTTGAGAAATTTTGAGACATCTTAAATCCCTATAGCTCTTG  1135

seq1  TTTACAAAGTCAGTCTAAATCAAAGTGCAAAATAACTTTTTACTGAATTC  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAAGTCAGTCTAAATCAAAGTGCAAAATAACTTTTTACTGAATTC  1185