BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-324D19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 111,106,600 - 111,268,181
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042518, E2f7, Csrp2, Zdhhc17, EG432502, LOC667904, Osbpl8, Bbs10, Nap1l1, EG382421, Phlda1
Downstream geneKrr1, Glipr1, EG639527, Glipr1l1, Glipr1l2, LOC627895, Glipr1l3, Caps2, Kcnc2, LOC100042639
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-324D19.bB6Ng01-324D19.g
ACCGA112604GA112605
length1,1751,081
definitionB6Ng01-324D19.b B6Ng01-324D19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(111,267,002 - 111,268,181)(111,106,600 - 111,107,680)
sequence
gaattcattccaaaatcattttaaagaggaacagactgaattaaagtgat
gtcacaatatgggtgatattagaattatttgttataactcctctgaagga
ccataatttgatttttttcttttcctttttgtgcttttgtgtttttatta
aaaattttaattaagagataattacttcatttttcctctcccagtccctc
tcttgtcccctgccccagctccaatattttgattttaaaaattatttata
tccttggatttaaaattttgtatatgcttaatgaaataatataatatctg
aggggttcaaaaaccagcttttacatcattaaattcatttcatggagacc
aggctttggaaaggaccccggaggagacaagctgttggacataggatgat
tgaaagagagtcacgaattatcattttattttaatatttccatttgtgca
acagctgattttattaacaagttactttttataatcctttcgtgtatatt
ttaattctattgttttcaaatgcactacctaaataaaaaacatttactcc
gagtctctgttcttttttagtttgtatttatgcataggtgtgacagccag
tagatgccagaagaggtgttgacccctaggagctggagctaccggtagct
gtgagctgctggattgggtgctaggaaccaagctcaggtcctctgcaaga
acagcaagtgctcttaaaccatgagtcatctccctgtcctaattctgagt
ccatgttcttcaccagaaagaaacacttttaattttatcctctcaagatt
aaaaggacgcctgtctttttgccatgattatgtggacttcaaatcttttg
actgctttgatcataaaaactgctatttataagttcaaaagaagaaacca
actgctcctcatagcactttttaaatcttatcaattcttctatcacatgc
tcaagtatatttcacctgctatactttcattcaaaattgtatgtattatt
tacccataatctattatatagaaagtgaatacatatatcagatctattta
ttccagcactgcatctgttagtgattactaaacattaaagattcgaacaa
atatgaccttctttcgcttgcataaaatgggcattctttatttctcttca
gactagcttgtgcttaactcaccac
gaattccttatgagagagtgtaaaacatagttttaagggaactaaaagtt
tgtccaagggaaaggtgtttgctccccctggtatttgtcagctgctaggg
cgggagggcccccggcttcctttcgcctcagtttctctgcatgctggaga
gaagattggagataaaaatggcggaatcattgtctctggccgaagcttac
cacagagaaatgatgcatagttaatgaccttttgtgacaaccttattttt
acaatcgattggggccatatgtggcctgcagtgacagatggtcccaatct
gctgcctccagataataacttgttttagagcctcaggatggccatgacaa
gtctcagctggaccagctgttgaccctgtgactaacgcctgctctgcctt
gaatgaacgccctcaacagaatgtaaaagacatgcctctgttcatggaag
gatgcacacttctctgtcaggagaatgaatatatttgtttgaaaaactat
catttcatcaccccttcggtcccactagggaccaggaaatatgggatttg
atctcattctgtcggttcctgagtgtataacttcagagtcttcacgtaaa
aactgtcaaaactcttattccgaaaatggatcctgactgaatcattgaat
ctaaactggggacccgagtacttggtgtggaaatgattcgtattcatgaa
catacccagtgttcacttctccgcaaagttcaccttctcctctttgaaca
gcggtgctcctccgtgctgtcatgattatccacccattaaagcgactggg
gaaagtaacagaatcctgccacttttcaaaaagtcaacagcggagacagg
gcaaagctgccatttgaacctttcctcactatgtgagctggagatgcaga
gagagagaatgaacttcccaaagtgtccacagatactccatgttagggaa
acctcctttttccctcctggcacgctttgtcagtatgtctgtatttgctg
gatctctgggtaccaccatatctatgacacagtctccctttctctactga
gacttgttgcctctagagcaagctcttgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_111267002_111268181
seq2: B6Ng01-324D19.b_48_1222 (reverse)

seq1  GTGGTGAGTTATGGACAAAGCCTAGTCTTGAAGAG-AATAAAG-ATGCCA  48
      ||||||||||| | ||||   |||||| ||||||| ||||||| ||||| 
seq2  GTGGTGAGTTAAGCACAA--GCTAGTC-TGAAGAGAAATAAAGAATGCCC  47

seq1  TTTTTATGCCAGCGAAAGA--GTCATATTTG-TCGAATTCCTTTAATGTT  95
       |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||
seq2  ATTTTATGCAAGCGAAAGAAGGTCATATTTGTTCGAAT--CTTTAATGTT  95

seq1  TAGTAATCACTAACAGATTGCAGTGCTTGGAATAAATAGATCTGATATAT  145
      ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAATCACTAACAGA-TGCAGTGC-TGGAATAAATAGATCTGATATAT  143

seq1  GTATTCACTTTCTATATAATAGATTATGGGTAAATTAATACATACAATTT  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTATTCACTTTCTATATAATAGATTATGGGTAAA-TAATACATACAATTT  192

seq1  TGAATGAAAGTATAGCAGGTGAAATTATACTTGAGCATGTGATAGAAGAA  245
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGAAAGTATAGCAGGTGAAA-TATACTTGAGCATGTGATAGAAGAA  241

seq1  TTGATAAGATTTAAAAAGTGCTATGAGGAGCAGTTGGTTTCTTTCTTTTG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTGATAAGATTTAAAAAGTGCTATGAGGAGCAGTTGGTTTC-TTCTTTTG  290

seq1  AACTTATAAATAGCAGTTTTTATGATCAAAGCAGTCAAAAGATTTGAAGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTATAAATAGCAGTTTTTATGATCAAAGCAGTCAAAAGATTTGAAGT  340

seq1  CCACATAATCATGGCAAAAAGACAGGCGTCCTTTTAATCTTGAGAGGATA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATAATCATGGCAAAAAGACAGGCGTCCTTTTAATCTTGAGAGGATA  390

seq1  AAATTAAAAGTGTTTCTTTCTGGTGAAGAACATGGACTCAGAATTAGGAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAAGTGTTTCTTTCTGGTGAAGAACATGGACTCAGAATTAGGAC  440

seq1  AGGGAGATGACTCATGGTTTAAGAGCACTTGCTGTTCTTGCAGAGGACCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGATGACTCATGGTTTAAGAGCACTTGCTGTTCTTGCAGAGGACCT  490

seq1  GAGCTTGGTTCCTAGCACCCAATCCAGCAGCTCACAGCTACCGGTAGCTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTGGTTCCTAGCACCCAATCCAGCAGCTCACAGCTACCGGTAGCTC  540

seq1  CAGCTCCTAGGGGTCAACACCTCTTCTGGCATCTACTGGCTGTCACACCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCCTAGGGGTCAACACCTCTTCTGGCATCTACTGGCTGTCACACCT  590

seq1  ATGCATAAATACAAACTAAAAAAGAACAGAGACTCGGAGTAAATGTTTTT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATAAATACAAACTAAAAAAGAACAGAGACTCGGAGTAAATGTTTTT  640

seq1  TATTTAGGTAGTGCATTTGAAAACAATAGAATTAAAATATACACGAAAGG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGGTAGTGCATTTGAAAACAATAGAATTAAAATATACACGAAAGG  690

seq1  ATTATAAAAAGTAACTTGTTAATAAAATCAGCTGTTGCACAAATGGAAAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAAAAAGTAACTTGTTAATAAAATCAGCTGTTGCACAAATGGAAAT  740

seq1  ATTAAAATAAAATGATAATTCGTGACTCTCTTTCAATCATCCTATGTCCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATAAAATGATAATTCGTGACTCTCTTTCAATCATCCTATGTCCA  790

seq1  ACAGCTTGTCTCCTCCGGGGTCCTTTCCAAAGCCTGGTCTCCATGAAATG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTTGTCTCCTCCGGGGTCCTTTCCAAAGCCTGGTCTCCATGAAATG  840

seq1  AATTTAATGATGTAAAAGCTGGTTTTTGAACCCCTCAGATATTATATTAT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAATGATGTAAAAGCTGGTTTTTGAACCCCTCAGATATTATATTAT  890

seq1  TTCATTAAGCATATACAAAATTTTAAATCCAAGGATATAAATAATTTTTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTAAGCATATACAAAATTTTAAATCCAAGGATATAAATAATTTTTA  940

seq1  AAATCAAAATATTGGAGCTGGGGCAGGGGACAAGAGAGGGACTGGGAGAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAAATATTGGAGCTGGGGCAGGGGACAAGAGAGGGACTGGGAGAG  990

seq1  GAAAAATGAAGTAATTATCTCTTAATTAAAATTTTTAATAAAAACACAAA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATGAAGTAATTATCTCTTAATTAAAATTTTTAATAAAAACACAAA  1040

seq1  AGCACAAAAAGGAAAAGAAAAAAATCAAATTATGGTCCTTCAGAGGAGTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAAAAAGGAAAAGAAAAAAATCAAATTATGGTCCTTCAGAGGAGTT  1090

seq1  ATAACAAATAATTCTAATATCACCCATATTGTGACATCACTTTAATTCAG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAATAATTCTAATATCACCCATATTGTGACATCACTTTAATTCAG  1140

seq1  TCTGTTCCTCTTTAAAATGATTTTGGAATGAATTC  1180
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCCTCTTTAAAATGATTTTGGAATGAATTC  1175

seq1: chr10_111106600_111107680
seq2: B6Ng01-324D19.g_68_1148

seq1  GAATTCCTTATGAGAGAGTGTAAAACATAGTTTTAAGGGAACTAAAAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTATGAGAGAGTGTAAAACATAGTTTTAAGGGAACTAAAAGTT  50

seq1  TGTCCAAGGGAAAGGTGTTTGCTCCCCCTGGTATTTGTCAGCTGCTAGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAAGGGAAAGGTGTTTGCTCCCCCTGGTATTTGTCAGCTGCTAGGG  100

seq1  CGGGAGGGCCCCCGGCTTCCTTTCGCCTCAGTTTCTCTGCATGCTGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGAGGGCCCCCGGCTTCCTTTCGCCTCAGTTTCTCTGCATGCTGGAGA  150

seq1  GAAGATTGGAGATAAAAATGGCGGAATCATTGTCTCTGGCCGAAGCTTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTGGAGATAAAAATGGCGGAATCATTGTCTCTGGCCGAAGCTTAC  200

seq1  CACAGAGAAATGATGCATAGTTAATGACCTTTTGTGACAACCTTATTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGAAATGATGCATAGTTAATGACCTTTTGTGACAACCTTATTTTT  250

seq1  ACAATCGATTGGGGCCATATGTGGCCTGCAGTGACAGATGGTCCCAATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCGATTGGGGCCATATGTGGCCTGCAGTGACAGATGGTCCCAATCT  300

seq1  GCTGCCTCCAGATAATAACTTGTTTTAGAGCCTCAGGATGGCCATGACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCTCCAGATAATAACTTGTTTTAGAGCCTCAGGATGGCCATGACAA  350

seq1  GTCTCAGCTGGACCAGCTGTTGACCCTGTGACTAACGCCTGCTCTGCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGCTGGACCAGCTGTTGACCCTGTGACTAACGCCTGCTCTGCCTT  400

seq1  GAATGAACGCCCTCAACAGAATGTAAAAGACATGCCTCTGTTCATGGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAACGCCCTCAACAGAATGTAAAAGACATGCCTCTGTTCATGGAAG  450

seq1  GATGCACACTTCTCTGTCAGGAGAATGAATATATTTGTTTGAAAAACTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCACACTTCTCTGTCAGGAGAATGAATATATTTGTTTGAAAAACTAT  500

seq1  CATTTCATCACCCCTTCGGTCCCACTAGGGACCAGGAAATATGGGATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCATCACCCCTTCGGTCCCACTAGGGACCAGGAAATATGGGATTTG  550

seq1  ATCTCATTCTGTCGGTTCCTGAGTGTATAACTTCAGAGTCTTCACGTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATTCTGTCGGTTCCTGAGTGTATAACTTCAGAGTCTTCACGTAAA  600

seq1  AACTGTCAAAACTCTTATTCCGAAAATGGATCCTGACTGAATCATTGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTCAAAACTCTTATTCCGAAAATGGATCCTGACTGAATCATTGAAT  650

seq1  CTAAACTGGGGACCCGAGTACTTGGTGTGGAAATGATTCGTATTCATGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACTGGGGACCCGAGTACTTGGTGTGGAAATGATTCGTATTCATGAA  700

seq1  CATACCCAGTGTTCACTTCTCCGCAAAGTTCACCTTCTCCTCTTTGAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCCAGTGTTCACTTCTCCGCAAAGTTCACCTTCTCCTCTTTGAACA  750

seq1  GCGGTGCTCCTCCGTGCTGTCATGATTATCCACCCATTAAAGCGACTGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTGCTCCTCCGTGCTGTCATGATTATCCACCCATTAAAGCGACTGGG  800

seq1  GAAAGTAACAGAATCCTGCCACTTTTCAAAAAGTCAACAGCGGAGACAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTAACAGAATCCTGCCACTTTTCAAAAAGTCAACAGCGGAGACAGG  850

seq1  GCAAAGCTGCCATTTGAACCTTTCCCCACTATGTGAGCTGGAGATGCAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCTGCCATTTGAACCTTTCCTCACTATGTGAGCTGGAGATGCAGA  900

seq1  GAGAGAGAAATGAACTT-CCAAAGTGTCCACAGATACTCCATGTTAGGG-  948
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GAGAGAG-AATGAACTTCCCAAAGTGTCCACAGATACTCCATGTTAGGGA  949

seq1  AACCTCC-TTTTCCCTCCTGGCACGCTTTGTCAGTATGTCTGTATTTGCT  997
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCCTTTTTCCCTCCTGGCACGCTTTGTCAGTATGTCTGTATTTGCT  999

seq1  GGATCTCTGGGTACCACCATAATCTATGACACAGTCTCCCTTTCTCTTAC  1047
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGATCTCTGGGTACCACCAT-ATCTATGACACAGTCTCCCTTTCTC-TAC  1047

seq1  TGGAGACTTGTTGCCTCTAGAGCAAGCTCTGGGG-  1081
      | |||||||||||||||||||||||||||| ||| 
seq2  T-GAGACTTGTTGCCTCTAGAGCAAGCTCTTGGGG  1081