seq1: chr1_156840719_156840806
seq2: B6Ng01-325A18.b_83_135 (reverse)
seq1 CACACACACACACACACACGTGTATGTTGTAAGTGTGCATGCACAGGAAT 50
|||||||||||||||||||||||
seq2 CACACACACACACACACACGTGT--------------------------- 23
seq1 ACACATGCCATAATGCATGT--GTGGAAGTCAGAGGACAA 88
|||| ||| || ||||||||||||||||||
seq2 --------CATA--GCAAGTACGTGGAAGTCAGAGGACAA 53
| seq1: chr10_120833172_120834379
seq2: B6Ng01-325A18.g_68_1272
seq1 GAATTCCAGAGGCCATGTTGGGGGGACAGCCATTGAGTTTATTCCTTTAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCAGAGGCCATGTTGGGGGGACAGCCATTGAGTTTATTCCTTTAC 50
seq1 CTCATGTGACCCCAGCAACTTTGGTGATACTGAGAGGCCAGCAGGCAGTA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCATGTGACCCCAGCAACTTTGGTGATACTGAGAGGCCAGCAGGCAGTA 100
seq1 GAGTGGACACCTCGGCCGTGGCCACTTTAGAGGGGGAAAAGTTTAAGTTT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGTGGACACCTCGGCCGTGGCCACTTTAGAGGGGGAAAAGTTTAAGTTT 150
seq1 TAAACTAAAAGTTACAGAATTGAATGTGGATACCGGCTTCATTCACCCCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAACTAAAAGTTACAGAATTGAATGTGGATACCGGCTTCATTCACCCCC 200
seq1 ACTTGGATTCTAAACATGACCAGTGAAATAGTGAAAGCTGACCACAGTTG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTTGGATTCTAAACATGACCAGTGAAATAGTGAAAGCTGACCACAGTTG 250
seq1 TTCCCAAATAAAGGTCGGCAGCTCCTACCAGGTCTGGGATTGAGATGTTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCCAAATAAAGGTCGGCAGCTCCTACCAGGTCTGGGATTGAGATGTTA 300
seq1 GAGTCTTCAGTTTTATAGCCGGCTCCTGAAAGCAGGCGACATCAGAGTGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGTCTTCAGTTTTATAGCCGGCTCCTGAAAGCAGGCGACATCAGAGTGG 350
seq1 TAACAGTCAGTAGGCTGCAGTAGGTGTCCTACCTCGAGGCCCTCAGATGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAACAGTCAGTAGGCTGCAGTAGGTGTCCTACCTCGAGGCCCTCAGATGG 400
seq1 AGGTAACACATTAGGATTGTGGGACACAAGATCCTCTCTGAACCTCCTGG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTAACACATTAGGATTGTGGGACACAAGATCCTCTCTGAACCTCCTGG 450
seq1 TTAAGGAACGTTCCTGCAAACATTCAAGTAGACCTTCTATAACAGACTGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAAGGAACGTTCCTGCAAACATTCAAGTAGACCTTCTATAACAGACTGC 500
seq1 AGCGTGCATGGCCTCTACCCACAAGAGATGCACTGCAGGAGGCCGGCCCT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCGTGCATGGCCTCTACCCACAAGAGATGCACTGCAGGAGGCCGGCCCT 550
seq1 GTTCTCTGTACTCAGCATTTTGACATCTCCTTTGAAGGCCAGGTATATGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTCTCTGTACTCAGCATTTTGACATCTCCTTTGAAGGCCAGGTATATGT 600
seq1 GTACCAGTGCTCTTCAAAGGGAGAACCATTAAAACCAACATGGAATGCAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTACCAGTGCTCTTCAAAGGGAGAACCATTAAAACCAACATGGAATGCAG 650
seq1 GGACTTCGCCTTATAAGATTTCCAGTTTTAAAACTGCCCCTCAGATACAA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGACTTCGCCTTATAAGATTTCCAGTTTTAAAACTGCCCCTCAGATACAA 700
seq1 TTTCAAAGTAGGGTACACATTAGAGTGTCTTTGAGTTCAACAAGTTGGTA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTCAAAGTAGGGTACACATTAGAGTGTCTTTGAGTTCAACAAGTTGGTA 750
seq1 CTGTTGCAAACACCTTCTGAATTGCCAGCGCCCGGGTTTTTATGTAAAAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTTGCAAACACCTTCTGAATTGCCAGCGCCCGGGTTTTTATGTAAAAA 800
seq1 TAGAGTGGCTATGGAAGTTACACCTTCATCTGTGGGAAGTATTCTCAAAC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGAGTGGCTATGGAAGTTACACCTTCATCTGTGGGAAGTATTCTCAAAC 850
seq1 GTAGGGGTATCTTTATCTTATGTTTTCTAATGGAAGATGGCAGCCCAGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAGGGGTATCTTTATCTTATGTTTTCTAATGGAAGATGGCAGCCCAGAA 900
seq1 TCCTCAAGACAAAGCAAGGGGTATCAGCTGATGGCCGCGGGACTGATGGG 950
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCTC-AGACAAAGCAAGGGGTATCAGCTGATGGCCGCGGGACTGATGGG 949
seq1 TGTCCTGGGTTCTTTAGCTCACCAGCACTTTGCGCTCAATGGACTTTGTA 1000
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCCTGGGTTCTTTAGCTTCACAGCACTTTGCGCTCAATGGACTTTGTA 999
seq1 AATTCTCATCAGCTGTTGTAGAAGTTCCTCTGCCTGGAG-CTG-TCATCT 1048
||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||
seq2 AATTCTCATCAGCTG-TGTAG-AGTT-CTCTGGCTGGAGCCTGTTCATCT 1046
seq1 CAGCCGCTCCCTTAGAAAGTGCCCTTCAACGGACCCTGTTCACTGCTGCA 1098
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2 CAGCCGCTTCCTTAGAAGGTG-CCTTCAACGGACCCTG-TCACTGCTGCA 1094
seq1 CTTCTCAATGAATTAAAACTGACTTCTGTTCTAGTGGCAATGTGTCCTTT 1148
| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| || | || | |
seq2 C-TCTCAATGA--TTAAACTGACTTCTG-TCTAGTTGCCACTGGTTCCTG 1140
seq1 GTTTTTAGTCCACAGGTGTTG-ATTCT-CACAATGTATAAG-AAGGTGGC 1195
| | |||||| || | || || || |||| ||||||| ||||||||
seq2 G--TCAAGTCCAAGGGGGCTGTATCCTCCACATGGTATAAGAAAGGTGGC 1188
seq1 TG---CTTC-GTGGAGT 1208
|| |||| |||||||
seq2 TGTCTCTTCGGTGGAGT 1205
|
