BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328J15
Chromosome10 (Build37)
Map Location 125,550,517 - 125,668,162
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043547
Upstream geneSlc16a7, LOC100042987, EG668313, LOC100042992, LOC668317, LOC100042994, Lrig3
Downstream geneLOC668336, Xrcc6bp1, LOC622567, Ctdsp2, Avil, Tsfm, Mettl1, Cyp27b1, March9, Cdk4, Tspan31, Centg1, Os9, LOC100043028, B4galnt1, LOC100043035, C78409, D10Ertd610e, Dtx3, Pip5k2c, Kif5a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328J15.bB6Ng01-328J15.g
ACCGA115819GA115820
length1,2081,088
definitionB6Ng01-328J15.b B6Ng01-328J15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,666,959 - 125,668,162)(125,550,517 - 125,551,606)
sequence
gaattcacagcactgctattctgaaaccacagcataattttctacacata
ataaaagaaacatgaaatatggctagaaaaattgaaggcttccaagattt
actaactactcgaatactagtctaagcagtatgtttgaaagtctaccaca
ggggaaaccatttaagttggtggagggtcacacttgagatttaaaatttt
ttatttcttcacatttcttttaaaggagcaaggattcattttggcactat
tggccaaggagtttagttctgaaaaaagaagctcaaataatataaaatat
tagcgggataatgcacaggcatggtgagagcagaatgatgttatgaacaa
tggtgaaaatcacagtgatgtcctatggtgactcccgagaaccagctact
ttgttaaatgcattacacaccagctacctggtaaaatgcattacatagca
gctactttgttaaaggcattatataccagctacattgttaaagacattat
ataccagctactttgttaaatgtattacataccagctacttggttaaatg
tgttacataccagctactttgttaaaggcatataccagctactttgttaa
atgtattatataccagctactttcttaaatacattatataccaactattt
ggttaaatgtgttacataccagctacttggttaaatgcattacatatgta
atttcttgtgcaactgactccactttacaaaggggtcactgtggttcagg
gacaatagagagcaatcacacactggaacaagccctgagtgacctgtagt
gacacacttgaatctaaatgcaaattagtgaccagctgagttatttgctc
taaaagattaatcagtatttgaacctgaatacctgcactaggagtcagta
ctgtgattttattgacattattttagattatttaccatttatagataaaa
tcagtgagacacaggaatcccggctcaatgtttcccaaatcacacagtta
gaaacagaaaagctggcattgtaactgggtcccacagatctgcagactaa
gtgatgtggcggccattaatcttgtgtatcctcatgcagaagaacttgga
gtctgcctcccagcacctaaggtgggtggtttacaaactgatgtactaca
gctccagaagtttgaatctccctcttctaagttctatgagcacatatacc
tcataatt
gaattctttaggcctctttaagcgttttgtttctttcatatctctctttc
attccttttgtgaaattctgtagcatatgtcctggctcattggcgctgtc
ccataagtcccacagctttctgtgttcttaccttttccttctgtcccctt
gggtggatctggttgcttttctctttttctgtggctccagaacttggaga
tgttttttatcatttgacatgtttaacggcctttttctcttggttgagct
tggtcagtttgttcatcacaatcttccccattggttttctccatctcctt
gtagctcatggactcctctgggctttcagtcatgacgtagactgacaatc
tttgaagtcaattgtgagaactttgctacttccatggtgccatgttttcc
caattctttatagaaccttacattatctaggcaatacattcgctaatctg
cagtctgtcttggaaagacaaaggccttcagcagagtagccagatgtttt
gcaagggtctgtaaaggggcatatatatgaaaaaatatgagaacaaaatt
ctcatgatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatcc
atatatgtctatatatgcatgtttatatatagttttgtttatatgtttat
atataaatgcatgtgtgtatacatatatatacttatacacacacacatag
atatgtttcagaggattcaaggctgggacctaatgttccactattttgct
gatataatccttttatgaactattagtgtcttccaactaggagtttgaaa
atcctatctggactcattgagtgggattgctataaagggctttagagctt
cactcttcatttactatatggacaagtaaatgtaaataatttacctcggt
gaattgagagctatatttagggaaatgtacaattgtgtgttgcctgagag
gtcaaagacgggccatgtgatgtcaaaaatcctgatagcttcttagatct
tctttcttcttctctaatgtagacacccactgattattttatttattatt
atattattttgctgatgatatctgctggggagagggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_125666959_125668162
seq2: B6Ng01-328J15.b_46_1253 (reverse)

seq1  AATTATGA-GTATATGTGCTCATAGAATTTAGAAGA-GGAGA-TCAAAAC  47
      |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  
seq2  AATTATGAGGTATATGTGCTCATAGAACTTAGAAGAGGGAGATTCAAACT  50

seq1  TCTGGAGCTGTAGTTACAATCAG-TTGTAAACCACCCA-CTTAGGTGCTG  95
      ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCTGGAGCTGTAG-TAC-ATCAGTTTGTAAACCACCCACCTTAGGTGCTG  98

seq1  GGA-GCAGACT-CAAG-TCTTCTGCATGAGATTACACAAGATTTAATGGC  142
      ||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||
seq2  GGAGGCAGACTCCAAGTTCTTCTGCATGAGGATACACAAGA-TTAATGGC  147

seq1  CGCCACATCACCTTAGTCTGCAGATCTGTGGGACCCAGTTACAATGCCAG  192
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCACATCA-CTTAGTCTGCAGATCTGTGGGACCCAGTTACAATGCCAG  196

seq1  CTTTTCTGTTTCTTAACTGTGTGATTTGGGAAACATTGAGCC-GGATTCC  241
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTTTTCTGTTTC-TAACTGTGTGATTTGGGAAACATTGAGCCGGGATTCC  245

seq1  TGTGTCTCACTGATTTTATCTATAAATGGTAAATAATCTAAAATAATGTC  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTCACTGATTTTATCTATAAATGGTAAATAATCTAAAATAATGTC  295

seq1  AATAAAATCACAGTACTGACTCCTAGTGCAGGTATTCAGGTTCAAATACT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATCACAGTACTGACTCCTAGTGCAGGTATTCAGGTTCAAATACT  345

seq1  GATTAATCTTTTAGAGCAAATAACTCAGCTGGTCACTAATTTGCATTTAG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAATCTTTTAGAGCAAATAACTCAGCTGGTCACTAATTTGCATTTAG  395

seq1  ATTCAAGTGTGTCACTACAGGTCACTCAGGGCTTGTTCCAGTGTGTGATT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGTGTGTCACTACAGGTCACTCAGGGCTTGTTCCAGTGTGTGATT  445

seq1  GCTCTCTATTGTCCCTGAACCACAGTGACCCCTTTGTAAAGTGGAGTCAG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTATTGTCCCTGAACCACAGTGACCCCTTTGTAAAGTGGAGTCAG  495

seq1  TTGCACAAGAAATTACATATGTAATGCATTTAACCAAGTAGCTGGTATGT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACAAGAAATTACATATGTAATGCATTTAACCAAGTAGCTGGTATGT  545

seq1  AACACATTTAACCAAATAGTTGGTATATAATGTATTTAAGAAAGTAGCTG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATTTAACCAAATAGTTGGTATATAATGTATTTAAGAAAGTAGCTG  595

seq1  GTATATAATACATTTAACAAAGTAGCTGGTATATGCCTTTAACAAAGTAG  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATAATACATTTAACAAAGTAGCTGGTATATGCCTTTAACAAAGTAG  645

seq1  CTGGTATGTAACACATTTAACCAAGTAGCTGGTATGTAATACATTTAACA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATGTAACACATTTAACCAAGTAGCTGGTATGTAATACATTTAACA  695

seq1  AAGTAGCTGGTATATAATGTCTTTAACAATGTAGCTGGTATATAATGCCT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGCTGGTATATAATGTCTTTAACAATGTAGCTGGTATATAATGCCT  745

seq1  TTAACAAAGTAGCTGCTATGTAATGCATTTTACCAGGTAGCTGGTGTGTA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAAAGTAGCTGCTATGTAATGCATTTTACCAGGTAGCTGGTGTGTA  795

seq1  ATGCATTTAACAAAGTAGCTGGTTCTCGGGAGTCACCATAGGACATCACT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATTTAACAAAGTAGCTGGTTCTCGGGAGTCACCATAGGACATCACT  845

seq1  GTGATTTTCACCATTGTTCATAACATCATTCTGCTCTCACCATGCCTGTG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTTCACCATTGTTCATAACATCATTCTGCTCTCACCATGCCTGTG  895

seq1  CATTATCCCGCTAATATTTTATATTATTTGAGCTTCTTTTTTCAGAACTA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATCCCGCTAATATTTTATATTATTTGAGCTTCTTTTTTCAGAACTA  945

seq1  AACTCCTTGGCCAATAGTGCCAAAATGAATCCTTGCTCCTTTAAAAGAAA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTTGGCCAATAGTGCCAAAATGAATCCTTGCTCCTTTAAAAGAAA  995

seq1  TGTGAAGAAATAAAAAATTTTAAATCTCAAGTGTGACCCTCCACCAACTT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGAAATAAAAAATTTTAAATCTCAAGTGTGACCCTCCACCAACTT  1045

seq1  AAATGGTTTCCCCTGTGGTAGACTTTCAAACATACTGCTTAGACTAGTAT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTTTCCCCTGTGGTAGACTTTCAAACATACTGCTTAGACTAGTAT  1095

seq1  TCGAGTAGTTAGTAAATCTTGGAAGCCTTCAATTTTTCTAGCCATATTTC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGTAGTTAGTAAATCTTGGAAGCCTTCAATTTTTCTAGCCATATTTC  1145

seq1  ATGTTTCTTTTATTATGTGTAGAAAATTATGCTGTGGTTTCAGAATAGCA  1191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCTTTTATTATGTGTAGAAAATTATGCTGTGGTTTCAGAATAGCA  1195

seq1  GTGCTGTGAATTC  1204
      |||||||||||||
seq2  GTGCTGTGAATTC  1208

seq1: chr10_125550517_125551606
seq2: B6Ng01-328J15.g_67_1154

seq1  GAATTCTTTAGGCCTCTTTAAGCGTTTTGTTTCTTTCATATCTCTCTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGGCCTCTTTAAGCGTTTTGTTTCTTTCATATCTCTCTTTC  50

seq1  ATTCCTTTTGTGAAATTCTGTAGCATATGTCCTGGCTCATTGGCGCTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTTTGTGAAATTCTGTAGCATATGTCCTGGCTCATTGGCGCTGTC  100

seq1  CCATAAGTCCCACAGCTTTCTGTGTTCTTACCTTTTCCTTCTGTCCCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAGTCCCACAGCTTTCTGTGTTCTTACCTTTTCCTTCTGTCCCCTT  150

seq1  GGGTGGATCTGGTTGCTTTTCTCTTTTTCTGTGGCTCCAGAACTTGGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGATCTGGTTGCTTTTCTCTTTTTCTGTGGCTCCAGAACTTGGAGA  200

seq1  TGTTTTTTATCATTTGACATGTTTAACGGCCTTTTTCTCTTGGTTGAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTTATCATTTGACATGTTTAACGGCCTTTTTCTCTTGGTTGAGCT  250

seq1  TGGTCAGTTTGTTCATCACAATCTTCCCCATTGGTTTTCTCCATCTCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGTTTGTTCATCACAATCTTCCCCATTGGTTTTCTCCATCTCCTT  300

seq1  GTAGCTCATGGACTCCTCTGGGCTTTCAGTCATGACGTAGACTGACAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCATGGACTCCTCTGGGCTTTCAGTCATGACGTAGACTGACAATC  350

seq1  TTTGAAGTCAATTGTGAGAACTTTGCTACTTCCATGGTGCCATGTTTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGTCAATTGTGAGAACTTTGCTACTTCCATGGTGCCATGTTTTCC  400

seq1  CAATTCTTTATAGAACCTTACATTATCTAGGCAATACATTCGCTAATCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTTTATAGAACCTTACATTATCTAGGCAATACATTCGCTAATCTG  450

seq1  CAGTCTGTCTTGGAAAGACAAAGGCCTTCAGCAGAGTAGCCAGATGTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGTCTTGGAAAGACAAAGGCCTTCAGCAGAGTAGCCAGATGTTTT  500

seq1  GCAAGGGTCTGTAAAGGGGCATATATATGAAAAAATATGAGAACAAAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGGTCTGTAAAGGGGCATATATATGAAAAAATATGAGAACAAAATT  550

seq1  CTCATGATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCC  600

seq1  ATATATGTCTATATATGCATGTTTATATATAGTTTTGTTTATATGTTTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTCTATATATGCATGTTTATATATAGTTTTGTTTATATGTTTAT  650

seq1  ATATAAATGCATGTGTGTATACATATATATACTTATACACACACACATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATGCATGTGTGTATACATATATATACTTATACACACACACATAG  700

seq1  ATATGTTTCAGAGGATTCAAGGCTGGGACCTAATGTTCCACTATTTTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTTCAGAGGATTCAAGGCTGGGACCTAATGTTCCACTATTTTGCT  750

seq1  GATATAATCCTTTTATGAACTATTAGTGTCTTCCAACTAGGAGTTTGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAATCCTTTTATGAACTATTAGTGTCTTCCAACTAGGAGTTTGAAA  800

seq1  ATCCTATCTGGACTCATTGAGTGGGATTGCTATAAAGGGCTTTAGAGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATCTGGACTCATTGAGTGGGATTGCTATAAAGGGCTTTAGAGCTT  850

seq1  CACTCTTCA-TTACTATATGGACAAGTAAATGTAAATAATTTACCTCGGT  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTTCATTTACTATATGGACAAGTAAATGTAAATAATTTACCTCGGT  900

seq1  GAATTGAGAGCTAATATTTAGGGAAATGTACAATTGTGTGTTGCCTGAGA  949
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGAGAGCT-ATATTTAGGGAAATGTACAATTGTGTGTTGCCTGAGA  949

seq1  GGTCAAAGACGGGCCATGTGATGTCAAAAATCCTGATAGCTTCTTAAGAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGTCAAAGACGGGCCATGTGATGTCAAAAATCCTGATAGCTTCTT-AGAT  998

seq1  CTTCTTTCT--CTCTCTAATGTAGAACACCCACTTGATTATTTTATTTTA  1047
      |||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||
seq2  CTTCTTTCTTCTTCTCTAATGTAG-ACACCCAC-TGATTATTTTA-TTTA  1045

seq1  TTATTATTATTATTTTGCTGATGATATCTGCT-GGGAGAGGGAA  1090
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTATTA-TATTATTTTGCTGATGATATCTGCTGGGGAGAGGGAA  1088