BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334M12
Chromosome10 (Build37)
Map Location 95,034,896 - 95,168,317
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG628119
Upstream geneTmcc3, EG667315, 4921537D05Rik, Plxnc1, Cradd, Socs2, LOC100042004, D10Ertd322e, Ube2n, Nudt4
Downstream geneEea1, EG432491, LOC667380, Btg1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334M12.bB6Ng01-334M12.g
ACCGA120202GA120203
length914819
definitionB6Ng01-334M12.b B6Ng01-334M12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,034,896 - 95,035,810)(95,167,501 - 95,168,317)
sequence
gaattcatttaaaatattacatattttgaaaattagttaaaaatcactaa
tacattaaactatactaaaaagtggatacatatattctccaagagtcttc
aatattccagtttgacaaatgaatcagaagaatggaaaagatggaaagaa
agaacaggaaaatatcagtacacaggggcatttttaacatttcttttctt
tatttttgagacagtctcacgtagcccaggatggtcacaccttgctatat
agtcaaggatgctctgagcttctcatcgtcctgcttccacctcctgagtg
ggatcatggatgtgtgtcgccggaagtggtttccatggagcaggctaggc
aagcacggtaccaactgagccccagccccagctttcttcaagttgtgatt
gctgtgatgccagggcatgaccaaaagcaacttggtggggagagggttga
tttggcttacacatccacactgtactctatcactgaaggaagtcaggacc
agaactcagacagggcaggaacctggaggcgggagctgatgcagaggcca
tggaggggctaggggggctgctgcttcatgacttgctcatgatagctccg
ccagctgctctctcacagaacccagaaccaccagtccagggatggcacca
gccacctgcccccatcaatcactaattaagaaaatgccctaaaactggat
ctaacggaggcattttctcaattgaggttcctgcctttcctagtgtgtgt
caagttgacataaaactagccagcacaccagccatatggatgcactttaa
aaaaaaaatgaatatttcaggctcagcttgtgtacagctagttacttaaa
aaagtaaaaaccaggtttggagagatggctcaggggtaagaacacttgca
gactggcgtggtgg
gaattcaagaggcagaagcaggcagatctctgtgagttcagggccaatct
ggtctacatagagagttacagaccagccaagcctacaagtgagactctgt
ctcaatatatatttacacaatgtacacacacacacacatacaaacataca
catacccacagtgttaaggggggataggaagcagtaaatttatagaccat
tttgagaacagctaagaatctggtttgttggtggtaatgatgtctctctt
gcacacatatacacaagcgtatgcacacacacacacacacatacacacac
acacacacatagtattcaggacggcaggaagcagaaaatgtatggaccat
tttaagccatttaaagaccaactaagaatcctgtgtgttagtgatgatga
tgtcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacct
cacacctctcttccttaggctgcaagtatcaagagagttaatccttgctt
ttgactcagtcatgtgcaaggttgctctcctcggagaggttcggtgccag
catcctctttagcctttgacggcatccatccggctctgttagtgatgcca
ggaacaagaatcaggagccagttctaggacttagaatgactcactgggta
acttcggtgtggcaacaatagaaaagtgactcggttgttctgtttgtgaa
actgggacagtgatgctggcagcctgcctctcacagggatgagacaggac
cagggtttccagatctcaggggctctggggcatgggtgtttacagggggt
ggggggttggatgaagagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_95034896_95035810
seq2: B6Ng01-334M12.b_48_961

seq1  GAATTCATTTAAAATATTACATATTTTGAAAATTAGTTAAAAATCACTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTAAAATATTACATATTTTGAAAATTAGTTAAAAATCACTAA  50

seq1  TACATTAAACTATACTAAAAAGTGGATACATATATTCTCCAAGAGTCTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTAAACTATACTAAAAAGTGGATACATATATTCTCCAAGAGTCTTC  100

seq1  AATATTCCAGTTTGACAAATGAATCAGAAGAATGGAAAAGATGGAAAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTCCAGTTTGACAAATGAATCAGAAGAATGGAAAAGATGGAAAGAA  150

seq1  AGAACAGGAAAATATCAGTACACAGGGGCATTTTTAACATTTCTTTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGGAAAATATCAGTACACAGGGGCATTTTTAACATTTCTTTTCTT  200

seq1  TATTTTTGAGACAGTCTCACGTAGCCCAGGATGGTCACACCTTGCTATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTGAGACAGTCTCACGTAGCCCAGGATGGTCACACCTTGCTATAT  250

seq1  AGTCAAGGATGCTCTGAGCTTCTCATCGTCCTGCTTCCACCTCCTGAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAGGATGCTCTGAGCTTCTCATCGTCCTGCTTCCACCTCCTGAGTG  300

seq1  GGATCATGGATGTGTGTCGCCGGAAGTGGTTTCCATGGAGCAGGCTAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCATGGATGTGTGTCGCCGGAAGTGGTTTCCATGGAGCAGGCTAGGC  350

seq1  AAGCACGGTACCAACTGAGCCCCAGCCCCAGCTTTCTTCAAGTTGTGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACGGTACCAACTGAGCCCCAGCCCCAGCTTTCTTCAAGTTGTGATT  400

seq1  GCTGTGATGCCAGGGCATGACCAAAAGCAACTTGGTGGGGAGAGGGTTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGATGCCAGGGCATGACCAAAAGCAACTTGGTGGGGAGAGGGTTGA  450

seq1  TTTGGCTTACACATCCACACTGTACTCTATCACTGAAGGAAGTCAGGACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCTTACACATCCACACTGTACTCTATCACTGAAGGAAGTCAGGACC  500

seq1  AGAACTCAGACAGGGCAGGAACCTGGAGGCGGGAGCTGATGCAGAGGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCAGACAGGGCAGGAACCTGGAGGCGGGAGCTGATGCAGAGGCCA  550

seq1  TGGAGGGGCTAGGGGGGCTGCTGCTTCATGACTTGCTCATGATAGCTCCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGGGCTAGGGGGGCTGCTGCTTCATGACTTGCTCATGATAGCTCCG  600

seq1  CCAGCTGCTCTCTCACAGAACCCAGAACCACCAGTCCAGGGATGGCACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGCTCTCTCACAGAACCCAGAACCACCAGTCCAGGGATGGCACCA  650

seq1  GCCACCTGCCCCCATCAATCACTAATTAAGAAAATGCCCTAAAACTGGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTGCCCCCATCAATCACTAATTAAGAAAATGCCCTAAAACTGGAT  700

seq1  CTAACGGAGGCATTTTCTCAATTGAGGTTCCTGCCTTTCCTAGTGTGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACGGAGGCATTTTCTCAATTGAGGTTCCTGCCTTTCCTAGTGTGTGT  750

seq1  CAAGTTGACATAAAACTAGCCAGCACACCAGCCATATGGATGCACTTTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGACATAAAACTAGCCAGCACACCAGCCATATGGATGCACTTTAA  800

seq1  AAAAAAAATGAATATTTCAGGCTCAGCTTGTGTACAGCTAGTTACTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATGAATATTTCAGGCTCAGCTTGTGTACAGCTAGTTACTTAAA  850

seq1  AAAGTAAAAACCAGGTTTGGAGAGATGGCTCAGGGGTTAAGAACACTTGC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAAGTAAAAACCAGGTTTGGAGAGATGGCTCAGGGG-TAAGAACACTTGC  899

seq1  AGACTGGCGTGGTGG  915
      |||||||||||||||
seq2  AGACTGGCGTGGTGG  914

seq1: chr10_95167501_95168317
seq2: B6Ng01-334M12.g_68_886 (reverse)

seq1  CCTCTTCATCC-ACCCCCCACCCCCTGT-AACACCCATGCCCCAGAGCCC  48
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCATCCAACCCCCCACCCCCTGTAAACACCCATGCCCCAGAGCCC  50

seq1  CTGAGATCTGGAAACCCTGGTCCTGTCTCATCCCTGTGAGAGGCAGGCTG  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATCTGGAAACCCTGGTCCTGTCTCATCCCTGTGAGAGGCAGGCTG  100

seq1  CCAGCATCACTGTCCCAGTTTCACAAACAGAACAACCGAGTCACTTTTCT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATCACTGTCCCAGTTTCACAAACAGAACAACCGAGTCACTTTTCT  150

seq1  ATTGTTGCCACACCGAAGTTACCCAGTGAGTCATTCTAAGTCCTAGAACT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTGCCACACCGAAGTTACCCAGTGAGTCATTCTAAGTCCTAGAACT  200

seq1  GGCTCCTGATTCTTGTTCCTGGCATCACTAACAGAGCCGGATGGATGCCG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTGATTCTTGTTCCTGGCATCACTAACAGAGCCGGATGGATGCCG  250

seq1  TCAAAGGCTAAAGAGGATGCTGGCACCGAACCTCTCCGAGGAGAGCAACC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGGCTAAAGAGGATGCTGGCACCGAACCTCTCCGAGGAGAGCAACC  300

seq1  TTGCACATGACTGAGTCAAAAGCAAGGATTAACTCTCTTGATACTTGCAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACATGACTGAGTCAAAAGCAAGGATTAACTCTCTTGATACTTGCAG  350

seq1  CCTAAGGAAGAGAGGTGTGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGGAAGAGAGGTGTGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  400

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGACATCATCATCACTAACACACAGGATTCTTAGTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGACATCATCATCACTAACACACAGGATTCTTAGTT  450

seq1  GGTCTTTAAATGGCTTAAAATGGTCCATACATTTTCTGCTTCCTGCCGTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTTAAATGGCTTAAAATGGTCCATACATTTTCTGCTTCCTGCCGTC  500

seq1  CTGAATACTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCATA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATACTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCATA  550

seq1  CGCTTGTGTATATGTGTGCAAGAGAGACATCATTACCACCAACAAACCAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTTGTGTATATGTGTGCAAGAGAGACATCATTACCACCAACAAACCAG  600

seq1  ATTCTTAGCTGTTCTCAAAATGGTCTATAAATTTACTGCTTCCTATCCCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTAGCTGTTCTCAAAATGGTCTATAAATTTACTGCTTCCTATCCCC  650

seq1  CCTTAACACTGTGGGTATGTGTATGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGTACAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACACTGTGGGTATGTGTATGTTTGTATGTGTGTGTGTGTGTACAT  700

seq1  TGTGTAAATATATATTGAGACAGAGTCTCACTTGTAGGCTTGGCTGGTCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAAATATATATTGAGACAGAGTCTCACTTGTAGGCTTGGCTGGTCT  750

seq1  GTAACTCTCTATGTAGACCAGATTGGCCCTGAACTCACAGAGATCTGCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTCTCTATGTAGACCAGATTGGCCCTGAACTCACAGAGATCTGCCT  800

seq1  GCTTCTGCCTCTTGAATTC  817
      |||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGCCTCTTGAATTC  819