BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337I10
Chromosome10 (Build37)
Map Location 124,029,731 - 124,167,947
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAI851790, 4930503E24Rik
Downstream geneLOC671416, Slc16a7, LOC100042987, EG668313, LOC100042992, LOC668317, LOC100042994
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337I10.bB6Ng01-337I10.g
ACCGA122122GA122123
length1,152623
definitionB6Ng01-337I10.b B6Ng01-337I10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,166,796 - 124,167,947)(124,029,731 - 124,030,355)
sequence
gaattccatgctatggtggataaattatatttcactacctggtgccaaca
ggctgccactataagctaaacttctgtacaatcatcgtttttattttttc
attgattgtctagcagatcataatttactttatccttttcaagccaagaa
ggctttgtgacacgccatggtttttgctgatatttaagctgcagtattta
gtgagtgcttcaagaatgtaggatgatttaataccttcttagtgaaagca
ttggtagctatctattaatgttacaaaaccaatgtacaatgcattcagaa
aacattagtggataaatgggtttttaaattttattttctttgaggccatt
cacaagttatttttatgcctgtataacattgttacgcagtgttataaaaa
gtgttatcctatgctccattaaggaaattgttatgaatagataatgtagg
aaaaattttcctaatcctgtaggaaaataatggcatgttgtcacattacg
tgggaaataaaacatatatatttaaatgtatataaacttatatacattaa
agtgaaaacagattacttgtttaatatgtaataattaatattatatatta
tttatattaatatgtgattatttgctaacactgtaacttgtagggaaaac
atacatattgtacttattaaacatctctaaacatttgcagttgtttaaat
gagaatggctccctttgtgtcctatatttacatgcatagtcccaagttgg
tagaaccgtttcagaaagattggctgtattaggaggtaaggccttgttgg
aggtaatacatcatggggtggatcttgagaaaagcacaagccaggcccag
cttctttctctcttactccctcctggagatcaacatgtgagggctcagct
acagtttcagcaccacaagaaactgccttgcccctgccctgataatccta
gactcatcatctgaaactgcaagcaaactcccagttacagccttcttttt
ataaatctccttcatcatgatatctcttccagttcatagcaaagctgtac
ctgagacaacatcgaatcctttttgtggtgtacatcttctttgaaattga
tttctctttctataagcagcacttgtaacccctactaccagtgaaactct
ct
gaattcctatcattaaaaaaatagataatttgcaattagcctttagtata
tgagtgttgttgttacatgcttaatgtttcttgttttgttattgccaatg
gttaaaatgcatatatatatatatgtgtgtatatatatatatatatatat
atatatatatatatatatatacacacatatatatatatatatatataaac
ataaatttgaaattcatttatgtcatctaatttactgagcatcatgattt
agtttgtatatgattttgttctgggaacatttactatagacaacgaaata
tctaatacagagcttttcataactatatgctatataatttattgaagttg
tatgcaaaaagtattgaaagcagagttcctgtcacccaaaataacagagg
tgtgataggacctgtgaactactaatttagtcctgcattataagagtatc
aaactgtgtattgtaagcacctaattttttcaaaatctcataaaaatatt
tttatgtaatcactttctcaatcacttacaggtctaactcttaacttgat
ctacatttggtgaatggatagattagatatagatacagatgatatagatg
tagatgatatagatagatataga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_124166796_124167947
seq2: B6Ng01-337I10.b_46_1197 (reverse)

seq1  AGAGAG-TTCA-TGGTAGTAGGGTGTA-GAGTGCTGCTAATAGAAAGGAG  47
      |||||| |||| |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||
seq2  AGAGAGTTTCACTGGTAGTAGGGGTTACAAGTGCTGCTTATAGAAA-GAG  49

seq1  AAATCAATTTTCAAGGAGATGTAAAAAAAAAAAAAAAAGGATTCGATGTT  97
      ||||||||||  ||| ||||||    | |  | |||||||||||||||||
seq2  AAATCAATTTCAAAGAAGATGT----ACACCACAAAAAGGATTCGATGTT  95

seq1  GTCTCAGGTACAGCTTTGCTATG-ACTGGAAGAGATATCATGATGAAGGA  146
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGGTACAGCTTTGCTATGAACTGGAAGAGATATCATGATGAAGGA  145

seq1  GATTTAT-AAAAGAAGGCTGTAACTGGGAGTTTGCTTGCAGTTTCAGATG  195
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATAAAAAGAAGGCTGTAACTGGGAGTTTGCTTGCAGTTTCAGATG  195

seq1  ATGAGTCTAGGATTATCAGGGCAGGGGCAAGGCAGTTTCTTGTGGTGCTG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTCTAGGATTATCAGGGCAGGGGCAAGGCAGTTTCTTGTGGTGCTG  245

seq1  AAACTGTAGCTGAGCCCTCACATGTTGATCTCCAGGAGGGAGTAAGAGAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTAGCTGAGCCCTCACATGTTGATCTCCAGGAGGGAGTAAGAGAG  295

seq1  AAAGAAGCTGGGCCTGGCTTGTGCTTTTCTCAAGATCCACCCCATGATGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGCTGGGCCTGGCTTGTGCTTTTCTCAAGATCCACCCCATGATGT  345

seq1  ATTACCTCCAACAAGGCCTTACCTCCTAATACAGCCAATCTTTCTGAAAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCTCCAACAAGGCCTTACCTCCTAATACAGCCAATCTTTCTGAAAC  395

seq1  GGTTCTACCAACTTGGGACTATGCATGTAAATATAGGACACAAAGGGAGC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTACCAACTTGGGACTATGCATGTAAATATAGGACACAAAGGGAGC  445

seq1  CATTCTCATTTAAACAACTGCAAATGTTTAGAGATGTTTAATAAGTACAA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCATTTAAACAACTGCAAATGTTTAGAGATGTTTAATAAGTACAA  495

seq1  TATGTATGTTTTCCCTACAAGTTACAGTGTTAGCAAATAATCACATATTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGTTTTCCCTACAAGTTACAGTGTTAGCAAATAATCACATATTA  545

seq1  ATATAAATAATATATAATATTAATTATTACATATTAAACAAGTAATCTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATAATATATAATATTAATTATTACATATTAAACAAGTAATCTGT  595

seq1  TTTCACTTTAATGTATATAAGTTTATATACATTTAAATATATATGTTTTA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACTTTAATGTATATAAGTTTATATACATTTAAATATATATGTTTTA  645

seq1  TTTCCCACGTAATGTGACAACATGCCATTATTTTCCTACAGGATTAGGAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCACGTAATGTGACAACATGCCATTATTTTCCTACAGGATTAGGAA  695

seq1  AATTTTTCCTACATTATCTATTCATAACAATTTCCTTAATGGAGCATAGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTCCTACATTATCTATTCATAACAATTTCCTTAATGGAGCATAGG  745

seq1  ATAACACTTTTTATAACACTGCGTAACAATGTTATACAGGCATAAAAATA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACTTTTTATAACACTGCGTAACAATGTTATACAGGCATAAAAATA  795

seq1  ACTTGTGAATGGCCTCAAAGAAAATAAAATTTAAAAACCCATTTATCCAC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGAATGGCCTCAAAGAAAATAAAATTTAAAAACCCATTTATCCAC  845

seq1  TAATGTTTTCTGAATGCATTGTACATTGGTTTTGTAACATTAATAGATAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTTTTCTGAATGCATTGTACATTGGTTTTGTAACATTAATAGATAG  895

seq1  CTACCAATGCTTTCACTAAGAAGGTATTAAATCATCCTACATTCTTGAAG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCAATGCTTTCACTAAGAAGGTATTAAATCATCCTACATTCTTGAAG  945

seq1  CACTCACTAAATACTGCAGCTTAAATATCAGCAAAAACCATGGCGTGTCA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCACTAAATACTGCAGCTTAAATATCAGCAAAAACCATGGCGTGTCA  995

seq1  CAAAGCCTTCTTGGCTTGAAAAGGATAAAGTAAATTATGATCTGCTAGAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTTCTTGGCTTGAAAAGGATAAAGTAAATTATGATCTGCTAGAC  1045

seq1  AATCAATGAAAAAATAAAAACGATGATTGTACAGAAGTTTAGCTTATAGT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATGAAAAAATAAAAACGATGATTGTACAGAAGTTTAGCTTATAGT  1095

seq1  GGCAGCCTGTTGGCACCAGGTAGTGAAATATAATTTATCCACCATAGCAT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCCTGTTGGCACCAGGTAGTGAAATATAATTTATCCACCATAGCAT  1145

seq1  GGAATTC  1152
      |||||||
seq2  GGAATTC  1152

seq1: chr10_124029731_124030355
seq2: B6Ng01-337I10.g_63_685

seq1  GAATTCCTATCATTAAAAAAATAGATAATTTGCAATTAGCCTTTAGTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATCATTAAAAAAATAGATAATTTGCAATTAGCCTTTAGTATA  50

seq1  TGAGTGTTGTTGTTACATGCTTAATGTTTCTTGTTTTGTTATTGCCAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTTGTTGTTACATGCTTAATGTTTCTTGTTTTGTTATTGCCAATG  100

seq1  GTTAAAATGCATATATATATATATGTGTGTATATATATATATATATATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAATGCATATATATATATATGTGTGTATATATATATATATATATAT  150

seq1  ATATATATATATATATATATACCCACGTATCCTTTCTGCAT-TAACAAAA  199
      |||||||||||||||||||||| ||| |||  | | |  || ||   |||
seq2  ATATATATATATATATATATACACACATAT-ATATATATATATATATAAA  199

seq1  CAGAAATTTGAAATTCATTTATGTCATCTAATTTACTGAGCATCATGATT  249
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATTTGAAATTCATTTATGTCATCTAATTTACTGAGCATCATGATT  249

seq1  TAGTTTGTCATATGTTAAATGTTCTGGGAACATTTACATTAGACAACAGA  299
      |||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||||  |
seq2  TAGTTTGT-ATATGAT-TTTGTTCTGGGAACATTTACTATAGACAACGAA  297

seq1  ATATCTAATACAGAGCTTTTCATAACTATATGCTATATAATTTATTGAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTAATACAGAGCTTTTCATAACTATATGCTATATAATTTATTGAAG  347

seq1  TTGTATGCAAAAAGTATTGAAAGCAGAGTTCCTGTCACCCAAAATAACGG  399
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTGTATGCAAAAAGTATTGAAAGCAGAGTTCCTGTCACCCAAAATAACAG  397

seq1  AGGTGTGATAGGACCTGTGAACTACTAATTTAGTCCTGCATTATAAGAGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTGATAGGACCTGTGAACTACTAATTTAGTCCTGCATTATAAGAGT  447

seq1  ATCAAACTGTGTATTGTAAGCACCTAATTTTTTCAAAATCTCATAAAAAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACTGTGTATTGTAAGCACCTAATTTTTTCAAAATCTCATAAAAAT  497

seq1  ATTTTTATGTAATCACTTTCTCAATCACTTACAGGTCTAACTCTTAACTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTATGTAATCACTTTCTCAATCACTTACAGGTCTAACTCTTAACTT  547

seq1  GATCTACATTTGGTGAATGGATAGATTAGATATAGATACAGATGATATAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACATTTGGTGAATGGATAGATTAGATATAGATACAGATGATATAG  597

seq1  ATGTAGATGATATAGATAGATATAGA  625
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGATGATATAGATAGATATAGA  623