BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347O21
Chromosome10 (Build37)
Map Location 91,386,158 - 91,538,111
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041799
Upstream geneAnks1b, Apaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
Downstream geneLOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1, Gm872, 4930485B16Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347O21.bB6Ng01-347O21.g
ACCGA129382GA129383
length9151,112
definitionB6Ng01-347O21.b B6Ng01-347O21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,537,199 - 91,538,111)(91,386,158 - 91,387,276)
sequence
gaattctgccttagacaaaggaagtgcttggagccccaccacacctaaaa
ccatgctttgaaggatctgccaagctcacttttaatcatgagaaagaaat
tacccacatggagacagcagaaaatgagaaagtagagatcgtgctgcgaa
taattccagcgagtgccaaggggctagttgaggaatggcttcatgaggtg
aatatctttagcttgtacttagggtttggttagcgtataatcattttctc
ttttaggagcgaatacaatcttaagtgtatttcccatccaagcaccgctc
agggcatttgtcagaatgttgacagatttaatatcagcctcgtcctagct
gttatttatgatgactaattttacatttataaatatgcagaaatcaatgt
aggtggaaaggctctctgagccccagtgtctgtcgctcactgtctgtctt
catgtgcagcgctctactgtgtgacctgtccagtgctgtatgtctctgtg
tatgtgtgtgctttcgttgtctcttctctgttgtgaatgtgcactgggag
aattagccttatgataggatcccaaaagatgggagccaagtctttcattt
catttctgggaaaacaaaagaagtttatcaaatcattttcagtttgtact
gaggagggtaccaatcgggtctcagtcgtcatagggcaaagcaaccagga
ttcaaattgaacatcatgttcagtgtcaaattagttacaagccccccacc
ccaccccaccccaccccacacacacctccttcatggttgctggctgaact
tctttatgtttgtttttaaagggtggggggtggggggctgcctgaattca
tccacagtatcatgtagcttatctattggttcatttttttctaaaatcat
attcaagaataatac
gaattctctggaaaataaaaaattgatattggaggaagcccttcccctcc
aggctaattctctattgtacccctccctgagcaaatattcctgaatctaa
tcacctttcatccttgcctcagcaacatctccttatgtaagctcggcata
tttagaatcccaacaagaaaaaggccagggcatttatagttgtgacccac
acgatttaaagctagctgggagtctggcaaaacacagtggcatgctgaag
ttatttccagaacagcgggcgtctcttcaagcaaaccagctcaaagatgt
caaactagccagcccatcttctcaagcacagttcttttaagactgagcaa
atggtagggaaaaaatttaatcttctcatatatccaaattaattaaccag
caagaatttattgcttgccacgagtcaggctataaaagagacctcatcag
tagcttggaatctggagttgaattttatgggtttgagacccagcttcatt
atttattggcagggagactttagcaagttacttaacttcctcatgctgtg
cctcagtttcctcttcaagaaactgttgataaaaattagacacacaccat
caagctatcaatataattaatttagttcattcacaacaggtgctagtaaa
tcacgtggtttctagtaagaggttataaatactagttcctattatagctc
tagcacctactccaactctcccatattgtcaatgtgagctaggaacacaa
gctctcaagaatcttatgttcaaatgagagatatcaaagacatataagac
aagagaaataacatactatggaaagcacacatacaaatgtatgtgtatta
gccatgaatggaccaaatatacagttctcattgggcatctatgtagatag
acaaaggtttcaagggaactgcagtgctcatgggtagactagttgtccat
atgaaggatcattattcagcaaatgttcatgaagtatttgagagactgta
gtcaaagtttgactcataagctaaaatctttaatatgaaataaaatatat
taagaatcagttatatttaatgctaatggtagaataaaacctgtctgatg
tctcaatgtttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_91537199_91538111
seq2: B6Ng01-347O21.b_52_965 (reverse)

seq1  TATTTTTCTTGAATGTGATCTTTAGAAAAAAATGAACCAA-AGAAAAGCT  49
      |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  TATTATTCTTGAATATGAT-TTTAGAAAAAAATGAACCAATAGATAAGCT  49

seq1  ACATGGTACTGTGGATGAACTCAGGCAGCCCCCCA-CCCCCACCCTTTAA  98
      ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACATGATACTGTGGATGAATTCAGGCAGCCCCCCACCCCCCACCCTTTAA  99

seq1  AAACAAACATAAAGAAGTTCAGCCAGCAACCATGAAGGAGGTGTGTGTGG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACATAAAGAAGTTCAGCCAGCAACCATGAAGGAGGTGTGTGTGG  149

seq1  GGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGGGCTTGTAACTAATTTGACACTGAACAT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGTGGGGTGGGGTGGGGGGCTTGTAACTAATTTGACACTGAACAT  199

seq1  GATGTTCAATTTGAATCCTGGTTGCTTTGCCCTATGACGACTGAGACCCG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTCAATTTGAATCCTGGTTGCTTTGCCCTATGACGACTGAGACCCG  249

seq1  ATTGGTACCCTCCTCAGTACAAACTGAAAATGATTTGATAAACTTCTTTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTACCCTCCTCAGTACAAACTGAAAATGATTTGATAAACTTCTTTT  299

seq1  GTTTTCCCAGAAATGAAATGAAAGACTTGGCTCCCATCTTTTGGGATCCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCCCAGAAATGAAATGAAAGACTTGGCTCCCATCTTTTGGGATCCT  349

seq1  ATCATAAGGCTAATTCTCCCAGTGCACATTCACAACAGAGAAGAGACAAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAAGGCTAATTCTCCCAGTGCACATTCACAACAGAGAAGAGACAAC  399

seq1  GAAAGCACACACATACACAGAGACATACAGCACTGGACAGGTCACACAGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCACACACATACACAGAGACATACAGCACTGGACAGGTCACACAGT  449

seq1  AGAGCGCTGCACATGAAGACAGACAGTGAGCGACAGACACTGGGGCTCAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCGCTGCACATGAAGACAGACAGTGAGCGACAGACACTGGGGCTCAG  499

seq1  AGAGCCTTTCCACCTACATTGATTTCTGCATATTTATAAATGTAAAATTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTTTCCACCTACATTGATTTCTGCATATTTATAAATGTAAAATTA  549

seq1  GTCATCATAAATAACAGCTAGGACGAGGCTGATATTAAATCTGTCAACAT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCATAAATAACAGCTAGGACGAGGCTGATATTAAATCTGTCAACAT  599

seq1  TCTGACAAATGCCCTGAGCGGTGCTTGGATGGGAAATACACTTAAGATTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACAAATGCCCTGAGCGGTGCTTGGATGGGAAATACACTTAAGATTG  649

seq1  TATTCGCTCCTAAAAGAGAAAATGATTATACGCTAACCAAACCCTAAGTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCGCTCCTAAAAGAGAAAATGATTATACGCTAACCAAACCCTAAGTA  699

seq1  CAAGCTAAAGATATTCACCTCATGAAGCCATTCCTCAACTAGCCCCTTGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTAAAGATATTCACCTCATGAAGCCATTCCTCAACTAGCCCCTTGG  749

seq1  CACTCGCTGGAATTATTCGCAGCACGATCTCTACTTTCTCATTTTCTGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCGCTGGAATTATTCGCAGCACGATCTCTACTTTCTCATTTTCTGCT  799

seq1  GTCTCCATGTGGGTAATTTCTTTCTCATGATTAAAAGTGAGCTTGGCAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCATGTGGGTAATTTCTTTCTCATGATTAAAAGTGAGCTTGGCAGA  849

seq1  TCCTTCAAAGCATGGTTTTAGGTGTGGTGGGGCTCCAAGCACTTCCTTTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCAAAGCATGGTTTTAGGTGTGGTGGGGCTCCAAGCACTTCCTTTG  899

seq1  TCTAAGGCAGAATTC  913
      |||||||||||||||
seq2  TCTAAGGCAGAATTC  914

seq1: chr10_91386158_91387276
seq2: B6Ng01-347O21.g_65_1176

seq1  GAATTCTCTGGAAAATAAAAAATTGATATTGGAGGAAGCCCTTCCCCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGGAAAATAAAAAATTGATATTGGAGGAAGCCCTTCCCCTCC  50

seq1  AGGCTAATTCTCTATTGTACCCCTCCCTGAGCAAATATTCCTGAATCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAATTCTCTATTGTACCCCTCCCTGAGCAAATATTCCTGAATCTAA  100

seq1  TCACCTTTCATCCTTGCCTCAGCAACATCTCCTTATGTAAGCTCGGCATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTTCATCCTTGCCTCAGCAACATCTCCTTATGTAAGCTCGGCATA  150

seq1  TTTAGAATCCCAACAAGAAAAAGGCCAGGGCATTTATAGTTGTGACCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAATCCCAACAAGAAAAAGGCCAGGGCATTTATAGTTGTGACCCAC  200

seq1  ACGATTTAAAGCTAGCTGGGAGTCTGGCAAAACACAGTGGCATGCTGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATTTAAAGCTAGCTGGGAGTCTGGCAAAACACAGTGGCATGCTGAAG  250

seq1  TTATTTCCAGAACAGCGGGCGTCTCTTCAAGCAAACCAGCTCAAAGATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCCAGAACAGCGGGCGTCTCTTCAAGCAAACCAGCTCAAAGATGT  300

seq1  CAAACTAGCCAGCCCATCTTCTCAAGCACAGTTCTTTTAAGACTGAGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTAGCCAGCCCATCTTCTCAAGCACAGTTCTTTTAAGACTGAGCAA  350

seq1  ATGGTAGGGAAAAAATTTAATCTTCTCATATATCCAAATTAATTAACCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGGGAAAAAATTTAATCTTCTCATATATCCAAATTAATTAACCAG  400

seq1  CAAGAATTTATTGCTTGCCACGAGTCAGGCTATAAAAGAGACCTCATCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATTTATTGCTTGCCACGAGTCAGGCTATAAAAGAGACCTCATCAG  450

seq1  TAGCTTGGAATCTGGAGTTGAATTTTATGGGTTTGAGACCCAGCTTCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTGGAATCTGGAGTTGAATTTTATGGGTTTGAGACCCAGCTTCATT  500

seq1  ATTTATTGGCAGGGAGACTTTAGCAAGTTACTTAACTTCCTCATGCTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTGGCAGGGAGACTTTAGCAAGTTACTTAACTTCCTCATGCTGTG  550

seq1  CCTCAGTTTCCTCTTCAAGAAACTGTTGATAAAAATTAGACACACACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGTTTCCTCTTCAAGAAACTGTTGATAAAAATTAGACACACACCAT  600

seq1  CAAGCTATCAATATAATTAATTTAGTTCATTCACAACAGGTGCTAGTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTATCAATATAATTAATTTAGTTCATTCACAACAGGTGCTAGTAAA  650

seq1  TCACGTGGTTTCTAGTAAGAGGTTATAAATACTAGTTCCTATTATAGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGTGGTTTCTAGTAAGAGGTTATAAATACTAGTTCCTATTATAGCTC  700

seq1  TAGCACCTACTCCAACTCTCCCATATTGTCAATGTGAGCTAGGAACACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACCTACTCCAACTCTCCCATATTGTCAATGTGAGCTAGGAACACAA  750

seq1  GCTCTCAAGAATCTTATGTTCAAATGAGAGATATCAAAGACATATAAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCAAGAATCTTATGTTCAAATGAGAGATATCAAAGACATATAAGAC  800

seq1  AAGAGAAATAACATACTATGGAAAGCACACATACAAATGTATGTGTATTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAATAACATACTATGGAAAGCACACATACAAATGTATGTGTATTA  850

seq1  GCCATGAATGGACCAAATATACAGTTCTCATT-GGCATCTATGTAGATAG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCCATGAATGGACCAAATATACAGTTCTCATTGGGCATCTATGTAGATAG  900

seq1  AC-AAGGTTTCAA-GGAACTGCAGGTGCTCATGGGTAGACTAGTTGTCCA  947
      || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGTTTCAAGGGAACTGCA-GTGCTCATGGGTAGACTAGTTGTCCA  949

seq1  TATGAAGGATCATTATTCAGCAAATGTTCATGAAGTATTTGAGAGACTGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAGGATCATTATTCAGCAAATGTTCATGAAGTATTTGAGAGACTGT  999

seq1  AGTCAAAGTTTGACTCATTAAGCTAAAATCTTTAATTATGGAAATAAATA  1047
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||
seq2  AGTCAAAGTTTGACTCA-TAAGCTAAAATCTTTAA-TATGAAATAAAATA  1047

seq1  TATT-AGAATCAGTTATATTTTAATGCCTAATTGTAGGAATAAAAACCTG  1096
      |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||
seq2  TATTAAGAATCAGTTATA-TTTAATG-CTAATGGTA-GAAT-AAAACCTG  1093

seq1  TCCTGATTGTTCTCATATGTTTG  1119
      | |||||   ||||| |||||||
seq2  T-CTGAT--GTCTCA-ATGTTTG  1112