BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-084N17.T7 (MSMg01no084_n17.b1) | MSMg01-084N17.TJ (MSMg01no084_n17.g1) |
ACC | AG304596 | AG304597 |
length | 718 | 712 |
length of high quality (start - end) | 562 (37 - 598) | 416 (66 - 481) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no084_n17.b1 PHD_FILE: MSMg01no084_n17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:35:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no084_n17.g1 PHD_FILE: MSMg01no084_n17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:35:00 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAAGG
CCCATACCCAAACATAATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCAACA
TCAAAGTAAATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACT
AGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAACATAGTACTTGAAGT
ATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCAAGGGGATACAAATTG
GAAAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATAT
ATAAGTGACCCTAAAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATAAACAG
CTTTGGTGAAGTAGCTGGATATAAAATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCT
TTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAATTAGGGAAACAACA
CCGTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATATCTCGGCGTGACTCTAAC
TAAGGAAGTAAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCAAGTCTCTGAAGAAAG
AAATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATT
GGCAGGATCAACATTGTAAAAATGGCTATCTTGCCCAAAGCAATCTACAG
ATTCTATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCAATTCTTCAACGAAATAG
AAGGAGCAATTTGCAAAC
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXTCCTGTAGTATTGTCTCACCATTGCGTGTTGTCTC
ATGGAATTTATGCCTTATTGTTTAGTGACCACTTTTTTTTAAGGCCTACT
TCCTTTAGGTACAATAATGTGGAGTTGTGTTCAGTGATTCTTAGTCTTCT
TGTATATGAATTAGTCATTAATGTAAGACCGTGAATCAGGCAGAGGGGAT
TCGTCTCTGACCATCGCTTAGCTTTTGACTTTTGGTTTGGCTCGGTTTTT
TGGTTTTAACCATAATTTGTCCTGGTAAGGCTTATATCAATGTTTGAATA
CCCAATATATTTTGTCTCTTATCTCTATGATATAGGTATTATTTATAAGG
GCCTAGCGCACAATTTCTGCAGTATTTCTGCTGAATTTGACAATCGGTTA
CCATTTCATTGAAAACTTATGAATATATATATATTCTTTTACTCCTAATC
CTGGTTGGAAGTTTGTTAATTCTCCAAATAAAGCAGTAGCTAATATCACT
TTGGCAACTGAACAAAAAATTGTTTGCTCACTATGAGACAAACTGGAATA
AAAATAAGGAGTCGCTACTGCAATTCCCAACCCTACAGCTGGGGAAAGTC
AGTCTTGGAATGATATCCAAGACCCTCCAGCTGTCTGCCAAAAGGGATTT
GCTGGTTAATCA
|
quality values | Open.Hide.36 39 39 39 35 32 15 19 9 9 9 19 25 47 48 48 29 28 28 28 28 23 23 11 11 9 9 9 9 16 15 14 14 15 19 19 26 39 47 47 36 36 36 36 53 38 47 47 37 48
37 37 25 25 22 24 24 19 17 15 19 23 31 33 33 33 48 48 48 48 48 53 53 53 53 53 53 57 40 40 40 37 37 36 48 48 57 48 48 48 42 48 48 57 57 57 54 68 50 50
50 41 41 41 54 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 48 57 57 54 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 54 57 57 57
50 50 57 57 57 57 59 54 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 57 57 52 52 62 62 52 52 52 52 52 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52
52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 52 62 62 52 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 52 62 44 43 43 35 35 35 43 43 62 62 52 52 52 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 52 45 45 52 43 43 36 26 26 26 44 44 59 43 38 26 26 43
44 57 68 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 50 38 38 42 43 43 43 39 39 39 43 44 42 43 43 44 43 42 37 35 43 43 52 57
37 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 59 32 32 20 28 28 42 42 48 48 54 54 59 59 47 35 35 35 44 48 57 57 57 48 48 48 57 57 57 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57
48 46 43 43 43 42 42 37 47 43 48 43 48 43 48 39 37 37 30 30 32 42 43 43 43 43 43 43 39 39 35 28 28 32 32 33 33 33 33 33 37 59 31 28 23 31 25 30 33 32
28 25 35 34 34 28 23 23 23 28 32 30 30 33 34 30 18 14 14 23 20 28 28 32 27 28 31 31 39 36 36 33 36 32 31 31 39 41 47 47 37 37 37 31 19 11 11 13 22 15
25 22 28 22 18 16 16 16 12 12 14 31 34 37 33 30 28 22 19 15 19 23 12 9 9 11 11 20 30 35 23 23 14 10 9 8 10 19 28 30 31 23 23 23 17 12 12 22 22 14
19 18 15 10 10 10 13 23 30 28 28 22 26 28 25 32 14 15 8 8 8 19 16 15 19 23 20 18 12 17 12 15 12 12 13 13 12 10 11 10 9 9 21 19 10 12 10 13 10 10
10 10 10 10 15 15 10 10 10 12 17 17 19 13 9 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 13 10 12 18 23 39 47 43 41 41 43 48 48 48 47 59 59 30 30 11 11 9 12 12 12 10 11 12 12 12 11 15 15 15 30 27 33 36 36 57 53 53 57 53 53 50 50 28
26 18 23 12 14 15 12 12 20 14 18 20 24 31 31 48 59 59 59 48 57 57 57 57 50 50 47 50 47 43 50 53 53 53 50 50 68 54 57 54 54 54 59 59 68 68 68 51 51 50
50 50 50 68 68 68 68 68 50 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 37 43 43 57 57 47 47 47 42 48 41 41 41 57 59 68 68 68 59 59 59 50 48 48 48 59 59 59 59 57 57
57 57 59 59 59 59 57 57 52 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 52 52 52 52 59 59 68 59
59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 52 52 52 62 62 62 52 62 62 44 43 26 26 36 34 33 33 33 43
43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 47 59 35 35 35 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 57 52 52 52 59 28 19 10 10 10 19 30 43 52 52 59 59 59
57 52 43 43 57 57 57 57 57 57 38 38 13 13 13 18 38 43 31 31 43 27 27 13 13 18 24 43 43 43 36 36 43 50 57 57 57 43 43 29 29 33 44 44 44 44 43 57 50 57
57 50 43 37 37 42 44 42 43 43 44 42 39 35 35 35 44 42 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 39 39 37 22 22 12 12 13 27 30 43 47 47 43 43 43 39 36 39 39
36 36 33 23 19 8 8 8 8 10 11 12 19 27 43 59 40 39 39 36 28 28 22 24 30 37 43 43 41 41 41 37 34 25 25 33 37 39 41 41 41 41 40 39 30 30 18 12 12 25
25 41 41 41 39 47 39 43 43 59 43 43 40 39 39 34 33 34 31 25 20 14 14 21 27 34 47 42 26 19 10 10 15 10 10 10 10 11 19 24 32 37 59 43 43 30 19 10 10 10
11 14 6 6 6 8 8 16 19 16 19 16 22 16 16 16 11 11 11 19 28 28 12 12 11 16 13 11 11 12 12 11 8 8 8 8 9 11 11 18 10 9 9 11 10 19 26 43 43 39
39 37 28 28 24 24 20 18 12 19 11 13 15 14 14 14 14 19 16 22 29 29 37 27 27 14 14 14 17 15 14 14 14 21 19 20 21 21 29 26 28 20 20 20 24 24 30 19 16 8
8 8 9 14 15 12 12 11 18 8 8 8 8 8 8 10 16 22 22 19 14 11 11 15 19 12 12 12 14 14 14 22 24 19 22 19 12 12 11 15 15 12 13 13 12 19 19 19 16 10
10 9 10 10 10 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 11 12 9 12 14 9 9 10 8 10 9 11 12 12 10 10 12 10 10 10 13 11 11 11 10 10 11 11 8
10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 |