BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-097J23.T7 (MSMg01no097_j23.b1) | MSMg01-097J23.TJ (MSMg01no097_j23.g1) |
ACC | AG314006 | AG314007 |
length | 737 | 941 |
length of high quality (start - end) | 283 (126 - 408) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no097_j23.b1 PHD_FILE: MSMg01no097_j23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:54:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no097_j23.g1 PHD_FILE: MSMg01no097_j23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:54:26 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | AGGGAAAGGGTAACGGGGGTTATGGGGTAGTCAACGAACCCCCAGGGATC
TGGGCCACTATAATTGCGGCGCTAAACGACTCCTATTTCAAAAGAGCGCG
GAATTCATTCTCCTCGAAAACTTTCATAAATAAAGATAACACAGTTGGGG
ATGTTGAGATTTGATTTTATGCTCACCCAGAATGACGGAATTCATTTCTC
CAAACTTTCCAGGTTGAGAACACACAAATGTATACTGTGTATTTGGTTGC
TTCAATGTTCCGTGTTTGTAAGAGAGATGAATGTGTATGTGAGTGTGTGT
GGATGCAGGCTAGTGCCACTGTATCCTGTGTGCAGGTCAGAGGCCAATCT
TAGGTGTTCACCCTCACTTTTTCACTTGTTTAAGACAGGTCTCTTGGTTG
GCTGACCCTTGAGCTCTTGGAGATCCTCCTGCCTCTGGCTCCCACTTCCT
GCAAGACCACTGAGCTCCCTCATGTGGCCATTACTCTGGTTCTGGGTATC
CAAACGCAGATTACCTGGCTTGCGTGTCGAGTGCATTTACACACAGCCAT
CCCTGACCCTAGGGTTATTAATTTGGACACTTTTCAATAGCGTGCACCCC
TGATAACATAAAGGAAAGGTAACGCGTTAATATAAGGTAAGTTTATGGAA
GCGGTTTAATGTCTATTAGAGGTACTGAATGGGAAAACCGAGGCCAAAAA
AATATTACCCTGTAGGTTAAGCCATCTCATTCCTGGG
| CGCCCCCCAAAAACCCAAAACTTTCCCATTACTCCCCGGCCCCCCTTCCC
CACCCCCCTGCCGATGATACGCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCAATTCCCGGCAGCCAGGG
ACCCTAAAGTGGAGACTTTGTCCTCCAAAGAGGGTTGGCCCAAGCGTGAG
AAGGGCGTATAGTCTGCCGTTCCACGCAAATTCCGTCTGTAATTTCGCTA
AGAACTCCTGGAACGCAATGTCTGCCACCAAGGTAAGGACTTTTGCATGA
ACGTCCCCCAGCGTTCCCCTCCAACACTTTAGCTCTTCTCCCTGGCCGTG
CAGCGAACCGGCCAGCCTGTGACTATACTAGCGCTAGACTTGGCAGTATG
GGACTCCCATGCCACACTTATATCGGTATTTACCCACACGCTCCATTCGC
CCCCCACAATGTTTACTTCTTGCGCCCTCTCCCGCCAAAAGTTCCTACCG
GCCCGCCCGCCCAATCTGCCTAATTTGCGCTCAAAGCCCTCCCACACCCT
GGCCTGTGATACCACTTGCCAGCCCACTCTCCCCCTTTGAGGCAGCCTCG
CCGCGCATCACGCCCCTTCCCCGTGCACCGCACAAGATCCACCCCCCTAC
CCCCCATATACACCTTCAGACACCCACCTTCACTTGGTGCCGCTCCAGGT
ATCAACCATTCGCCCCTACTCCTCTCGCATATACTTCCCCCCGATGGCGG
TGAGCACGACCCGCCTCCAGGGCACCCCCACCCCGTTTGCCACTCCTTCA
AACATGCAGCCCACCCCTTCCCCACCCCAACAATGGGCGCGCTTTCCCGG
CTCCTCCCGGTCCCCTATCTGTCACCTCCGCTATTCGGTTTCACGCCCTC
CAACCCCCCCCCATTGTCACCGCCTCACCACCGCCCATAGT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 10 11 9 9 9 10 10 10 11 11 10 17 12 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 12 11 8 8 8 14 16 12 21 8 8 8 10 15 19 19 15 11 11 10 9 9 9
10 10 13 11 11 9 9 9 17 11 12 12 14 15 25 22 23 17 9 9 9 14 21 12 12 10 15 15 23 21 10 10 10 15 10 9 12 12 8 8 6 6 6 8 6 6 11 9 21 21
28 28 28 28 33 31 30 24 15 15 9 6 6 6 6 8 8 10 16 15 21 18 17 16 11 13 19 30 39 53 47 47 47 43 43 42 42 31 31 25 25 26 36 40 54 54 57 54 37 33
33 33 26 26 24 25 16 26 26 41 41 43 48 50 50 50 43 40 28 25 25 28 32 25 44 44 57 48 48 41 41 41 41 47 47 47 47 47 47 47 47 57 47 48 48 57 57 57 57 57
48 44 44 43 43 43 59 57 50 50 35 42 32 44 44 57 54 52 52 57 57 52 52 52 52 43 43 37 43 37 52 57 57 57 44 44 23 27 23 43 43 43 43 43 43 41 43 43 52 52
52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 44 43 43 43 33 33 43 42 42 42 43 43 52 52 46 57 50 54 50 50 46 43 42 35 35 37 32 32 20 20 20 31 32 42 35 35 33 33 33 41
32 30 30 32 32 43 41 36 28 28 28 36 32 35 35 37 41 41 23 28 23 36 37 46 43 42 42 24 24 12 12 13 30 30 37 30 30 30 30 30 30 42 39 39 39 39 34 39 35 26
26 13 13 12 12 12 18 25 34 39 32 36 36 37 22 24 13 12 13 16 14 14 14 15 24 23 28 25 28 28 29 31 20 20 20 32 30 37 20 21 20 32 32 43 37 32 20 20 15 26
23 30 28 23 23 14 14 13 13 11 17 11 11 11 12 25 25 19 11 11 12 12 12 19 22 34 36 37 33 33 30 30 30 32 32 32 32 40 39 39 47 39 39 30 30 30 41 30 23 21
11 11 11 17 18 22 24 37 30 28 28 29 19 15 15 15 23 28 32 30 28 21 24 14 14 14 13 13 12 12 12 18 18 18 18 18 18 14 24 26 35 33 29 24 15 13 13 13 21 21
28 34 34 21 21 12 12 11 15 11 16 11 11 11 18 16 12 12 13 18 18 12 12 11 11 11 11 11 11 21 15 12 12 17 16 20 22 29 15 13 11 10 10 10 10 10 10 19 29 28
23 23 20 20 21 22 19 26 15 10 10 10 11 14 12 19 19 23 24 28 23 18 18 12 12 12 15 11 12 12 13 13 10 10 10 9 9 10 19 12 13 18 18 11 10 10 8 8 8 10
12 13 13 11 11 12 12 12 15 11 11 10 13 13 11 14 10 11 11 11 15 10 8 8 8 8 8 10 9 10 9 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 11 11 12 12 8 8 8 8 8
8 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 11 12 16 12 11 11 11 11 11 8 8 6 7 8 8 7 7 9 9 16 12 14 12 15 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 25 22 25 16
10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 16 14 18 9 9 9 11 12 13 10 8 8 8 10 10 | Open.Hide. 7 7 6 7 7 9 12 12 10 21 21 8 6 6 8 8 9 13 13 17 14 14 10 12 17 15 12 10 9 8 8 8 8 8 11 11 8 7 9 9 13 13 8 8 7 7 8 10 13 15
10 11 10 17 19 19 22 15 10 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 10 6 6 6 8 18 10 12 12 12 15 18 12 11 12 17 9 8 8 8 8 10 8 6 6 7 7 6 6 9 9
9 10 10 12 15 11 11 11 17 15 23 21 19 11 19 18 21 21 23 19 9 7 8 8 12 25 11 12 9 9 10 10 8 8 9 11 13 19 17 16 16 19 19 17 17 22 26 15 13 8
8 8 8 12 15 12 21 28 14 9 9 9 9 14 29 21 21 19 10 8 7 7 15 15 29 25 21 21 18 18 15 20 12 18 18 24 17 16 14 14 14 17 12 13 8 10 13 15 22 22
22 28 25 22 12 12 12 19 12 19 11 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 15 16 12 12 12 20 20 21 15 12 10 10 10 11 10 13 6 6 8 12 21 13 11 9 9 10 15 22
12 13 13 28 22 13 13 6 7 8 10 8 8 6 6 8 13 26 19 22 13 14 11 15 12 9 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 18 11 10 7 7 8 8 8 6 6 10 10 21 13
12 12 12 10 9 9 9 18 10 8 8 8 8 8 10 25 13 8 8 8 8 8 10 11 6 6 6 13 15 10 8 8 8 6 6 6 8 10 11 13 10 10 10 16 16 15 15 13 13 10
11 8 11 8 10 15 15 15 19 16 14 14 10 10 10 11 9 9 12 12 14 15 11 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 11 9 10 9 9 10 13 10 10 10 10 16 13 9 9
8 6 8 9 9 9 12 18 17 17 11 9 9 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 8 10 10 8 8 8 8 10 9 10 12 12 10 8 8 8 8 8
8 10 16 10 14 16 20 19 17 31 20 20 14 13 13 8 8 8 8 9 9 10 12 10 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 10 16 19 10 9 9 10 10 9 6 6 7 6 8 8
10 8 10 10 10 8 12 10 14 12 13 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 12 8 8 8 8 8 11 11 14 8 8 10 6 13 8 9 12 12 11 10 9 9 8 11 10 11
11 11 15 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 9 9 10 8 8 8 11 11 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 9 9 9 9 13 13 11 11
11 17 23 15 13 13 10 10 11 13 9 9 9 15 15 15 14 12 9 6 12 6 6 8 7 6 6 6 10 7 10 12 10 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 8 10 9 9
14 14 12 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 10 8 10 9 9 6 6 8 15 15 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11
8 8 11 9 8 10 9 9 10 13 11 11 11 17 18 10 6 6 6 10 7 9 10 10 10 9 9 9 16 10 8 8 8 8 8 8 11 8 11 14 14 12 11 11 11 13 11 12 6 6
6 6 8 10 8 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 9 10 8 8 8 6 6 8 7 12 14 13 8 8 6 6 7 9 10 10 8 8 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 7 10 8 10 10 8 10 10 10 14 9 10 15 22 14 13 7 7 10 15 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 7 6 6 8
6 8 9 9 9 9 11 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 10 8 9 9 9 10 10 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10
6 6 6 6 7 7 19 19 20 21 8 8 6 6 6 6 8 8 13 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 9 8 8 8 8 |