BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-102E16.T7 (MSMg01no102_e16.b1) | MSMg01-102E16.TJ (MSMg01no102_e16.g1) |
ACC | AG317478 | AG317479 |
length | 719 | 709 |
length of high quality (start - end) | 182 (128 - 309) | 79 (161 - 239) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no102_e16.b1 PHD_FILE: MSMg01no102_e16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:00:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no102_e16.g1 PHD_FILE: MSMg01no102_e16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:00:50 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTTCAAGAACAGGCGCGGAATTCCA
TTCTATTACCTCAACCTCAGCCTCTAACATACTTATTAACAACTGACAAA
GCTTCACAAATGTCCCACCTAGATGTTATTTCTTATGCTTTCAGAAACAG
AATTATAATAAAATAAAAGGTCTGGTATCTGTATGCATAAAAACGCCTTT
TCAAAAACTTTTCAAAAACTATTTCAAAAACAAAATTCTCTGTGCCCTAT
TCCTTCTAAATTACAAGGCACAGTTTTAAATATTCTCCTGGATCTTAAAA
TGATCTAAGTGATTTTTTTTTTGAAATTATTTTGTGCATGCTATCAGATG
CTTGGGTCAGAATACCTTGCTGACTCGTCTAGTTGTATAATTTTAAGTAT
GTTTTTCAATTTTCTTTAAGCCCCATTATGTTCATTGATAACAATAAAGA
CAATTAATGACCCCCTAATATTTTATTACACAATTAAATGGAAATAGCAC
TCAAAAAGCACTTAACTCACAACGCTCCCAAGGTTGTCCAAACTATCATT
AATATTCCTAACACCTGGCTATGTTTCCTGCCATAATGCACCGATTCAAA
ATACACAAATTATGTATTATTAAAATACCTTTTATCTTCCCCCACTTTCG
CAACTTTGACTTCCCCTTTAACATTCTTCTGCTATTTTACCCCCCTCATT
TTGTTATTTTCGCCAACCC
| ATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXTCTCTTAAGATGAAACGAACTTTCCTTTCTTTC
AGAGAAGGTTCGACCCCCTTTGAAGTATTAAATATGTAAGATCACCAGAA
AGGCAGAGGGGACAACATAGACTGATTTTATTGGCTACCACTTCAATGCT
TCTTGGGAAAAAATGTATTAATAAGGTAGATTGCGAAACAGAAGGATACT
CACGGTCCTCCTCCAGCCCCAGCACATGTACCCATGCCCCCAAGCACTGC
GCACAGACACTGTTTGTCTACACAAGCTCACAAATCTCTGCATTTATCTG
GCATCTTTTATTACCTCCCCCCGCCTAATTTATGGGCAATTTAAATGTTA
TCTCCTGCATAATTATAATGTAATACCAGAACCGGTTTGTGAAGCATCCA
TCCTCCAATTTTTCAATACCGCTTCATCACACTAACTGCCCACCTCCTAT
TATTTTCTTCTGTGAAAGCAAAGCGCGTAATTGCTAACCCAATTTTCTAG
ACCCTATTGTAAATTTATACATTTCTCTTCAAACAGCTCAGCATTCATCT
CGAAAACAATAATATTCCCCTCTACACCCAACCATTATTCACCCTCTCAT
CCAGTTTTACTCACCTTCCCCGCTTCCCTGGCTTATCACCACACTATCTG
CCTTCAAAA
|
quality values | Open.Hide.13 17 17 20 20 16 16 13 12 8 13 12 10 10 21 21 22 19 12 19 9 13 13 23 23 20 24 17 15 9 9 6 6 6 6 6 6 6 8 13 17 24 33 33 33 33 31 28 26 25
25 19 21 11 11 13 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 12 12 10 9 15 30 43 43 48 33 39 30 28 33 29 36 36 43 43 40 23 23 12 12 12 20 29 23 19 8 8 8 12 12
33 33 34 26 30 14 14 14 28 26 33 33 33 19 19 10 10 10 10 14 9 11 11 19 17 26 12 15 18 24 31 39 39 42 19 19 9 9 9 23 23 36 28 28 18 28 21 21 20 23
23 41 42 42 42 57 48 43 43 43 36 36 39 42 42 31 32 28 23 23 23 34 40 30 28 28 33 33 24 19 13 10 10 14 24 23 28 28 34 28 23 12 11 11 12 20 26 37 39 34
30 24 20 20 20 28 23 37 37 39 39 33 28 36 36 42 36 30 33 28 28 33 31 30 33 28 28 28 37 37 30 30 30 37 32 35 35 42 43 47 43 39 39 37 41 41 37 36 43 39
43 44 57 42 44 32 32 30 32 32 39 37 43 33 33 24 24 18 28 13 14 14 23 21 36 25 25 25 33 28 28 25 25 25 25 23 28 28 28 14 15 15 28 28 39 39 37 37 39 37
33 32 28 28 28 28 28 21 14 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 18 23 19 25 19 24 16 19 19 19 23 23 22 22 22 21 17 14 9 9 10 15 19 26 17 18 18 15 12
12 12 22 12 13 14 18 24 12 12 11 15 15 11 12 12 22 19 25 19 26 13 17 17 22 22 23 15 13 17 10 10 11 19 19 31 31 30 28 30 30 22 27 19 13 8 8 8 10 8
12 12 12 12 15 15 17 16 15 16 16 18 21 31 28 23 18 15 11 11 11 17 17 23 31 20 20 20 20 20 23 30 24 17 17 14 13 12 14 9 9 10 10 10 13 13 16 11 11 12
12 15 18 21 15 17 17 25 24 14 14 14 13 19 13 15 10 8 8 8 12 13 28 23 28 19 23 10 8 8 8 8 8 10 15 20 21 21 28 21 21 19 21 12 13 11 10 10 10 12
13 11 10 10 10 16 8 8 7 6 8 8 13 10 10 6 6 6 6 10 11 8 8 8 10 12 14 12 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 16 12 8 8 8 8 8
8 10 10 10 10 15 10 10 9 10 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 10 13 9 6 8 6 6 10 8 8 8 10 9 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 11 12 12
11 9 9 9 8 10 10 11 10 15 10 8 8 8 10 10 8 9 10 10 12 12 15 13 11 8 6 8 6 6 8 10 15 10 10 10 9 10 14 23 22 22 17 17 15 19 14 11 8 8
8 6 6 7 8 8 10 12 12 10 10 13 13 8 8 8 7 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 10 17 23 14 17 17 17 15 18 10 10 10 10 9 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 8 8 13 15 13 17 21 30 19 16 12 16 16 23 23 34 22 17 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 10 18 17 10 10 10 21 21 37 33 30 28
19 12 9 9 10 9 9 13 9 9 9 9 9 9 10 11 12 19 20 31 31 30 31 37 28 14 13 9 9 9 23 21 30 30 30 39 37 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 43 31 31
26 22 15 19 18 19 10 15 8 8 8 8 8 10 12 14 19 16 24 23 28 28 22 29 24 33 33 33 39 47 47 59 36 24 28 28 28 19 19 17 19 23 27 33 23 19 11 11 11 16
18 28 19 21 20 20 20 28 28 14 14 14 28 28 46 46 31 31 23 22 27 24 24 32 30 30 35 43 43 41 42 37 35 35 39 42 42 42 43 43 43 42 42 35 35 35 42 37 42 43
43 35 43 32 24 12 11 11 19 24 24 24 19 19 17 36 38 38 27 20 20 21 27 16 16 16 15 18 15 15 32 32 20 23 19 30 22 22 22 18 21 13 13 13 14 16 16 18 18 32
24 14 14 14 15 27 32 32 43 47 46 37 37 23 23 23 23 25 36 36 32 30 30 30 36 36 39 39 28 28 27 23 23 41 26 30 30 32 32 33 24 24 18 18 18 19 19 23 15 13
13 12 15 19 21 24 28 21 17 17 13 13 10 11 11 12 12 12 11 12 12 18 22 28 28 35 30 33 24 22 25 25 25 29 29 37 37 35 35 32 40 28 28 28 32 32 28 19 21 9
9 9 12 12 19 20 17 14 15 14 13 12 12 8 8 6 10 11 20 10 9 8 8 8 8 8 8 13 15 31 33 23 19 18 13 13 13 18 15 15 18 19 12 11 11 11 11 10 9 8
8 8 8 10 10 19 19 12 12 10 10 10 10 11 17 16 18 16 10 10 10 10 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 13 16 14 14 14 17 15 17 14 14 14 28 28 39
39 34 34 28 22 13 9 9 9 10 10 10 12 12 12 12 19 19 16 15 15 15 25 23 23 8 10 6 6 8 8 11 11 10 10 8 8 11 10 8 8 8 10 8 9 8 8 10 8 8
8 21 21 12 12 12 12 12 12 12 11 11 11 11 11 10 8 8 7 6 8 8 11 11 11 10 10 9 10 10 12 13 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 10 8 10 11 8 8 8
10 10 12 13 10 10 6 6 6 8 8 7 9 10 8 9 8 8 11 8 8 10 11 15 21 12 10 8 8 12 8 10 10 13 10 10 10 8 12 10 13 13 10 10 8 10 12 10 10 10
11 12 12 8 8 8 6 8 6 6 8 8 13 17 21 13 10 10 6 8 6 6 8 8 10 10 11 11 14 11 10 10 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 8 9 7 7 8 8 9 12
18 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 9 9 9 9 13 15 10 8 8 11 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 9 8
8 8 8 11 11 12 12 12 12 |