BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106O15.T7 (MSMg01no106_o15.b1) | MSMg01-106O15.TJ (MSMg01no106_o15.g1) |
ACC | AG320871 | AG320872 |
length | 710 | 1,885 |
length of high quality (start - end) | 376 (58 - 433) | 564 (114 - 677) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o15.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_o15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o15.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_o15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:01 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCACACCCGGCCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXCGCGGAATTCAAGGCCCACACCTGAACATGATAAAAACAATCT
ACAGCAAACCAATAGCCAACATCAAAGCAAATGTTGAGAAGCTGGAAGCA
ATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGTCCACTCTCGCCCTACCT
ATTCAACATTGTACTTGAAGTCCTAGCCAGAGCAATTAGACAACAAAAGG
AGATCAAGGGGATACAAATTGGAAAGGAAGAAGTCAAAATATCACTTTTT
GCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCACCAGAGA
ACTCCTAAGCCTGATAAACAGCTTCAATGAAGTAGCCAGATATAAAATTA
ACTCAAACAAGTCAATGGTCTTTCTGCACACAAAGTATAAACAGGCTGAG
AAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATACA
ACACCTTGGCGCGACTAACTAACGAAGTGAAAGATCTGTACGATAACAAC
TTCTTGTCTCTACATAAAGAAATTACAGATGATCTCCGAACATGGAAAGA
GCTCCCATGCCTCTGCATTCCCCCGATCAACATTGCCCAACGTCTATCTT
GCCTAATGTATCTACCGACCCCATGCAATCCCTATCTAAATTCCACATCT
CATCCTTCAG
| NAAAACACTTTTTTTTNAGGAAAGCGTCGGCCGCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTTAACTCATTTTTGTCTANTA
CTCCTCTTTGAGACACACAGAACAATTTATTTATATTAATGAATAAGCCT
TTGCCCAAGATCTGTGAGACTTAATGTAATCAAATTTAAATATTAAAGAC
ACTATAATTTTCATAGTAATTTTAATTAAAATTAGGTGTTAAATGTTTTA
TATTTTCCTAGCCATGCAGGCAAAATACAATTTCATAATTTTAGATAATA
AAATTTCTACCACTGGGGCTGGAAAAATGGCTCAGTGGTTAAGAACCCTG
ACTGCTGTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAAGTCCCAGAAATCACATGGTGGC
TCACAGCTATCTGTAATGAGATCCTATGCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAG
ACAGCTACTGTGTACTTATTAAAATAAATAAATCTTAAAAAACAAAACAA
AACAAAACTTTTTTCTACCAGTGGAAAATTAAGTAATATGGCCCACAGTT
AACCAATGATGAAAAATAATCTCAAATATCTATGAATACTATCTAAAGAC
CCATTCCTGCTTGCAAAAAATTACTGTAGAGAGAATCTTTATGTACTGTG
TAGAAGCATCACCTGTCAATAATAAGCTTTTGGCGTCTGAGCTGAGGCAT
GATTAGAAATTGAAACATTCAGCATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGA
TAGAGAGAGAGAGCAGAATTCTGATAGTCCGAGGTGAGAAATTTGTTACC
CAAACACTGAAAAATAATCAGTCCAAGACTAAAGGAAAGGTAACTACCAA
TCACGTTGCTGAACTCAAATTCAAGTAATGCGGTTATATAGTTATGGACT
TATCCGGAAATGATCCTAAATTTATGGCCCCGAACTTTGCCCATAAAAAA
TATAGTTTTAAAACTATTACCCGGGGAAAAAAAAGTTGTGGTAAAATATC
TGATTTTTCAATTACACCTTCCAAAAGGCGTGAATTTTAACTCCTCTTCC
CTGTTTGAGGAAGGAACCCCCTTCCTTCTCCAAAATTTTACCCTTAAATG
TCCTGTCTTATTGAATTCCTGCTCTAAATTGGGACACTTTCTTAAATAAA
TATCTCTAGAAATACCCCCCCCATGTATTTTCCTATTTGTAACTCTATTC
CACATTTTTTGTTATCCAATAATTTTTTTTCATTTACTCATACTCATTTT
CTGATAACACTAATCATCCTCTCTATATATCTTCTACCTCCTTTATTATT
TTTCCTTTTGTTAATTTCAACTTAATTTTCTCATATTCTATCTTTTTTTA
TACATTCCTTCTTCTGAATTCTATCTCTTATCTATCTTTATTTAACCTTA
TTTCTTTCAAAATTATATAATATTTCCTCACTAAATTTCCTCTTTCTTTC
TTCTTATATTATATATCTTTTACTTTTCTATAGATTTCTTATTATATCTT
ATATCATTTTTACTTACTTTCTTTTCTCTTTCATATTTCTCCTACTATCC
TATTCTTAATTTCTTNTCTTAACTTATTCTTATATTTTTCATAATATTCT
ATTTATATTTTCTTTATATATCNCTNACCTTTATCTTTAATTCTCTCTGT
ACTTCTTCACNTCTTTCTTGATTATTCATATATCTTCTCCTTATACTTCT
ATCCTACATCTACTACTTTATATCATCATATATACACTTATCACTCACAC
ATATTATCTTGCCTATCTACTCTTTGCTACTTATATTCTTCATGTCTATC
TGATTATTCTCATCTCTTGTCCTCCTACTATTCTTNTTATATCTCATCAT
ATTACCACATTCTCTCTCTCCATTATAGTTACTAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 8 7 7 8 8 8 8 13 12 12 12 19 30 30 21 19 18 21 22 23 30 22 22 15 13 13 22 24 24 22 24 24 24 41 41 19 19 11 9 11 6 6 6 6 6 8 8 11
23 25 29 30 28 21 24 28 34 43 48 36 36 36 33 33 31 29 23 16 11 9 10 10 10 9 10 11 25 24 41 24 28 28 26 26 28 36 38 57 57 59 36 37 37 37 37 37 48 34
42 42 48 48 48 54 54 48 42 42 42 41 42 57 42 41 41 47 47 41 41 41 41 41 42 42 39 39 35 35 35 37 35 35 35 37 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 59 57
57 57 57 54 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 43 34 19 16 22 23 35 43 35 43 43 57 57 62
62 62 52 62 62 62 62 62 52 45 45 43 43 43 33 35 43 43 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 52 52 52 45 45 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 43
43 39 39 39 43 44 43 39 39 39 62 62 52 43 43 27 35 35 43 43 52 52 43 43 39 39 39 39 43 35 35 34 26 13 12 33 33 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 52
52 62 62 62 57 57 43 39 39 43 43 57 57 52 43 43 43 42 35 35 35 43 43 57 52 43 43 39 39 29 27 24 24 18 22 22 22 19 28 39 39 39 33 43 28 31 31 43 44 33
33 32 43 32 32 28 28 32 43 43 37 38 32 27 20 15 10 9 9 9 19 19 43 43 33 28 24 38 19 16 13 11 11 15 15 25 36 27 17 16 16 16 17 30 37 35 25 30 19 15
19 19 19 18 17 15 15 18 18 17 17 18 24 19 32 32 25 28 30 30 30 30 37 39 43 43 36 27 22 17 15 15 16 13 13 13 15 15 15 13 15 9 13 13 13 10 10 11 11 9
9 9 11 12 12 23 27 15 15 10 15 13 14 15 26 28 30 19 22 10 10 10 10 12 15 11 12 12 15 15 15 16 19 17 12 12 12 12 10 10 10 10 10 12 13 12 12 11 12 12
13 15 8 8 8 8 8 10 14 14 15 15 12 11 11 12 18 12 11 8 8 10 8 8 8 11 11 11 11 11 11 11 14 15 17 15 9 9 9 10 12 9 9 9 9 12 18 18 10 10
10 11 11 10 16 12 12 10 10 8 8 11 12 19 11 10 10 9 9 9 9 9 12 12 12 10 10 10 8 8 8 15 15 16 9 9 9 8 8 8 8 9 9 11 11 10 9 9 9 17
20 20 12 12 8 8 8 8 8 8 10 9 11 13 10 9 10 9 9 10 8 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 12 8 8 8 10 9 10 10 10 11 13 8 6 6 6 8 8 6
6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 6 7 8 8 8 18 22 21 21 3 0 3 6 6 6 6 6 7 10 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 9 9 7 6 8 6 6 6 6 10 10 7 9 3 0
3 6 8 10 8 8 10 8 3 0 3 10 10 14 23 25 28 31 30 24 23 21 21 16 19 28 23 25 28 28 24 24 24 29 35 35 35 31 41 30 28 24 19 13 19 10 3 0 3 15
10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 17 20 34 34 33 33 33 31 36 36 50 50 35 35 35 37 37 37 40 40 40 40 37 42 42 35 35 36 36 38 36 53 41 30 42 42 27
25 23 27 21 16 12 13 13 15 20 29 23 28 24 26 27 35 35 50 36 36 36 36 42 42 42 40 40 40 43 48 42 42 37 33 37 33 39 39 42 48 54 54 54 68 68 68 68 68 68
50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 50 48 48 48 46 48 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 47 50 57 57
57 57 68 68 68 50 50 51 51 50 50 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 35 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 62 52 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 52 52 57 57 57 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 46 32 32 32 32 37
57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 47 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 54 54 54 59 59 59 54 42 43 32 32 32 37 42
47 59 43 43 43 59 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 47 36 30 29 29 28 28 24 28 24 30 22 27 28 28 28 23 26 26 28 29 26 14 14 21 21 36 36 39 39 39 39 47
43 47 43 43 43 43 40 40 37 37 37 37 32 26 31 40 37 41 39 40 41 37 31 31 36 31 31 33 40 46 41 39 39 37 32 31 37 41 41 47 46 41 50 48 48 43 39 31 32 34
36 36 36 48 48 43 41 32 19 19 16 26 25 30 25 23 26 30 30 25 24 24 25 37 37 30 26 20 20 28 32 34 24 19 20 16 16 14 32 43 43 37 36 36 33 32 26 17 17 22
18 11 11 16 18 21 20 30 32 39 39 40 43 39 43 31 31 19 19 19 29 32 34 28 23 14 14 18 30 25 19 10 9 11 8 9 12 21 21 13 12 12 15 18 11 21 15 15 15 14
24 24 23 23 23 20 20 12 12 10 23 20 30 28 18 24 13 8 8 7 9 8 15 13 13 10 10 11 11 11 12 11 11 11 11 10 12 10 10 13 15 13 13 10 10 10 12 8 8 7
7 8 15 17 12 11 11 10 13 12 10 10 11 10 10 11 7 6 8 8 12 14 18 13 11 11 11 11 16 11 16 16 8 8 8 8 8 8 10 11 12 17 13 17 9 8 8 10 15 18
22 13 10 8 8 8 8 10 20 15 20 9 9 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 8 10 9 9 8 12 10 10 18 11 12 13 10 10 12 18 17 11 11 12 12 12 13 12 12
10 8 8 8 10 10 19 10 12 11 12 10 9 9 9 9 9 9 8 11 10 8 8 8 8 8 8 19 13 9 9 7 8 6 8 8 9 6 8 8 9 9 8 12 9 8 8 8 8 8
6 6 8 8 12 9 9 9 8 13 10 16 13 12 8 8 8 8 8 8 10 10 17 16 13 11 11 15 14 12 9 9 11 10 8 8 9 8 8 10 10 11 10 10 15 10 10 10 12 8
12 8 8 8 8 8 10 10 10 15 12 10 8 6 6 6 8 8 10 11 11 11 11 11 12 12 12 12 18 18 30 26 17 17 13 16 9 9 9 9 10 8 8 8 10 6 7 6 6 6
10 8 8 8 8 12 12 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 10 10 12 11 17 11 11 9
13 10 9 9 11 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 11 16 12 12 10 10 10 14 16 23 22 19 11 9 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 9 8 8 8 6 8 8 10 10 10 8 9 9 9 9 9 10 8 6 8 8 8 8 10 12 10 9 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 10 10 11 11 11 10 11 16 15 10 8 8 8 6 9 10 10 8 11 12 13 12 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 8 9 10 11 8 11 7 6 8 8 8 10 15 10 8 8 6 8 7 7 8 8 11 11 10 9 8 8 8 10 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 10
15 11 8 8 8 9 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 7 7 8 8 8 8 10 7 7 8 8 8 8 10 10 18 10 10 7 7 12 12 7 7 7 7 8 11
11 8 6 6 6 7 10 15 10 8 8 13 13 22 15 13 8 10 10 10 8 8 6 6 6 7 11 8 10 8 8 6 8 8 8 8 10 13 10 6 6 6 6 13 10 12 10 13 10 11
10 10 12 8 8 8 8 12 9 11 11 11 11 11 10 11 10 10 8 8 6 6 6 6 8 10 8 10 9 10 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 12 12
14 14 13 13 9 9 9 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 9 13 15 15 13 9 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 7 8 8 10 8 10 15 11 11 9 9 9 9 11 17 11 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 9 8 8 6 8 6 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 8 8
6 7 10 10 10 10 10 14 12 6 8 6 6 8 8 13 10 10 12 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 15 8 8 8 10 10 11 11 10 15 10 10 3 0 3 9 11 13 8 8 8 8 8 10 10 8 12 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 11 10 8 10 8 8
8 16 12 8 8 8 7 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 9 9 3 0 3 3 0 3 7 8 10 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 13 15 10 9 9 9 6 6 6
6 8 10 10 10 9 10 10 9 3 0 3 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 11 13 10 10 10 10 8 8 10 8 11 6 6 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8
15 12 9 10 9 12 11 7 7 8 8 8 8 6 6 8 10 8 7 8 6 6 6 6 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 6
6 8 10 10 9 9 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 10 7 7 8 6 7 8 8 8 8 13 8 6 8 8 8 8 14 15 17 12 10 8 8 8 7 8 8 8 8
6 6 6 6 6 6 6 8 6 10 10 10 10 8 8 10 8 9 9 9 9 10 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 3 0 3 10 10 7 7 7 13 13 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 6 9 11 11 11 |