| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107D20.T7 (MSMg01no107_d20.b1) | MSMg01-107D20.TJ (MSMg01no107_d20.g1) |
|---|
| ACC | AG321106 | AG321107 |
|---|
| length | 1,310 | 1,297 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 328 (133 - 460) | 279 (128 - 406) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d20.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_d20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d20.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_d20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:50 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCGGTAATTTNNNNCGGCATTCGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCCAAGCATGGCTCCTCCCTTTAAGCTCTTTAACCTCTTA
TCCATAAATTCCGATGCCGCCTTTAAGTGACCATGTATATCCTAGCAAGG
ACACCTTTTTGAGCTGTGGCTATCCAAACTCCCTTGACCCTTGGATTCTT
AGACTATATTCCTAAGTAATTTAGTGATCTGTCACTTTTACAAGCTTGGA
AGAAGTAATAGCTGCTGTGAGGACACTCAGGCAGGAAGTGGATGGGGGAT
AGAATCCGCCGCAATAATTTACTTGGGAGAGATCTTGAAGCCATTTCGAC
CTGGCTTTACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA
TTTATTTATTTATTTATTTTGCACATGTGTGCATGAGCACACATGAGCAC
AAATGCATTTGTTCCCCCCCCCCCCACAGGTTAAGAAATGGATAGCAAAC
CCTCCCCCTGCACCCCCCAGAGCTGAGTTTACAGGTAGTTTTGAACCACC
TGTTGTAGGTGTGAGGAACGGAATTCAGGTCATCTACAAGCACAGCAGAT
GCTCTTAAGCCTCTGAAATACCACCCTTCCTGCCTCACGTTAGGGCTGAT
TGCATTGTCCCAGTGAACCGTATCTGTTCCACTGAAATGATGATAACAGA
ACCACTAGGGTACAACAGTTCTGTGTCACAAATACCTCCTGTCTGTCCCA
TGTACGATGCTAAAACTGTCCCACATTGCGTTGCGACTTAAATCTGACAA
TGGCTTCACTCAACCCAGTGTCTTGAGTTCTCCTCTCAAACTTTCCCCCT
AGTGATCTCTTTGACCCCGGTTCCTGAATGATTGTCTCTCTGCTGTGCTG
CCCGAACCCTATTTGCCCTCATTCATTGTGGTCCCCTATTGAAGAAATCT
GGCCACTTTCTGTTTCTCCATCCTTTCCCTTCCTTGAACTTTCTTTTTCT
TCACCTGGTCTCAATCTCTTACAATCACTCTGGCCCCATGTTACTTTATC
CCCCTCTTTTACCATATCCCTTCCCACCTCTTCAATTTTTCCCCATCCTC
ACAAATTAACCCTAAATGGTCCTCCTCACTCTTTCTTATTATACATATTA
TTTGTCCTGTGATACTTTAATCCTTCCCCTCTCCCTCTGCCTACATTCGT
TTCCCTCTAACCTCATTTCCCTATCTACATTTGCCATCCTTTACAATTTT
GTATCTCTTATACTATCGTTTTCTTCCNCTACCTCATNTCTCTACCTTCT
AAATATATCC
| CAATCCTTTNNNAAAGCATGGAGCCGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGGTAGACCAACCTGAC
CTTGACAACTCACAGAACCCTTTAAAGCCTCAACCTCCCAAGTGGTCCTC
TGCAAGAGCAATAAGGGCTCTTAACCACTGAGCCATCTTGCCAGCTTCCT
CATGCATATTTTTGTCTGGTGCACATGCGTGCTTGTGTGTGTGTAATCAA
GTGGAGGCCAGGGGCCAACACCCGGCATCTTCCACATTTGCTTCTTTGCT
TTATCTTTTGAGACAGGCCTCCCTCACCGATTTCACTAATTCCGTTAGAC
TGGCTGGCCAGCAGGGCCCAGAAATTGGCTTGTCTTCACCTCCCCAGTGC
TGAGTTATGTTCACAGGTTGTAGTGCCTGGCCTTTATGTGTGTACTAGAG
TCCCAAACTCTATTCTGTCCCACCAACTGAGCCATCTCCCCAGCCACACA
AGGAACCGTTTATAAACCTTCACTTATGCGTTTATAAAAAGATAAAGAGA
GAGGAGATATGTTCTATGGATGTGTAGTCAGGTGTGGAGAAAGGGGATGT
CTCAGATGGGTCCATGCATATACATCTCTTCCCTCTGAGCCACCATCCAC
ACCATGACAGTATAGTGTACAATAATGTTTATTCGCCTCATGATGAGGGG
AGTTAAGAGGTTAGTAGATATATCAGATAAATATATCCTACTTTTTTTTT
CTTTTCCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTATTTCTTTCTTCTTATCTTTTT
TCTTCTTTATTCCTTTTTTTCTCCACCTTTTTTTATTTCATCTATTCTCT
TTTACCTTTATTCTCTTTTTTCTTATATTTTATTTTATTTTTCTTTTCTT
CTCCTTCTTTCTTCTATTCTTCTTACTTACATTTTTTTTCCTTAATAATT
ATTTTTAACTCTTTTCTTTTTATTTCCTTTTTTATCTATTACCTCACTTT
TTTTTTTTCTCTTATTATTCTCTATATTTCTCTCCTCTTTTCTTTCATCC
TCTATTCTCTTTATTTTTACTTCCTTTTTTTACTAATTTTTCACCCATTC
TTTTCTATCATTTTTTATTTTTTATTACTCCCCTTACTTATCTATTCTTC
CCTTTTTCACCACTCTATCTTCTCTTTCTCACATATCTCTACATCATAAT
ACACATATATATTCTCTTTCTANCACTATATCTCATTTTTCTANCTATCT
CCCTACCTAACTTTCTATACTACCATATAANCTTCTTTTTTTTCCTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 9 16 3 0 0 0 0 3 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 19 21 10 8 8 12 11 15 19 19 37 37 40 40 40 40 40 37
48 47 47 40 34 34 34 34 37 37 47 47 42 36 33 36 33 33 29 29 28 30 36 23 23 11 11 14 12 10 11 9 8 8 8 8 10 14 14 13 19 27 28 31 33 36 35 35 36 36
53 38 36 36 36 35 35 36 33 33 33 33 33 33 33 21 21 9 9 9 12 10 8 8 10 8 8 8 15 10 11 15 15 26 28 32 43 48 48 53 53 53 53 50 50 48 59 57 50 50
50 50 50 50 50 54 57 57 59 59 59 57 57 57 48 47 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 43 36 37 37 44 44 57 57 57
43 43 47 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 57 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52
52 52 52 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 57 52
50 52 43 43 43 43 41 50 43 52 52 52 52 52 52 52 50 59 59 68 68 59 59 59 43 37 37 37 43 43 57 57 57 57 57 57 42 39 37 37 42 43 44 57 44 59 54 54 46 57
57 57 43 46 46 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 47 47 46 39 39 39 35 35
39 47 48 48 46 46 46 43 25 30 13 13 12 29 29 47 47 46 46 46 48 59 59 48 48 39 39 39 39 39 43 43 43 43 43 36 43 37 39 39 39 35 39 36 36 25 24 24 33 31
33 34 32 32 24 26 13 13 16 13 10 10 10 10 10 12 13 13 26 19 22 23 10 10 10 13 10 21 21 25 25 32 32 28 25 18 26 21 23 23 28 28 29 25 28 28 21 21 13 13
13 15 18 24 23 28 28 31 34 42 37 30 30 33 42 42 28 24 14 14 18 24 28 28 34 25 28 28 39 34 28 28 20 20 20 23 23 30 32 33 28 31 36 37 33 33 30 37 37 37
37 28 22 29 23 29 15 17 15 21 21 31 22 28 25 32 28 24 24 16 19 17 14 14 17 18 12 19 24 12 12 18 28 37 18 18 12 18 12 17 17 19 18 12 12 11 11 11 24 24
25 25 44 44 32 32 18 13 13 13 19 34 42 43 36 32 23 20 20 15 15 14 21 22 40 32 44 30 30 25 25 36 40 40 39 30 30 30 30 24 28 13 13 13 13 13 21 23 11 11
11 18 16 20 22 32 31 30 28 22 21 12 12 12 12 15 19 19 22 24 21 10 8 6 6 8 19 15 19 10 10 10 16 19 19 10 8 8 12 8 10 10 10 14 15 18 13 13 15 11
11 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 6 10 10 10 10 10 10 10 19 19 16 13 12 13 11 11 8 8 10 10 11 15 16 14 11 17 16 19 20 24 18 10 10 10 10 10
12 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 9 8 10 8 8 8 10 12 16 18 23 19 14 7 7 8 8 8 8 15 15 16 16 16 15 21 11 11 12 11 11 10 10 10 11 12
16 12 12 8 8 8 6 8 8 13 8 8 10 13 11 9 9 9 13 10 10 8 8 8 10 10 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 15 15 11 11 11 11 11 15 10 10
11 11 11 12 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 10 12 13 11 11 12 12 12 12 11 11 11 11 11 11 10 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 13 11 11 11 10 8 8 8
8 10 8 10 11 13 15 12 10 10 8 8 8 8 8 8 12 10 11 11 11 11 11 11 13 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 10 12 12 12 12 15 19
22 18 10 9 9 9 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 10 12 6 6 8 8 8 11 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 11 13 17 30 19 12 12 8 8 6 7 10
12 8 8 8 8 11 6 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 9 11 10 9 9 9 10 10 10 9 9 10 9 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 9 11 11 13
11 14 15 16 18 11 11 15 10 10 9 9 8 8 8 8 8 12 13 8 10 10 8 13 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 12 10 8 8 8 7 7 7
10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 11 16 16 8 10 7 7 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 9 9 9 8 8
8 8 8 8 8 11 14 10 8 6 6 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 9 10 12 13 10 8 8 8 8 7 6 8 8 10 10 10 8 8 8 11 9 9 9 9 9 12 9 7 8
8 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 6 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8
6 6 8 9 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 13 12 7 6 3 0 3 8 8 8 10 8 8 8 3 0 3 10 9 10 6 6 8 15 15 11 10 6
6 8 6 9 12 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 11 12 3 0 0 0 3 6 6 6 6 7 6 7 6 8 8 7 7 6 6 6 6 9 9 9 11 8 8 9 9 10 12 17 17 20 20 19 20 21 24 17 15 8
8 17 22 28 35 37 37 37 32 28 28 28 29 36 36 33 41 39 37 37 41 34 23 10 6 6 6 7 7 10 9 11 11 8 8 8 11 9 9 17 25 34 48 37 30 35 35 35 35 35
35 35 35 35 35 35 36 33 33 33 33 33 37 28 22 8 7 6 6 6 6 9 6 6 6 6 11 16 16 33 30 30 37 37 43 48 47 47 48 42 42 42 42 42 42 47 40 43 39 43
43 43 43 48 48 48 43 47 43 43 43 46 46 48 47 47 47 47 47 47 48 51 50 54 54 48 57 57 57 57 39 39 57 46 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 47 57 57 68 57
57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 50 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57
57 52 52 52 52 52 52 57 57 52 52 52 45 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 44 44 23 23 23 43 43 54 57
57 57 43 42 38 38 29 29 32 43 43 52 52 52 52 52 52 43 50 35 35 37 50 57 57 57 48 48 43 44 43 31 31 43 44 50 44 43 43 46 57 57 48 44 43 43 43 43 43 43
42 44 42 25 24 12 15 12 12 12 12 12 12 15 18 28 30 43 43 40 40 25 24 24 29 40 42 43 41 41 39 39 47 46 57 48 57 42 42 35 35 35 37 39 37 34 23 23 23 28
28 37 37 41 43 43 29 29 15 21 15 13 13 13 18 18 11 11 11 12 15 15 15 20 16 20 20 15 19 19 19 18 25 25 39 39 34 37 28 24 21 15 15 20 31 22 26 17 17 17
17 18 10 11 11 22 25 41 39 41 39 39 35 37 35 43 39 43 43 36 33 25 29 36 43 25 27 14 14 14 19 26 37 43 43 43 43 42 42 32 30 30 29 29 28 28 28 23 23 14
21 21 21 21 16 16 18 32 32 32 37 28 28 25 36 32 39 35 39 42 42 42 43 36 36 33 33 28 28 28 28 23 28 20 24 20 20 20 28 28 36 30 24 15 12 12 12 32 32 43
43 24 24 10 11 11 22 10 8 8 8 10 12 19 24 21 21 19 19 13 16 13 16 11 11 12 19 22 28 43 30 30 30 28 29 26 21 13 11 10 13 10 10 10 12 12 13 13 18 21
13 15 14 26 15 20 15 27 13 13 11 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 15 13 17 17 29 29 19 19 10 12 16 18 11 10 10 10 10 10 22 29 33 24 21 15 12 15 15 15 15
12 16 16 17 17 11 11 11 13 19 19 12 11 11 11 11 9 9 10 10 10 10 13 12 9 9 9 10 10 10 10 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 8 8 6
6 8 8 10 9 9 10 10 10 10 10 10 11 12 11 10 10 10 12 10 11 12 11 15 12 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 12
15 15 15 19 11 10 11 6 6 8 8 8 8 8 8 8 15 11 11 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 18 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8
10 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8 10 12 12 10 11 10 17 13 13 11 17 10 8 8 8 8 10 10 11 11 10 17 11 10 9 9 8 8 8 8 9 8
8 8 8 10 11 12 12 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 8 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10
10 11 10 10 10 10 10 10 8 10 7 7 12 8 9 12 15 18 19 19 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 14 15 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 11 13
10 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 11 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 10 10 11 10 10 10 12 10 9 9 9 6 8 10 8 8 10 8 9
13 13 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 10 6 7 6 6 10 8 9 10 10 8 15 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 8 12 10 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 13 12 10 9 11 8 8 6 6 8 8 8 6 7 8 8 10 10 11 11 7 6 8 8
9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 7 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 10 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 11 9 9 9 10
10 9 9 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 3 0 3 8 8 10 9 10 10 11 11 30 37 31 11 11 9 9 |
|---|
