BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-109F14.T7 (MSMg01no109_f14.b1) | MSMg01-109F14.TJ (MSMg01no109_f14.g1) |
ACC | AG322558 | AG322559 |
length | 752 | 721 |
length of high quality (start - end) | --- | 605 (87 - 691) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_f14.b1 PHD_FILE: MSMg01no109_f14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_f14.g1 PHD_FILE: MSMg01no109_f14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTGCCACATCTAAATTGCGGCGCTAATACGATCCTATTCGAGAGGACCG
CGGATTCTGATTTTTCCCTGTATGAAGAGTTTGTATGAGAATTTACAGAG
CCTGAAATAAGTCAGAACATTTCTGGTCATGTTATTAATTCCCAATCATG
TGAGAACATGCTGTCCACCAGTGATGCCTCAAACCAGACCTTGTACCCGT
ATTAGAGTTTTCTACGACGAGCATAACATTCGACGATAGTGTCCTCTAAG
GTTGCCTACATAATCCGCTTACTTGACACATCTATAGTACCCCATCTACG
GCCATTTCCTGCCCCACAGTTTCACTCTCTACCATTTGCTTATTTTTTAT
CACCCTGTACCTCTTTTTCCCCCTCCCCTCCCTCCATACTGGACTATTCC
TGACGACCCGCTCAACTCCCTGATTATATTTTTCTCAACCCCCTTTTACT
CCTTTCTCCCTACCTTCCTTCCCCTTTCACACTTCTTTTCCCCTCTTTCC
CGTCTTTCCCCTGATCTATTTTTTTTATGACCCTTCCCCTCCTTTTCCCA
TCCTTTTCCTTCCCCCCTCCCTCCCTTTTTTCCCTTTTCCTCCCCTCCCC
TCCTTTACCCCTTCCATCCCCCTATTCCCCCTTCAATTTCCCCTCCCCCT
CCCCCCTCTTTCCTTTTCCCACCTTCCTTTTTTCGCCTTCCCTCTAACCA
TATTCCTTCCGCCCTCCTTCTCCCTTTTCCCCCCCTCCTTTTCCCTTCCC
CN
| AATAATANNNNNCCGATGATAGTGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTAACGAGGATTT
CATCTCTGTATACAGGAAGAAACTTAACAGAGGTCCAGAAATTGGGATAG
AGGGATTCCTCACCTCTTAGAGGAGAGGAATACTGGTCCCCCAATTAAGA
AAAGAAATTTTAATAAAATGTAAGGTAATTAGGAACGTGAAGGCAGAGAC
TTCCTTCCCAACGTTCTCAAGGAAGGCAGGTTGAGAATAAGCATGTGGCA
TGAAGCATACTCTTTACCATCCTGGAACAGGGGCATGCATTTGATTTTGG
AGTACCCATGTGTAAGCATTAAAGAGTTTGGTTCTATTTATAGATTCTTG
GTGTTTGGGGAGACCTGGTTCTGTCCTTGCCCCTGTAAATGTAGGCATGA
TGTTTTAGTGTATAAAATACCAGACCTAACCCCAGGAAGTGCTACAGACC
ATCTAAGCTGCCAGCTACTCCGCTGGTGTTTGGCTTGTAGCGTGTTCGGA
AGGATGCTGCCCTACCCCTCCCTCATGTCTGGATGTGCTCTCTCTTGGGT
TCTGTTGACCTCAGTTGCCTCATCTCATCACCGGTTCTGTTTGTCCATCG
GCTTGACTGCTTTCGTTCTAGCAGACTGAGGCTCCTTCCACTCCCATTGC
AGCTAAGGATTCCGCATGTGA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 6 6 6 6 6 8 11 9 9 9 10 10 11 17 15 18 17 13 16 14 14 28 31 31 25 24 12 9 10 12 9 9 22 12 12 9 9 9 12 18 18 15 10 10 10 15 12
19 15 15 11 13 13 26 19 28 22 15 15 10 12 13 12 15 10 10 10 10 10 19 23 37 28 37 28 24 19 11 14 13 14 21 13 17 11 21 16 40 32 42 34 28 24 23 27 20 15
13 8 8 8 10 10 10 22 21 24 28 22 22 22 23 22 21 15 12 10 15 10 10 10 9 10 24 16 19 19 19 15 15 17 24 29 32 36 36 28 22 22 24 21 22 22 23 28 28 32
24 24 17 17 17 20 19 24 19 24 32 43 32 43 24 21 16 16 16 15 21 9 9 9 9 12 12 14 19 15 24 21 28 32 32 32 32 24 23 11 11 10 11 11 8 8 8 9 12 24
23 23 15 10 10 11 15 15 14 15 15 19 19 26 10 10 9 9 9 9 11 15 12 14 12 15 12 9 9 9 9 10 10 12 11 11 11 11 11 17 18 12 12 12 12 12 11 16 12 15
12 12 11 11 12 9 8 8 8 8 12 15 13 13 13 10 10 10 16 14 19 13 14 14 15 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 13 8 8 6 6 8 10 13 13 13 8 8 6 6 8
6 10 18 18 28 22 15 15 11 11 11 15 19 19 24 19 21 12 12 12 12 11 12 11 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 13 19 19 13 12 12 16 12 10 12 12 10 11 8 6 6
8 8 8 8 12 14 14 18 15 12 11 11 10 10 10 13 14 10 12 13 13 8 8 9 14 10 11 9 10 10 19 13 8 8 8 8 8 8 11 12 12 9 8 8 8 8 8 8 9 9
11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 10 12 13 13 20 20 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 11 12 16 15 14 14 14 8 8 8 8 8 8
10 10 17 12 15 10 10 10 10 10 12 10 8 10 10 10 10 10 8 8 8 10 8 9 11 18 8 10 10 10 7 9 11 11 12 10 11 8 8 8 8 12 12 8 8 8 12 11 8 6
6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 22 24 16 16 11 19 12 8 8 8 8 8 8 11 13 15 12 12 9 8 6 8 9 9 9 10 11 11 11 11
8 8 8 8 8 9 11 11 14 18 15 15 11 12 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 22 22 24 23 23 22 17 24 10 9 9 9 8 8 8 8 9 8 12 9 9 12 10 18 22
18 18 23 21 26 19 22 18 19 18 9 12 8 8 8 10 9 9 9 15 10 10 9 9 9 22 22 37 25 21 20 12 12 6 6 8 12 9 14 17 15 9 11 14 16 11 7 8 7 7
7 13 19 19 17 9 8 8 8 13 12 10 8 8 8 15 13 11 9 8 10 10 9 15 10 8 8 10 10 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 10 8 10 8 8 12 8
8 8 8 10 10 16 14 10 13 10 10 8 11 6 6 6 8 8 13 8 9 9 9 9 14 21 19 13 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 10 17 15 12 7 7 7 8 7 11 15
3 0 | Open.Hide. 7 7 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 3 6 8 8 11 10 13 13 11 17 19 9 9 9 10 15 16 39 31 33 37 37 33 33 48 42 42 47 59 25 25 13 10 6 6 6 7 8
8 11 15 19 19 33 28 33 26 24 11 11 11 24 24 53 53 53 47 32 30 15 14 21 17 22 12 12 12 25 21 42 42 50 42 42 42 43 43 43 50 57 68 68 50 50 50 50 50 50
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 59 59 59 57 57 68 57 57 47 50 50 50 42 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50
68 68 48 48 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 41 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 39 39 39 59 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62
52 52 52 62 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 57 57 52 52 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 57 57 57 57 54 54
57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 59 59 57 68 68 68 57 57 68 59 59 57 48 47 50 57 43 43 44 44 46 46 57 57 57 57 43 43 48 43 43 43 43 43 59 59 59 59 57 57
57 47 47 47 47 47 48 57 48 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 57 57 46 47 43 48 43 57 48 48 42 42 36 36 43 43 43 57 57 57 59 59 48 43 37 37 37 43
43 41 39 46 41 41 41 39 34 34 39 39 39 39 41 40 40 46 48 48 47 47 35 37 37 35 32 41 37 47 37 37 37 30 33 25 30 24 25 24 24 25 33 36 37 33 33 33 33 37
37 37 39 27 27 14 14 14 19 19 33 37 37 37 28 22 22 21 19 13 11 11 10 10 10 10 10 22 26 31 28 37 37 59 30 34 19 12 12 11 11 11 21 13 12 11 11 12 16 14
29 26 26 15 18 12 11 10 10 10 12 15 15 18 13 12 12 15 15 11 11 |