BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-114E02.T7 (MSMg01no114_e02.b1) | MSMg01-114E02.TJ (MSMg01no114_e02.g1) |
ACC | AG326182 | AG326183 |
length | 710 | 712 |
length of high quality (start - end) | 396 (46 - 441) | 291 (74 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no114_e02.b1 PHD_FILE: MSMg01no114_e02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:19:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no114_e02.g1 PHD_FILE: MSMg01no114_e02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:19:54 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCAGAGGACCGCGG
AATTCCACCCTCCTTCTCTCATTTACCAGACAGTGTTACAATCACTGCAA
CCACGTTTTTGGTTTTGCTCAAATATTTAATGCCAGCAAATGACCTTGCA
CAGTAAAAGAGGAGAGTTTTCTGTGTTTTACACACACACACACACACACA
CACACACACACACACAGAGGGTGATATACTGGTGATATCAATGCAAGTAC
ATGAAATGCCACTGGACGTCATGCAAAAAAAATGGTTAAAGGATAACTTA
TGCTATGTGTATTTTACTATAATAGGGAAGTGAACAAAATGTCAATAAAT
AGTTTTGGTTGTAACCATAATTCAAAAAGATATTTTGAAATACTTCAGTG
AAAACAAGAAATTGTAGCATAACTGTGTGGTACGTAGTTAGCCAGTACAC
AAAGGAATCAGGAAACAGTGTAAGAAAGAGCTGCACACTTTCTCCTAAGT
TCACAAAGGCAGGAAAGGTTAAGTTCTGACGGTGGAGTTACACTCAGATG
GTCTGAACACCCTCTTTGCCTAGCTCTGTTCCTTCTGTGAATGTGAAAAC
ACTCAGTCACCCCAAGTCTGTCCTCTCCTCAGGGATTGTACCACACACCC
CTGGTTCAAGATCTATGCCCTTGACTCCAGGGTGGGGTCGACCAAACCAT
GAAAATTTGC
| TTGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAATCCCTACATCTTCCATAGATGCTA
GGTGGTCAGGGTGATGGTGGAGACACAGGATCCCCAGAGCAAGCTGGCTT
GTCAGACCAGTTATGCTGATTATCTCTAGGTTCAGAGGAGAGATCTTATC
CACATCCAATATCATCCTTAGGCCTATAGAGATGCAGGCTCATATGTGCG
TGCGCGCGCATGCGTGACGCGCGTGCATGCGCCACACACACACACAGACA
CACACACAGACATACACTCATACACACACACATGCACACACAGAGACATA
CACACAGATATACACATCTATACACACACACATGCACGCACACACAGACG
CACACAGACATACACACATGCATACACACACAGAGACACCCCGACGTACA
CACACATGCCCACACATACACGCCCGCAGACCCATAGACACACAGACACA
CAGACACTCACTCACCTACACACACCCACACACCCTAGCTGACACTGATG
CCCGCCCGGGTGCACCTCATACTGGCAAAGCTTGCTAAAGTGGATAAGCT
CAATGCGAGCCTGGCCTACCCTGGGAGATCTCCTTACTAAACAGAAGAAA
CCCGAACAGACTGGGCTCTATGCAAATTACCAGCTCGGACTACAATGAAA
ACCCCTCCTCCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 10 8 8 10 17 11 22 24 21 19 14 14 20 26 26 48 48 48 43 46 47 47 47 29 29 30 30 25 28 23 9 8 8 9 8 8 11 10 12 9 9 9 15 16 30 37 33
36 36 50 50 50 48 48 33 27 30 24 18 12 10 10 9 9 10 19 19 30 31 31 40 31 29 29 30 30 30 29 29 17 17 25 31 29 43 43 40 40 40 36 36 36 36 37 42 42 54
46 47 47 48 48 57 54 57 57 50 50 47 50 50 50 57 57 50 42 42 37 42 41 47 46 54 54 57 48 39 37 29 30 30 26 38 38 42 48 37 37 47 47 47 47 47 57 44 43 41
50 50 50 47 48 50 50 54 54 54 57 57 57 52 52 52 57 50 50 43 43 43 50 50 57 54 54 57 57 43 43 32 32 32 44 38 38 38 43 43 57 57 57 52 43 43 43 43 57 43
52 52 52 52 52 45 45 43 43 35 35 35 43 42 39 39 43 43 57 39 45 45 52 57 57 57 57 57 36 38 26 43 43 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 52 43 43 35 35 35 44
35 35 43 43 62 62 52 43 43 39 39 43 43 39 43 43 43 43 35 41 39 39 39 43 43 62 62 62 62 62 43 43 43 35 31 39 39 43 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 59 43 35 27 27 35 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 39 43 43 62 43 52 52 62 62 62 52 52 43 43 43 35 33 43 43 39 43 43 52 43 43
43 43 57 57 57 43 32 27 14 14 14 28 22 38 24 35 35 44 44 52 43 43 33 28 29 39 43 39 52 52 57 57 52 52 54 57 59 59 59 57 59 52 57 57 43 37 35 44 35 35
43 43 57 57 50 50 38 38 35 50 50 57 57 43 38 18 14 14 28 30 38 39 50 50 57 57 57 50 48 44 50 43 42 30 30 12 12 11 19 24 15 13 13 19 15 24 12 14 14 26
25 43 37 43 43 47 46 43 43 37 37 37 39 39 47 42 42 37 37 35 41 41 48 48 48 59 59 47 43 43 37 39 39 36 36 43 43 39 48 48 48 48 48 48 48 47 40 33 25 25
29 32 33 28 28 28 33 37 37 37 37 32 32 28 31 26 31 31 24 31 30 28 14 14 18 28 28 28 28 19 24 18 20 20 23 28 23 23 31 34 39 43 40 34 34 23 32 23 24 20
14 28 14 29 19 24 20 22 25 30 37 37 40 46 48 43 43 43 43 34 36 23 23 18 23 12 14 14 15 15 20 23 23 28 26 23 28 30 23 20 20 23 22 22 32 39 32 27 32 30
21 21 15 12 10 9 9 10 15 15 21 18 17 14 15 19 18 13 14 9 8 8 8 8 12 14 22 20 30 24 22 12 13 15 17 15 13 11 11 11 11 10 10 10 10 10 9 15 10 13
11 11 11 16 16 16 12 12 11 12 11 15 15 14 13 15 12 9 9 9 9 14 14 22 14 10 10 8 8 8 13 18 12 12 11 11 9 9 9 9 9 9 10 12 14 13 21 21 32 30
30 17 20 12 12 11 10 10 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 22 18 29 25 29 18 18 14 9 9 12 23 23 14 18 17 24 23 15 11 11 10 10 10 13 10 10 10 11 14 23 37 30 30 37 37 30 32 20 20
19 32 27 37 37 43 32 30 19 28 29 29 36 29 34 28 23 14 26 26 42 42 28 32 28 42 42 44 46 48 31 31 29 29 41 41 57 48 48 47 41 41 42 57 57 57 57 57 57 57
57 43 42 42 37 37 37 39 39 47 46 47 44 46 39 39 35 37 37 43 43 43 43 35 35 35 37 32 36 36 50 50 50 43 43 37 50 50 50 50 50 37 37 52 50 44 43 33 33 43
44 44 35 35 35 38 38 16 16 14 26 26 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 35 35 33 43 38 45 42 43 43 43 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 33 32 32 36 41 57 57 52 57 57 59 57 57 54 57 57 52 52 52 52 52 52 43 43 38 38 39 43 43 43 43 42 43 50
41 41 28 28 35 44 44 50 48 48 47 57 43 43 43 57 57 50 48 48 57 57 57 57 44 43 43 44 46 57 57 48 48 48 48 59 59 44 43 43 39 39 37 36 36 37 42 39 43 37
35 35 27 29 22 22 22 36 37 46 43 43 32 32 20 23 23 32 28 30 40 40 28 28 20 20 20 28 28 33 28 28 28 37 33 33 19 23 15 15 14 28 28 43 31 34 23 23 20 32
15 15 11 21 13 19 19 30 34 39 28 28 14 14 14 25 23 18 13 14 12 25 24 33 30 30 30 39 33 33 30 28 23 21 14 14 30 28 24 28 20 21 15 11 11 11 23 25 12 12
12 21 12 12 12 22 22 24 20 20 20 32 28 28 14 14 14 30 28 27 14 8 8 8 10 10 15 15 11 15 15 21 22 34 24 24 9 8 8 8 8 9 8 15 10 25 16 17 8 8
8 11 11 15 12 12 9 14 10 13 10 10 11 11 11 12 12 15 13 8 8 8 8 12 10 12 9 11 11 17 13 14 11 11 12 12 25 24 28 23 19 19 16 22 11 12 12 16 16 24
24 11 9 13 15 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 10 8 8 8 10 11 11 11 15 10 19 13 16 10 10 10 10 13 18 21 21 13 15 12 13 14 10 10 10 13 19 21 8 8 7
8 13 7 9 9 10 12 13 13 18 16 18 9 9 9 11 8 8 8 8 8 16 12 12 12 12 12 18 15 23 22 13 8 8 8 8 8 10 18 12 12 11 10 10 8 8 8 8 8 8
10 18 24 17 11 12 12 12 14 22 10 12 12 9 9 8 15 17 11 8 8 12 11 13 13 18 11 11 11 13 15 19 20 23 8 8 7 7 7 8 12 12 12 16 12 10 10 8 8 6
6 8 8 10 10 10 16 13 11 15 17 19 27 11 12 11 10 12 10 9 10 11 9 10 10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 10 10 16 19 15 11 11 12 12 12 12 12 11
11 11 18 15 14 10 8 8 10 10 8 8 |