BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123J22.T7 (MSMg01no123_j22.b1) | MSMg01-123J22.TJ (MSMg01no123_j22.g1) |
ACC | AG333179 | AG333180 |
length | 1,238 | 1,203 |
length of high quality (start - end) | 332 (137 - 468) | 359 (129 - 487) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_j22.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_j22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_j22.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_j22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCAAATTTNTNNNGATCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCCCTTTATGACCCCCACATGA
AAAAATGTTCAACATCCTGAACCTTTAAGAACACGCAAATCAAAACAACC
CTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCCGG
TGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATT
CTTGGTGGGATTGCAAGCTTATACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAG
TTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCCGCAATACCTCT
CCTGGGCATATATCCAGAAGATGCACCAACTGTTAAGAAGGACACATGCT
CCACTATGTTCATAGTTTCCTTATTTATAATATCCAGAAGCTGGATAAAA
CCCAGATGCCCCTCAACATAGTAATGCATACAGAAAATATGGTACATTTA
CACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCC
TAGGCAAATGGATGGATTTGGAGGGCATCATCCAGAGTGAGGTAACCCAA
TAACAAAAGAACTCGCACCATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCC
CAGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACCATTTGCTAAACACATGA
AACTCATGGAGAAGGAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAAA
ATTGAGAACAAAACACCCTTAGAAGGACTTTACAAAGACCAAGTTTGGGT
CTGATACTAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCCTATCCGGGGATCCAT
CCCCATAATCCCCTTTCCAAATGCCTGACCCAATTGCATACCCTAGCAAG
ATTTTTGCTGAAAGCACCCCGGACTACCTGTCTCTTGGTGAAACTATGCC
TCGGTCCTGCTCAACCCATAAATTGGCATGCCTCTCCTTCCCTCTATTGG
ATAGTATTCCACAGTCCCCCCTCTGGCAAACATCTTTTTCTATATTCCCC
CTGTACTCTACAGGGTTTCCCCAATCTCTATTACTGGGGAATCCCTCTCT
TTGCAAACTTACCCCTTAACTTCCCCTCTAAATGCTCCGCGCTCCCTCCT
CCTTCCCCTTAGACTTCCAAAATATACGTTNCTCTTTTCCTCCCATTCTA
TCTCGCAAATCAGACTCCCCTCCCTGTCTCTCTTGCCG
| NNAAATATATTNNNTATGATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTATAACGCCCCTCTGNCTGNNC
CTGGCTTTTGGTCATGCCTTTAAAGCCCCCTTTCAATGGAAGCTCTTAGT
TCCTTCTCTGTCTCAATAGGATTCTTCTGAATATTGATATTTCTCCTTAT
GAAAATGCACCAGCTTTATTAAATGGATATTATAGTGATTTACAGATCCT
ATTTCTCTTTGAAATATTTAGTGACGTTAAATTATTGAGATTCTAAAAAG
GTAAAAAAAAAAAACCAACAAACCAAAACCAAAACAAAAAACAAAACCAC
AACCTCCACCTCATTAATTCATTTGCTTAGTACCTGTTTGGTTCTCTAAG
CATATATTTTTTTTAAAATATTTAACTTATTGCTTATTTATAAAGGATAT
TTCTAGTTTTTTTTTTTTTTCCAAGGAAGGTCCAGTGTCTCACAATTCAA
AAAGAATTTTCTTTTATATATTTGAAATATTGTGTTACCAAAATTTAACA
TTCTTCCCTCCCACTGCAAATTTTACCTTATTTCATTGTCTTGCGGACTT
CTAATAAATATGATCATGAAACATCAGACTGTATGGTTTTGACTTTTCCT
GACATAATGCCCTATACTAGCTATCTCGTTACTTTAATTTGCAATTCCAT
TTTAACAAGCATCAGAGTTTTTTCCAAATTTTGCTGCTTATAATTCCGAT
TGGTCAAAAAGTAATCTATTGACAGTAGTTTCCATTCCTCCTGATTTTTT
CACCCCCTTGATTTCCTTCTGCTTGCTTTAAAAATGCCCGCTGTTAATAA
CATGTATTTCATTTTGTGGTTTCAAAGGTATTTTGTGCCCTATTATTTAA
AAGTCTTCTCCTTAAAGGGTTCTTCCTTACTTTCCATTATCTTTTATTTT
ATTATTTCGATGACATGGTATTTGCCATATAATATCCTTTTTTTCCTTAC
CTCTATATGTCCTCTGTACGTCACATTGCACTTCTCTAATTTTTACATAC
ACAATTTCTCTTCTTCTTATAATTTCCAATTCTCTTTTTAATTATCTGGT
TCTCTTGTTTCAACCCCCTTCCTATAATATTCCTCTAATTCTGTTCTCCT
TTCTACTTTACCTTTATCTCGTCTTTCTTTCTTTTTTCTATCTATACCCC
TCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 8 8 8 10 8 8 3 0 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 10 10 7 6 8 8 13 19 19 8 8 8 10 10 15 17 24 35 36 36 37 37 37 40
43 43 39 39 39 39 39 39 43 42 42 42 37 36 36 36 36 32 32 32 31 31 31 37 37 35 35 24 21 13 13 11 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 12 10 16 16 25 26 28 28
30 41 59 59 57 57 57 53 53 50 50 47 44 44 39 37 37 37 26 26 12 12 11 12 12 14 12 12 11 11 10 8 8 8 8 8 10 15 32 32 48 48 59 48 59 57 57 48 53 50
50 50 50 50 53 53 53 48 57 57 48 48 50 57 57 57 68 57 54 50 48 48 50 47 47 48 48 57 57 57 47 47 47 50 47 57 59 59 46 54 54 59 59 59 32 32 14 14 14 32
34 57 57 48 47 43 42 41 35 35 42 42 57 48 57 57 57 59 59 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 57 57
57 68 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52
52 52 57 59 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 48 48 57 47 47 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 59 44 44 41 41 41 47 41 43 43 48 59 59 59 57 54 54 59 59 59 57 57 48 48 48 48 59 48 48 48
59 59 57 57 59 53 48 50 50 50 41 30 24 12 12 10 10 10 10 10 16 29 31 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 43 47 43 48 48 57 57 57 59 59
59 59 57 48 48 57 48 48 59 59 47 34 34 21 20 11 8 8 8 8 8 10 12 13 11 11 11 11 13 15 12 25 30 57 44 50 44 44 43 43 37 33 30 30 32 32 35 39 37 39
39 37 24 24 11 11 11 11 11 15 15 18 28 32 39 37 34 37 43 46 48 57 44 59 47 43 43 46 46 48 48 46 47 46 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 46 46 43 47 48 43
43 39 32 32 30 31 28 31 36 30 37 40 57 47 47 43 43 42 44 37 37 37 39 42 43 42 47 42 39 41 42 40 35 28 36 28 36 28 35 37 43 42 43 42 43 37 43 35 43 43
44 43 43 35 35 43 50 50 43 43 42 42 42 42 42 43 44 46 42 42 35 32 28 36 27 27 28 40 28 28 28 40 40 47 46 42 40 28 25 28 28 35 39 44 26 23 11 11 11 23
23 19 19 16 30 24 35 25 23 13 13 24 23 18 11 11 12 16 23 29 37 30 33 33 24 24 19 17 17 24 26 20 20 20 30 32 32 32 33 25 24 18 18 16 16 16 23 23 24 20
14 12 9 9 8 8 8 9 16 13 23 16 17 17 12 19 12 11 11 11 11 18 22 12 12 12 12 18 26 22 28 28 28 28 34 30 28 28 28 28 20 29 30 34 25 18 11 8 8 10
11 13 23 23 16 12 10 11 10 10 13 9 9 9 11 10 8 10 8 8 10 10 13 21 19 22 21 21 25 24 12 15 12 9 9 11 11 12 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 8 8
9 12 16 10 8 8 10 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 14 13 10 10 10 10 10 13 12 16 11 10 10 8 8 8 11 9 12 10 12 9 9 9 9 9 9 11
11 12 18 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 21 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 7 8 8 10 10 10 10 9 13 16 16 10 8 8 8 11 8 8 9 9 12 9 10 10 10
10 11 11 34 17 17 14 20 10 10 8 8 8 8 9 8 8 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 15 11 11 10 10 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12
11 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 21 21 11 10 8 8 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 11 9 8 8 6
8 6 6 6 6 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 10 10 9 10 9 11 9 9 9 10 10 9 11 9 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 10 10 9 9 9 8
10 8 6 8 6 7 8 8 10 8 9 9 17 17 11 11 15 12 11 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 10 8 6 6 8 8 8 8 7 7 10
10 8 8 8 8 8 10 9 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 9 11 9 11 11 11 12 16 11 8 9 6 11 6 9 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 8 10 8 6 6 8 11 8 12 14 10 10 8 8 8 8 8
8 9 9 8 8 8 8 11 8 9 8 6 6 6 6 10 9 9 12 15 15 8 8 10 10 8 8 10 10 15 10 10 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 7 10 10 3 0 0 0 3 7 6 6 7 7 6 6 6 6 7 10 9 9 9 9 10 14 15 15 8 9 3 0 3 18 19 22 12 14 18 17 17 17 12 19
24 35 35 35 35 35 28 28 28 28 31 31 33 37 37 34 34 23 12 12 9 9 8 7 8 11 11 13 9 9 9 6 6 6 6 6 8 10 14 10 10 21 3 0 3 17 3 0 0 3
21 21 33 33 37 41 23 19 9 9 9 9 19 23 23 21 10 10 10 15 14 19 13 13 12 12 15 15 32 28 26 21 25 27 47 47 47 48 57 41 57 43 43 30 36 36 42 42 47 47
35 35 43 48 48 48 48 43 44 43 42 37 33 36 29 29 42 42 43 47 57 48 44 43 44 44 43 43 43 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 44 46 48 48 48 48 47 47 47 50 57
57 48 48 48 44 50 44 43 43 43 43 44 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 47 43 43 57 47 54 54 57
57 57 57 57 37 37 40 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 54 54 54 48 57 48 48 54 57 34 41 18 18 18 32 34 57 57 59 48 48 48 59 43 48 48 57 57 48 48 57 57
48 48 48 48 48 48 59 59 47 47 43 47 34 33 24 18 25 19 23 18 30 19 22 22 30 30 37 32 30 30 32 37 37 30 28 28 31 33 31 32 23 25 25 34 40 25 28 28 28 40
34 34 24 30 33 40 30 30 32 39 39 48 48 59 59 59 59 48 47 47 47 48 48 59 41 33 19 24 14 26 26 28 26 26 35 39 42 43 57 48 48 47 43 39 39 43 36 34 37 37
28 32 37 47 59 59 59 25 21 15 14 11 9 9 10 10 13 27 34 42 47 48 48 48 48 57 59 59 59 57 57 48 57 57 57 59 59 59 59 59 47 47 46 46 43 59 59 59 59 48
48 48 48 37 39 37 41 25 27 15 18 17 34 32 24 16 16 11 15 21 28 18 18 18 24 26 37 37 48 47 47 35 28 28 25 26 21 21 18 11 8 7 7 10 10 16 12 12 12 11
9 12 12 12 12 11 23 28 28 32 33 39 43 59 59 59 59 59 57 57 57 41 34 20 24 20 34 34 47 34 34 23 32 29 32 25 39 28 30 17 17 17 32 30 43 39 33 30 30 24
32 22 26 15 14 14 14 13 14 12 15 15 14 13 24 21 28 37 37 30 30 18 23 18 28 15 20 20 32 28 36 29 37 28 28 23 31 28 36 36 37 27 19 14 11 13 16 29 29 36
32 35 32 32 34 23 18 18 12 18 15 28 22 32 23 23 23 37 31 26 26 15 10 10 12 10 10 18 27 37 37 32 32 24 20 20 27 19 16 14 18 11 11 11 13 11 11 11 19 19
30 22 25 21 12 17 10 10 11 13 20 20 22 25 20 19 17 17 16 21 18 12 19 10 9 9 9 9 15 8 8 8 8 6 7 10 10 11 19 15 22 12 12 9 9 9 15 16 13 11
8 6 6 8 9 10 21 15 20 20 24 18 21 11 12 12 18 18 25 33 23 27 12 9 8 12 8 8 10 10 13 12 11 11 11 13 11 10 10 10 14 13 12 10 10 9 9 9 12 19
13 6 6 8 6 6 8 10 13 9 9 8 8 8 8 8 13 21 19 25 18 15 8 11 8 9 9 11 12 12 12 20 13 10 12 11 8 8 6 6 10 10 22 15 13 13 11 15 15 10
10 10 8 12 10 10 10 10 13 23 11 9 9 15 10 10 10 8 8 8 8 6 7 11 8 10 11 19 22 21 19 8 8 8 8 8 8 9 11 10 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8
8 8 8 9 9 11 8 15 12 10 10 10 15 15 13 10 10 8 8 8 10 10 11 11 9 9 9 9 9 10 10 10 10 13 16 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 15 19 19 9
9 9 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 7 6 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 19 32 19 15 10 11 10 10 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 12 17 13 13 13 20 17 15 8 8 8 8 8 8 8
8 6 7 10 8 10 8 7 6 8 8 10 10 10 10 11 11 8 8 8 10 10 17 19 9 9 8 8 6 6 8 8 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 7 7 6 6 10
10 8 8 10 11 8 8 10 10 10 11 12 12 12 11 11 10 10 11 14 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 11 8 8 10 9 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 16 11 10 12 13 10 6 6 6 6 8 8 12 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 13 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11
11 10 10 |