BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-128H24.T7 (MSMg01no128_h24.b1) | MSMg01-128H24.TJ (MSMg01no128_h24.g1) |
ACC | AG336753 | AG336754 |
length | 874 | 754 |
length of high quality (start - end) | 235 (48 - 282) | 337 (76 - 412) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_h24.b1 PHD_FILE: MSMg01no128_h24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:41:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_h24.g1 PHD_FILE: MSMg01no128_h24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:41:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGCGCGCGG
AATTCAGGCTGACTTCCCAATTCTTTGTGCAGTCTACCCTGACCTCAATT
TTCTAATCCTCCTGTCTTTGTCTCTCCGGGATCACAGGTGCCCATACCCC
CATACTCAGGAATAAGACAACACACTACAGCACACTTGTGTGCTCATGAG
AGTCAGAGAGAGAAAGAGTTCAGGCTATGGGGACAGGGTCAGGGGAGGGT
GGAGGGTGGCATAGAAGGGTTAGGGAGGGGCAGGTTTGGCACCTTCAGGG
TTCCGTTCCATGTTCTACTGCCCCCTTTCTTCCTCTGTTGAACATTCCCC
CAGCCCATTCCCTTTATTTATCCCGACTTATCCCCAGCTCTATTTCCTTT
GTCACTGTCTCTTTTCGCCTTTTCCCCCCCTTTTTCTCTATCTTGTGGTT
TCCCCGACCCCTTATCTGTTTTTGTCATCTATCACCTTCCTATTTTTTAT
TAATTTGCTTTTTCCCCACACTCTTTCCCTGCCTTCTTCCCCCTTCTCAT
GTTTCTCCTTTCCTTTTCCCCTCTTTGCCCCCCCCCGCAATATCCACGGC
TTCCCGCTTTCTTCCTCTTCATTTCTCCCATGTTATTTTTGCCCCCCTTT
CCCCTCAGTTTTTTTTCCATTTTTACATATCTCGCCCCTTAATTAACCTT
CCAGTCTCTGTCTCTTCTTGCCTCATCTCCACGCACCTCCGCAATTTATT
TATTGACCGCACCTGTTTCATCCTATTCGACCTTTATCGCCTCTATCCCC
ACATCATGCCTTCTGTTATCCTCCCCTATCCTCTCTTTATTTCCTCTTTT
CTCCACCCCGTCTTTGTTCCCCCC
| CGATTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGAAGGTGGACTCCAGAAAATCAA
ATAACCCCGTTAAAAAATGGGGCTCAGAGCTAAACAAAGAATTCTCACCT
GAGGAATACTGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAGCATCCTT
AATCATCAGTGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACAC
CAGCCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGA
GGATGTGGAGAAAGAGAAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCT
TGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACA
TAGTACTACCGGAGGATCCCGCAATATCTCTCCTGGGCATATATCCAGAA
GATGTCCCAACCAGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGC
CTTATTTGTAATAGCCATAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCACCTCAACAG
AGGAATGGATACAGAAAATGTGTAACATTTACACAATGGAGTACTACTCA
GCTATTAATAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCT
GAAGGGCATCATCCTGAGCGAGGTAACCCAATCACAAAAGAACTCACATG
ATATGTACTCACTGATAAGCGGATATTAGCCCAGAAACCTAGAATACCCA
ATAA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 7 12 25 39 37 37 37 32 29 29 32 37 37 37 37 41 41 48 48 48 28 28 28 25 23 21 21 11 11 9 9 9 9 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 21 27 31
31 31 31 31 31 31 31 31 41 25 30 15 12 12 12 8 8 8 8 8 11 17 28 35 34 34 37 43 43 48 48 57 57 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 42 47 42 47 47 50 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 25 23 10 10 10 10 13 23 32 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 43 47 47 59 57 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 46 46 50 41 52 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 48 48 44 57 46 48 48 43 50 43 44
42 33 33 33 42 42 43 47 47 48 48 48 57 48 48 43 39 37 37 37 42 47 44 44 46 44 44 37 36 25 25 36 36 44 44 39 35 35 42 42 39 39 37 39 39 39 42 32 35 35
39 39 43 39 35 39 39 39 35 35 32 37 23 28 28 36 33 30 30 33 39 39 39 30 30 24 28 19 23 28 24 23 15 14 15 15 25 15 15 11 10 10 10 10 15 12 12 13 12 13
12 20 12 15 12 12 12 16 15 16 15 16 16 11 11 11 12 12 10 10 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 12 11 10 15 19 17 22 10 11 9 15 9 9 9 13 10 10 10 15 23
12 12 12 11 15 13 13 10 9 10 15 16 11 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 13 10 12 12 10 10 10 10 10 10 17 11 11 11 11 19 17 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8
11 12 8 6 6 11 8 10 10 10 10 9 9 12 12 11 8 8 9 9 9 9 12 12 13 14 24 23 11 8 8 8 8 10 12 15 10 10 6 6 8 8 8 8 11 15 10 10 10 12
13 21 19 21 9 9 11 19 18 25 21 19 11 11 11 11 11 11 9 11 8 8 8 8 10 10 10 13 13 14 10 10 9 11 11 10 10 10 15 19 9 10 10 18 13 12 15 8 8 8
8 8 10 9 15 10 10 10 13 10 14 15 14 16 15 11 8 8 6 7 8 8 10 9 10 11 8 10 8 8 8 10 9 9 9 10 9 10 10 11 11 21 11 10 10 8 12 8 8 8
8 13 13 8 8 8 8 8 8 18 15 10 9 8 8 8 12 13 9 8 8 10 10 10 10 10 10 10 15 26 31 31 37 18 18 11 11 11 8 8 8 8 8 11 9 9 9 8 8 8
12 8 8 10 8 8 8 15 15 10 10 12 16 13 8 8 10 10 8 8 7 9 9 9 13 15 11 12 9 10 10 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 21 22 14 14 14
10 8 8 6 8 6 6 8 8 9 12 12 11 12 12 12 8 8 8 8 14 18 24 13 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 11 12 17 15 11 11 11 11 11 11 15 10 8 6 8
10 6 8 9 9 8 6 10 6 6 8 8 11 10 8 15 12 8 7 6 6 6 9 9 9 10 16 11 9 7 7 7 8 11 16 16 10 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 9 12 12 12 12 9 8 8 8 8 15 15 8 8 8 9 9 10 8 8 7 13 8 10 8 10 12 15 13 8 10 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 7 7 13 9
9 9 9 6 8 6 6 6 6 8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 11 8 10 8 8 8 10 10 7 6 7 7 8 8 8 8 13 15 8 8 8 12 13 9 14 14 14 14 19 15 19
23 19 10 8 8 8 9 8 8 8 7 9 9 18 12 8 8 8 8 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 21 25 40 48 48 48 53 57 57 50 53 59 59 59 59 37 37 37 37 37 37 27 18 9 9 9 8 7 7 7 7 8 11 11 11 11 15 29 25 33 33
33 33 33 33 47 47 47 37 37 34 29 16 19 10 10 10 14 12 11 10 13 21 25 33 33 37 37 39 48 47 47 47 50 47 47 47 53 53 53 47 43 43 43 43 43 50 54 54 54 54
54 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 50 50 50 50 46 50 57 57 42 38 36 22 22 23 36 37 57 59 57 57 57 57 54 54 47 48 50 47 47 50 57 57 57 57 50 50
50 37 37 41 50 50 50 50 50 50 50 41 50 50 50 50 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 50 50 57 57 54 54 57 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 45 45 45 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68 68 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 52 54 52 52 52 52 52 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 54 52 50 46 46 43 43 43 50 43 44 43 43 39 59 59 57 57 40 43 37 39 43 32 30 14 14 18
34 32 37 37 36 33 31 28 32 42 42 44 42 39 59 59 54 57 57 46 46 37 36 36 25 36 30 36 36 47 57 54 40 43 39 30 30 25 25 28 37 37 48 47 47 48 48 48 57 59
48 48 48 48 48 59 21 19 9 9 9 15 17 29 22 17 17 15 27 11 11 11 16 16 28 34 43 50 59 59 48 48 48 59 43 43 43 39 39 43 59 59 59 57 57 46 43 39 39 32
32 35 42 42 57 59 48 47 48 43 43 43 43 37 43 44 59 43 43 43 46 46 44 44 48 57 57 57 57 59 57 57 40 40 40 44 46 47 43 43 47 57 57 36 36 23 25 25 44 44
40 44 37 43 43 42 40 30 26 27 28 31 28 28 15 18 11 11 11 11 24 28 28 13 17 17 34 34 43 35 37 37 32 28 28 28 28 36 28 30 30 24 28 18 12 11 12 12 28 28
37 37 32 25 25 30 22 22 22 19 19 19 23 23 32 28 28 28 28 24 19 16 15 15 26 27 43 43 43 34 34 25 25 25 34 34 38 29 28 21 15 13 13 26 30 47 48 47 39 35
32 32 37 37 41 25 25 11 11 11 17 21 22 21 21 22 19 22 30 34 37 37 27 19 16 17 19 19 27 39 32 34 23 19 24 18 16 16 26 26 22 22 25 34 20 24 15 17 17 16
12 10 8 8 8 10 15 17 26 26 36 39 47 43 37 19 13 10 9 9 13 11 20 20 18 20 28 25 19 12 12 22 20 24 27 24 24 29 34 12 8 8 8 10 8 23 26 33 26 30
15 15 12 19 15 16 19 32 32 30 30 30 30 29 22 14 12 10 10 10 10 12 11 10 9 9 9 9 10 10 15 11 12 12 12 21 17 20 15 15 9 9 9 14 18 21 14 14 12 13
8 8 8 8 |