BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-140P01.T7 (MSMg01no140_p01.b1) | MSMg01-140P01.TJ (MSMg01no140_p01.g1) |
ACC | AG345947 | AG345948 |
length | 683 | 712 |
length of high quality (start - end) | 283 (69 - 351) | 606 (77 - 682) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no140_p01.b1 PHD_FILE: MSMg01no140_p01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:58:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no140_p01.g1 PHD_FILE: MSMg01no140_p01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:58:50 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCAAATTTGCGGCGCTAAACACTCACTATCGAAGAGGATCCGCGGAATTC
TTCTATCTCTACCTTAGAGTGCAATTTGAAATAACAGTGTGTGCTCACAC
AGTTGCCCCACCCACTATGAAAGGAGTTCTATTCAAAGAGCAAAGGCTGT
CTCAGTTGTCTCCTTAGTCTTCAGGTATTGGCACACAATGAGCATTCGTA
AAATGTTTTTGTACTTGTATCATGACTATTCCCAACTGAGAAATGCAGTC
ACTTCCCAAGACCCAAAGACATGTTTGTCTCAGACTTGGTCAGATAACAT
CAGGCCAAGAAGTCAGGGAGTGGCAGTGAAGAGCAGCAGCCAAGGATCCC
TGGTCAAAGAAGTGCAGAACTGGGTTCTTTTGGGCCTGTGCTCCCAGGCA
CTGGGAAGGGCATAATTTGCCCTTTTCATTTCCTTTTTCCCAAAAAAAAG
GGAAAAAATGGTATGTCCTTGCCCAAGGGGGCCCCTTGCCAAAAAACTTT
CCCCCCTGGCAAATTATAAACCCTCCCCTTGAAAACCAAAATTTTGGGGG
CCCGGTTTTTATAACCAAAAAATATTTTTGATTTGTGGGGGGGAAAAACC
CCCTCAAAAATGGGGTGGTCGCCTCTGTTTTTCCCCCAAAAGGGCCAAAA
AAAAAAAAAAAATCTTTTTCATCATGGTCTCCT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAACAGAGGAATCTCCAGTGGCC
GAGAAGCACTTAGAGGAATGTTCAAAGTCCTTAATCATCAGAGAAATGCA
AATCAAAACAATGCTGAGATTCCACTTCACACCAATCAGAATGGCTAAGA
TCAAAAACTCAAGTGCCAGCACATGCTGGCTAAGATGTAGAGAAAAAACA
ACACTCCTCCATTGCTGGTGTGATTGAAAATTGGTACAATCACTCTCGAA
ATCAATCTGGAGATTTCTTAGAAAACTGGAAACCTGAAAGCAAAGTTATA
CACTCTTTGGTATGTATCCAAAAGATCCTCCACCATACCACAAGAACATG
TGCTCCACCATGTTCATAGCAGCCTTATTTGTAATAGCCAGAAGCTGGAA
ACAACCCAGATGTCCCTCAACTGAAGAATGGATACAAAAAATGTGGTTCA
TTTACACAATGAAATACTACTCAGCTATTAAAAACAAGGACACCATGAAT
TTCACAGACAAATGAGTGGAACTAGAAAATATTACCCTGACTGAGGTAAC
TCAAAAGGACATGCATGATATGTATTCATTAATAAGTATATTTTAGCCCA
AAAGTACAGAATACCTAGGATATATCCCACAGACTGTAAGAAAGACCCTA
GAGAGGATGCTA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 13 24 15 28 23 19 11 11 15 20 19 15 8 8 8 13 12 17 20 15 12 11 7 9 7 6 6 8 8 9 14 23 23 25 18 18 28 30 39 48 36 36 36 33 33 33
59 41 41 39 23 20 6 6 6 6 6 7 17 21 22 9 8 8 22 22 31 36 36 38 35 36 36 36 37 37 57 44 37 24 24 30 42 42 42 42 42 42 42 42 48 48 48 48 48 48
48 54 54 57 57 57 47 47 47 47 47 47 50 47 47 47 57 44 44 30 30 30 44 42 47 50 50 50 51 68 68 50 50 50 50 50 50 57 47 47 47 57 57 57 57 57 47 47 50 50
50 50 50 50 50 50 50 50 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 41 41 41 50 50 41 52 52 52 50 57 52 43 43 36 32 20 20 38 38 57 57 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 42 57 35 35 35 57 47 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 50 44 35 32 32 43 43 44 59 43 43 37 50 50 57 57 43 44 23 23 28
43 43 59 50 44 44 57 57 57 57 54 54 47 57 57 57 57 57 44 42 35 35 35 28 31 35 44 42 43 36 44 36 37 37 46 46 57 44 44 48 48 48 59 59 59 47 54 54 59 46
48 46 43 43 43 43 43 28 28 11 11 11 15 19 16 23 22 24 25 26 32 32 35 47 39 47 39 39 37 35 32 32 32 32 18 21 10 13 13 13 12 12 25 23 30 28 19 18 20 18
25 13 10 9 9 8 8 8 12 9 8 10 10 16 15 10 10 10 12 13 9 8 8 8 8 9 17 15 17 19 18 21 16 13 8 8 8 8 8 12 11 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 9 12 10 8 8 8 8 15 12 15 9 9 13 9 11 11 11 15 8 11 12 13 13 16 18 14 11 12 16 24 22 37 26 22 12 12 12 14 10 9 8 8 8 9 9
9 10 10 11 15 8 8 8 8 10 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 9 10 9 8 8 8 8 8 10 19 19 13 10 10 8 8 8 13
16 16 24 19 17 10 10 9 9 9 12 12 6 8 6 6 7 11 10 10 12 14 14 11 11 11 12 12 10 11 11 9 11 12 10 10 9 10 10 10 9 9 10 12 10 10 11 11 12 13
12 13 10 10 9 9 9 17 10 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 12 10 14 14 14 24
21 16 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 12 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 9 8 8 8 8 8 10 11 11 14
17 15 20 12 12 12 12 11 11 16 11 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 13 6 6 6 6 8 11 13 26 22 25 25 30 33 33 33 33 47 40 37 37 37 37 37 39 25 27 15 12 9 11 9 8 8 8 8 10 10 10 19 15 19 11 19 26 36 36
36 36 33 33 33 37 37 34 23 16 12 10 9 9 9 10 12 18 21 26 23 33 33 33 33 36 36 50 50 35 35 32 37 33 48 36 37 37 36 37 37 37 36 36 40 40 54 54 57 57
57 57 57 48 46 39 43 46 46 44 44 36 35 35 42 44 50 50 48 50 41 41 47 41 48 50 50 50 50 57 57 57 57 48 50 51 50 50 50 50 50 50 57 50 48 48 48 46 46 57
57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 51 51 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 37 37 43 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 57 57 59 59 57 59 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 44 41 27 20 20 38 41 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 44 43 33 28 29 44 44 57 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 59 59 57 54 54 57 59 57 57 57 59 52 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 50 50 50 50 50 59 59
54 54 57 59 59 59 54 54 54 48 57 57 57 48 48 47 59 44 42 42 37 37 37 44 44 59 59 59 59 59 54 54 54 34 34 20 20 20 23 32 36 48 47 48 48 59 41 42 30 32
32 39 59 43 43 34 36 25 36 40 59 59 59 59 59 57 57 46 46 46 46 47 34 34 25 25 34 34 41 35 35 37 37 37 39 39 40 39 39 43 39 39 35 39 39 43 43 43 43 43
48 48 43 43 39 43 43 43 43 43 43 54 54 54 54 54 54 57 54 47 44 41 28 28 36 44 44 54 54 54 54 54 57 57 43 43 37 44 44 44 37 39 37 35 35 39 43 46 48 48
42 42 33 32 32 42 32 42 42 42 42 42 42 42 35 42 43 43 44 44 59 44 44 30 23 23 25 25 35 42 42 46 46 41 41 41 42 44 36 23 23 16 27 24 28 28 24 24 37 42
40 43 39 39 43 34 28 18 21 14 18 18 31 23 30 30 39 39 43 43 34 31 24 24 28 33 34 37 37 39 31 30 25 28 20 23 32 34 47 39 39 37 26 26 15 17 17 24 24 29
29 30 23 22 22 23 25 28 27 26 26 21 19 18 19 19 18 14 20 28 30 26 30 24 30 31 27 21 15 15 19 21 28 24 18 12 11 9 9 12 9 11 24 37 30 24 20 15 15 12
12 13 14 18 22 20 19 15 10 10 8 8 |