| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-141B20.T7 (MSMg01no141_b20.b1) | MSMg01-141B20.TJ (MSMg01no141_b20.g1) |
|---|
| ACC | AG346074 | AG346075 |
|---|
| length | 1,230 | 1,214 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 647 (127 - 773) | 472 (85 - 556) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_b20.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_b20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_b20.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_b20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:09 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCGTCCTTNNNNNGACACTGCGCGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCAGAAGGCTCAGAGGACCCCATAAAACTCACACCTTGTTTG
ATGGCATTCCCAGGCTGCCGTAACCAGCTGCACTGCCCGCTGGGCCCCTC
CCCCATCTCCACTTTGCCACTATGATGCCTGTCTGAGGCTGATTTAAGTT
TTGAGGTTTTAAACATCCATTGTAGCTGGCGTGATGGCGCACGCCTTTAA
TCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTTGAAGCCAG
CCTGGTCTACAAAGTGAGTGCCATGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACC
CTGTCTCTAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAC
AATCCATTGTATCAGGCTACATTCTCCCTGGTAATTTCTAGAAGCTTCCG
TAACCCCATCTGGACCTCAGACTGTAAGAGGAACAGAGAAGAGTCTGATG
TATCTCACAGATTCTTTTCCAGCATCTGGCAGGCCTTGGCTCACACAATA
AACACCTCAGAGTATTTGCCAGATGAACGACTCCAAATGGTAACCGCTTC
GTAAAGTGGAACCACCCCCCCCTTGACCCACTCGTCTCCTACATTCTGTT
ATAAAAACCAACTAGAATCTTTCTTATCTATAGCCCAAAAGTCTCTCTCT
TATTTGTTTTTTTCTTACTTATTTGATAGCCCAGGCTGGCCTCACACTCG
GTGCTCACCTTCCTGACTACACACTTAAGAGTTAGGAAAACAGGTATATA
CCCTCACACCCGGATTATGGCGTACTGAGGAAGGAACCCAAGGCTTTATT
GCAGCTATGGCGCACTCAAATTAGCCTTCACACCCCCTCCAGTTCTGAAA
GCCTCCCTCTTCTTGAAAAATTTGTCTCCTTCACATCTTTCCTGGAATAT
TCCCGGCCCTGGCCCTTTCTCTTTTGAAAGGCTACCTAAAAACCATACCC
AACCCTGTCTAAAACCAGTTCTAGACCAATCTCAAACCCGAACCATTTTT
TAATTGGTGGTCCCCGGAAAAATTCCTCCTGAACCTTTAAGCGAACCCCC
TCTGAAATGGTCCCACCATACCATCTCTCTGGTAAGGTTTTTAACTCTTT
CGTGTGGGCGGAATACACCTCCTCCCTCAATATAACATATGTCCTCTGTT
TTCAATAACTCCCCCATGTCGCTTTCAAAA
| CCTGTCTTTTNNNACGATGGAGCCTGGGGCGCCGGTXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTTGAGTTGAATCCTTCTCAACAG
TCTGTTTTACGGGACCTCTTCATTAACATGACCCCCCGTTCTGGTTCCGG
AATGAGGGATCTTCCTTGCGCCGGTGATGGTAACCGTCCCGGTTTTTCTC
ATCCCAGGATTTCTCGTCCCGGGTTTCGGCACCAACTCTTACACGCTTTC
TCACGACCGGCCAGGAAGAACACAACAAACCAGAATCTTCTGCGGCAAAA
CTTTATTGCTTACATCTTCAGGAGCAAGAGTGCAAACCCCAAACCCAAAA
ACGAAAGCGAAACCCCGTCCCTCTTAAGGAGAGTTATCCTTCGCCTAGGA
CGTATCACTCCCTGATTGGCTGCAGCCCATGGCCGAGTTGTCGTCACGGG
GAAAGCAGAGCACATGGGGTGGAGGACTACCTTTGGCACATGCGCAGATT
ATTTGTTTACCACTTAGAACACAGCTGTCAGCGCCATCTTGTAACGGCGA
ATGTGGGGCCGGCTTCCCACAAGTTGAATCTACTCCCTGCTACACATCTC
TGACCACACCCCTATAGAAGTGGCCACAGACTATTGCTCCTCCCGAGACC
TCACATGGTTGCCTGGTTCTCCTCTCCCCAAAGCATGACGAACTCCGTCT
CTCCTTCCTTGTGTCTCCCTTTTCCTCTAGGAACCCGGAAGCCTCACCTT
ATCTTCCATCCAATAATTGTACCGTGGTTTTCTTTACTTGACTGATCATG
ATCCTCTTGGGTAACTGGACTTTTATCATCGTGCCTAACCTGACCTCTTA
TTGTTAGCCTGATTTTCTATAAATAGGTCCATTTTTTCTTTGTGCGAAAT
TATTTTTCATTTTTTTTGTTATTCCCAACTTTTTTTTTTACCTCTTTTTC
CTTTTATTTGTCCTCTGTTCCATATTTTGTATAATTCTTTCTTTTTTATC
TATTTTTTTTTTTTTCCTACTTTTTTCATTCTCTAATTTTACATCTCTCT
CTCTTTTACCTTTCTTTTATCTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTTTCTTTCT
TTTTTACCTTTTTTGTTTTTTCTTTATATTTTTTCTCTTGTTTCTCCTTT
TATATTAATTAATTTATTTTATTCTTTCTTATTCTCCTTTTATTTTTATT
ATTTTATCTTTTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 7 9 7 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 17 19 16 17 13 10 8 8 8 15 21 28 24 28 28 33 34 37 43 43
42 33 33 33 33 34 37 37 43 34 24 24 24 32 32 33 33 44 39 37 37 31 21 13 9 9 9 11 11 10 9 9 9 9 8 9 9 10 16 24 37 37 31 31 35 35 35 35 35 53
50 53 57 57 57 38 36 36 33 44 37 40 37 27 19 10 12 8 8 8 11 12 11 16 16 23 21 22 26 28 28 31 33 33 23 17 9 8 10 8 19 18 33 39 39 37 33 33 36 50
38 57 48 47 47 47 47 53 53 53 53 53 43 43 43 42 42 42 42 47 47 68 68 68 50 50 57 54 50 50 50 47 47 48 48 48 48 48 57 57 59 57 57 57 57 48 42 35 41 42
42 59 59 59 59 59 59 43 48 43 41 41 57 59 59 54 57 47 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 59 59 57 57 48 52 52 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 52 52
57 59 59 52 43 43 57 57 68 50 44 32 23 23 23 43 43 43 43 33 33 39 43 57 57 57 57 38 32 20 20 36 38 57 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 43 43 23 22 31
43 35 43 31 35 43 43 57 43 35 35 28 34 18 18 18 34 28 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 39 43 31 44 44 35 35 31 43 43 52 52 62 62
62 62 62 62 68 62 62 43 43 35 39 43 62 62 62 62 62 62 62 44 44 26 26 26 39 27 31 43 43 35 35 35 43 43 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 43 43 39 14 10 10 9 9 9 11 23 26 43 43 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 44 39 43 43 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 35 43 43 62 43 43 39 39 39 43 44 39 43 43 43 43 39 39 39 43 43 20 35 35 44 59 62 62 43 39
39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 68 59 59 57 57 57 52 52 52 59 45 43 43 43 31 27 39 43 59 43 52 52 57 57 57 68 68 44 44 43 42 42 33 39 43 57 52
52 45 52 52 52 59 38 32 15 15 21 38 43 57 59 59 68 68 59 59 57 52 52 57 57 57 57 54 57 57 52 43 43 29 29 29 44 43 43 43 44 44 42 43 44 57 57 47 59 35
35 35 47 47 47 28 28 20 19 19 27 32 39 39 43 44 46 48 59 54 54 54 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 48 54 48 57 48 54 48 59 47 47 43 39 36
42 36 34 34 36 36 43 42 42 42 47 40 47 42 48 57 57 57 59 59 44 36 28 28 28 33 33 41 47 41 41 39 41 32 32 37 31 31 30 39 39 40 48 48 43 48 43 43 40 40
40 43 43 39 40 35 35 37 37 47 50 50 50 47 57 48 57 38 36 36 33 33 39 40 40 39 39 37 39 36 36 39 37 36 37 37 37 29 29 30 30 30 28 31 37 33 33 33 33 33
29 25 22 22 25 34 34 39 37 37 34 25 22 23 28 23 28 24 30 18 10 10 8 7 8 10 10 10 11 11 12 16 24 25 23 18 16 18 18 19 22 22 19 19 17 17 16 15 11 17
11 11 11 23 12 17 17 24 21 30 27 23 19 23 21 19 12 12 8 8 8 8 8 10 10 10 13 11 9 8 8 8 8 9 13 14 10 12 14 10 8 10 9 10 10 22 10 9 9 13
15 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 9 9 9 9 12 11 10 10 11 16 12 11 11 11 12 12 16 12 18 13 10 10 10 9 12 13 11 16 16 28 13 8 8 8
8 8 9 12 10 12 12 12 14 18 15 10 12 12 19 12 12 10 9 9 10 15 13 10 10 8 8 8 8 10 10 10 12 13 14 20 21 23 14 12 10 10 10 9 10 9 9 8 8 8
9 8 8 8 7 7 8 8 8 9 10 11 15 10 13 11 14 18 11 11 11 16 11 10 10 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 10 10 9 9 10 15 11 9 9
11 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 14 12 14 10 16 8 8 6 6 8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 10 15 9 9 12 20 21 28 18
9 10 10 8 8 6 8 10 8 8 10 10 12 10 9 11 11 18 16 12 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 15 8 8 11 10 8 8 10 10 8 8 10 8 10 12 12 11 10 13 8
8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 11 11 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 10 8 8 6 6 6 13 8 9 8 8 8 8 11 9 9 10 11
8 8 8 8 8 8 11 10 10 11 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 6 8 6 6 10 8 9 6 12 8 8 8 8 8 6 7 7 7 7 6 6 6 6 8 8 9 9 9 10 8
7 7 6 6 8 9 8 8 7 7 10 10 9 9 9 9 8 6 8 6 6 6 6 10 7 9 9 10 10 10 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 9 17 3 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 9 12 13 8 6 8 8 8 8 17 19 19 9 10 10 19 22 24 12 12 12 21
9 9 9 23 23 35 34 34 38 38 53 47 50 50 50 50 47 41 27 19 8 6 8 8 8 10 10 10 9 8 8 11 11 14 20 23 29 37 39 41 47 47 50 50 50 47 57 42 42 42
36 39 39 39 39 35 35 31 31 26 19 13 10 9 10 8 6 6 13 22 31 33 28 32 22 22 22 33 33 47 47 27 34 15 15 12 11 11 18 23 43 44 48 42 42 42 47 48 54 59
57 57 48 46 42 39 35 35 39 44 46 54 50 54 47 47 48 48 57 57 47 47 41 39 57 46 57 57 57 57 57 40 46 46 54 54 54 57 57 57 47 43 43 42 44 37 47 43 43 57
57 68 57 57 57 54 50 50 41 43 43 59 44 43 43 33 44 44 42 38 27 27 28 35 43 50 50 43 37 39 37 43 43 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57
57 47 57 57 57 57 57 52 57 43 38 34 23 18 16 32 22 27 27 35 43 43 52 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 62 43 44 43 52 43 62 43 43 52
62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 68 62 62 52 52 52 52 45 44 44 26 26 27 43 43 62 43 43 27 27 27 43 43 62 41 41 41 43
35 39 39 39 39 39 31 35 35 44 44 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 43 43 43 43 39 43 43 62 62 59 44 35 31 31 43 43 43 43 31 39
43 43 43 43 27 27 13 13 13 13 13 39 39 62 62 62 62 62 62 39 39 43 43 43 62 62 62 62 43 43 39 31 31 31 44 43 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 44 43 35 35
39 39 24 24 23 39 20 26 38 43 35 35 43 43 43 31 31 27 34 23 17 17 17 38 38 62 62 62 62 52 52 62 62 62 43 43 26 27 27 43 43 39 43 43 43 35 35 35 59 59
62 62 62 62 52 52 52 57 52 52 52 52 52 33 33 12 12 12 32 32 52 57 57 38 30 14 16 16 24 34 43 52 57 59 43 47 35 43 43 43 43 43 21 21 12 12 12 24 15 27
32 43 43 26 21 13 13 12 12 12 12 11 12 12 24 15 18 38 38 43 43 35 23 23 17 24 23 44 43 52 52 54 57 57 43 43 43 43 33 33 44 44 32 32 14 18 18 44 44 43
36 36 44 44 19 28 14 15 13 18 18 44 44 40 36 27 27 20 20 15 18 15 12 12 12 19 19 40 28 32 32 37 43 59 59 35 35 35 59 59 44 43 30 30 30 25 25 25 22 18
24 12 13 13 19 23 17 10 10 10 21 20 15 22 12 13 23 30 22 31 33 43 37 37 33 30 21 28 13 13 12 15 12 18 16 18 9 9 9 11 15 25 32 39 36 36 43 43 37 37
37 37 33 28 15 15 10 10 11 18 21 25 23 23 22 29 27 17 17 17 22 20 29 39 34 18 12 12 9 9 9 9 9 9 9 13 11 12 14 14 12 12 12 11 11 12 16 15 23 19
13 13 11 11 11 21 13 13 10 10 8 8 8 10 12 16 19 15 10 10 10 10 11 15 15 8 8 8 8 8 8 10 20 13 11 9 9 8 19 13 13 10 9 9 9 15 10 9 9 11
11 11 11 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 8 10 10 10 10 10 12 9 10 9 9 10 12 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 9 9 10 9 11 11 9 9 9 8 8 8 13 10
8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 12 12 11 11 11 11 11 11 12 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 8 11 10 8 8 9 11 9 9 9 10 10 10 14
15 13 10 11 11 16 11 11 11 11 11 13 15 15 17 10 10 8 8 8 8 10 8 10 9 10 10 16 15 16 10 8 10 8 8 8 12 12 11 10 10 10 10 11 9 13 10 10 10 9
9 9 13 8 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 19 19 11 11 10 13 15 14 14 14 14 19 10 12 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11
10 9 9 12 12 12 10 12 12 16 19 21 10 10 11 8 8 8 9 9 12 14 18 18 15 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 7 11 8 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8
8 10 10 10 11 15 10 10 8 9 8 8 6 6 8 10 15 8 6 6 7 7 14 19 18 17 11 11 11 16 13 13 13 9 6 8 8 8 15 16 24 22 13 12 12 12 12 15 12 15
21 27 19 22 12 8 8 6 6 7 6 8 8 7 7 8 10 18 15 13 10 10 10 10 10 8 8 10 10 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 9
9 9 10 10 13 10 10 6 6 6 6 8 8 11 8 7 7 10 10 8 8 8 6 6 8 8 13 17 11 10 14 16 12 12 8 8 6 7 10 7 6 6 8 8 13 10 8 6 6 6
6 10 11 13 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 |
|---|
