BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-158A24.T7 (MSMg01no158_a24.b1) | MSMg01-158A24.TJ (MSMg01no158_a24.g1) |
ACC | AG358379 | AG358380 |
length | 751 | 712 |
length of high quality (start - end) | 326 (33 - 358) | 293 (63 - 355) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no158_a24.b1 PHD_FILE: MSMg01no158_a24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:23:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no158_a24.g1 PHD_FILE: MSMg01no158_a24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:23:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCATCAAAAT
TAAAAAAAAATCAGAGTAATATTCTTTTTTTTAAGTTGGAGATTTTTTCT
TTTTTATCATTTTTATTAGATATTTTCTTCATTTACATTTCAAATGCTTT
CCTGAAAGCACCCTACACCCTCCCCCCGCCCTGCTCCCCACCTCACCCAC
TCCTGCTTTCTGGTCCTGGAATTCCCTTCTGCAGCTGGCTAAACTACCAC
CAAGTGTTTTACAAACATATTCTACTTAAGAGTCTTTCACACATTGTTGC
TGTTGTTTTGCTTTGATTTTTGTTTGTTTTGTTTAAGGTTTTGGTTTTCC
TTTTGTTGTTTACCCTCCCCCCATATGTGGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNCCCCCCCCTCAAAAAAAAAAAAAANCTTTGGGGGGGCCGGGCCCT
CATACCACTCTCCTCTCTCCTTATACATCATACCTTTTCTTCTCCCACAC
AACTCATACTAATTATAAACTTACTCTTATTATTTCCACCTACTACATAA
ACTACTTCTTCTCATCATCCCATCTTTTCATCTCCATCCATCTTCTCTTA
TTCTTACTTCTTTCTGCTACATATAACACCCAATCTTACTAACTACCCAA
TTCCACTATCTATCAAATCTTCTCCACATTTTTACTCTCCTTCCTTAATA
TACTTCCAACTCTACTAAATCCTCTATATACCTCTCCATCATTCCTCCTT
C
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTTACCTGAGGAATACCAAATGGCTGAGAAGCACCTGAA
AAAATGTTCAGCATCCTTATTCATCACAGAAATGTAAATCAAAACAACCC
TGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAAATCAAAAATTCAGGT
GACAGCAGATGCTGGTGAAGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTG
TTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCTGTCTGGCTGT
TCTTCAGAAAATTGGACATAGTACTACTGGAGGATCCTGCAATACCTCTC
CTGGTTTTATATCCACACCACGTTCTAATTGGTAAGTAGGACACATGCTC
CACTATGCCCATACCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAAAAA
CAGGTGTTCCTCAACAGAGGAATGGATACAAAAAATGTGGTACATTTATA
CAATGGAGTACTAATCAGCTATAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAG
GTAAATGAATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGATGTAACCCAATCA
CAAAAGAACTCACATGATACGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAG
AAACTTAGAATACCCAAGATACAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAAC
TCAAGAACGAAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 14 19 10 8 8 8 8 21 21 41 26 26 24 24 24 35 34 53 47 47 47 47 48 48 48 29 29 18 21 21 37 34 59 59 42 42 42 42 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 51 50 68 57 68 68 68 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 51 51 51 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 30 33 12 12 12 12 12 12 13 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 22 24 24 37 37 29 22 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 3 13 13 21 21 12 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 19 16 22 27 26 18 17 3 0 3 22 12 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 9 9 9 9 9 10 12 12 12 10 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 10 16 10 8 8 8 7 7 9 10 10 10 13 9
10 10 10 9 9 10 9 8 8 8 8 11 11 12 16 11 11 11 11 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 12 12 11 9 9 10 10 8 8 8 6 6 8 8 10 10
10 10 12 10 10 9 9 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 10 9 9 11 15 10 8 8 8 10 12 13 10 10 8 8 8 8 10 10 8 9
8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 9 9 9 13 9 9 7 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9
10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 13 13 13 9 10 9 12 9 9 9 8 8 8 8 8 10 12 14 15 13 9 9 10 12 13 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6
7 7 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 11 8 8 8 10 10 8 8 10 8 8 9 19 20 15 10 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 10 15 13 12 13 16 16
13 | Open.Hide.12 12 23 23 37 37 40 41 43 50 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 48 37 36 36 36 37 42 54 48 48 43 46 41 42 42 42 43 43 54 54 54 54 54 59 48 48 50
50 50 50 57 57 54 41 41 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 46 46 46 46 50 50 57 57 57 47 57 48 57 57 50 57 48 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 52 57 50 50 50 50 50 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 57
57 57 38 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 62 62 45 62 62 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 54
57 57 54 57 57 57 52 52 47 57 57 57 59 59 59 59 59 50 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 57 57 57 57 57 57 57 48 59 48 57 46 57 44 48 48 57
57 59 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 46 37 37 33 33 34 40 37 48 48 59 59 59 48 48 48 57 57 48 48 57 57 57 57 59 48 59 59 57 59 48 50 50 50 47 47 39
30 13 8 8 8 8 8 12 15 13 18 16 21 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 29 30 59 47 47 46 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 59 48 48 48 59 48 50
50 59 59 59 36 34 28 14 14 12 12 12 11 12 12 22 29 30 30 30 39 43 47 43 48 48 57 57 48 50 57 57 57 48 48 48 47 40 47 43 43 43 59 59 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 44 44 43 57 57 57 57 54 57 57 68 57 57 57 57 48 44 44 59 59 54 57 57 57 59 59 59 57 57
57 57 43 46 43 59 48 57 59 68 68 59 59 48 48 48 57 57 57 48 57 48 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 47 41 41 39 44 41 43 37 37 44 44 44 47 59 46 47 48
47 46 46 43 43 44 39 37 34 38 31 36 38 39 39 39 34 37 39 39 39 41 40 40 47 48 48 48 59 59 48 43 43 36 36 36 37 37 37 37 37 37 29 32 37 41 41 41 46 46
46 59 59 59 36 32 28 36 39 41 41 41 41 37 37 37 36 36 36 39 59 48 48 47 47 39 39 37 39 39 36 33 33 34 28 28 22 25 24 30 32 30 30 30 37 29 30 29 16 9
9 9 9 18 16 30 23 19 13 21 21 28 24 30 26 32 32 37 39 34 34 33 33 33 33 34 34 34 33 29 26 31 31 29 32 37 31 31 30 33 31 31 35 37 16 11 11 11 11 15
18 30 22 22 24 19 21 25 19 13 3 0 |