BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161I19.T7 (MSMg01no161_i19.b1) | MSMg01-161I19.TJ (MSMg01no161_i19.g1) |
ACC | AG360924 | AG360925 |
length | 1,175 | 1,221 |
length of high quality (start - end) | 427 (27 - 453) | 383 (66 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_i19.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_i19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_i19.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_i19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:17 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNTTGCTATGGCGCTATAGACTCNATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTT
TGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTATTTGATTCTCTGGAGT
CCAGCTTCTTGAGTTCTTTGTATATAATGGATGTTAGTCCCCTATCGGAT
TTAGGATTGGTAAAGATACTTTCCCAATCTGTTGATGGAATTTTTGTCTT
ATTGACAGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCGC
ATTTGTCAATTCTCAATCTTACAGCACAAACCATTGGTATTCTGTTCAGG
AATTTTTCCCCTGTGCCCAAATCTTCAAGACTTTTCCCCTACCTTCTCCT
GTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCATCCTCACTTTTGTTTTT
CTTCCAGTTTTATTAGGTCATGATAGGCAAGCTTAGACTGAGATTTTTTT
TTTTCCCCCCCCCCCCTTTGTGGAAAGATTATGAAAAAAAAGAGAGGANA
TATTTATTCAGAANAAAAGAAATGGGTTGGAAAATGAGAAGATAGTATAT
TAAGGGAAGNCTTGGTCCCAAGCCAATCATTTCAATGTTAGAGAACTTTC
ATAAATATACCCACATTCTTAGCTTTGTGTCCACATGTTCCATTTTTCAT
GCTTAGAATCAAGAAATTTGACTCTTACGGTATCCTAAACCAGCTCAAGG
CAAATGTCTACACTTTTGAGTAAATCTATCCTTTATGTTTTGTTTTGCTT
CCACTTACATGGATGTCATAATAACTAATACATCACCAAAAGCCAGTTAT
TTTTGTTATAATAAAAGTCATGATCTGTTAAGATAGATTATGGTCTTTGC
AAAACAATTCTTTAGGAAATTTATTATCCTAATCCACACCTAATTTTTCT
TTATAAGTGCATTTTTTAATTAAAGGGTTCCTGTAAACTATAATTATAAA
CTGGGGGTTTGTTTTGTTTTTTTAATTTTTTGTTTATATTTGGTTATTTT
TCCCTCCTTTCTCTCTTTTTTTTTATATTTTACATTCCTTTACTTTCTTA
TTTTATTTTTACTTAATCCTTCTTTTATAGTTATTTCATCATTTATTTCT
TCTCTCCTTTTCTTACTTAGTGATATATTCTTTCTTTTACTTCTTTCTTC
TTACTCTTTTATATTATTGCATTTG
| NNTTATATAGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCTCCTCTCATATAGTTATAAAGCTATCTTTTCTT
ATAGTGGCCCTACCTAGGAAATCTGATTAATAGATTTGGTGTGTGGTGAT
GATGAATTTCCTGCTGTTTAGAATGGTACTTCCTCATCTCAGGTGGATGA
AGAGAGTGAATGAATTCCTTTGGATTTTTTCTATGAGGGCAGCATGCCAC
TCATGACGGCTTCATGACCTAGTCAGCTCCCCAAAGGTCACATCTCTTAT
CTTCATTTCTTTTGAGATCAGAATTTCAGGTGTGCACTTGGAAAAACAGA
AAAGGACTGTAGTCTCTAACCTGTTTATTCAAATAGCAATCATTTTTGAA
TTTTAACTGTAACATCCACCAATAGTTTATCAGTCATCTGGGCATCCCTT
TTTTTTTCCCCCCCCCCATATAAAATTAATACTCACATTTAAATCGAAAT
TGCCCAACTATTAATGTATGCACAACAGTTCTAACTCTGTCTAAAACTGA
TCATCTTTAGTAAAACTTGTAATGCTCCAAAACATGGCACTGGACTGAAC
TGAAGGTCCATTCCCAAGCAATATATAATTCTCATTCTACTAGAATGTTT
TTCTATTTGAGAGTGCAGAGATTATTACAATTATAATTCATAATGGATTG
ATTTTTTATATAGCATCTGAGGGGCTTCTGGTAAGTGGGGAAAAAACCTC
ATTTGGTAATACAGAACATGTCTGGACTGTCTTTTCTCTCCTCTGTAGCC
TCTTTTAGGCCACTGGATGTTTCTTGCTTTCACCCATCTGGATATTGCAT
GTCAGGAGGAGGAGGTATGGTGTAGTATTAAAATCCTATCTTGTTGAGGC
ACATGAAGTACGTAATTTTGATTCTCGATCACTCAGGTTTGATAAGTGTC
TTGCCATTTAAGTTTCTCTTAGTCTATTTGGGAAATGAAATTTTTTTAAA
TTTTCTCAAATTTATTCCCTCCTTTGGGTAGGGTGATTATTTTATCATTT
TTTTTCTGTTTGTTTTTTGTCTTTTTAATAAATTTTTTATTAAAAGATTT
TTTTTTATTATTCATTCTTTTATTATGTTATGTGTTTTTCGTTATAATAA
CTATTATTTTTATCTTCTGATCTTATTCTTTCTCTTAGTTGCTTTTTGTT
TTATCTCTTCTTTTTATATAG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 7 11 10 10 15 13 8 8 8 8 8 8 10 15 8 3 0 3 8 19 19 25 33 33 33 33 33 36 36 38 38 53 47 57 50 43 43 47 47 53 53 57 53
53 50 42 40 42 36 36 42 51 47 47 47 43 47 47 44 44 30 30 30 44 42 42 42 42 48 48 51 50 50 68 68 68 68 57 57 57 47 43 37 37 39 57 42 57 47 47 47 43 57
57 57 48 42 37 30 37 37 57 43 50 50 50 50 50 50 51 51 68 57 57 43 43 43 37 37 32 36 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 43 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 57 45 45 45 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 68 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 44 44 37 37 44 44 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 50 53 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 29 27 12 12 11 13 13 13 11
12 12 29 25 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 50 50 46 46 40 37 37 21 17 13 13 25 30 26 36 16
16 11 9 9 9 14 16 16 14 14 13 12 8 11 9 12 29 27 59 59 59 59 59 47 47 39 17 18 9 9 9 9 9 10 11 14 27 29 22 17 12 12 11 11 12 11 11 3 0 3
27 9 9 9 21 9 10 10 19 13 7 7 3 0 3 15 23 43 43 42 41 41 41 41 39 37 19 9 9 9 9 18 21 47 59 46 50 47 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59
59 47 47 47 59 59 23 23 3 0 3 25 25 34 35 28 25 34 41 41 30 32 32 59 59 59 59 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 54 54 54 54 57 57 59 68
59 59 57 54 54 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 43 43 39 44 42 48 48 48 48 57 57 57 48 48 43 48 43 43 43 43 43 43 43 48 39 43 35 35 39 39 43 43 47 47 39 37 34 28 28 28 32 34 28 31 39 36
32 32 24 24 35 39 37 37 37 37 30 30 30 39 37 48 48 48 48 48 32 29 18 18 22 32 31 59 59 59 36 36 20 28 23 32 32 40 39 36 34 17 13 9 10 10 19 18 34 36
39 23 21 11 11 12 23 22 37 32 29 29 37 21 20 20 17 17 20 19 14 15 18 15 21 15 18 20 19 21 12 12 11 11 11 13 15 15 13 10 10 14 26 26 34 30 14 13 14 17
22 22 12 10 12 13 12 15 11 10 8 12 9 9 13 13 9 11 11 12 11 9 8 11 6 6 8 8 8 8 10 18 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10
10 10 9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 9 9 11 12 15 10 10 8 15 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 12 13 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 9 10 8 8
8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 21 21 18 13 11 11 10 12 8 8 8 8 8 8 11 13 11 11 11 12 10 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 12 9 9 9 13 10 11
12 11 16 16 11 11 11 9 14 12 9 8 8 15 14 15 14 12 13 15 12 13 9 9 9 13 14 16 16 10 10 11 11 11 8 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11
11 10 10 10 11 11 11 11 13 13 17 10 9 9 10 10 16 24 26 24 15 11 10 10 10 8 6 6 8 8 10 8 6 6 8 6 6 6 7 8 10 10 10 10 10 11 10 10 10 11
11 17 17 17 17 12 12 8 8 6 6 8 8 11 11 10 10 13 9 10 11 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 13 10 8 7 6 6
8 8 8 8 11 8 10 10 10 11 6 6 8 8 6 6 8 8 6 8 8 6 6 8 13 7 9 10 8 7 6 8 8 22 17 22 13 11 11 9 11 10 8 8 9 7 9 9 12 10
10 6 6 8 6 6 8 12 10 6 6 6 8 8 8 7 9 9 8 8 6 6 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 19 28 21 14 9 9 9 16 12 21 22 23 25 33 33 33 31 30 32 26 26 28 24 21 12 12 12 26 21 42
42 42 53 57 53 53 50 50 50 50 42 59 29 23 11 11 11 12 12 11 13 25 25 31 31 33 36 36 36 38 42 42 42 53 53 50 37 37 33 33 28 28 36 57 50 47 47 31 31 31
31 31 30 26 25 12 11 11 10 10 10 10 10 17 19 22 29 32 43 41 36 36 50 50 50 36 47 47 47 43 53 50 47 47 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 57 57 57 59 59 57 57 44 26 17 10 10 10 10 21 24 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 48 48 59 59 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59
57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 30 17 12 11 11
11 12 11 12 15 19 30 36 59 47 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 24 23 15 14 14 10
11 19 20 21 16 14 14 22 33 30 22 22 22 15 12 11 10 12 12 25 29 36 59 59 59 59 59 59 47 43 47 47 59 47 30 25 12 10 10 9 9 10 10 14 14 15 15 13 13 15
25 24 41 41 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 59 59 57 59 54 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 48
48 57 57 50 43 43 50 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 43 43 43 48 48 54 54 54 59
59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 43 43 39 40 37 43 23 27 15 15 24 35 43 57 57 57 59 59 37 37 37 47 39 47 47 59 41 41 41 27 22 11 11 11 19 21 37 37 37
37 37 37 41 44 48 39 39 35 34 34 28 27 11 11 13 25 25 37 36 32 19 19 13 14 14 28 26 28 20 20 25 24 24 29 28 24 20 32 32 37 47 47 37 32 30 25 24 27 28
28 33 31 29 22 25 25 28 37 37 37 37 40 43 43 48 48 47 50 50 44 39 39 43 43 47 47 37 37 37 31 31 29 22 22 24 37 37 41 37 41 39 37 33 25 30 30 30 25 27
28 37 28 31 24 24 30 31 30 28 28 39 37 32 24 16 13 15 10 10 10 19 25 37 59 47 47 47 37 37 30 30 19 27 19 23 22 17 10 11 11 11 15 19 30 28 24 22 32 28
30 30 24 23 18 22 30 29 34 28 19 19 11 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 12 8 8 8 8 8 8 23 17 19 10 12 9 9 12 9 9 12 14 15 17 10 10 10 10
10 11 13 13 9 10 9 10 9 9 9 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 10 10 10 8 8 8 12 10 11 9 10 10 16 19 17 12 9 8 8 6 6 8
10 13 8 8 10 11 13 10 10 10 9 9 9 11 12 8 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 12 8 8 8 10 10 11 10 10 9 9 10 10 12 12 9 10 11 10 8 8 8 8
8 17 13 8 8 8 8 8 8 14 13 12 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 8 12 11 11 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 15 12
21 21 15 13 9 9 9 9 9 8 10 6 6 8 8 10 9 8 8 6 7 10 9 12 12 10 11 10 10 19 24 15 18 23 28 21 17 10 9 9 12 12 12 14 11 11 11 13 18 22
21 21 12 10 10 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 16 11 13 11 9 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 15 20 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8
8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6 9 11 11 11 11 11 8 6 6 6 11 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 11 10 7 7 8 10
10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 13 10 10 13 8 8 8 10 10 9 9 |