BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-162A13.T7 (MSMg01no162_a13.b1) | MSMg01-162A13.TJ (MSMg01no162_a13.g1) |
ACC | AG361280 | AG361281 |
length | 692 | 693 |
length of high quality (start - end) | 317 (376 - 692) | 275 (75 - 349) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no162_a13.b1 PHD_FILE: MSMg01no162_a13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no162_a13.g1 PHD_FILE: MSMg01no162_a13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:19 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCAATTAATTTAATTTAAATTTGCCTAAAACATAATGGTCTTATTC
CTTGGTGGAAATTGTCAGTAGGTCTAAGATCTCCAAGACTCCAGGAAGAC
TGGCAGCTCCTTCATACTCAGTCAGATAACACTGCTTGAAATGCACTCAG
ATTCTCCTGTGGGTTAAATACATGACAACCTTAACCTGTCTCTGTCTCCA
CTACATTTTGCAAAGTCAGCTACTTCTCTTGAGTAATCTGAGAATGGCGA
TGTTATGCTTGGGATATTTGTGAAATTTCTAGATTTCTGATTATATAACT
ACTATATCCCAGCTCCCCCCGCTTTGGCTCCTGGTCCTAATTTAACCATA
AAAGCAGTGGATAATTTCAATCTGTCAGTAATCTAATTTAAATTGGGAAT
TCCTTATCTGAAAGGTTTATATCTTGATGTAATTCTAGTATCTGAATCAT
AGCAGGATATTATGACTGACATGTCTTTTTCAAAATGTTTCTATTAAAAT
CTAAAATAGAATGCCCACTTGTAGCCCCACAAATTCAACTGTCCATTTAC
TCAGATCTGGATTAGGCAGAGTGAAGGAGAGCTTATGGGACACCCATTAG
CTACTCTCCCTGGCCATGCTAGGCAAGGATGTATTAAGTGGT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTT
AATAGGGTTATTTGTTTCTCTGGAGTCTAACTTCTTTAGTTCTTTGCATA
CATTGGATATTAGCCCTCTATTGGATGTAGGACTGGTGATGATCTTTTCC
CAATCTGTTGGCTGTCATTTTGTATTATTGACAATGTCCTTTGCCTTATA
GAAGTGTTGCAATTTTATGAAGTCCTATTTGTAGGTTCTTGATCTTAGGG
CATAAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGGAAATTTTCCCCTGTGCCATGTGTT
TTTTTTTCTTCCCCACCCTCCCCTCTATTAGTTTCTATGTATCTGGTTTT
TTTGTGGAGGCCCTTAATTCACTTGGACTTGAGCTTTTACACAAGGAGAT
AAGAATGGATAAATTTCCATACCTCTACATGCTGACTGCCAGTTGAACCA
GCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCTACTGGATGGTTTTAGCTC
CTTTGTCAAAGATCAAGTGACCATACGGTGTGTGGGATTATTTCTGGATC
TTTAATTCTGTTCCATTGATCTACCTACCTGTCTCTGTAGCAGTACCATG
CAGTTTTTATCACAATTGCTCCTAATACAGCTTGAGATCAGGG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 10 8 8 8 9 13 18 37 39 37 37 32 31 31 32 32 30 27 25 32 37 37 41 59 30 28 24 24 24 35 43 43 36 36 43 43 57 57 57 37 37 34 29 29 42 43 57 54
36 36 40 47 53 68 50 50 48 48 42 47 47 47 47 48 48 53 53 53 54 57 57 50 50 50 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 38 36 21 15 15 17 23 32 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 41 32 23 23 23 32 37 46 46 46 68 68 68 68 68 59 59 59 57 53 53 53 53 53 53 57 57 59 59 59 57 57 53 53 50 50 59 59 34 30 19
16 15 11 11 11 12 11 12 12 12 19 17 10 8 8 8 10 10 12 10 12 11 12 12 12 15 20 30 37 41 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 43 43 37 33 37 37 32 32 32 36 36 39 35 35 32 31 25 25 36 37 59 59 68 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 57 57 59 68 68 68 68
68 57 57 48 48 47 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 57 59 43 43 43 59 59 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 59 59 59
59 59 59 59 48 59 59 59 47 47 50 39 39 39 43 43 59 59 59 47 46 43 41 41 44 37 37 41 41 41 41 41 50 41 48 43 43 36 43 43 48 48 57 57 50 57 43 39 35 35
59 43 47 48 59 59 59 59 59 59 39 31 26 31 31 39 39 44 47 47 47 47 41 32 29 29 25 26 32 37 30 37 37 39 37 39 37 39 18 13 9 9 | Open.Hide. 7 7 8 13 12 8 8 8 8 7 7 9 9 16 19 37 37 44 37 37 41 42 50 50 50 50 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 42 27 23 10 14 14 22 22 50 54 23 26 11 11
11 21 21 48 68 68 68 54 54 42 42 41 41 43 48 57 68 68 48 48 46 46 50 50 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 68 68 68
68 57 57 68 68 57 57 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 68 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 52 57 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57
57 68 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 57 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57
57 57 59 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 48 43 43 43 30 36 36 27 27 28 31 33 59 43 59 54 59 59 59 57 57 57 50 53 53 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 48 41 39 39 31 22 19 10
10 10 10 9 10 11 13 15 20 31 31 16 12 11 9 8 8 8 8 8 14 20 18 18 20 32 32 41 43 40 41 41 43 23 19 8 6 6 8 19 19 41 41 47 47 59 59 59 59 59
59 59 59 48 47 47 34 28 28 22 16 19 21 19 22 24 17 17 14 18 14 18 16 25 18 23 36 44 48 59 48 48 48 48 48 59 59 57 57 48 48 54 57 57 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 27 25 9 9 9 25 27 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 38 38 23 24 29 43 44 57 57 57 59 59 68 59 57 57 57 57 68 57 57 57
57 57 57 57 68 57 59 59 59 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 57 57 42 42 35 43 35 35 35 43 43 37 43 43 57 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48
57 57 57 57 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 48 54 57 57 57 48 48 47 48 48
48 48 57 59 59 59 59 57 48 48 43 37 37 37 37 23 27 12 13 13 27 27 37 37 37 37 37 37 40 43 43 43 43 39 36 36 36 39 37 41 37 37 37 |