BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176M24.T7 (MSMg01no176_m24.b1) | MSMg01-176M24.TJ (MSMg01no176_m24.g1) |
ACC | AG371398 | AG371399 |
length | 1,208 | 1,248 |
length of high quality (start - end) | 629 (129 - 757) | 331 (124 - 454) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_m24.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_m24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_m24.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_m24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATTTTNNNNNTTTCATTGGGCGCTNACGACTCCTAAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCTATCACTTTATATGAACCTGTAAAAATTGCTATTTTTATGG
TTTATTCCTGTGTGTTCGTATATAACTGAAGCATCTTGGAAGGCACCTTC
AGCTTTCAGGATGGAACGTCTTCACTAACTCTGGACTCTCAGATTGAAGA
ACTTTCCATTTACACGACATCCTTCAGTTTTTCCCATGCTTTAATTGATC
TTCACATTGTGCCTGTGAGATAAGACTAAGAAACAAGTGTCTGCATGGTT
TTCATGTTCAAATAGCAAAATCAAAAAACAGCACAAAGGCCACATATTCA
AACGTAAACAAAATTAAGGGATGCTTGAGAGTGTACATAGCTAGGAGCCT
GAATTTCTCTTTAGGCTTTATAAGTCTTTGTTTTAAAGACACTTGATACT
AGAAACTAGCACAAACACCCATATAAAATTGGCTTTGTGTTTCGAACAGA
CTTCTAGGTACCACTCAATCATTGTACCCAATAATGATGCCTGCTGATAA
AGGCTGTCTGAACTTAGCAGATTCACATGGCCATTTTCATTTTATATGTG
TTTCCACTAAAGCATTTATGATTCTCTTTTCTGAAATGTGAAAATATACT
TACAATTTTCTTATACTTTCAAACGATCATATAAACATGAATGTTAACTG
GGACGGAAAATTTTATCACTAACATTTTCCCGGAGAGCTGAAAAAAATTT
ATTACAAGATGTGGATCAAGCTGTTTGTAGATAAAATATTTAGCAAAATA
TCCCCCAGCAAGGAAATTATTATTTTAAGAAAAAAGTGTAAGTATGTAGA
ACAGTGGTTTCGAGGTTGGTCTTATTACAGTGCTTTATTGTCCATGAATG
AGGTCCTCAATCTAGGGAAACTTTTAAGGTCCCCATGAATGATCTAAAAG
TACAGCTTATTTTATTGCTTGGGGAGATTGGGCTTTCAAGTTTAACCAGA
TTTTGAATAAGGATCCCCTTAACAACTTGGAAATTGCATTGGGATTTAAA
GACTTTTGATTATTTGGAAATAATTTGGCTCCTCGTTCCCATAAAAATTT
TTCTCATAATATCTTAACAAACCTCTTTTGCTATTAGGAAAAATGTTCTT
TCTAATACTCATTTCTTTTTTTCTTCTCTTTTTCCCTCTCTTTTTTATTT
GTACCTCC
| NNNTTCCTGAGTGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAACCCCTAAGCCCCTTACCCCATAAAAA
CACGTAGCTCTTAAGACTCGTGGCTGACATCCTTTATCTCCTGTATGGGA
TGCATGTTGGTTCGGAGCTCCGTAATTAAACATCCTCATGTATTTACATC
AAGATGGTCCTTCGTGATTTTTTGGGTGCACGCCGAATTGGGAATTGGGT
GGGGGTTTCCCCACTAGGTTCTAACAATGTCTGCTCTAGCAAGTGACCCT
TCATCCATATCCCTCTAAGTAGCCCCAATAAAACTCATTGATTCACTATG
TTGAACTTTGATTGTATGGGTACTTTGATCTATTGTGAGAATTCTATCTG
ATTATAGTAGAAGTGTGTGATTTCCACCCCTCAAAAAGTGCATTTCATAC
TATTATTTTATACCCAAGATGACTTAGTGGATTTAGTCTAAGAGTTTAAA
TAATAGTAGATATTTTCCAAGTTTATATAAAATGTAAATACTTAACATAC
CTATATATTAAATTTATAGTCTAGAATATTACTTATGTTTATGATTAGCA
CAAGCAAATATCTAAGTAAATCTCATTTGTAATGTTGATATATTGGTCTT
CACACAATAAATTATATTTGAAAATTCATCCAAATATCTTGAATAATACA
TTTTCACTTGAATATTAAGGATACTAGGGTTTCATGTATCATTGCATTGT
AAATGTTTATTTGAATGTTAGCTTCTTCTATTAATTCCTAAATTTCCTAC
TTTCTTTTATATGCCATTTTTTTCATTTTATGAAAGACCATCCTAAAATC
CCTAGTATTTTCTATTAAAATTTTGGATTTTAAACTACTTGACCTAATTT
ACAATTTGTTTCCCCTTATGTTTTTCCAAGATAAATTGCTTTTTCTTTCT
TTTATAAATACCTCAATGTTTCTTTTTTTTTTTGTCTCTAATACCAATTG
TACATTTTCTTTATTTTGTTATTTATTTTTTCCTCTTTTAATTTCTTCTC
TATTATTTATATTCTCTTAATTATTTTTCTTCCTTGCTTCATCATTTCTC
CTTTTGTCTCTATTATTTACTATATTATTTTCACCCCTCTCTTTCGTTTC
TTCCTCCTCCTCTTTTCCCCCTTATTATTTTCTTTTATTATTCTCTTCTT
ATTTCTCTCCTTTCTTAATCTCTTTCTCCTCTTNCCTTCTTCTTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 7 7 7 9 9 9 10 9 9 9 3 0 3 9 12 19 17 8 8 8 8 8 8 22 22 28 23 26 23 23 23 37 43 47 48
39 34 34 34 37 37 37 37 36 36 36 36 35 36 36 31 31 31 33 33 30 30 24 12 9 9 9 9 10 11 11 10 10 10 10 10 11 10 10 19 23 31 37 53 53 53 38 42 42 57
43 43 43 53 53 38 35 35 35 35 31 31 21 21 8 8 8 8 8 8 8 8 15 16 28 21 21 22 16 17 24 32 36 38 50 36 36 34 39 39 47 59 59 59 53 53 53 53 53 54
57 57 57 57 53 50 57 54 54 54 54 68 68 68 54 57 57 57 57 54 48 57 57 47 47 50 50 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 44 44 28 28 28 43 38 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 62 68 62 62 62 68 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
44 57 39 39 43 44 44 35 35 42 38 27 20 20 34 38 59 68 68 68 68 68 68 59 59 52 57 57 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57
57 59 57 44 44 43 50 39 59 59 52 52 48 59 57 54 54 54 59 57 57 57 59 59 59 68 59 59 42 42 43 59 47 57 59 59 59 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59
59 59 44 32 20 15 15 32 34 54 54 57 57 59 57 48 48 59 59 46 46 48 59 59 59 59 59 59 54 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 50 50 50 59
59 59 59 47 25 23 9 9 10 10 21 25 59 59 59 41 43 43 39 39 48 48 48 48 43 43 43 43 43 44 43 48 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54
46 46 39 39 39 46 59 59 59 48 48 46 59 48 48 48 48 43 43 43 39 39 43 43 57 48 48 48 48 48 59 48 47 43 32 31 30 37 39 36 37 39 37 37 37 37 37 40 43 39
39 39 39 39 39 35 32 36 34 37 37 37 37 47 47 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 39 39 48 43 37 37 28 28 28 28 30 37 37 39 41 36 37 41 41 37 37 43 37 37 39
32 33 28 25 18 19 19 27 23 22 17 16 16 16 19 30 28 30 31 37 31 32 35 37 31 28 22 22 13 13 11 19 19 30 25 27 27 28 30 29 29 30 30 28 15 13 12 15 11 12
17 17 22 24 21 16 30 32 36 36 35 17 15 11 9 10 10 17 19 25 25 22 19 19 28 25 24 21 27 22 11 17 13 9 9 8 9 10 11 19 24 30 23 24 18 11 11 11 14 19
19 12 12 10 15 10 12 16 19 15 10 11 11 14 13 32 23 16 14 14 10 12 11 13 12 16 15 11 17 15 13 17 27 23 29 13 20 21 25 17 13 8 8 8 10 17 16 16 14 19
13 16 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 23 19 15 13 11 14 12 19 15 13 10 10 10 12 12 9 8 8 8 10 8 8 8 10 13 13 19 11
11 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 17 13 17 12 17 12 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 11 12 12 10 10 9 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 9 12 14 14 10 13 9 10 9 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 10 13 10 10 8 8 6 7 11 7 9 9 10 14 9 9 12 12 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 8 8 8 8 9 9 8 10 10 10 8 8 12 8 9 8 11 8 8 6 8 6 6 8 6 9 10 17 11 11 11
17 16 13 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 9 8 7 8 8 8 8 8 9 10 12 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 11 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 10 11 10 10 8 8 10 10 8 8 11 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 12 13 9 7 9 9 16 12 28 21 23 10 10 13 22 21 30 22 22 35 35 36 36 50 50 37 42
47 53 50 50 53 57 53 53 50 50 50 50 47 33 27 17 9 10 10 8 8 8 8 6 8 14 21 21 16 13 16 22 41 48 48 36 38 38 42 53 57 53 43 42 42 42 38 57 53 53
48 41 39 41 41 27 23 9 9 8 8 8 8 8 8 11 13 17 13 10 10 11 10 18 27 31 35 39 48 42 57 57 43 43 43 47 47 43 50 50 48 43 47 47 47 51 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 54 54 48 57 44 48 57 41 41 41 50 50 68 68 68 57 57 44 43 43 46 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 47 50 54 57
57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 54 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 59 57 57 47 54 54 54 57 57 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 59 59 59 57 47 47 37 47 47 57 48 50 50 48 48 48 59 59 59 59 57 50 50 50 48 48 48 47 47 47 47 24 21 11 11
11 12 12 9 10 16 18 25 28 46 46 43 43 48 48 48 48 48 59 59 59 48 47 47 43 43 43 43 43 39 31 31 28 40 39 48 57 48 48 48 48 48 59 59 59 47 39 39 28 18
10 10 8 6 6 6 6 6 12 16 12 12 11 11 9 16 12 12 21 31 37 46 46 34 34 28 23 28 24 24 30 37 37 37 31 30 30 37 25 23 11 11 11 15 15 21 28 32 41 40
37 33 33 33 28 22 28 28 28 28 37 37 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 59 43 43 43 43 39 37 39 39 48 46 42 39 36 36 36 43 47 48 43 48 42 42 35 35 39 40 43
57 57 43 36 36 32 32 28 37 37 43 43 40 47 41 41 31 28 23 18 18 23 23 28 28 37 15 13 8 8 12 19 28 35 35 35 35 35 37 43 43 48 48 43 30 30 17 17 22 22
26 23 20 20 20 31 20 30 30 42 42 43 30 26 14 14 21 24 30 28 31 21 25 25 28 30 44 32 47 41 37 33 22 22 22 31 31 40 22 21 10 10 10 23 18 12 11 12 13 17
10 10 10 11 19 15 22 22 31 31 22 20 15 15 15 19 9 11 8 13 10 11 14 16 23 30 30 23 22 20 13 10 12 8 8 10 12 19 22 23 21 24 22 12 12 10 10 8 8 11
11 23 27 27 11 11 11 19 18 22 17 14 14 12 12 10 9 15 15 11 10 6 8 6 6 8 6 9 13 10 10 10 12 11 11 19 19 17 15 12 12 12 20 18 24 24 16 21 23 23
28 24 17 15 24 24 25 18 8 8 8 8 8 8 12 17 22 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 15 8 8 9 9 8 10 8 9 10 10 19 16 14 11 11 16 21
13 9 9 10 9 9 10 10 10 15 15 13 12 9 9 12 16 14 16 12 12 9 8 10 8 8 8 11 10 10 8 8 8 10 11 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 12 16 19 16 14 12 11 13 14 19 10 10 10 13 13 10 10 10 10 11 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 15 15 18 20 19 23 14 16 10 9 9 9 9 8 8 8 9 9 11 8 7 7 8 8 9 9 9 9 9 10 9 8 11 8 8 8 10 9 11 11 15 8 8 8 8 8
8 12 8 8 9 10 10 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 22 21 23 19 13 11 10 12 14 14 22 15 21 10 13 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 11 11 11 9 9 9
9 9 9 9 9 9 14 10 10 10 10 10 10 11 15 15 11 11 11 11 11 11 10 10 9 9 10 10 8 8 10 8 8 9 15 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10
10 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 13 14 12 8 6 8 8 8 10 9 9 18 13 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 7 8 11 10 10 10 8
8 8 18 14 8 8 6 7 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 10 10 12 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 17 9 8 6 6 6 6 10 12 10
8 6 6 6 6 6 6 8 19 15 10 10 8 10 12 9 7 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8
8 8 8 12 13 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 8 8 6 10 9 9 9 10 10 11 10 10 3 0 3 8 8 8 8 10 10 10 16 14 11 11 11 11 |