BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-185E05.T7 (MSMg01no185_e05.b1) | MSMg01-185E05.TJ (MSMg01no185_e05.g1) |
ACC | AG377308 | AG377309 |
length | 725 | 727 |
length of high quality (start - end) | 235 (124 - 358) | 285 (76 - 360) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no185_e05.b1 PHD_FILE: MSMg01no185_e05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:59:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no185_e05.g1 PHD_FILE: MSMg01no185_e05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:59:55 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (30,255,519 - 30,255,746) | (30,140,589 - 30,140,869) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAGGATATCCAGGGCTATACAGAGAACCCCTGTCTCAAAAAAAAAC
AAAAAAGCAAGAAAGTTAGATCTCATTCAGGGAAGTGCTATATGAATTTA
CAGTAAATTTCCAAAAGTCTGTGTGTAGTTGAATGTGAATTTAAAGAAAT
ACATAGGAAAAGGAACTTTATTTTAACTTAGGTTTCTGTTTCTGCTTGAA
ATTGATTGTGAGATTGAGTGTGAAACTAATGTTTCAGGTTTCTGTCAGTC
CTCTCATCTAACCCAGAATGTGTGGGGCATTCTAACCCAGATTAACTCTT
TCAATGTTCATTGTTTACCCCCGCACCTCCAGGCCTTATTTAGCTGTGAA
GTCTATAGGCGTGGAACTCCCCAGACAAAAAGCATCTGCATCTCTTGTGT
TGGAATCTCTTGTGCTGATGGAATGGGGACACAGTTTGAAGTTTTGTGTA
ACTTTGTGACATTACAAACTGCCACAGTTTCCTGGTGTATCCCTTCTCTC
TTGACGTGAAGCTTCTTTGGTATTATCCACAGCCCAGATGATTTCAGGGA
ACGGTGAGATAGTTGTAGTCTGACCATGTTCTTTCTCTTTGCCCAGTGAG
GTGAAGTGATGTCACTTGGAATTCCCAAGTGTGATGCAAATGTAGGGTGT
GTATTCATACTGTAAAGCCAAGCCG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGTAGTCTCTGCACCTTGGAGGAT
AAGACAGGTCACAAATAAAACGCCACTGTGGCATTAAGGAGATCTTATCT
CAAAAAAGAAAAGCAAAAGCATGCAGATTGCTTTAGATGTAATGGGTCCT
CTGTCTACACAAGACACAAGACCCTCTCTGTCAGCCAGACAGCAGGCTAA
GGTCCACACCCAATTATTTCTCTTGCTAAATTTAGTCCAGTCTGCTGTTC
ATTTCTCCTAAGAGCAGTAAGTGGTAGGATAAGTCAAGTTGATAGCTTGG
TTCTCCTATTTTTCAGCCCCCACCCCATTTAGTCTAGAAAAATAATTCGT
TGAGAAAATTTGACACCTTTTTTTTGATCATGATTTTTGAAAGCCAACAG
ATTTGATCAGATCTGAATTACACAAAGTAGGGAAGTCAGCCTCTGGGCCA
GCCAAACTACCTGCTTTCTGAAGGGGTGGTTTAAAAAAAATCAATTCTGT
GTGGACAAGATACAAGGTACAAAAGATGAATTATTATGAACAGAAATTTC
ACAGATTTAATAGTCTTTAGAAAAGAAAAATGATAAAAATTCCAAAAGTA
TTTTGAGACCATTTCAATAACAAATAATGATCACAATACTTTGTGGTACC
TTGTAGACCTTGAAAGAACAGTTATCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 15 25 41 37 33 32 32 28 28 37 23 23 24 28 28 28 37 46 28 25 23 19 17 9 11 9 10 9 9 10 12 18 18 24 24 33 33 33 33 41 53 53 35 35
31 31 33 31 31 22 19 10 8 6 6 8 13 8 10 10 10 15 24 29 37 37 41 37 47 47 47 57 57 57 46 48 48 48 48 48 57 37 37 48 37 43 43 59 59 59 59 50 53 50
50 50 50 59 59 44 44 39 37 37 37 33 22 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 23 23 39 39 40 33 33 37 37 47 47 59 59 59 59 59 57 57 57 50 53 53 53 53 53 57
57 50 54 54 51 51 47 47 47 47 54 54 54 57 68 68 59 57 54 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51
68 68 57 57 44 44 33 42 42 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 48 50 50 59 59 68 68 68 59 59 47 47 43 59 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 54 48 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 39 39 21 26 16 27 20 18 16 15 12 18 28 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 50
50 41 27 25 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 10 9 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 10 11 11 18 16 15 19 28 41 59 59 59 59 59 59 57 48 48 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 21 12 12 25 20 29 18 15 12 12 9 9 9 11 11 10 8 8 8 8 8 10 28 34 37 37 39 39 32 39 39 48 47 47 37 43 43 57
57 59 59 35 30 26 34 34 36 37 59 57 57 59 59 59 59 59 50 47 47 43 39 32 23 23 27 28 33 37 42 50 50 50 46 46 46 46 57 41 37 30 30 37 43 43 48 48 48 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 43 47 39 37 37 43 33 36 39 43 48 46 57 54 54 48 48 48 59 59 57 57 47 40 36 44 28 30 37 42 57 57 57 57 59 57 57 57 54 54 54
54 59 59 48 48 54 47 47 39 35 32 42 43 43 42 43 33 34 23 34 34 48 27 30 32 24 24 29 29 43 43 57 41 30 21 12 12 30 30 47 47 59 41 39 30 18 19 14 14 17
25 24 24 11 11 11 23 23 43 59 48 48 48 48 48 48 42 23 23 11 16 16 32 32 41 39 39 39 41 41 43 30 31 35 30 30 39 43 41 39 32 29 27 30 28 24 31 30 34 29
30 28 28 37 33 37 30 36 37 37 37 37 39 41 34 32 31 18 18 27 27 30 32 22 22 23 19 20 28 28 39 33 33 30 24 23 10 9 9 12 19 19 30 22 26 12 18 18 28 21
28 28 29 20 22 14 14 14 28 26 37 36 18 17 15 14 14 10 10 9 9 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 11 10 8 6 6 8 11 14 26 30 30 37 37 37 47 40 39 37 37 37 37 37 30 31 39 31 30 30 22 22 22 28 30 33 33 29 22 28 28 36 30 57 57 57 27 23 11
11 10 26 26 53 68 68 48 48 48 32 36 36 36 41 50 59 57 57 41 41 50 42 50 47 48 48 57 57 48 48 48 47 59 57 57 48 57 57 68 68 57 57 57 68 68 48 48 48 48
48 48 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 59 38 20 8 8 8 8 12 25 43 52 57 52 59 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 59
59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 54 54 54 54 54 54 57 59 59 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 57 57 57 57 48 57 57 68
68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 48 48 47 44 44 37 31 28 23 23 23 28 28 28 42 43 54 54 50 50 50 57 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 50 53 53 48 48 48 47
59 41 29 23 21 12 12 12 12 21 25 27 23 15 11 11 11 23 11 12 8 8 8 9 8 9 10 10 13 20 18 28 28 28 37 37 37 48 48 57 57 57 57 50 50 59 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 54 43 43 28 26 14 14 14 15 24 25 28 28 28 28 28 16 16 11 11 11 11 32 34 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 44 46 44 47 47 57 48 48
48 57 57 59 48 44 43 43 43 43 57 44 47 42 39 35 39 39 42 42 24 24 24 30 30 35 36 36 36 36 37 39 39 43 43 43 42 39 32 35 35 42 47 47 43 39 43 43 54 57
43 43 43 43 39 59 35 39 43 43 39 43 41 47 43 57 48 48 48 43 43 48 43 39 35 35 31 30 28 22 22 30 25 34 30 27 27 17 16 16 31 24 28 32 34 39 46 37 31 30
29 28 28 28 32 31 28 28 35 37 39 34 31 23 19 24 19 19 17 13 11 11 16 24 30 39 33 33 33 33 33 33 33 33 33 37 37 33 20 20 30 30 32 37 33 33 28 25 19 11
9 8 10 14 14 23 23 28 18 11 9 9 9 11 15 16 16 19 11 9 9 12 16 12 13 13 22 24 28 31 30 31 28 24 24 24 23 15 15 15 13 13 11 11 11 19 22 21 13 10
10 10 9 10 11 16 16 24 33 28 22 13 8 6 6 10 8 6 6 8 8 10 9 11 15 13 19 24 31 28 25 17 16 15 26 26 28 28 33 28 25 21 13 14 10 10 8 8 9 8
11 11 8 8 8 9 10 12 9 9 10 9 9 10 12 13 11 10 12 9 9 10 10 10 11 9 9 |