BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-265P11.T7 (MSMg01no265_p11.b1) | MSMg01-265P11.TJ (MSMg01no265_p11.g1) |
ACC | AG407080 | AG407081 |
length | 744 | 752 |
length of high quality (start - end) | 313 (45 - 357) | 240 (129 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_p11.b1 PHD_FILE: MSMg01no265_p11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:03:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no265_p11.g1 PHD_FILE: MSMg01no265_p11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:03:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTGGTTCATTTTGAGACAAACTCACTGTTCTGATCAGGCTAACATG
GAACTTATGAGCTCATTTGATACTCCTGTCTCAGCATCCCAAATAGCTGG
GACCAGCAGTACATGTCACCATGTTTAACCCAAGTGAAGGATGCTGTGGT
TGTTTGAACAGATATGGCTTCCATAGATTCGTGTGTTTGAATGCTTGGCC
CTTAGGGAGTAGCACTGTTAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAGTATGT
CACTCTGGGGGACAGTCTTTGATGTCTCCTCTGCTCAAGCTCCACCCAGT
ATGGAATCTTGNCTCNCTTGACCCCCCCCCCATCAAGATGTAGAACTCTG
GGCTCCTCCAGCACCCCGCCTGCCTGCAAAATGACATGCCTCCCACCATG
TTGATAATAGACTAATTCTCTGAACTATAAGGCAGACCCAATTAAATGTT
GTCCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCATAGCAATAAAA
TCCTAAGATGGATGCTAATAGTTAATAGGCAGGGTTAGTGGTTGCTAAAG
TAGCCTGAACTCAAGTTAGGCAATGAACCCATGCAAATGTAACTTGTATT
TGAGTGAGAGTCATTGTTTACATTTACTATTCAGTCCACAGTATGTAAAA
AGACTCACAGTCACCCAAGGTAATCCGTGTCCAGCATTAGACCA
| ACGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGCTAATAAACTAAACCTAGT
AAAATATCCAAGATGGAGTACTGAGCCCTAACACTGTGAAGATAAACTAG
AAAGGTAATCACCAACCACTCTATTAAAGGACAGCCTAAAGAAAGCACTT
TGACAGAAAGCAGACATCTTTGCAGATAAGATGTAAAAAGGCCTGTCACT
CATGTCTGTCTTGTGTGTACGTGTGCACACATACCAAACAAACTATCCCA
AAAGGTAGGGATGGGAGTGGAATTGAAGTAGGGCCTGTACTGCTTAGAAG
CTGAAGCTACTGAGTGTTTCTTACATGCACCCCCCAGGGTAACCACTTCA
AGAAACTTGGGGTATCATCCGCACGTGACAGCAGATAAAAAGAACACTGA
CTAAAAAAACCACCCAGAAGCATGGGTGCCTGACATGTTTCCTGCCTTTC
TTCTACTACATCTATAGCAAGACATTAACAGTCTTAGATGTACAAGCGCA
TACTTTATAAAAACACGGAGATGGCTGTACCTCACTGGTTTTATATTACC
TTCCTTTATTTTTTCATTTAATGTGTATGTATGTATATATTTTTACTATT
ATTATGGGCAGAGGATGTAGCTCAGGCAACAGAATGTTTCCTTAGCATAC
ACAAAGTCCTTGTTGTGCATGGAAAGGATGGTACAGGGTTTATAATCCGC
CC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 15 19 33 34 29 23 23 18 12 19 11 3 0 3 10 14 18 37 25 25 31 31 31 35 37 37 28 28 25 33 34 43 43 26 26 15 21 21 37 28 57 48 40 40
42 42 47 47 59 57 57 34 26 13 21 25 32 33 39 31 34 32 46 48 57 57 57 48 50 50 48 48 42 47 48 57 48 48 48 48 48 48 48 50 57 57 59 59 50 57 57 39 34 32
47 39 50 50 48 48 48 46 46 46 46 37 25 22 15 12 11 11 11 11 9 9 9 9 9 24 24 41 43 41 39 39 39 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 44 44 43 39 39 42
42 43 47 47 68 68 68 68 68 68 46 46 43 48 48 48 57 57 57 59 48 54 54 59 59 59 57 54 54 57 57 47 47 43 47 44 57 44 41 41 41 41 41 41 46 42 37 32 44 35
39 39 57 43 57 57 57 57 68 68 68 44 44 43 43 33 44 44 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 43 57 43 43 44 46 48 59 59 50 57 50 47 47 47 57 39 42 35 44 48 57
57 44 44 33 33 33 44 44 59 59 59 43 36 40 37 44 43 47 47 43 43 43 59 59 41 43 43 46 43 47 42 44 42 43 35 40 40 46 46 48 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48
48 48 47 59 47 37 32 36 41 53 53 53 53 41 44 59 47 27 27 14 12 12 11 12 12 30 30 59 59 59 37 37 35 39 39 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 50 48 48
48 47 59 47 27 21 10 8 8 6 3 0 3 6 3 0 3 6 10 10 10 8 8 8 13 17 15 17 15 15 13 11 11 9 22 22 39 39 39 25 25 12 12 12 24 26 43 44 59 47
40 40 40 44 44 47 50 47 47 30 30 13 11 11 13 10 8 6 8 13 23 12 12 9 12 9 9 9 14 14 9 11 11 11 11 11 20 15 25 30 47 40 37 37 28 28 28 37 37 40
43 43 43 43 43 40 33 36 25 25 28 37 37 48 48 40 40 46 59 47 43 39 32 37 39 39 39 41 37 37 30 30 37 32 32 43 30 34 28 25 25 30 37 43 39 39 39 39 39 57
48 48 48 48 36 33 33 33 25 25 15 15 16 24 23 25 30 25 14 18 21 14 16 30 30 37 39 35 22 17 19 21 22 28 30 30 30 30 29 31 28 28 37 33 36 39 39 36 36 43
43 44 59 37 28 23 14 14 25 15 19 32 34 30 39 28 28 18 28 22 23 32 31 31 24 24 12 12 12 22 23 21 21 17 17 11 16 13 14 15 15 24 26 25 35 39 37 39 35 22
22 11 10 10 17 15 14 15 12 14 14 16 20 28 29 28 23 15 15 12 12 14 16 32 34 34 34 35 37 36 39 32 28 18 12 10 13 14 16 13 20 13 10 9 9 9 19 17 24 22
22 25 24 20 20 24 19 17 16 12 12 12 21 21 29 35 37 37 24 22 11 11 11 14 13 9 9 8 10 8 8 10 10 14 13 19 21 24 24 15 16 10 10 13 10 10 12 20 24 18
18 15 26 24 23 12 11 11 11 10 10 10 11 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 12 11 11 11 10 11 13 10 8 8 10 10 13 11 12 10 11 11 11 11 11 | Open.Hide. 6 6 7 7 10 8 8 8 8 15 21 39 41 41 41 41 41 41 39 44 50 53 53 53 50 50 50 50 47 41 28 15 10 8 8 8 8 8 8 19 12 19 19 33 26 44 44 57 57 47
47 50 47 47 44 44 59 50 47 35 25 15 9 9 9 9 15 17 12 15 16 13 18 25 29 33 33 37 47 47 47 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 53 53 38 36 36 36 36 33 50 50 50 42 30 29 12 12 12 12 20 11 11 11 16 11 19 12 28 30 41 42 42 48 50 53 53 38 38 53 53 53 57 59 57 57 57 57
57 57 53 53 50 50 68 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 68 59 57 52 57 52 57 57 59 59 52
52 54 54 52 59 52 52 52 59 59 50 50 39 43 43 52 52 59 59 59 57 57 43 43 43 57 57 47 47 43 57 50 59 59 59 43 43 43 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 46 43
43 43 47 47 57 48 47 47 44 44 44 46 44 57 39 39 35 35 35 42 42 34 34 20 24 14 13 12 12 15 15 24 32 42 35 42 35 43 43 39 39 35 42 34 40 28 28 32 41 41
43 46 47 43 59 59 59 59 47 46 34 34 17 16 9 8 8 8 8 8 6 8 8 9 10 10 10 10 10 10 11 13 14 13 12 12 12 12 12 15 22 32 37 37 37 43 44 44 43 47
43 43 43 48 48 48 48 43 43 43 43 43 47 47 47 43 29 19 15 10 8 8 10 11 18 18 28 34 30 24 12 12 11 11 11 12 12 29 29 59 47 41 41 41 48 43 43 39 39 36
37 30 24 19 18 18 25 26 34 32 36 36 39 34 37 30 30 32 30 30 30 37 37 31 31 35 36 37 43 41 46 46 37 37 25 30 28 34 41 41 41 37 37 28 40 43 57 57 57 50
50 48 48 39 39 39 43 43 27 27 20 28 28 28 29 17 16 16 16 29 30 30 20 20 26 24 20 20 24 26 29 43 36 40 40 25 25 25 44 37 46 39 39 33 36 39 39 37 35 35
39 36 41 36 36 36 36 39 35 32 42 42 39 39 39 30 28 28 28 33 33 32 31 20 20 16 24 16 25 28 30 28 20 20 19 19 16 27 30 30 37 37 37 37 30 30 30 37 37 36
25 24 22 22 28 19 18 17 17 17 30 34 32 28 17 13 15 10 10 10 11 15 20 17 12 15 10 8 8 6 6 13 10 24 22 26 21 21 22 22 24 16 15 10 10 10 10 13 15 29
19 14 11 10 11 10 21 13 13 12 15 10 11 11 13 18 15 15 10 11 11 10 13 10 9 9 9 10 10 10 10 9 9 9 10 9 10 21 21 26 25 20 22 9 9 8 8 8 8 11
11 12 8 8 8 8 8 8 8 14 17 13 10 9 10 10 8 8 8 10 8 9 9 9 9 13 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 7 7 10 12 13 10 10 10 8 8 8 8 10
10 10 |