BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-267H23.T7 (MSMg01no267_h23.b1) | MSMg01-267H23.TJ (MSMg01no267_h23.g1) |
ACC | AG408202 | AG408203 |
length | 1,625 | 738 |
length of high quality (start - end) | --- | 290 (75 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no267_h23.b1 PHD_FILE: MSMg01no267_h23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:05:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no267_h23.g1 PHD_FILE: MSMg01no267_h23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:05:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATTCCATCACGTTTCTCTTTTTCACGCACCTCCGTATACGTTCGTTCTT
ACGTCGCGCCCTCGCNTCATTTTGTACCATATGCAATTACTGTGTGGGGG
CGCCGCGGATACCGCGTAATATATCATACATAACTGCACCCGAGAGAGCA
CATATGATAGCCACGTCTACCTCTTTCGCGATGCAAGACTCAATCACACT
CCGAGTTCATCACCGCGCACGGGAAGGACTCAGTCGCCTTAGAGCGTTCT
TCTTCTCGCCGTCCCGGTTTATCTCATTCTCTCGGTGCGCGAGGCGCACG
CGCGATTACCAGGTCTATAACTACAGTTTATTCGGAGGCGAGTACAGCCG
TCGCGATGTGGACGAAGCGTCCACAACGAGTCTCTCGCTCGTACGCATCT
CCTCCATCGCACTAACCACCGCGTCCTCCCCACGTCGCTCCTACCCACTG
TTCTCTCGTTATACAATATAGAGCCTCGTCTATCGACGTACTACGCACGA
AATTTTCTACATTGGTAGGTGATCGCCGGCGGTGTCGTCCGGAGTGCGCA
TCNAATATTCTCGATTGTTATATTTGGTTAAGTATTTGCACACATTCTCC
GAGACGAGCTCAGAGTCCCTATTCATATCCGCCAACCATAGTAGTGCACG
CCGCCCTGCCGATGATAAATGCCGCAGCGGCCATCGTCGGAGATCAGCGG
AGGTCTAGATCTGCGCGACCCGACCACACCAGCACTCGTATATTATTATT
GTTATGTGAGACCGCGGCTCAGCGCAACGACCACGAAGAAAACATTATGC
GCGGNACCGGGACGGAGATGAGGAAATATACGTAGAGCCACGAGTCAAAG
CGATGCGGAGAGTGATGACGCCAGATAACTATACGATAATATGCAGGCGG
GACTGCTACGCGAACTCNTGTTATGAGATCATATATCGACACGACATCGG
TCGGCACTGCAACGTCACCCACATCAATACTATCATACCGAAGGCGAGAG
ATGTGCGCACGGCTGCGCGCAGACACTAACTACACTACACTTGTGATAAC
TCTCTATAGTACTCGCGACACGACACTATACAGCTACTCAGCTATGAAGG
TATTAGTCATATCGCACACATCATCAAACACGTACACTCAGACATGTGAG
GAATAGAGAANGCGACCACTGCANCANGATGCGAATGTGGCGACGGGGGT
GAGTGAGATAGCGNTAGCTCAGAAAAATAATAAAGCTGGAGAGAGATGAC
GACGCATAACACGCCTCACGAGAGAATGATGAATAGATAACTATAATACA
TAATGAAAGTATGCGTGCACTGCGCCGATGCAGCGTAGCTNTACTCGCGC
GGACGCTAGACGAGGGTCATTCGCGATTCTNTGATGCGCGGACGCGACAG
TTATGATCGTATACAGCGTACATCGTATGTAGTATATCTGTATTATCGAT
GTAGTGAAGACTGCGTCCGACGTACTACGCATGTATATAACCNCAGTACT
AGAGACGNGATCATCACAGCAGCATGACGNCACGCTCATGATCATATGAT
ATATACGTNTGTCATCGTATGTGCGCGCCGTATGTGTAATTCATTTATGT
CTGAGANCGTATGGCATGACGGAAN
| CGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGCCTCTGGATTTGATAACCGACT
AACTCTGCTTCTTGACAAAAGGAGAACTTTAATTTGGTAAATGTAAATGT
GCTTCATGTTCATGTTATCGTGTTGTTTGAGACAACAGACAAACCTGTGC
AGAACTTCCAAGGCAAAGAACAAAATCTGCTCTGGATGTTGAGTCACTAG
CAAGTATCTTGAGATAACTTTCCAGATTCTGTCTTCATAATTACAGATCT
CTAATGGTGATGGTTACCCAGAAACAACATTGTGCATGGTACCAAACCTG
CAAAAACCCCTGTGTCTTTATTCAGCACCCCCCCGCTAGTTCATCTGTTG
TCCAGGGTATTAATGAAGTGGCTGAATGAAAGCTGTGAGTGTCAAACAAG
GAGGCAGAACCCATTTAAGTCATGACATTAGCAGAAGGCTAGACGGTTGG
CTGGTCTGAGCCCCATATGACTCTGTCAGCAGAAGCAACCTCATGGTGTT
GTCAAGGAGAATGGAGGCATGGGTGGGTGGAGTTTGTCATTTCTTTGAAC
CCATTCTTGATATGTTTCCAAAATCACAAGATGAGACTTATTGTCTGTTG
CTTATTAATCAATAATTGGAAATCAAAGTTCTAGTCAGAATTAAAGAGAG
GGAGGCAAGATGGCAAGATTTTGTCACAAGCATGATTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 8
8 8 8 8 10 10 12 10 8 11 8 6 6 6 3 0 3 6 6 8 7 12 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 9 11 12 10 14 19
21 15 15 11 17 10 10 10 10 10 11 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 12 9 9 8 8 9
10 9 8 8 8 8 8 8 6 7 7 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 11 11 10 10 11 12 12 10
8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 7 6 8 6 10 10 10 9 8 8 8 8 12 10 13 6 6 6 8 8 11 11 16 12 12 10
10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 17 10 10 7 7 7 7 8 9 8 8 8 8 8 8 13 13 10 10 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 6 6
8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 7 10 6 8 8 10 8 6 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 14 12 13 19 10 8 8 8 8 6 6
6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 8 8 8 8 9 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8
8 10 10 8 8 6 6 6 6 9 9 11 8 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 9 10 9 9 9 10 10 10 8 6
6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 6 13 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 8 8 8 9 10 11 11 13 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6
8 6 8 8 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8
9 3 0 3 8 10 12 12 13 6 6 8 10 7 6 6 8 8 8 6 6 6 7 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 10
8 10 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 19 11 10 7 6 8 8 9 10 9 9 8 8 6 6 7 7 6 6 8 8 11 11 8 11 7 9 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 12 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 7 8 8 8 6 6 6 8 8 8
6 6 6 6 9 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 9 10 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 7 7 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 10 10 9 7 10 6 6 8 8 6 6 7 7 13 15 13 11 11 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10
8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 6 6 6 8 6 9 9 9 11 8 11 9 8 6 6 6 8 8 8 9 9 6 6 8 6 6 7 8 8 6 6 10 6 10
10 11 11 11 13 10 10 14 10 10 8 8 6 8 8 8 6 7 10 7 8 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 7 9 8 13 8 3 0 3 8 6 10 6 6 6 6 10 10 10 10 12 12 18 18 8 8 6 6 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 7 7 9 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 7 10 7 6
6 6 8 8 8 8 9 9 8 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 11 8 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 10 9 9 9 9 9
9 9 9 9 16 12 10 9 9 7 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 7 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 7 10 12 8 8 8
8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 10 12 14 15 8 8 6 6 8 8 10 10
6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3 8 8 7 7 7 7 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9
9 10 9 8 8 8 8 9 9 13 10 10 3 0 3 10 10 15 13 14 11 8 6 7 7 7 6 6 9 8 8 8 9 8 7 7 6 6 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 10 14
10 10 9 10 10 7 6 6 6 6 8 6 10 10 8 8 7 6 8 10 11 6 6 8 8 6 6 13 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 10 10 10 7
7 7 6 7 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 15 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 7 6 6 6
8 8 8 7 6 6 6 6 7 11 11 8 7 7 8 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 9 8 6 6 6 8 6 6 7 7 6 6 6 8 9 9 9
9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 6 10 13 8 8 14 8 8 10 3 0 3 6 6 10 10 19 16
11 11 13 10 13 9 3 0 3 6 6 6 6 6 8 9 6 6 6 6 8 6 8 9 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10
8 8 7 8 6 6 6 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 11 12 10 10 8 8 6 6 6 6 8
8 15 11 11 9 3 0 3 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 9 9 7 8 11 11 9 9 18 12 10 10 10 19 32 47 41 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 50 53 48 43 43 22 23 21 10 10 10 23 23 42 42 43 24 24 24 36 43 48 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 23 33 21 26 35 35 34 44 43 29 40 48 48 50 48 51 50 50 50 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 59 59 50 43 37 50 50 57 57 68 68 68 51 50 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 47 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 48 59 57 57 57 57 54 57 59 68 68 68 59 59 39 30 24 24 18 23 23 23 23 28 29 43 59 68 59 59 48 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 50 50 50 50 42 41 41 25 15 8 6 6 6 6 7 6 8 7 11 10 10 9 9 10 10 10 10 17 8 8 8 8 9 12 11 18 25 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 57 59 59 47 47 35 39 42 48 54 54 54 32 35 15 13 13 15 13 12 12 12 25 26 44 59 59 68 68 59 59 57 57 57
48 54 54 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 54 59 59 48 48 54 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 47 47 47 47 47 43 43 41 41 44 59 59 59
59 59 47 48 48 46 46 46 39 37 39 39 31 36 41 44 47 59 59 43 34 34 25 25 19 24 28 39 34 34 41 41 37 37 43 44 39 47 42 42 50 50 47 47 44 41 21 17 17 17
19 28 44 47 59 47 47 47 59 43 48 48 41 41 42 41 34 34 24 22 22 34 34 43 35 35 32 34 34 47 35 37 37 30 30 30 37 37 48 48 47 59 43 43 37 43 37 43 43 47
47 59 59 44 44 43 37 31 37 36 36 36 39 39 41 24 18 18 18 16 21 23 32 36 32 18 13 10 10 10 18 25 23 20 18 18 15 13 9 9 9 14 15 27 27 32 30 36 35 29
29 25 27 14 14 15 19 19 28 24 17 10 11 17 14 11 19 15 19 16 25 18 12 12 16 18 20 32 28 30 26 15 12 19 10 9 9 9 |