BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-302A01.T7 (MSMg01no302_a01.b1) | MSMg01-302A01.TJ (MSMg01no302_a01.g1) |
ACC | AG428028 | AG428029 |
length | 720 | 720 |
length of high quality (start - end) | 320 (46 - 365) | 291 (77 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no302_a01.b1 PHD_FILE: MSMg01no302_a01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:39:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no302_a01.g1 PHD_FILE: MSMg01no302_a01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:39:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTCTCTAGAGATGTACTTGTTATCAGGGTCATCCTGGACAAGAAGT
AAGTTTAAGTGATCTAAGTGGCATATAGCTGCTATATAGCTCTGATAATA
TATTAAAATTTATAAATTCACCATGATTGTAGACTTACTGATTTCCACAG
TAAAAAGGAAAATAATTATAGAAAATAAAACAAGTTTTGGGATAAAAATA
AAGTGTTAAAATGATAGCTGATGAGAAAGAGAAAGATTATCTGGTAGGTT
TACTTGAGTGCTAGGGAGACTATAGTTTTGAAGACACAATATATGATATA
TTCACACATATCCAAATTATTATTATGCCCCCCCCTACATCATGGTCACA
GAGGATATCCTTTCCGTGGGAATTACCAGGTGTGCCAGCAGTAGGGTGCT
GACTGAACAGCAGCAGTCATCTAGAATGCTGTCTTCACAGCTCATACTAT
CAAATGCATTTAGTTTAGCTTTGGCTAGTTATTAATATTTAAATATAGTA
TTCGTAAATGATGCTGAGGTTCAAGACTAGTCTAAAAAGGAACACCAATA
GGTTTTAACATCTTAAAACATCTATATTCCAGAGATTAAAGAATGAGCAC
TGATTTACAAGGGGTTTTATTGTTTTGTTTTTTATTTGAAGCTCTTCTAT
CTCCCTCATGCTCATTCTTN
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGTTGAGTAAAGCTGCTATGAGA
GAATAATAGCAGCCCAAGAGAAAGAAGTGTGTTGCAGCCAACAAAGCTGA
CAGGAGTTGAATGCATAAAAAGATTCTTGATATCAGATATGAAGATGCAG
AGTTTGGAGTTTGTTCAGCTGATTTTCAGTCTTGCTTTAGTTCAATTATT
TCCTCATGGTCCCACTCTTCCCTTTAAGAATGATGGTATATATCCTGTGC
TATTACATGTTGGAAATATGTGATCAGGTTCTTCATTTTGATTTTACAGG
AGACTACAATTGTGAGATTGTTTGACCCCCCCACCCACATTTTGACAGAC
TCAGAATAATTTGTTACAGACTATGGGGATTTTTGAGGTTGGACTGAATG
TGTTTTGGCATTATCATATAATTATAAGCCTATGGTTGCCAGGAAACTGA
CAGGTGTTAAAAAAAATGTAACTTACAGAGATCTACACATCATTTCACCC
AAACACAAAAGAACATACCTTCTTTTCAGCACCTCACATAACATCATCCA
AAATTGAGCATATACTCAGTTACAAAGAAAGGCTCAACAAATACATAAGT
TGGAATAACACCGTATATCCTTCAAGACCACCACGAGTCAAAGCTGGATT
TTAACAATAGAAAGCCTTCA
|
quality values | Open.Hide. 7 10 6 7 7 9 12 22 34 34 33 32 32 28 28 37 37 32 32 28 32 32 33 41 43 27 24 24 24 24 35 39 53 50 57 57 48 48 57 57 37 37 24 30 30 36 40 42 43 42
47 42 42 50 50 59 59 57 57 57 57 57 50 50 48 50 48 48 54 54 57 57 57 68 57 51 41 41 41 48 48 57 48 48 57 57 57 57 57 57 48 41 41 41 50 50 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 52 59 59 59 59 59 57 57 57 57 62 62 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 51 51 68 68 68 68 68
57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59
59 57 59 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 57 68 68 54 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 41 34 30 18 11 10 10 10 10 10 19 26 28 28 21 15 15 12 16 10 12 12 10 10 10 10 17 19 30 36 59 59 59 59 59 48 48 57 50 50
53 50 50 50 50 47 47 47 57 57 57 59 59 57 48 43 59 43 57 48 50 53 48 54 54 59 44 28 22 18 18 18 20 23 18 21 18 30 36 44 59 59 68 68 59 59 57 54 57 57
57 57 57 57 57 57 48 48 48 44 44 48 48 48 47 59 48 50 57 57 59 59 59 50 50 50 50 57 57 59 59 54 52 57 57 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 57 59 57
52 52 59 59 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
59 50 43 43 59 59 68 59 68 68 59 59 59 59 57 57 48 48 39 44 39 44 44 57 57 57 57 57 44 44 30 37 42 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 54 54 54 54 48 48 48
48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 48 48 43 48 43 50 47 47 47 47 47 47 57 59 59 59 59 39 37 37 35 30 37 39 41 43 41 37 37 41 41 41 41 40 40 39 39 35 43 39
48 40 42 42 41 40 40 32 28 28 31 31 41 41 43 43 39 41 39 37 37 32 28 28 43 43 41 36 36 43 59 59 59 46 41 41 59 40 37 37 39 43 37 37 32 37 41 41 41 41
41 41 40 48 48 48 48 48 48 48 37 37 37 37 37 27 25 15 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 10 9 8 7 8 9 9 15 19 36 37 41 39 39 41 41 50 50 41 41 47 47 47 47 48 48 48 48 48 47 43 34 33 32 32 32 37 42 42 30 30 30 43 43
46 46 36 36 46 44 44 48 48 48 57 50 50 50 50 48 48 57 57 57 50 50 48 42 57 47 48 48 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 54 54 54 57 48 68 68 68 68
50 50 57 57 57 50 57 57 48 48 50 46 52 52 52 52 57 57 52 52 54 59 59 59 54 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 37 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 41 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62
62 62 62 57 59 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 52 52 52 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 59 48 57
57 59 59 57 57 57 54 54 57 59 59 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 47 47 43 43 43 59 47 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57
57 57 48 59 59 59 59 59 59 57 59 39 32 21 15 12 12 20 16 23 20 32 28 20 20 18 19 19 22 18 12 10 10 11 11 10 10 10 10 21 30 37 59 41 41 48 48 48 48 43
39 39 32 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 54 54 54 48 48 57 57 57 42 41 24 24 15 20 19 20 21 15 15 12 12 12 12 15 18 27 28 44 44 48 47 32 32 32
35 35 35 35 42 42 35 42 44 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 59 59 54 59 59 57 57 57 59 57 57 52 54 57 57 59
57 52 52 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 43 37 52 57 57
57 57 52 52 52 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 57 57 43 44 44 57 57 50 50 57 57 57 57 57 57 57 44 42 42 32 42 29 42
44 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 57 48 43 43 43 43 48 57 47 57 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 43 43 40 43 43 43 43 57 43 43 36 36 35 43 47 57 57
57 48 47 43 43 46 46 47 43 46 43 43 43 37 37 37 37 39 37 39 34 34 33 31 31 32 30 25 25 28 30 34 34 40 46 36 34 25 25 25 31 31 41 41 41 29 29 32 37 37
37 37 29 29 32 29 22 28 15 14 14 20 15 18 14 14 18 34 28 24 |