BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-303D17.T7 (MSMg01no303_d17.b1) | MSMg01-303D17.TJ (MSMg01no303_d17.g1) |
ACC | AG428884 | AG428885 |
length | 677 | 736 |
length of high quality (start - end) | 255 (49 - 303) | 667 (70 - 736) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no303_d17.b1 PHD_FILE: MSMg01no303_d17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:41:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no303_d17.g1 PHD_FILE: MSMg01no303_d17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:41:05 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCACTACATAGGCAATGCCAGCTTCAAACTTTCAAACCCACCTG
GCTCTGCCTCCCAAGTGCCGGAATGGAAGCCTGTGAACCATGTCTGACTC
AGAAGAGCAATCCAAAAGCACAGAACTTTGCGCGCGCGCGCACACACACA
CACACACACACACACACACACACCCCTACCTTTCTATATGGTATGCATAC
TTACACGCTATCTTACAAAGTAGCAACCGGTCTCTAAGAAGCCTTCTTTA
ATCCCTCCATGAATACATTCCATTTTTTCTTTAACCAAACATTTAAATTT
ACCCCAAAAAAATTCCCCTTTATCCGGGAACAAACAAAAATCTTTTCAAA
AAGGGCCCCCCTTAAAAAAAGGGGGTAAAAAAAATATAAAACCTCCCNTT
ATAAACAAAAAAACCCCCCCAATCCCCCAAAAATAAATAATAAAACACCC
CTCCCTCCGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTATAATTTTTTTTTCTCGCT
TGCGCGTGAAAAAACTAAAAAAAAACCCCCTTCTTTCCTTCCTTCTCCCC
TTTCAACATACCTACCACTTATTTCCATACNNTTNNNNNCCCCCACCACC
CAGGACCTTCCTTTTTTTTTTCCTGTG
| ACAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACATATACCAGTCTTGGTTATGTAAACCT
CGCTCCCCAGTTTAAAGTTAATTGGTTAATAAAATGCTAGAGCCTGCGAT
TGGGCAGTAGAGAGAGAAAGGAAGGACTTGAGGATCAAGTGAGGCATCTC
AGGAGACCAGAAGAGGAAGGAGGAAGGAGCACAGGGGGAGGATAAGGTCA
CCATGAGGCCAGGTGGATCATGATGGATCATTCATGGGAATGAATGACTC
AGGTGAGACTCAAACATGTTTGTAACAAGTTGCCTATGGCTGGAAAGTAA
GTTACAATAGCTCACAACCTGCCCAAGCTCGGCTTAAAAGCTTGTAAATA
AAATACCAGGTACTTGCGCCTTTTATACAGGCTAGCTAGAATAATAACTA
ATTTTGACATGAGCCTCGCTAAATGAGACCACTGCTCAAATATCATGTTC
TGGGAGAAGCTTCCCAGACCCTTTTCCCAGGACGGCCTCTTTCTATTCAT
TCTATCACGCTAACCCAGGCATTAGTTACTTTCCGTAGCAATGACCAAGC
AGTGACCTTGGCTAACTACACAAAGGAGGAAGAATTTTCCTTGGCTCAGT
TTCGAGGGGTCTAGTCCTTGCTTGCTTGTCCCAACAGTCTACTTCCTCCA
ACTGGGCCTTCTTCCTAAAGTTTCTAATCTTCCAAC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 6 8 8 9 8 20 20 28 30 37 37 37 31 31 37 37 30 30 33 33 30 30 37 47 31 29 26 26 26 25 26 13 10 10 7 7 7 13 13 30 18 18 21 28 28 31 47
48 57 36 38 38 36 53 36 36 33 33 39 37 37 22 21 13 13 13 13 17 30 27 37 37 37 37 41 33 36 36 36 36 50 57 59 42 42 42 47 50 50 53 53 53 53 53 53 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 50 50 50 50 47 47 54 57 57 59 68 68 68 68 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 48 48 50 53 53 57 59 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 47 39 39 38 34 35 39 41 41 41 39 32 32 32 26 26 28 39 39 41 39 37 30 25 22 28 22 22 27 25 25 29 37 41 37 19 18 9
8 8 9 15 11 11 16 28 35 28 15 14 10 10 10 13 13 15 14 11 13 14 11 11 23 19 11 11 10 12 17 20 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8
8 9 8 8 8 8 9 14 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 10 10 10 12 12 13 11 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 7 10 14 14 14 13 16
11 11 8 8 8 10 11 9 12 11 9 9 10 8 8 8 8 10 12 12 10 9 8 8 8 8 10 11 12 13 14 10 10 12 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 3 0 3 7
8 8 8 6 8 6 6 8 8 13 30 16 10 13 10 11 11 9 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 12 17 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 6 6 8 10 10
10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 25 30 33 28 28 15 15 9 8 9 14 19 15 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 15 17 21 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8
10 10 12 11 11 11 12 10 10 16 17 15 9 9 8 8 8 10 10 8 8 10 8 9 10 12 15 16 12 12 18 11 11 9 10 10 13 12 10 9 12 11 10 9 8 8 12 8 8 8
12 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 8 8 7 6 10 7 8 8 8 10 8 8 6 6 8 3 0 0 3 3 0 0 0 0 0 3 23 23 15 12 12 8 11 7 6 7
8 7 7 8 10 9 10 10 10 10 8 8 8 8 10 18 19 24 28 14 12 9 10 9 9 9 9 | Open.Hide.10 10 9 9 15 10 8 8 10 22 27 37 33 33 50 50 53 50 59 59 59 47 41 39 25 18 9 9 9 7 6 6 6 6 10 14 11 23 20 30 37 37 44 47 47 47 53 44 50 50
50 47 27 27 9 10 11 11 12 12 16 15 18 13 17 24 28 31 31 44 47 53 53 57 57 53 59 50 42 42 47 47 47 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50
50 51 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 68 68 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 50 50 50 50 50 47 30 26 13 10 8 6 6 6 7 11 15 15 24 24 41 41 50 59 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68
68 68 68 57 57 57 57 59 57 54 54 54 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 32 30 21 15 10 8 8 10 17 34 59 47 50 59 59 50 53 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68
68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 48 59 48 48 47 57 57 57 54 54 54 54 54 57
59 54 48 48 48 48 48 48 43 43 40 43 43 43 43 57 37 43 36 39 39 43 43 59 59 59 47 47 59 59 44 32 28 28 32 32 33 59 59 59 44 44 41 41 43 41 47 41 46 46
46 48 46 47 46 47 47 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 59 48 48 47 47 39 39 36 37 37 43 41 39 41 39 39 39 39 37 37 41 41 41 31
31 39 39 31 31 31 31 29 32 43 41 34 31 31 31 39 39 41 43 41 37 37 41 41 41 41 43 43 41 31 27 29 22 29 20 20 |