| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-313H02.T7 (MSMg01no313_h02.b1) | MSMg01-313H02.TJ (MSMg01no313_h02.g1) |
|---|
| ACC | AG435369 | AG435370 |
|---|
| length | 1,271 | 1,297 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 307 (504 - 810) | 334 (129 - 462) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h02.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_h02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_h02.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_h02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:08 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (88,377,969 - 88,378,275) | (88,537,997 - 88,538,316) |
|---|
| sequence | NCTTTTTTNNNNNNAACCACTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCTAATGGCATTCCTATCTTACACCCAGGAGAGCTCCACAG
AGTAACTCACCAGCCTTGTAATATTCTGCCAACACTTTTATTGGTGTATT
TCCCAGTCTTCTGGACCATTTCAACCTTTCTTTTTACTTTCTGTGCTGCC
TGAAGGTACGGTAGGAGATAGTTGAGATCCAAACTTTGCTCGATCAAATC
ATATCTGTGTTTAAGTTTTGTATCTTCGATGATGTCACCCCCAGCCCACG
TGCTTCGATGTCACCCCCAGCCCACGTGCTGCCACCAGACTTTGCAGCTC
AGTCTGAGTCCTCTTGCTATCCCCTGTGCTGTTCCCACATGCCATAAGTT
GGGGGACTTGGTGTTCTTATCTAATTGTGCTTTCTCAGATTGCTCACTGG
TATTTGTTTTTTATGGCACTGTGATCTCCACTGAGCAGCCAACAAAACAA
CCACTGAGTGGGCCTCCATAGATTTCCCACTGGTCATTGCAGCTAGGTCC
TGATAAGTAAAAGAATCTAAGAACCACTCTTCCCTCACTGCTGGTGAGTC
TGCCCTCCATCCATAGCTGAAGTCCACTCTTTTCTATCTTCCCAAGTTGT
TCAGCTGAACATTGAATACTCTAGACTCTCTGATGATGAATCAGTTAAAT
TCCCATCAGGTTTTTCTGAGAATGCTAAAGACTGCTCTTTACCCACCAAC
AGAAATTTGTTTTACATTTGACAGCCATTCAAGTTCAGGTAACTTGTTAG
TTACTGATTCTCAAGAGGTCAAGTATAAACTTTATCATGGCTACAAGATA
AATGGTAGCCATAGGCCTATCCTAGTGAGTATTGCTGTGAGCCACTTGGT
CCTATGATAAAAACCCGATCATGGGTAATTCCAACCTTCTTCCATAGATT
TTCAAGAAACAGGACATCTCACCAGATGTGAATTTTAACAAACCTTATTC
TAATTTATTCTTTACAAATAAATTTTCTTTATGAAAAAAAAAATTTCCCA
CTATTTCGGACTGAAAACCAGTTTAAACCCTTTTAAAAAATTTTCCCAAC
TTTGAAAAGGACCCCCTGTTAAAAAATTCCTATTAAACAATTTCTCCTGG
AAACCGAATTTATTTGTCTCACCACACTCTGTAAGGGGGCCGCCCACAAA
AAAAACCCGCTCTTTTGTAGATAAAAAGAAGAGTTCTTTTATAATCTCTG
AAAAAAATATTTCTTTTTTTC
| NNNCCCGTCACGCGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGTCAGTGCACACAGATTCTGCAAAAAT
GCAATCCAATTAGCACCACATGCCCGNAGGTGTGTGACAAGTAAGAGCCC
TGTCACAGAAAACCTCTGAGGCAATGGCTTCTTCCTTGAATGAACTACGA
GGCAATCAAATGAAATGAAACCAAGAGCCAAGGGAAAGGCCACCAGCTCA
CTGTAGGAAACCTACTTTGGGAGACTGGCTAAGGACATCAATGACCTTAG
ACAAGTGAATGACTTTAATGGGAAATGTTGAAAAGTAGACTATTTTTTTA
AAAAAAAATGATGATAAAACATCTTAGTTCATTTTCAAAGTAAAAATTTA
TATAAACATTTTAAGTTAGAGTTCAAACTGTTGAGTTTCGTATATGTCTT
TTTTTTTTCCCCCCCCGNNNGCTGCGCCTTCCCCCCAAAAAAAAGGGGGG
CNNCNCTGCCTTCNTTTGGTANGCTTCCTAGTGTGCCTTCCTTTCTTGTT
GTGAAACAATTGGATAAGAACTACTGTTCATAGCTCCTTTATCAAGCTAC
AGGATTTAGCAGTAAATTTGTCTAGAACTTGGATTTTTTTTTGTGGATGG
TCTTTTTGATACTGCTATAATCACATTGCTTACTGCACATGTGTTTATAG
CTTCTTGGTTTAATTTTGGTCATATTCCTGTGTATCTAGCACTTTATCCC
TTCCCTTTAAATTTTTCCATTTTTCAATTTAACCTTTCAAAGCATTTCCT
AATGATTCTTCCAACTTCCTTGGACTCTTTTATAACCTTAATTTTCCCTC
CCTAACTTTTATAATTTTTGTTTTCCTGCCCCTTTTCCTTTCGCCGACGC
CTACATCACCTTTAAACACCCCTCTTCACGCACCCCACTTCTGCCTTGAT
TGCCTTCCTCTGCTCCGCTTCTTTCTCGCCCTCCCTTTCCATTGCCATCT
TCTTCCCCCCCCTCCTCCCTCAATCTCCTTTCCACCTCCTCCTCTCCCCT
CCCTCCTCCCTCCTCTTACCATCCCTCCTCTCCCTTTTCCCCCCCTTTCT
CTCCTCTTCTTCCCCTCCCCTCCCTCCCTTCCCACCTCCTCTACTCCTCC
TTCTCTCCTCCTCCTCCCTTCCCTCCTCTCCTCTCCTTNCCTCTCATTCT
TCTCCTCCCTCTTCTTCCCATCTCTCTCTCTCCTCCCTCTCTACCACTCC
CTCCTCTACCTCCACTCCCACTCCTCACCTCTCTCCTCCATCGCTCC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 8 7 8 12 11 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 19 21 36 33 33 33 33 33 33 37 37
37 37 37 37 32 32 21 21 14 10 10 22 22 28 33 50 50 50 50 50 25 23 18 15 15 10 10 10 16 13 13 28 34 36 33 22 22 31 32 38 50 42 42 42 43 43 57 50 50 53
50 50 50 50 50 36 36 33 33 50 37 37 21 21 10 13 11 11 10 10 10 11 12 21 22 37 37 27 25 10 8 8 8 8 15 21 33 33 37 37 41 41 53 53 50 50 50 53 53 53
57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 53 53 50 53 53 53 53 57 57 53 53 57 53 53 50 50 50 50 37 37 27 21 12 11 12 15 12 16 12 12 17 24 30 37 39 35
32 28 21 15 30 32 44 48 53 53 53 53 53 53 53 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 41
30 19 12 11 12 12 18 22 27 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 27 27 11 11 11 13 16 28 8 7 6 6 8 6 10 12 12 16 11 12 17 26 35 39 50 59 59 59 57 53 48 43 43 40 37 37 31 23 23 12 12 10 11 11 10 10 10 12
11 12 16 18 24 27 33 37 44 48 53 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 59 59 57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 47 47 59 59 44 39 39 44 44 44 59 47 50 50 50 50 48 59 47 43 37 44 41 43 37 48 48 59 59 59 48 48 48 48 48 40 41 46 43 59 41 41 37 37 39 39 39 41
41 41 47 47 47 59 39 32 28 31 43 59 59 59 47 43 32 32 18 18 18 28 32 37 37 37 37 37 37 39 35 39 39 43 59 41 41 41 41 41 39 34 34 39 39 37 37 41 40 39
36 35 25 27 30 37 37 37 59 59 41 41 37 32 30 37 37 41 37 37 37 37 37 39 31 32 39 39 37 35 28 31 40 31 24 26 14 14 27 30 43 47 47 47 59 47 47 37 36 30
22 23 27 37 37 30 21 21 20 20 19 32 24 15 19 10 10 10 19 10 12 12 23 19 35 37 27 29 29 27 25 27 39 39 39 47 37 32 25 25 30 19 22 11 10 10 18 9 10 8
14 17 19 15 16 19 11 11 11 16 27 34 25 20 20 29 29 37 22 21 20 14 16 11 11 11 22 18 18 11 11 12 21 11 11 12 22 22 23 14 12 14 9 9 9 9 9 10 17 22
15 18 23 20 10 10 9 9 8 8 8 8 11 11 19 14 27 30 28 27 15 8 9 8 10 15 14 21 22 8 13 8 8 8 9 14 16 10 12 12 15 15 17 15 13 10 10 10 13 14
30 20 21 19 11 11 8 11 8 8 11 10 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 7 9 9 10 10 13 10 9 9 10 10 18 8 8 7 7 8 9 8 10 8 8 11 12 10 10 6
6 6 6 8 8 8 8 9 9 11 11 8 10 8 8 8 10 8 10 10 15 15 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 15 17 19 20 24 18 14 14 11 8 8 10 15 10 8
8 8 9 9 13 12 12 10 10 13 13 10 9 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 13 12 18 12 12 9 8 8 8 15 17 10 16 9 9 8 9 9 9 15 13 11 11 11
9 11 9 10 10 9 11 9 11 9 9 9 11 12 10 7 6 6 6 8 8 26 23 23 23 10 10 10 10 10 11 9 9 8 8 8 8 9 9 15 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6
8 6 6 8 6 6 8 6 9 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 8 8 8 8 9 8 8 8 8 11 9 10 9 8 9 9 9 10 9 9 8 8 8 10 8
9 13 9 12 10 10 10 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 12 11 10 10 10 13 11 11 11 25 9 12 15 13 12 9 9 10 12 9 7 10 8 8 8 10
9 9 8 15 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 14 11 9 9 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 9 7 9 9 9 10 13 9 8 8 3 0 3 3 0 3 10 10 10 22 21 31 24 30 22 23 19 16 14 20 26 19
33 42 34 32 40 40 48 48 43 43 39 28 28 32 32 57 48 34 43 25 25 24 31 27 32 31 31 32 43 43 48 54 54 57 54 54 54 48 32 32 28 25 22 25 25 32 32 39 39 37
32 33 33 37 43 43 34 34 30 30 30 36 47 37 32 41 37 31 22 15 11 15 8 8 8 3 0 3 21 23 37 29 26 23 23 20 20 32 27 47 39 47 53 47 48 47 59 28 37 37
37 25 42 24 25 28 37 37 59 59 59 34 34 23 33 30 31 31 34 34 50 47 47 54 50 48 44 30 21 25 22 35 35 44 39 44 39 44 44 42 35 41 41 43 43 32 32 32 32 43
48 48 43 43 43 57 43 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 31 31 31 44 44 44 43 27 27 20 38 41 68 68 59 59 59 41 41 20 27 27 38 38 43 38 38 27 32
27 38 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 35 32 32 43 43 52 57 57 57 59 59 59 57 57 43 43 43 43 52 57 57 57 44 44 44 43
33 32 32 37 50 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 43 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 32 44 44 57 59 59 68 68 68 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 43 43 43 43 40 40 40 59 34 40 37 43 48 57 47 57 43 43 39 47 39 48 59 30 28 18 16 10 8 8 8
8 15 17 31 31 47 41 46 46 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 57 46 48 48 48 48 48 57 59 48 48 48 48 59 48 59 59 59 59 47 47 46 47 41 27 27 9 9 11 19
19 37 41 37 28 28 18 18 16 9 9 9 9 9 7 8 3 0 0 0 3 23 19 14 10 10 10 9 11 11 11 17 13 12 9 8 8 10 10 11 16 14 11 9 8 8 8 10 10 9
3 0 0 3 0 3 29 29 59 59 27 29 3 0 3 27 27 44 27 25 3 0 3 25 14 9 9 9 9 18 23 41 47 47 43 43 43 48 59 59 48 48 46 59 59 57 57 59 59 59
57 57 57 50 43 43 36 36 36 43 43 32 32 32 32 37 30 39 37 44 30 42 42 39 39 30 39 39 43 37 37 44 37 35 42 42 48 48 48 57 46 44 41 28 18 18 20 22 22 13
13 13 34 28 43 30 28 14 14 19 24 23 28 23 37 34 47 47 43 36 36 30 37 30 30 21 28 19 21 21 19 17 22 22 22 30 39 47 43 47 37 37 28 28 28 23 23 34 31 23
23 23 34 34 43 43 34 27 27 14 14 14 29 31 39 39 36 36 34 22 22 17 17 15 19 19 30 30 33 23 18 12 8 12 10 8 8 8 9 24 24 28 31 25 31 39 39 37 26 26
19 24 24 20 15 15 11 14 16 20 21 18 22 15 14 10 10 8 10 8 8 12 14 30 39 35 39 31 31 15 22 11 11 11 19 19 27 17 13 13 6 6 8 17 23 33 15 13 9 9
13 24 18 9 8 8 8 8 7 8 9 9 10 27 23 11 8 8 8 10 15 15 9 9 8 8 9 16 13 18 13 13 10 10 9 10 10 9 9 9 12 8 9 9 15 12 21 17 13 11
11 16 12 14 19 24 19 19 16 19 13 14 11 9 10 17 14 9 9 9 13 9 9 8 8 10 10 12 15 16 15 12 16 12 11 8 8 8 8 9 10 12 15 10 14 13 14 12 16 19
16 14 20 19 18 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 8 8 8 12 10 7 6 8 8 8 9 10 9 10 12 12 9 9 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 18 12 12 8 8 8 8 8 10 21 15 13 7 7 8 12 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 11 11 11 12 10 11 11 10 10
10 11 11 13 12 9 9 10 10 10 9 9 9 10 9 9 9 10 10 10 8 8 6 7 6 6 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11
10 12 15 15 12 12 19 10 10 10 8 8 8 8 8 7 12 12 14 12 10 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 10 7 7 8 13 8 8 10 10 10
10 15 9 9 9 13 10 10 10 8 6 6 8 8 9 9 10 7 8 7 7 9 9 17 25 22 19 13 13 11 11 11 17 11 13 12 11 11 17 18 13 15 15 15 9 9 8 8 10 12
9 9 12 15 10 9 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 9 11 11 13 8 9 9 10 13 10 10 8 8 8 10 9 9 12 12 12 15 26 26 12 12 9 7 8 8 8 8 8 9
9 9 10 19 14 14 14 14 11 10 6 6 8 6 6 8 10 7 6 8 8 11 14 13 10 9 17 9 9 13 7 6 6 6 10 8 7 3 0 3 8 9 10 10 6 6 6 11 11 10
10 10 12 11 8 8 8 10 8 8 7 7 7 8 8 6 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 12 12 13 8 8 8 15 13 14 12 9 9 9 9 8 8 6 7 8 8 7 7 8 10
9 8 8 13 13 8 6 8 8 11 15 13 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 15 15 20 12 12 10 10 8 10 11 8 6 6 6 6 6 8 8 6 |
|---|
