BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313K03.T7 (MSMg01no313_k03.b1) | MSMg01-313K03.TJ (MSMg01no313_k03.g1) |
ACC | AG435504 | AG435505 |
length | 1,264 | 1,215 |
length of high quality (start - end) | 424 (43 - 466) | 264 (188 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_k03.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_k03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_k03.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_k03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:33 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCGCTATGGGCGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCCTGATCTTTCTAAGACTTTTATCATGAATGAGTGTTGGATTTTGTTGA
ATGCTTTTTCTGCATCTAACAAGACGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGT
TTGTTTATATAATGGATTACGTTGATGAACTTCCATATATTAAACCATCC
CTGCATCCCTGGAATAAAACCTACTTGGTCAGGATGGATGATTTCTTTAA
TGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTTTATTGAGTATTTTTGCATCG
ATATTCATAAGGGAAATTGGTGTGAAGTTCTCTATCTTTATTGGATCCTT
CTGTGGTTTAGGTATCAGAGTAATTGTGGCTTCATAGAATGAGTTTGTTA
TAGTTCCTTCTACTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGTGNAGATCTGTATTT
TTTTTTCCCCCCCCCCNCNGGNAGAACTCTCCCCAAAAAAAAGGGGGGGG
NGNNNNNNNNNNNNCNGNNNNNCNANNANCGACCGCNNCNACCCCCNCAC
NCAANACGCCCCCACACACACCCCCAACCCGACCCCGACCCAACCCCGCC
ACCCGAAACCCGCCCCCACACACGACCCCACAACCCACACACCCCCCGCC
AGCCCACAACCACCCCCCGCACAACCCACCCACCCAGCCCACACCACACC
CCGGCCCCACCCCCACCCCCACACAACCCCACCACCCACCCCCANCAACA
CCAACCGCCAAACCACCACCCAACAACCCCACAACCCCCCCACCCCACAA
CCCCCCCCCCACCCCCCACCCCCGCACAACAACACCACACACCACCCACC
ACCAACCACCCACCCCACAACCACCCCCCCCCACACCACACNCCACAACA
CCACCCACAACCCCCCCCACCCCCCACCCCACCCCCCCACCACCACGCCC
CCCCAACCCCCCCNCCCCCCCCACACCACCACCACCCCCCACACCCCCAC
CCCCACACCCACCAAACACCACANCACCCGCCACACACACCACCCCCCCC
ACAAGCAACCACCCAAACCACAACCACCACAACACCACACCCCACCACCA
CCACCCCCACCCCACCCCACAACCCCCCCACCACACCACCCAACCACCCC
CCACCCACACACCACACCCACCCCAACCACCNCACACAACCACACACACC
CGACACCACCACAACAACACCCCGCCACAAAAAACCCACACAAAACAAGA
ACCACAAAACAACA
| NNGGAAAATGATGGNTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGGATAGTTTGGTTAGTTGATATTGTTCT
TCCTATGGGGTTGCAATCCCAAACCAGGAAAGGGAATATTATTTGAAATG
TAAATGAATAAAATGATTAATAAAAAAATATTTGTCATAAAAACTAATTA
AAAAACTATCTAATCTGTACATTATTTAAGTGAGATGGATCAGAAAAAAA
ATCTAGATTTAGAAGCCAAGAATCAATGAGGAAATATTAAATCAATACAT
AAAGAAAATAAGAGCCAAGGACATGAGCATTACTCAATGAATGAGATGTA
GAAAGTGATCAATAATCTCCAAAAGTTTATCTGCAATTTAAGTTATGTTG
TTCTTCTAAATTCATTAGCTTGAACTTTCCTCCATAGTTTGGTTTTGTGC
GTTTTTTTTACCCCCCCCCAAGNTTCAGNGAANACCTCAAAAAAAAAAGG
GGGGGCTTCTTNNNNNNNTGTCTCTNCNNNAANNNNCNTCNAANTGTTTT
GNNNNCCCTGCCTTATCCTNCNCCCNNTNCNCNTNCNNCNNGATTGCNNC
CNCCTGNNNGCCNNGAACAGATGCCTCATGTAAACAAGAGTAGCTGGAAG
CTAATCTTTCACTTGTAAACACAAGAGCTATGATAAAATAAGTGTTTTGT
TGTTGTTGTTGTTGATGATGATTCCAATAGTATCTCAGAACTGCATTGCT
AGCATAACAATGGAATATCCAAAGGTACAAAATTCCTTTGAACTTGGTCA
ATTCAAGTACTTTACTGCGGTTTACATTATTGTAACTATGTTTCACTAAA
ATAGGTCCATCATGATGAGGAGAGAAAAAACCCACACTACTTTCTTGTTA
AATAGTTAATTAGGTACGCAAGTTTAATGTAACATTTTTTGTATCCCTTT
TCTTTAATTTAACTTCTCCCTTTTTTTTTCCTTNCCTTCCTCTATTATCT
CTCATTTTCCCCTTTTTCCTTTTCCCTCTTTTTATCATTCCTTCTCCCTC
TTTTTTACTCCTTTTCTCCTCTTCCTCTTTTTTTCATTTTCATCCCCTCT
CATTTCTCCCTTTCTTCCTCTCTCTCTTCTCTTTCCTCTTCTCTCTCTTC
TTTTCTCCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTCTTCTCCCCTTTATCTCCCTCT
TTCCTATCTTCTCTA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 9 15 13 13 10 10 10 12 12 9 9 12 19 24 24 18 14 8 8 8 19 21 28 17 24 21 23 28 42 43 48 54 42 42 39 36 43 43 51
57 57 54 54 54 57 57 57 54 54 50 50 50 50 50 50 57 57 57 50 51 51 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 48 57 59
59 57 57 57 57 57 53 53 53 50 50 50 53 36 31 31 31 30 28 28 28 13 8 8 8 8 15 16 37 37 33 33 33 33 36 47 48 57 57 53 53 53 50 53 53 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 54 57 57 68 59 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 59 57 57 57 57 57 48 57 48 48 57 57 59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 50 59 27 27 12 12 9 8 8
8 11 13 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 43 43 43 43 41 41 46 34 34 16 29 3 0 3 27 27 44 21 19 10 7 7 8 15 17
30 37 39 31 25 20 18 18 26 26 28 28 27 15 15 3 0 3 0 3 3 0 3 9 9 9 9 15 11 11 11 10 10 10 11 9 11 12 18 17 18 13 13 11 12 12 12 13 12 3
0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 0 0 0 0 0 3 0 3 0 0 3 0 3 12 19 8 8 8 3 0 0 3 0 3 6 6 6 6 3 0 3 7 3
0 3 8 3 0 3 8 9 9 9 9 9 8 7 7 7 7 9 11 10 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 10 13 13 8 8 7 8 8 9 9
9 10 8 7 7 7 8 8 6 6 8 6 8 8 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 12 15 9 6 6 6 6 8 8 15 8 8 6 6 6 6 8 10 9 9 9 6 6 11 6
9 9 11 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 13 13 11 12 13 11 8 8 10 14 10 11 10 9 10 10 11 11 13 10 8 6 6 8 15 12
12 10 9 9 7 10 8 8 9 9 10 8 10 6 6 8 8 10 10 7 6 8 6 8 13 8 13 11 11 7 9 6 8 6 6 10 8 6 6 8 8 10 15 3 0 3 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 11 11 9 9 12 10 10 9 9 9 9 10 9 9 9 9 6 6 6 7 10 13 9 9 10 10 9 9 12 12 18 14 14 10 13 10 10 13 16 12 8 7 6
8 8 8 8 7 7 8 8 10 9 9 9 13 9 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 7 10 10 10 10 10 14 15 8 15 8 8 8 8
8 8 6 6 8 6 11 11 17 18 9 9 9 9 9 11 11 9 11 9 6 6 6 6 10 8 9 9 9 12 9 8 8 8 8 13 8 10 10 10 3 0 3 6 6 8 8 8 6 7
7 6 6 8 8 10 10 9 12 9 9 11 11 7 7 7 9 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 14 20 12 12 12 16 12 14 13 12 12 13 13 10 9 8 8 8 6 6 7 16 12
12 13 7 6 6 8 8 8 8 12 12 12 3 0 3 6 7 8 9 9 14 11 10 15 13 12 10 15 8 7 6 8 13 10 8 13 13 10 10 6 6 6 7 8 8 8 10 8 9 9
11 13 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 13 9 3 0 3 6 6 8 7 6 6 8 8 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 10
10 10 10 7 9 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 13 8 8 6 7 8 8 11 12 12 10 10 10 10 9 9 8 8 7 6 6 6 10 8 8 6 6 8 10 8 8 6 9
7 9 7 8 6 10 9 9 9 11 15 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 6 8 11 6 9 9 9 9 9 9 6 8 7 9 11 15 17
23 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 6 6 6 6 8 8 13 8 8 6 6 8 8 10 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 7 9 8 8 10 10
6 6 6 6 8 8 6 6 8 7 7 6 6 13 13 8 6 6 8 8 10 11 9 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 13 6 6 6 7 7 8 8 8 6 6 10 6 6 6
6 6 7 6 6 8 6 8 11 7 7 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 10 9 9 6 8 3 0 3 6 8 13 6 6 6 6 8 10 13 9 7 9 9 13 16 3 0 3 10 10 10 23 21 27 27 11 11 16 12 12 11 12 26
21 37 29 21 15 18 16 23 28 34 30 43 43 48 44 44 39 37 34 39 28 26 13 10 10 10 10 19 22 37 37 39 33 33 36 36 36 36 50 50 44 43 43 34 27 25 19 15 19 19
19 21 30 42 42 43 53 53 53 47 47 47 47 47 47 53 53 53 53 39 47 35 35 32 34 32 33 30 28 28 24 19 15 13 12 12 15 15 32 32 42 50 50 50 59 59 59 59 57 57
57 53 50 50 59 59 50 50 50 53 53 53 59 59 59 53 53 38 38 36 36 33 33 39 59 59 36 35 21 19 11 11 11 11 12 12 19 22 19 24 30 34 23 23 23 23 34 34 59 59
59 59 59 59 57 50 50 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 57 57 57 48 44 43 50 38 38 50 50 59 59 59 59 59 59 59 47 35 33 33 29 43 38 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 40
40 35 39 39 59 44 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 27 12 9
9 9 12 13 24 32 28 27 12 12 12 18 11 16 16 11 11 8 8 8 8 3 0 3 29 29 27 3 0 3 18 3 0 3 22 20 11 11 11 18 21 20 20 20 18 11 11 9 8 8
8 9 9 9 8 8 8 20 27 27 3 0 0 0 0 0 0 0 3 29 27 59 27 27 3 0 3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 3 0 3 3 0 3 3 0 3 27 27 59 29 29
3 0 0 0 0 3 25 27 59 59 47 47 59 59 59 59 27 27 3 0 3 0 3 27 3 0 0 3 0 3 0 3 0 3 0 3 0 0 3 0 0 3 25 25 25 27 3 0 0 3
3 0 3 27 27 3 0 0 0 3 27 3 0 0 3 7 7 9 18 22 41 43 43 47 47 43 39 35 59 41 59 59 47 39 39 39 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 41 41 42 48 44 57 57 48 48 47 57 44 57 57 59 57 59 57 57 54 54 54 54 54 54 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57
57 59 59 57 48 48 57 57 57 59 57 57 57 57 48 48 48 48 30 27 15 15 15 25 25 28 28 37 37 37 41 39 41 32 25 25 12 25 13 12 15 18 30 12 12 12 28 24 26 26
41 30 48 57 57 57 57 59 48 46 57 57 57 57 39 35 48 37 37 30 37 32 37 37 37 30 25 25 21 21 12 10 10 13 8 8 8 8 11 13 14 17 19 27 21 9 9 8 8 10
12 19 26 16 13 8 8 8 9 13 13 11 11 15 13 15 9 9 9 6 8 6 7 8 8 10 11 13 16 17 21 16 15 13 10 11 10 10 10 19 19 19 13 14 14 10 9 9 9 7
6 8 11 17 16 16 11 10 10 10 12 15 27 24 19 12 17 15 12 10 11 11 9 10 10 10 9 9 17 17 20 16 18 13 13 9 10 8 13 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 9
9 9 11 11 18 12 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 7 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 6 6 6 7 7 8 8 12 10 9 15 10 10 10 8 8 15 8 8 12
8 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 10 13 13 19 19 18 21 17 18 16 22 10 10 8 11 9 3 0 3 13 12 9 9 13 12 9 9 9 10 9 8 8 10 10
6 6 8 8 9 12 10 10 11 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 7 10 7 8 8 8 13 8 8 10 9 9 9 9 9 6 8 10 11 15 8 10 9 8 8 8 8 8 13 10 10
8 9 9 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10 12 15 12 8 8 8 8 6 8 8 10 10 9 8 11 8 8 10 10 10 10 10 15 11 9 9 8 8 12 10 8 10 11 11 9
9 11 7 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 9 8 8 8 7 7 10 8 10 10 17 8 8 8 8 8 13 19 30 33 19 16 12 12 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 12 12 15
15 8 8 10 13 12 10 10 10 10 15 18 9 9 9 8 8 6 7 8 10 8 8 10 8 8 8 13 7 7 8 6 6 8 8 10 17 17 14 8 7 7 8 13 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 17 12 14 10 8 13 10 8 |