BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-318I12.T7 (MSMg01no318_i12.b1) | MSMg01-318I12.TJ (MSMg01no318_i12.g1) |
ACC | AG438307 | AG438308 |
length | 720 | 1,487 |
length of high quality (start - end) | 302 (72 - 373) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no318_i12.b1 PHD_FILE: MSMg01no318_i12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:00:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no318_i12.g1 PHD_FILE: MSMg01no318_i12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:00:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTGCCTGTGTCACAGAGCACAGCAGGTCCAGCAGAGATGCTGAGCGT
CATTGGGAGGTCACTGAGACATGCACATATGATGAGATAGGAGCTAGGTA
AGAACTGCAAACAAAAGTCATGAGAGGTCCTATAATCTCGACTTTCTGTG
TAAGGTATTATATATATATATAAACATGTATGAATATATGTATATATATA
TGCATATATATCATTCATTTATTAACTTAAATTATACAATATTTTGACCT
GAAGTCAGAAATAAAAATCACTGTTTGCATTCCACAGAATGTTTTATCTT
TCAGCCCCAAATTCCTTTATTCTCATCCTTCCAATCAATGTCTTCCTTCT
CCAGACTACATAGATCCCCCCCCCCTCTCCCTTGAAGCATATTTTTTTTA
ACAGAATGATTCTGGTTGGAGGAGCAATGTCTGAGTCAGGTAGGAAGGTT
TTGGAGAAGTAAAGCTTTTTCCAAAGTCAGCTCCGAAAAGTAAATAAAGC
TAAAGTATTATAGGATATCGTAACAGTCTTTATAAAGAGGTCAGATCCCT
AATACAGATGAGACCTTTGAATAGTCTGGAATCAGTCAAGCTTATAATAC
CTACACCAAAGAGTTAAGCACTGTTGCAATCTTGCTCTGAACTTTTCGCC
CCAGTTGAAATCATGTGTAT
| AACGAATTGTGTCGCTGGCATCAGAGCAGTACTCGAGCTATATGTATATT
TATCTCCACAACAAAATAAGGCGCAGGCGNCTACAGACACAGATTTCTAT
TCTATTTTCTCTACAAATACACNCAACTATAATATGCCGCAGAATAAATA
ATAAATACTCGCAGCGAACAATTGATCCACATATAATAGTTTAGCCCAGC
TAACACTGTAAGTACAATATAAAACAGTACAAAATATATTATTCCCTGTA
TCGCACGAATATATCGATATATCTACAGAACCGGTGATTTGCCGGCACCG
GTATATATCATATTATATANGTATAACCGTGCCGCTTACGACCCACGCGC
AGAACTTTCAATATGCAATCCTCTGTANAACCTCCGCCTTCGTCGACTCT
TCTTTGGCAGATATTAATCATATAATACTCGCGACGTACGCACACGCAGG
TGCATTTCACGACTAACTCTAAAGTATGTATACAGGCTCACCCCGATATG
CACACGCGTTATAAAATGGTTAGTTACTCATTGTCCGTATGTCACGCACG
CGAATACNCGAGCTGACCGTCATGATCTCTTCAGCAGTTATTTACAGTAC
GATTTTTATTTTGATTCTATCCTGCGTACGCGTAGATGCTGTGATCTGAT
GTGATGCCACACTAACGGCGACGCGCCAGACGTTATCTGTGTATGCGCTA
TGATCTCGTCCACAGCTCTCCTCATTATTATTCGCTGCTCAGCCTCACAC
CTATATATCTTATTGTCAGTGTGTCGTTGTCGGCTGCTCACATACTGTTG
TATTTTTCGTACACTTCCCATCTCTCTCTATTTATGTTGGTACTGNATAT
ATGAAGCGTGAAGAACAATACGCGCGACGGAAGACTAGACACGGTCGTCT
TATCATCTCCTATCCAGTCTATATAATTGCGAGCGCGTATTATTCGCGTA
CTTTATATATTTCATCCTTCGCATGACCATATATTATTACGGCGCGCGTA
ATCATATACTAGCGTCGCACCNGTATCTATTAGTATATGNTGCAGTGAAN
TTCGTGGTTATACATCGCAGTATACATCTCGNCACACCGTACTCATCACC
TTGTGTCTCTCCGGCCTCACTCCGTACATATCGTTTCTCGCTTATATATA
TATCGCAGTCGTGGACCGCTCGCTCGTTCCGTCGTATGAATGTGACTGTG
CAGCACAGTTNTATAATCGTATAGCGATATGTATGCACATATACGTCTCG
CGATCGCGGCGTGGTATACAGACTGATTACAGCACAATACTATAAATACT
GCTGATAGCACTGGTACTATTATGCGTGTGTGATGAATCTCCCATAAACG
CTGTAGTCGATATATCTGAAATGCGCANTAATTCATAAATGTCGCGAATA
CATCTATGAGTCGTGCCGCGATCTGTCTACACGCTATACATGTTCGNGTA
TACGCCAGTCTTCCCATATTATGANCAACACTATCAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 15 30 59 43 37 37 32 31 31 37 37 37 31 31 41 37 37 41 42 28 28 25 25 24 25 29 21 13 10 11 9 9 9 12 11 10 12 23 23 30 30 41 34 36 36
36 31 33 33 50 42 41 39 25 23 10 10 10 9 9 9 9 9 11 12 12 16 26 27 37 37 43 48 48 50 42 42 43 43 43 57 48 47 47 50 53 53 53 57 57 57 57 57 50 50
53 50 47 43 57 57 57 57 59 57 57 53 53 44 44 42 42 37 25 23 12 11 12 11 11 16 28 34 37 37 37 41 41 47 36 36 36 36 36 36 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57
57 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 54 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 43 43 43 39 39 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 47 47 47 59 59 59 57 57 57 57 43 47 47 59 59 59 68 68 57 57 57 57
42 42 37 42 42 57 48 48 48 48 48 48 48 57 43 43 43 43 48 26 26 12 21 21 34 24 18 18 24 34 43 57 57 68 68 57 59 48 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 37 30 21 14 14 12 20 15 12 14 14 30 30 41 30 30 12 12 12 11 10 13 10 10 10 11 11 11 11 15 12 18 20 32 34 59 59 59 53 53 57 57 57 57 59
59 59 59 28 28 13 13 13 18 28 25 23 11 11 12 11 8 8 8 8 15 11 20 14 13 8 8 8 8 8 15 23 41 39 37 39 39 48 53 53 59 59 59 59 59 59 57 57 43 43
43 43 43 43 30 32 23 30 30 33 43 43 43 39 40 40 30 32 32 43 37 37 39 47 43 42 42 42 43 43 47 39 37 32 28 28 30 32 32 28 28 23 23 23 32 28 32 28 21 25
20 19 24 29 25 19 12 12 12 24 21 28 28 28 28 30 37 37 48 32 32 20 20 20 24 28 30 37 28 30 31 33 39 32 25 25 22 27 12 12 11 11 11 15 23 32 32 35 35 30
28 22 12 12 11 19 19 37 37 43 43 43 43 36 36 36 36 43 43 39 43 39 39 24 23 15 17 17 27 17 12 8 8 8 10 12 23 28 33 33 37 28 28 24 31 23 20 22 30 30
25 25 21 30 14 14 14 28 28 30 18 18 15 30 26 36 39 39 37 32 28 28 23 34 28 30 19 18 16 24 22 28 28 23 23 23 23 18 18 11 11 9 13 11 11 13 22 25 25 19
19 17 19 12 15 12 15 15 16 16 16 11 10 10 13 13 11 11 13 23 23 15 15 15 21 19 17 14 14 19 30 30 30 33 28 30 32 35 13 13 8 8 10 17 17 22 20 20 20 17
23 21 14 14 15 26 21 12 11 9 9 9 10 11 16 16 10 12 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 7 8 8 8 6 6
6 6 7 6 8 8 6 6 6 7 6 7 8 13 13 15 14 16 10 10 8 10 10 8 8 8 8 10 3 0 3 8 6 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8
8 8 8 8 8 13 15 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 10 10 7 6 8 8 14 9 10 10 8 8
8 10 10 12 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 7 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 7 9 9 6 8 9 7 10 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 8 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 9 15 11 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 13 10 10 10 10
10 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 12 9 8 6 7 7 8 8 8 8 8 8 10 9 11 11 12 12 10 8 8 10 10 6 6
8 8 8 8 8 8 8 10 10 16 11 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 13 10 10 10 10 9 8 6 6 6 8 8 14 13 10 8 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 6 8 6 6 6 6 8 8 8 11 11 11 11 3 0 3 8 8 8 8 10 10 10 10 12 8 8 8 7 8 6 6 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 10 9 12 10 12 9 9 11 8 8 9 15 15 16 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 13
15 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 7 7 10 10 10 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 13 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 10 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 8 7 7 7 9 7 10 8 13 11 16 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 6
8 6 6 6 6 8 3 0 3 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 14 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 11 13 13 10 9 9 8 8 10 6
6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 7 10 12 12 9 8 10 8 12 8 8 6 6 6 6 8 10 7 9 8 12 10 10 9 9 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 10 10 10 10 10 10 9 8 6 6 6 8 10 15 15 9 9 7 8 8 9 10 8 9 9 9 8 9 9
9 8 8 8 8 8 10 10 17 14 8 10 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 7 6 8 8 12 10 8 8 8 10 10 9 6 6 6 6 10 6 6 6 8 8 9 12 9 9 11 10
9 9 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 9 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 12 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 12 18 16 12 13 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 6 6 7 7 8 6 8 8 8 8 9 7 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8
8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 9 8 8 6 6
6 7 10 9 9 10 12 14 9 9 9 9 10 10 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 7 9 7 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 17 13 15 15 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 9 9 9 10 12 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 11 9 10 9 9 8 8 8 8 8 6 8 6 9 7 7 8 3 0 3 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 15 13 16 3 0 3 10 9 13 12 8 8 8 3 0
3 8 8 7 7 6 7 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 11 10 10 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 9 8 8
10 11 12 11 9 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 7 6 6 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6
7 7 8 10 9 8 8 6 6 8 8 7 6 6 6 8 8 10 10 12 15 15 8 8 8 8 6 6 7 8 8 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 10
10 11 13 13 12 12 12 12 12 3 0 3 6 8 8 9 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8
8 8 10 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 7 6 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 6 10 10 18 24 10 10 8 8 8 8 8 8 6 9
9 12 12 12 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 17 22 14 12 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 6 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8
8 8 8 10 7 9 9 9 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 11 8 6 6 6 8 8 11 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 10 8 10 8 10 12 8 11
10 10 10 10 10 10 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 11 9 9 7 7 7 6 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 10
9 10 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 10 8 13 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 10 19 10 10 10 10 3 0 |