BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-330H04.T7 (MSMg01no330_h04.b1) | MSMg01-330H04.TJ (MSMg01no330_h04.g1) |
ACC | AG447002 | AG447003 |
length | 746 | 733 |
length of high quality (start - end) | 319 (43 - 361) | 286 (75 - 360) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no330_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no330_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:16:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no330_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no330_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:16:09 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTTCTTTCTGTCTGGAACTTAAACTAGGAAACAGCTTCCACAATTCCCT
TTGATCAGTTCAAGGTTTGTCAATATTGCCCTAGATTGGCAGTATTTAGA
GGAATTTGCCTTTAGATGGATTTCCTAATAAGGTACTGACTTCACAGTTT
TGATAACATATCCTAGAATTCGATAGAGAAAAATTAATACCATAAACTTC
TAGTTTCTCTCAAGCATTCCACTTAGGTCATCAGGTCACATGGCTCTTCA
CAGAGAACATCAGGAAGCGACACGTGACCGTGTTTGAAGAACAGCACTCT
AGAATTATATGATCNCTTTCCCCCCCCACCCGTACTCTAAACGTGTTTAC
CATCCAAATATTCACTACTAAACAGACAAATAAATATCTTTTAGAATGAT
GTATCCAAGAAAGTGACTTCAACTGTTCTGTGTAATGTGATTAGGGCCCA
TGTTGTAGAGTTTCTTCTGTTCTCATTAGAAAACATTCGGAATATTTTTG
TCTAATCCTTGTATGAGGCAACTTATCCTGTGGTCTCCAGGAGTTATAAA
GCTATTAGAAAATTCTCTTAATAATTGCCTATGCTGATACCCAAGGTTAG
ATTCCCTCAAGATCACGGACAGAGCTCTGTGACAGTTGACCCTCCATTCT
GCTACTAGTGTTACAGCCCCCATGTTAGAATGAGAATTCTCTTTTA
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGAAATATTGAATGGCTGA
GAAGCACTTGAAAAATTGTTCCCATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAAT
CAAAACAACCCTGAGATTCCATCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCA
AAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACA
CTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTAGAAATC
AGTCTAGCAGTTCCTCAGAAAATAGGACATAGTACTATAGGAGGATCCCG
CAATACCTCTCTTGTGCTTATCACCCCCCCCATCTTCCAACAGGTAAGAA
GGACGCATGCTCCAATATGTTCATAGAAAAAATAAAAATAATAGCCAGAA
GCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATG
TGGTACATTTACACAATGGAGTACTATTCAGCTATTAAAAGGAATGAATT
TATAAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGAAGGGCTTCATCCTGAATG
AGGCAACCCAATCACGAAAGAACTCCCATGATATTTATTCCTTGAAAAGT
GCATATTAACCCAGAAACTTATAGAATCCATGATATTAGATTTAACTTGG
CAAGCCCATGATACTGAAGAATAATGAAGACCC
|
quality values | Open.Hide. 7 7 9 9 18 37 59 41 33 32 32 28 19 19 10 10 10 14 15 32 32 44 31 29 26 26 26 35 35 35 20 20 20 24 31 40 43 37 37 34 36 36 42 43 57 57 47 47 47 47
50 50 68 68 68 59 59 57 46 46 37 37 37 57 46 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 48 50 50 53 53 68 68 68 68 50 50 50 53 53 57 57 57 57 59
59 53 53 53 53 50 50 47 36 33 33 32 30 22 34 32 27 22 11 11 11 11 11 18 25 34 37 37 47 48 59 59 50 50 50 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 53 53 59 59 59
68 47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 54 54 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68
59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57
57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 47 43 59 59 59 59 47 36 32 28 20 20 20 24 32 42 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 41 47 34 34 23 23 11 11 9 9 9 9 3 0 3 9 10 10 10 10 15 15 18 17 13 8 8 8 8 8 10 11 15 27 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 53 48 48 42 50 47 34 34 18 18 11 11 11 11 11 27 11 11 11 29 24 36 35 39 39 46 46 27 18 9 9 9 10 19 34 32 37
35 39 39 43 43 43 43 43 43 43 48 43 43 43 43 43 57 57 57 43 47 47 48 57 54 54 57 48 46 43 43 43 44 57 57 47 48 48 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 59 57
48 48 44 57 44 47 42 35 35 47 44 57 48 48 54 59 59 59 59 59 59 57 57 39 37 29 32 29 43 48 59 54 68 68 46 43 42 35 35 44 44 46 48 54 57 57 57 59 57 48
48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 48 48 48 59 59 43 43 39 39 39 43 43 47 47 47 47 59 32 32 18 18 18 25 25 37 37 41 47 37 37 41 39 37 37 37 37 37 32 31 31
37 39 37 39 28 30 26 35 31 23 23 25 25 25 32 37 47 59 37 32 31 37 31 29 34 34 28 28 28 35 37 37 30 32 30 30 30 37 37 41 34 22 22 15 15 11 15 18 19 19
10 13 13 25 28 22 17 11 11 12 23 24 28 25 28 34 39 39 37 35 35 35 39 34 34 28 24 24 15 12 14 21 23 24 24 24 12 20 10 9 9 18 28 20 16 15 17 14 19 23
24 24 33 30 24 12 12 12 21 22 29 22 23 23 28 34 31 37 37 37 28 28 25 18 16 12 11 11 12 12 12 9 9 9 12 12 24 34 37 30 30 25 25 28 13 13 | Open.Hide. 9 9 9 13 12 8 6 6 8 15 23 37 37 37 37 31 31 44 37 37 37 37 37 37 48 42 42 47 39 25 23 14 13 8 8 8 8 7 7 9 13 21 19 39 30 35 27 25 12 12
11 26 23 37 37 37 23 18 9 9 9 9 13 17 12 12 10 10 8 8 22 22 36 36 36 36 36 36 42 42 42 47 47 37 42 37 42 42 47 53 53 53 50 50 50 50 48 48 48 48
48 50 50 50 57 53 53 50 59 50 50 41 21 16 8 8 6 6 6 11 11 13 10 10 10 24 24 47 41 40 41 48 50 50 48 53 53 50 50 53 42 42 37 50 50 50 50 47 43 43
43 43 57 57 57 57 68 68 68 68 68 47 50 43 43 43 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 44 44 21 18 11 15 12 12 18 12 12 14 21 25 30 28 40 30 30 30 43 43 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59
59 59 59 59 46 27 28 15 10 6 6 6 6 6 6 6 7 9 12 8 8 6 6 6 7 15 24 21 20 15 15 9 9 9 9 12 18 23 32 39 39 47 47 47 39 39 35 35 35 39
39 43 48 43 43 43 43 43 43 43 43 37 37 35 35 35 47 47 34 34 18 25 20 20 11 11 11 17 16 16 20 9 9 9 14 12 14 12 23 25 37 30 30 18 14 13 13 13 13 13
17 18 18 32 32 37 33 30 22 19 19 25 30 30 30 30 30 37 37 36 36 39 59 34 33 24 24 28 34 34 41 41 37 37 37 32 29 29 32 37 37 30 37 37 39 34 37 18 15 10
10 10 15 20 29 19 20 23 34 32 39 32 37 37 36 33 24 17 14 13 13 25 30 34 22 28 24 30 21 25 18 18 15 21 21 28 28 27 31 31 22 15 15 15 19 19 22 31 25 24
22 24 25 21 24 20 20 28 34 30 28 13 12 12 9 9 11 11 19 21 25 18 20 18 16 16 10 10 10 9 9 11 16 28 20 23 10 9 9 9 9 10 15 24 23 18 9 9 9 12
10 10 10 10 10 12 12 8 8 10 10 10 11 10 15 21 21 20 20 30 28 20 12 12 11 11 12 14 11 12 12 14 13 23 11 13 11 11 14 13 10 10 8 8 8 8 11 10 10 13
12 12 14 18 16 18 13 9 9 12 22 23 28 28 22 25 16 12 10 9 9 8 6 6 6 6 6 8 13 10 10 9 10 8 8 8 8 8 18 12 12 12 11 12 12 12 12 16 12 10
8 8 8 8 8 8 12 12 11 11 12 10 10 10 10 12 15 11 8 6 7 7 7 7 10 8 8 10 10 10 12 15 15 |