BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332D13.T7 (MSMg01no332_d13.b1) | MSMg01-332D13.TJ (MSMg01no332_d13.g1) |
ACC | AG448310 | AG448311 |
length | 1,271 | 1,292 |
length of high quality (start - end) | 559 (133 - 691) | 732 (129 - 860) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_d13.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_d13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_d13.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_d13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:27 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNAACGACCATTTNNNAACATTGGCGNTAAGACTCCTAAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTTACACAAAACAAAGGACCTCACGACGCACGAACTGGNA
GGAACCAACTGGGGNAAACCTTAAAGTTAACAACTGGGATCAAAACAGCT
CCACCTAAGGTCCACTTAATCTTAGAAGCCAGGGGCAAGGGCTTCGTGCC
CTCGCCATAGTTCCTACTCTAGTCTATTGTATAGTCCACCTTCCCCCTAG
GCCATTGTAAATACTTGTTTGTGTATGGGTGTAACTCAGCTATCTATAGT
TCTAAGTATCTACTCTGGTTTCTCTTTAGGTCACAAACTTCCTTCTTCCT
AAATAATGGTAAATTTCTGAGTAGGGCAGTGACTTAGCTATCCATGCCCA
AGGTCAGATCAAGGACTGCCTAGAATCTAACTTAGCTATATTCAAAATAT
CAGTCCTTAGGAGCACTTATAATAAAGCAATATTAAGGGAAAGCACACAG
ATTCGTTTACCAACTAAAGGACATTGGAGCATTCTTTATACAGGATGTCA
CGATTCCAGGAGACTAAGTTTCCGTGAACTTTTCACCTTGGGACAGCGCC
CAGGTTTTTGGGGCCTGCTCGATTGTCACTACTGGAGTGGATGTAGCATC
ATACAGGTAGTAACCCAGCCCATTTATTTAGAACTATAGATTGTTCTTGT
TACTCAGTGTTAAATAGACACTTGCTAAACAGGACTCAACTTCTAAATAT
CATACATGTAGGACACCATCCTATTTAGGACTATAGATTGTCTATGTTAT
TCAATGATCAATAGATACTTGCCAAACAGGACTCAATTTGTTTTGTAAAT
TTGAAAGGGATATCTCATTTTCTATTCTCATCCCAATGCTTTTCCTAAGC
AGGTTCCTAAATTGAGTCGGCCACTTCCTGTTAAGGAAACTGAACATGGT
TTAATACTCCCCCAGCTAAGAAAATTCTCCAAAATTTCTGCTTTTATGGA
CTTGAACACTTTAGGAAGATGGACCTAACTGACCCCCAAAACCGGTTTTA
TAACTTTGTAATTAACATAAAATATAAAAGAGGGGTTTAAATTCCGGCGG
AGGAAAACCTTCCCGAGTTCCTCCCCGACAAAAACCCCCAAAAGCTTGGA
CAGGGGGAACGAGATCGGCCCTTGGTTTGGAGACAACACGGAATCTAGGA
GTCTTTAATTAGGTGGGAACACCACTCACGTCTAACCACAAGCAAGGANN
NNNNNAANAATCAAATACTAA
| CCAACCCTTTNNNNNAAGCATGGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAAACTCAGGAACAGAT
CATTAACTACCTGCACACACCTCACACAATACAAAATGTATGCTTATGTA
TTTTACAAACATAAAAATAGAGATTGTGTTATTTACTGAGAAACCTTGTT
TCTAGTTGTGGTGTGGCTCAGCCTTTAGCATACATAACACCGTCAATCAC
TGTGGCTGGAATACAGACTGCAGAGGAGTTTGAGCCAGAACAGCTGAGTT
GAACCAGCCAGCCAGTGTTCAGAAAGAACTAAAAAGAGTGAGCTTATGCA
GCAGTAAGTCTCAGGGGCTGAGAACATTCTAAGCCTAGATCAGATTGTAC
AGAGGCGAGAATCTTCCAAGACTAGGCCTAGGTTAGCAGACAATTACATC
AAGTGAACTAAAGATATCTTCACATGTTTATAAACTGAATCTCTAGGGAT
GTTCTAGGAACAGGTTTAGATGCTTGGAATTAAAGGAAGTTTGAAACATC
TCTCCATTCCTAGTAGGAGCTTTACAATTAGAAAGCATTTTCTCCAAATA
CAAAAATTATTCATAAAAGGTTGTGCCATCCTTAATTATTCACTATTGCT
AAATGGATAATGGTGGATATTCTCCTCCCGCCCCCGGTTTTTTTGAGACA
GGGTTTCTCTGTGTAGTCCTGGCTGTCCTAGAACTCACTGTATAGACCAG
GCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCGCTTGCCTCTGCCTCTCAAGTGCTGGG
ATTAAAGGCGTGCACCACCACTTCCCGACCAATCACATACTTGTTGTCAG
CTGATGAAATCTGTGTCTGTGTCTCACATATAGATAAATGAGGCGAGCAA
AATGACTCTGGTTGCAGAAGACTCAAGATTAAGCTTTTAACACTCAAAAC
AAGTAGTTCCACATGCCCTGCACTCCAGCTCCTAAGGATTGAATGCTCCC
AACTTCCCTCCCCAGGAACCTGATGCCCATGGTATATACAAAACTCATAC
CGGCAAAAAACCCGCATTTAAAAAATTAATGGTCTCACTATATCAGCCAC
TTTAAGGGCGGCCTTAACTAATACCCCCAAGAAAATGGAAGCCCTTACCC
TTATTTAACTCTCTGGCCCAATGTAATTCTCTCCCCTTTTAATATCCAAA
ATTTATAAAAAGGGTCTCTCCTTTAACCACAAAAAAAACCGCGCGCTACT
TTTTCGTTTTTTCCCACCTGAAGGTGCGTCTCCACCCCTACA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 8 9 7 7 8 3 0 0 0 3 6 6 7 6 8 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 22 19 20 20 20 21 28 30 37
37 37 37 37 37 37 32 21 23 37 30 30 33 33 33 44 48 53 44 44 50 50 47 30 23 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 11 11 23 23 23 23 3 0 3
23 23 37 37 37 50 33 31 31 30 29 21 21 3 0 3 19 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 15 15 26 26 36 50 53 53 53 53 57 57 57 59 59 50 50 50 50
50 50 50 68 68 68 68 51 50 50 48 48 48 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 54 46 57 46 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 62 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 45 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 39 59 59 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62
43 59 59 62 52 43 38 39 43 43 35 35 35 43 43 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 52 52 52 62 62 44 44 35 35 35 44 44 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52
43 43 43 38 41 34 30 30 18 18 26 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
36 37 33 32 27 27 38 38 32 43 37 43 43 52 57 57 57 59 57 57 52 52 52 52 57 50 50 38 38 39 50 50 46 43 43 43 59 44 44 44 43 43 43 42 35 35 28 29 31 42
36 47 35 35 35 43 35 35 35 44 28 28 28 30 28 36 36 42 43 59 37 32 30 18 18 22 32 31 40 43 46 59 42 35 35 35 39 39 39 42 39 42 35 39 35 39 39 43 42 34
32 18 18 20 30 34 59 59 48 48 48 59 34 34 23 23 23 28 28 20 20 20 18 18 17 17 18 25 25 35 35 35 35 36 32 28 20 20 22 27 18 19 14 15 15 32 32 30 30 23
23 23 32 32 32 32 23 20 20 24 24 30 30 21 22 21 14 14 24 27 26 25 28 36 36 36 36 26 28 15 15 15 21 21 30 28 28 19 29 17 18 18 12 12 12 18 18 18 13 13
13 26 21 21 15 11 9 12 9 11 11 23 27 24 24 12 12 12 21 21 37 34 39 36 36 36 27 26 25 27 25 24 25 30 28 32 20 18 18 31 32 35 31 31 27 32 28 28 23 28
28 33 32 32 30 21 24 12 12 12 18 18 18 18 18 22 14 14 12 18 12 12 12 18 14 24 14 14 14 19 15 17 18 19 13 26 13 13 13 14 14 17 19 18 28 14 14 14 28 30
32 20 18 18 25 20 23 23 23 23 16 23 11 11 11 12 12 24 16 10 8 8 8 8 8 13 16 23 20 19 23 20 19 11 9 9 8 9 8 9 9 9 9 13 9 9 9 11 9 10
10 12 22 17 24 9 8 8 8 7 7 9 16 16 19 12 15 14 21 24 15 16 15 16 14 12 12 12 12 10 10 12 13 10 10 9 9 7 8 8 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8
10 10 9 9 9 11 11 10 10 12 9 9 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 10 10 11 9 9 9 11 13 12 11 11 8 8 8 8
9 9 13 9 9 9 9 9 9 16 16 16 11 11 11 11 11 11 11 11 11 12 11 11 12 10 8 8 8 8 8 9 14 14 12 9 9 12 12 12 17 18 19 12 12 10 9 7 8 8
8 8 9 8 8 8 8 7 9 14 16 12 15 8 8 8 9 10 9 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 9 7 7 6 6 7 9 9 7 8 8
15 9 8 8 8 9 9 11 11 6 7 6 6 8 8 8 10 8 10 10 14 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 19 14 12 11 11 10 8 6 6 8 6 6 8 9 9 8 8 8
8 8 8 14 12 8 8 8 8 8 10 12 12 15 10 12 10 10 9 9 9 9 9 13 10 11 11 11 11 8 9 9 9 8 8 10 15 11 14 21 29 11 9 8 8 7 8 8 8 14
14 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 16 9 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 8 11 10 9 11 11 10 8 10 6 6 6 8 8 8 8
8 8 6 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 8 10 10 8 8 9 10 8 8 8 8 7 7 8 9 9 8 8 7 7 7 12 12 11 10 13 9 9 7 8 8 8 11 9 3 0 0
0 0 0 0 0 3 3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 7 7 8 8 7 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 10 9 9 11 8 8 9 8 10 10 15 16 12 8 8 8 19 19 24
12 12 18 19 21 28 28 33 37 37 33 28 33 33 36 36 36 33 33 39 37 47 41 27 23 9 9 12 15 8 9 9 8 9 10 16 17 11 11 11 9 11 15 21 25 33 37 39 41 44
53 53 53 53 50 38 36 36 35 35 31 31 31 30 33 27 27 12 9 10 10 10 10 10 11 15 17 13 28 21 26 22 35 35 39 39 39 39 44 47 50 50 47 47 47 47 47 47 53 53
53 68 68 68 68 68 68 68 51 47 47 50 50 50 68 68 68 68 68 50 50 59 57 57 57 57 57 50 50 50 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50
50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 57 57 57 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 54 57 57 57
57 57 57 57 57 52 57 52 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59
59 59 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 50 48 50 50 54 54 68 68 68 68 59 59 59 59 48 42 43 43 43 50 53 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 59 41 30 21 12 15 11 11 12 24 24 21 28 32 59 48 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 59 48 54 59 59 59 57 57 59 59
68 68 68 68 68 68 57 57 59 54 54 54 54 54 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68
57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59
59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 50 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59
59 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 54 48 54 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 34 34 23 23 23 34 34
41 37 37 44 43 43 47 59 46 46 48 48 43 40 34 36 28 34 34 39 36 37 32 23 22 22 22 22 23 14 14 14 30 30 41 41 47 46 48 48 48 39 33 28 28 28 33 32 28 25
28 30 34 43 39 28 31 32 37 37 37 37 37 34 31 25 28 22 30 32 39 39 41 41 41 39 39 39 37 34 39 41 41 39 37 37 39 43 39 25 20 19 24 25 30 31 28 23 11 17
8 9 9 10 10 10 14 19 20 39 37 37 37 32 29 37 41 37 31 24 25 15 9 8 8 9 14 17 17 10 10 10 19 25 41 41 40 43 43 43 37 39 39 39 46 33 37 37 37 37
33 32 34 22 22 22 17 17 10 12 12 23 17 15 9 9 9 14 10 10 11 15 15 14 14 9 9 9 13 17 15 10 10 10 13 13 13 13 12 23 21 15 11 15 16 15 15 18 22 18
23 22 10 12 10 13 10 12 12 10 11 9 11 15 14 9 9 9 9 9 9 18 15 11 12 10 9 9 10 10 8 9 8 8 15 17 11 12 10 14 10 14 8 13 8 10 11 17 23 13
7 6 6 8 8 15 9 8 8 8 10 8 10 12 15 13 10 8 10 11 10 10 10 10 10 10 10 15 12 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 8 10 9 9 12 12 16 10
10 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 9 10 12 10 10 9 9 6 7 8 8 6 6 8 13 11 10 12 8 8 6 6 6 8 13 13 13 10 12 14 14 15 10 11 11 10 13 10 8
8 8 8 10 19 14 11 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 12 9 10 10 15 19 16 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8
8 11 12 9 10 10 10 15 15 11 11 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 17 11 15 9 12 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 10 8 8 8 9 15
11 9 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 13 8 12 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 12 19 25 18 20 10 10 10 11 9 9 9 8 8 8 8 8
10 10 12 9 9 9 9 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 8 11 12 10 10 8 8 15 22 17 11 9 9 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 9 13
13 13 9 8 10 8 8 8 8 8 13 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 7 7 |