BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-380P04.T7 (MSMg01no380_p04.b1) | MSMg01-380P04.TJ (MSMg01no380_p04.g1) |
ACC | AG485204 | AG485205 |
length | 765 | 1,348 |
length of high quality (start - end) | 350 (60 - 409) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no380_p04.b1 PHD_FILE: MSMg01no380_p04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:22:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no380_p04.g1 PHD_FILE: MSMg01no380_p04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:22:11 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAATCCGCGGAATTCCACATCA
ATACCGTATGAAATACAGCTTCAAAGTAGCAACAAAACCTTGCCTAGTTT
AAGGTTCAAAATTACTACTTTGACAGTAGTGTATCTAAGAATATTATTCA
TATGGTGCAGGGTTTGATAAATGTTAAATAATATTTAAACATTAATAAAG
TGAAACTGTAATTCAATAAAAAGTGATTGTCATTTTGTGCCTTTGCTTTG
ATTCTGTTTGGGGACATAACAGAGGTGAGGAAACTAATTAGTGGACAGTT
TTCATGTTCTGTTTTTCCATTAATCTTTCTAAGTATGTAATAAGAACTCA
GATTACTCAATCACAAGTATAAAAGAGGTAATCTAAATAACTACCAAAAT
GTCATTCTGTGATCAAGGGTAAGATTATGTATATTTTTAGTTACTGCTAA
TTTGAGGATGTTTAACTATGTTCTCTTTAGTAATTAACAGCCACATACAA
CTATAAGTGACTGCATTTCTGACTCCTTCATGGGAATATGACAGATATTA
TCTATAACTAGAAAATTAGTATTCTAGCTTTATAAAGTGTTACACTCACC
ATAACACATTCCATAACATTTCCCTCAGAATCACTGTTTGGTTGATACTA
TTAATCCTACNCCTTAATACTAAACCAAACCACCTATTTTTATGCACATT
TTTAGGCATATTTTGATTCCCAAATAACTTTAAAGGAAGCCTTATATAAC
ACAAACATATTTCCC
| CCATCCCCCTCCGCGACCTTACTGCTCATGTTTACCTCCTATTGCTCAGC
TNAGCGCGTACAGAAAGAGANAGATTACTGATAATTATAGTAAATTCTCT
GTAGATCAAAATTAACTATAGTCGCATACTCGGTTCATAACGAGTCTATA
CTACACTCCGATATACGTCACACATTATTATTATATCTTAATCACTNTNA
TANTATGACACGTGTCTTATCGTGTTTTCGTCTATCATGTGATGTACATC
GGTGTGGCTTGCTATGTCTGTTTTATTGAAGTATTAGACCCGATCGCTCT
ATCATTCGCGGCCGTCCATAGAGAGATATGCGACGATGCCGAAGCTATCT
CTACTCCCCCTGTGCGAGTCCGACTCGCGCTCAGGATATAGTTGCGCATG
TGTAGGTGTTTAATGATAGTTACTGAGAGGAGATCGAAGACCAGAGGAGA
CTGGTGACTGATCCCGAGACCACAGAATAACTAACACATACAGAGAGACC
GAACGGGACGCCAGGCGACGAGAGGCGCAGCATATCGCACGCGTGAACGA
GAGCGCGAGTAGGAACATGAGAACAGAGGATAGTATTATGATCGAGACGA
CCCACGCTCGCATTGCACTATGATTATATTGAATGCTATGCGTCCTCTAT
CTCGCGCAGCGTGTACACATAGTCATATCGTTGGTATTCCGCCGTCAGAT
CATTATATCCGGCACTACTCAGCTCAACGCATTGATATTACTAACCGCGA
AGAGATATCTGGTGAAGCCTGGCTATGACATTATGACATAATCATATATC
TAGATCCGGACTGTCACTCTCACTGCGCTAACGTATAATACATCTAGAGC
CGAGCACCGATGATATATGAGAATACTTGTCTTTAGATATNGGCAGAATA
TCGCGCTATCGTAGTAAACCGGAGTACTAGGATTAGTAGACTCTAGAATG
TGTATATAAATAATAATTCATCGCTGCGCATACACACGTAAATTATCAGA
TTACTCCTTATATGGATATGTGCGGAGTGAGAGCAGTGCGCATGCGACTG
CCGTACTTATATTATATCGTACATCTTGTATTATCNCAACCCCCATCACC
TCACGATATCGTATACAGAAGAATCACAATAAGATTGATACAGCAACGGA
ACATTCTAATGATGAGCAGAAAGAATTTCTTACTCTCCGATAATACCCGA
CTATTAGTCTAATACGAACTAGATAGTACGCGTCTAGTGACTTTGCTCAC
ACCTGATGCCCGACTATTGCGCACAGCTGCAGATATCTGATATATATCGC
CTATGATGCGACCGCCGTCGCCACAGGTCACACTGCGCNCGACTATAG
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 10 10 10 6 6 8 10 21 35 59 26 19 18 18 16 19 19 6 6 6 7 6 7 9 9 9 9 10 10 12 13 15 25 25 33 33 33 33 31 31 31 30 23 19 23 9 9
9 9 9 9 9 9 10 11 22 22 20 24 32 37 37 37 37 37 37 33 33 36 36 36 50 50 50 50 50 50 47 47 50 50 50 53 57 50 50 50 59 57 57 57 57 54 59 57 57 57
57 54 54 32 26 15 15 12 12 13 28 32 48 54 54 57 57 57 57 68 68 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 47 47
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 52 52 43 57 39 39 39 43 43 52 52
57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 43 43 43 35 35 39 39 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 52 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 43 43 39 39 39 43 43 43 43 39 39 39 43 43 62 62 62 52 52 43 43 43 43 35 39 39 43 62 62 62 62 62
43 43 52 43 43 43 43 15 15 8 8 8 19 23 43 33 35 23 43 33 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 62 38 38 31 31 31 38 38 35 35 35 44 44 43 43 31
35 28 38 30 43 43 43 39 35 35 35 39 39 43 43 43 43 62 59 57 43 43 26 26 27 34 38 41 39 35 44 35 43 43 43 43 52 52 43 44 41 38 24 22 16 16 16 27 34 43
44 38 22 17 17 34 30 26 13 13 13 18 19 17 27 24 28 20 21 20 32 18 16 16 27 27 35 38 35 35 43 43 52 57 59 59 50 50 38 32 36 43 43 52 50 43 35 35 33 33
33 35 43 43 27 23 18 24 19 12 12 13 19 27 17 20 20 32 32 35 35 37 44 59 59 57 48 44 35 35 35 35 32 36 35 35 35 37 37 37 47 32 32 12 12 11 23 18 25 25
40 22 30 12 12 11 15 15 24 34 43 37 30 28 28 32 31 28 33 28 28 22 28 24 32 24 19 19 15 15 15 21 15 15 12 21 19 28 16 17 11 11 11 9 9 10 13 8 8 8
8 12 17 23 24 22 28 19 22 11 10 9 9 9 11 13 15 9 9 9 10 19 29 20 15 15 9 9 9 23 17 24 13 13 13 14 17 22 28 15 16 13 10 8 15 8 10 8 10 14
12 12 16 15 8 10 10 12 17 14 12 10 15 19 31 28 22 22 22 19 19 21 21 21 15 17 11 11 8 8 8 8 8 8 11 13 8 10 10 10 16 17 18 17 16 11 9 9 10 9
13 10 15 15 16 15 11 10 10 3 0 3 8 9 10 10 13 6 6 6 6 8 8 13 9 14 12 14 12 9 9 12 16 21 12 21 15 21 14 10 12 13 16 10 12 16 10 12 12 10
10 10 17 8 8 6 6 6 8 9 9 10 13 13 14 10 10 10 10 10 9 11 13 20 18 20 20 21 24 18 18 11 10 9 9 8 8 8 6 6 7 6 8 8 10 10 10 11 11 7
7 8 8 10 10 9 15 10 11 8 9 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 9 8 6 6 6 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7
3 0 3 8 10 10 10 10 12 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 9 9 6 8 7 6 8 7 10 10 8 8 8 8 8 8
15 12 6 6 6 6 10 8 8 8 7 8 9 6 6 8 8 8 9 8 8 8 9 9 8 9 13 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10
9 9 9 9 8 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 10 7 6 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 14 14 14 13 16 10 8 8 8 8 8 8 13 10 10 3 0 3 0 3
8 3 0 3 8 6 7 6 6 6 8 8 13 16 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 11 11 11 11 12 11 10 6 6 6 6 6 6 8 9 6 6 6 6 8 6 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 11 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 11
11 6 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 7 6 10 10 8 10 11 11 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 9 8 8 7 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 10 9 6 6 6 6 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 11 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 13 10 8 8 9 9 10 6 6 6 6 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 6 6 7 6
6 6 6 10 10 11 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 13 15 10 10 10 12 10 10 10 10 9 12 14 15 12 18 11 10 8 8 6 6 10 10 10 8 8 8
8 8 8 15 10 9 10 10 10 6 6 6 6 6 6 13 8 6 6 6 8 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 10 6 6 6 6 8 7 8 10 12 11 11 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 11 11 10 10 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 7 7 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 7 8 10 12 12 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 10 10 15 15 12 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 9 8 8 8 8 6 6 7 6 6 6 8 6 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8
8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 11 9 9 12 12 14 14 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 10 10 10 11 10 9
9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 9 9 6 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 6 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 6
8 7 6 7 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 12 10 11 12 10 11 9 9 8 8 3 0 3 8 8 8 11 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 12 8 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 14 15 19 11 8 8 8 8 8 9 8 6 8 6 6 8
8 13 11 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 6 6 6 6 8 8 8 10 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 8 10 10 8 8 6 6 6 7 8
8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 16 16 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8
6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 11 12 10 10 11 8 6 6 7 10 12 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 7 6 6 8 6 8 10 10 10 13 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 12 10 9 7 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 8
6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 7 6 8 8 16 10 12 10 10 10 12 10 10 10 10 10 13 16 10 9 9 6 6 6 6 10 10 8 8
6 6 6 8 8 6 8 6 6 8 8 8 9 9 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 10 10 12 12 12 9 9 9 9 8 8 8 8 7 7 7 7 7 7 8 6 6 6 6
6 10 10 10 10 9 9 9 7 13 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 10 8 10 11 6 8 6 6 6 6 10 8 10 9 8 10 9 10 8 10 8 8 7 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 9 9 9 |