BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-388F15.T7 (MSMg01no388_f15.b1) | MSMg01-388F15.TJ (MSMg01no388_f15.g1) |
ACC | AG490868 | AG490869 |
length | 771 | 769 |
length of high quality (start - end) | 505 (34 - 538) | 563 (79 - 641) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_f15.b1 PHD_FILE: MSMg01no388_f15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_f15.g1 PHD_FILE: MSMg01no388_f15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCCATCCAG
ATTATTTTAAAACTAACTGCAGTTAGAAATTATTTTCGTCCTTCTCCTTA
GAACCCCAGTGAGATATAAAAATAGATTTTTCAAAAAGTTCCAGAAATGA
AACATTGTTCACTGAGAAATCACAATATTATATCTTCATGGTTACAAACA
GCGGCCATTTGCAAACTGTATCCAAATTCAGTTGACCAAAATCCTACTGA
ATCCTTGTAATAAAATTAAAATATAAAAAAAGAAATCAAATTTAGTTTAT
CTGAAATTCCCTCAAATTTTATCTGCAGTCTACTTTTTTAAACATATTTA
AATCTTTCATTTAAATAGTTCATAATTCAGCCATCAGAATTTTAACTCTT
TTGAAGGATCTCAGTTCTGTTCATTTAAACAAATAAGAATTATTCTTTCA
TTTCATCCTATTCTATCTGAAATGATATTTTTATAAAAAACCATGTTGTT
AGGAAAAGATACAAATTTTAAGACTCCAACAATAAATCCTTCACAACCCA
ACTTACTCCATATGAAGGGAAAATATTCTTCATCTTTGTATTAATTGATA
GNTATTGGTCAAGACAACTCACAACATTGTTTCCATACCAGAACAATGCC
TCATATTAAAAGCAAAATTAAATTTCTGAATTGGCATTTGCTTTCAGAAC
TTGTGGTAGGAAGCTACTTTGGGCTTCTGTANNGCCAAAGATATCGCCAA
CAGACCAAGTGCCAGCCCCCA
| NCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGCCAGAGCAATTCGACAAC
AAAAGGAAATCAAGGTGATACTAATTGGAAAGGAAGAAGTAAAAATATCA
CTATTTGCAGTTAATGTGATAGTATATATAAGTGACCCCAAAAAATTCTA
CCAGAGAACTCCTAAATATGATAAACAGCTTCAGGGCAGTAGCTGAATAT
AAAATTAACTCAAACAAATCAGTGGCCTTTCTCTACACAAAGGATAAAGA
GGTTGAGAAAGAAATTAGCGAAACAAGACCATTCACAATAGTCATAAATA
ATATAAAATACCTTAGTGTGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTAT
GATAAGAACTTCAAGTCTCTGAAGAAAGAAATCGAAGAAGATCTCAGAAG
ATGGAAAGATCTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGATTAATATAGTAAAAA
TGGCTATCCTGCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGTAATCCCCATCAAA
ATTTCAACTCAGTTCTTCACTGAGTCAGAAAGGGCAATTTGCAAATTCAT
CTGGAATAACAAAAAATCTAGGATAGCAAAAACTATTCTCCACTATAAAG
GAACCTCTGTTGGAATCACCATGCCTGAACTCAAGCTGTACTACAGAACA
CTTGTGATTAAAACTGCCTGTTACTGGTACGGTGACAGACAGGTAGATGA
ATGGATAGAACTGAACACC
|
quality values | Open.Hide.17 23 17 12 15 10 8 8 11 13 24 23 30 12 12 9 9 9 15 25 18 12 12 12 27 30 59 59 31 31 31 29 29 30 32 32 28 19 25 23 29 23 19 10 10 10 22 19 28 28
29 37 43 48 48 47 39 39 50 53 35 35 24 28 28 43 28 28 23 27 24 30 43 43 68 57 53 53 53 53 53 53 53 53 48 57 46 43 30 41 26 25 33 28 28 28 32 22 22 23
27 59 44 41 33 34 24 19 19 29 41 37 41 41 53 47 50 50 53 53 53 47 41 41 37 37 37 37 33 27 23 10 10 10 25 25 37 37 37 32 30 22 17 17 29 27 38 42 42 43
43 43 30 30 32 43 42 26 23 10 10 14 19 24 32 32 43 48 27 46 36 36 32 35 35 44 44 54 54 54 57 46 57 41 26 26 17 17 13 27 34 57 32 34 14 17 17 35 29 37
35 44 44 27 26 11 18 18 32 32 57 54 54 42 44 43 43 35 44 47 57 57 54 57 57 57 38 38 22 17 17 38 38 57 57 57 52 52 52 57 57 44 44 52 52 52 52 52 52 57
57 57 57 52 43 43 44 44 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 36 36 24 24 24 39 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 57 57 43 35 35 57 59 59 59 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 27 43 43 57 57 57 59 57 57 68 68 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59
68 44 44 38 43 43 43 37 37 37 43 44 59 59 68 57 57 57 43 43 43 43 44 57 57 43 30 21 12 12 30 24 24 22 22 12 12 30 32 57 57 57 59 59 57 43 44 44 48 48
59 59 59 68 59 57 54 44 43 33 29 21 15 13 27 28 31 32 23 32 32 21 21 28 32 41 59 43 43 30 30 30 43 41 59 59 57 57 57 57 57 53 37 37 30 32 25 35 28 28
28 27 27 14 14 14 27 30 41 41 43 43 35 35 35 43 39 41 41 37 37 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 47 47 47 47 59 59 30 31 20 18 18 28 24 39 36 36 36
43 43 59 59 59 59 41 39 37 21 19 11 11 11 23 25 39 39 39 35 34 25 25 21 17 14 11 11 11 17 13 19 30 59 59 19 11 9 9 8 11 8 8 10 14 14 21 25 16 15
15 24 29 39 39 41 30 23 18 22 23 30 34 37 32 31 34 34 37 37 27 30 17 17 15 17 17 11 11 11 11 11 11 11 11 11 23 12 13 13 26 26 29 27 28 19 25 12 11 11
3 0 3 20 17 17 23 12 15 9 12 12 22 12 12 12 11 16 16 9 9 9 10 10 13 18 14 16 23 23 11 10 10 9 9 10 13 12 11 9 9 14 14 19 18 14 23 11 11 11
11 10 11 11 20 16 29 28 25 30 25 32 30 25 25 34 24 25 15 14 12 12 12 18 17 14 12 10 12 10 11 9 11 8 12 10 8 8 13 15 19 17 11 12 9 7 7 7 9 10
9 12 10 10 10 9 9 9 10 10 10 10 10 9 10 9 10 10 11 12 12 11 13 10 8 8 8 8 7 10 3 0 0 3 11 10 10 12 11 13 8 8 8 8 8 7 9 10 10 8
8 8 10 8 9 11 12 9 9 9 11 9 7 7 7 8 15 14 14 13 13 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 10 8 10 8 8 8 10 10 12 9 12 13 28 28 37 32 39 43 39 39 39 35 30 29 37 25 19 8 10 7 7 7 9 9 18 17 16 18 18 30 26 37 44 53 53
53 38 36 36 33 33 33 59 46 33 19 8 10 8 8 8 8 10 21 28 39 39 33 33 36 36 50 50 57 57 57 42 37 36 36 36 42 48 50 57 57 57 57 57 48 48 37 37 41 41
41 42 48 59 68 68 68 53 50 48 47 47 47 48 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50
50 57 59 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 44 38 33 13 13 13 13 18 22 35 43 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 57 59 59 57 57 68 68 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 59 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 48 48 46 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 44 43 44 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 54 54 54 53 53 50 50 50 50 57 57 57 50 53 50 50 50 57 59 59 50 53 48 50 50 50 59 59 59 59
44 41 37 41 41 59 47 47 47 41 32 29 29 32 37 37 41 47 50 50 48 48 48 48 48 41 41 47 47 34 34 28 24 17 30 15 17 17 30 30 41 39 59 41 39 37 37 35 28 39
39 31 25 34 23 18 18 30 34 37 39 36 37 37 37 34 34 25 25 25 34 32 30 28 32 31 15 9 9 9 9 9 18 31 37 31 31 35 32 32 28 24 20 20 26 25 23 18 18 20
32 32 34 31 31 25 18 15 16 18 17 25 36 37 37 37 33 28 21 18 18 17 16 21 19 24 21 22 22 30 27 30 23 23 30 24 29 19 12 9 9 10 13 10 11 10 8 8 10 13
9 9 10 10 10 13 15 18 12 12 12 18 11 16 10 12 9 9 10 13 10 10 15 14 16 10 9 9 9 8 10 10 16 16 23 20 18 12 12 12 18 18 14 10 10 10 10 11 12 11
11 11 13 10 10 9 11 9 8 6 6 8 13 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 9 9 9 17 12 12 12 11 11 10 11 17 21 9 9 9 16 16 10
9 8 8 11 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 11 9 9 12 12 |