BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-404E12.T7 (MSMg01no404_e12.b1) | MSMg01-404E12.TJ (MSMg01no404_e12.g1) |
ACC | AG502989 | AG502990 |
length | 750 | 755 |
length of high quality (start - end) | 232 (312 - 543) | 434 (67 - 500) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no404_e12.b1 PHD_FILE: MSMg01no404_e12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:18:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no404_e12.g1 PHD_FILE: MSMg01no404_e12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:18:53 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCGGCGCTAAANGAANCACAATCATTATCGGATCCGCGGAANNCNGCATT
TCCAAAAGCAGCTCTTATATAATAAAACATTTTTTAGAACATGATTTTAA
TATTTTCAACTTTTAATATTCAACAAACAGAATAGTTATTTTAAGATATA
TTTCGTTGTTATGTCACCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAATTTGGATACA
GTCTCTGTGCCCTCTGGTTAGTCTGAACAAAGGTTTCTCTATCTTGTTTA
CTTTATCAAAGAACCAGCTCCTGGTTTTGTTGATTCTTCATACAGTTCCT
TTTTGNTTTATTTGGTTGATTTCACCCCTGAGTTTGATTATTTCCTGCCA
TCTACTCCTCTTGGGTGTATTTGCTTCCTTTTGTTCTAGAGCTTTCAGGT
GTGCGGTCAAGCTGTTAGTGTATGCTCTCTCCGGTTTCTTTTTGGAGGCA
CTTAGAGCTATGAGTTTTCTTCTTACCACTGATTTCATTGTGTCCCATAA
GTTTTGGTATGATATATCTTCATTTTTATTAAATTATAAAAAGCCTTTAC
TCTTTCCTTATTTCTTCCTTAACCAAGGTATCATTGAGGAGAGCATTGTT
CCACTTTCATGTAGATGCACGCTCTCTGGGNATTTTGATTTTGTTTTTTC
GGAAAAAGGCAATTTTGCTCCGCTCCGCTTAGCACTTTGTACTTCACTAT
CTTTTCTTCCTTTTATTAATTATATATCATTTTACTACCTCCCTCCCCCN
| GTGTTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXATTTAGGATTCACAATTTCAAGAAATGTATGACT
CATTAAATAAATTCGTCTTATAATATCATTTTTAATTTTATTTCTTATGG
AATGCAATGTTTTCTCAATTGTACTTACAGAGTAACTCATGAGTAATTCA
TTTTGGAATTGGAAACAACTCCTTCTAAGCAAGATGAAGATTTATTTTAA
AGCTAAAAAAATTGGAAGAACTTTCAAACCAACACTTGTACTTTCAAAAG
CTCATTTTTCATAGAGGTTAGTAATATGAAAATCATATTGTTTCTGAGGA
AATCAAATATTAAAGCTCAGTTATTTTACTGTTGACAGTGACTCTTACTT
AGAAATGATTCCTGTGTTCCAGTAGTTTTTAATTGGCAACTTTCATGTAA
ATACAGCTTTTTAATTAAAGTCTACATGTATTTCTTCCCAAAGGACTTTT
TCATGTACAAAGATGATTTGAATTCCACAAACCAGACATAGATTTTTAGT
ACTTATCAAAATGATTTGCTTTCAGCCATAGACTTAAAAATATTCCCAAT
ATCCGAACAATTACTTTCTAAACCCCAAATTTTGTCTTTGTTTTAAACAC
ACTTTTATCCATTTTACGCCCGTATTTGGAACAGCGCATATTTGAATATC
CACCCTTTATTGGTTATTTTGTGCCTTACATTTGCTTTATTAATCCCCCA
TTATT
|
quality values | Open.Hide.13 15 10 12 12 16 10 10 9 13 3 0 3 7 3 0 3 8 3 3 6 6 7 7 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 12 22 33 43 25 19 3 0 0 3 0 3 9 9 9 10
8 8 8 8 8 8 11 11 11 17 12 15 23 32 37 41 50 50 53 53 57 57 57 57 57 47 50 43 43 50 50 59 59 57 53 48 48 42 42 42 42 42 51 53 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 40 40 12 12 12 14 44 44 57 57 57 57 57 57 50 50 47 47 47 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 48 48 68 68 68
68 68 68 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 50 57 50 50 53 50 50 50 50 47 27 27 15 17 12 12 12 18 15 32 25 59 59 59 50 50 53
53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 47 47 50 53 50 50 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 59 59 47 59 59 47 44 44
24 7 7 6 3 0 3 7 6 7 7 21 27 37 30 37 37 41 43 48 48 48 48 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 68 59 59 43 43 32 32 23 28 28 37
37 46 46 54 54 54 54 59 59 68 59 59 57 54 54 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 48 47 47 57 57 57 57 57 46 39 44 57 48
54 42 42 36 32 23 28 28 42 37 57 57 57 57 57 57 48 48 48 47 44 43 46 46 54 59 59 59 59 59 59 46 46 43 44 44 37 37 46 57 57 57 57 43 43 43 43 43 43 36
26 23 23 11 11 11 18 25 37 39 36 36 25 25 25 34 34 44 40 40 41 43 40 41 41 37 32 40 39 37 39 40 33 32 30 22 22 21 34 34 21 21 22 29 30 33 33 30 22 19
11 11 11 25 23 25 24 28 28 34 34 40 40 40 39 37 37 32 22 22 22 25 30 37 30 36 31 30 28 32 24 28 28 28 33 29 30 31 30 29 21 15 6 6 6 15 19 23 10 10
10 15 13 18 23 22 22 25 30 30 32 28 28 33 33 33 37 35 28 25 31 22 24 13 13 13 13 12 10 11 11 10 8 8 8 12 10 10 14 13 11 11 12 12 12 16 24 14 12 12
12 10 10 13 13 9 9 8 8 8 10 13 8 7 6 6 8 8 8 8 11 13 19 12 11 11 12 12 15 3 0 3 9 14 10 12 9 9 9 15 15 10 10 10 11 10 15 14 11 11
10 10 9 10 10 17 11 10 10 7 7 7 8 12 10 15 14 14 12 10 9 9 10 10 12 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9
9 11 11 12 19 15 14 10 13 8 13 11 10 10 10 10 10 11 9 9 9 8 8 8 9 8 8 10 8 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 12 10 12 11 11 11 10 10 11 3 0
| Open.Hide.10 10 10 10 10 10 10 11 11 13 10 8 12 12 12 12 31 37 25 23 9 12 12 14 11 9 11 16 19 11 13 13 22 23 28 25 26 26 39 23 23 20 30 30 30 34 26 23 11 9
10 9 10 10 10 14 23 29 47 41 33 33 36 36 38 38 50 50 47 48 48 42 47 43 37 37 42 42 42 48 48 42 47 47 43 43 43 54 57 54 54 54 54 50 50 47 57 57 51 48
48 48 50 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 44 43 43 46 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 41
41 41 41 41 48 47 57 57 57 50 59 57 57 68 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 68 57 68 68 68 54 57 50 57 43 44 43 43 48 43 43 40 43 39 39 39 47 47 39 48
48 48 59 59 46 39 21 21 8 6 6 8 19 27 39 42 47 42 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 57 50 53 53 43 43 32 32 32 42 42 54 59 59 68 59 59 48 48
48 48 48 48 48 39 36 41 36 36 43 44 44 37 35 35 35 35 35 42 48 57 48 42 35 33 33 42 44 57 47 57 47 47 47 59 59 59 54 54 57 59 57 57 57 57 57 50 57 50
59 54 57 57 59 59 59 57 57 43 27 27 21 21 33 43 43 52 59 59 57 43 43 43 36 43 44 44 44 43 43 43 43 43 50 43 43 42 44 44 57 43 46 44 42 42 42 33 33 42
42 46 46 43 43 46 46 57 57 47 59 37 37 35 39 39 59 47 37 37 44 44 54 54 57 57 57 57 46 46 43 47 43 48 48 48 48 54 48 48 48 47 59 48 48 48 48 48 28 28
12 12 12 29 29 48 48 48 48 41 47 47 47 37 37 22 20 22 27 25 32 24 24 24 24 28 28 25 28 28 24 22 30 21 14 14 24 24 35 39 34 34 28 25 24 28 25 24 15 15
15 21 22 24 20 20 20 24 32 39 48 57 59 48 43 43 43 43 43 43 43 39 39 35 35 24 19 14 14 14 19 23 37 36 39 59 26 17 10 14 11 14 19 30 39 30 19 25 21 19
14 11 11 13 11 13 17 22 22 12 11 11 12 15 18 18 18 18 19 23 22 15 21 12 12 11 12 12 12 21 19 22 17 17 15 16 24 21 16 10 10 10 19 20 32 31 31 18 21 13
15 15 21 15 11 11 11 10 10 17 18 15 10 21 21 37 33 30 28 28 17 14 9 9 9 9 10 15 15 12 12 9 9 9 10 10 15 12 12 10 10 11 17 16 19 19 17 30 30 20
19 21 15 15 15 16 10 10 10 10 10 11 12 12 13 16 14 10 10 10 16 10 10 10 17 12 14 14 18 18 19 16 10 10 10 10 12 8 6 6 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8
8 8 9 10 9 9 9 9 9 9 12 15 12 8 8 8 6 6 8 8 13 10 12 11 11 11 15 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 13 11 10 10 12 15 8 8 8
8 10 8 12 11 14 12 12 8 8 8 9 9 9 12 9 9 8 10 10 8 8 9 10 11 11 10 9 12 9 12 12 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 7 7 10 10 13 16 13 12
8 8 8 7 7 |