BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-443P12.T7 (MSMg01no443_p12.b1) | MSMg01-443P12.TJ (MSMg01no443_p12.g1) |
ACC | AG533247 | AG533248 |
length | 724 | 769 |
length of high quality (start - end) | 241 (71 - 311) | 220 (78 - 297) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no443_p12.b1 PHD_FILE: MSMg01no443_p12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:11:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no443_p12.g1 PHD_FILE: MSMg01no443_p12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:11:44 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (60,360,278 - 60,360,517) | (60,508,053 - 60,508,272) |
---|
sequence | CCAATTATAATTGCGGCGCTAATAGAATCCTAATTCAAAACACGGCGGAA
TTCATTGATTGCAGAAACGGGTGGTTGTGAAGCTACATGCTGATGCTGGG
AACTTAACCCATGTCCTCTCCAAGAACAGCAAGTGCCCTTAACTGCTGAG
CCATCTCTCCTGCCCCAGACATCTTTGCTTTTAGAGACTCATGTAATTAC
ACTAGAGTAATTTATTCCTCAGCCAATGTAATTTAGTATAATCATTCCTT
TTTAAGGCCAAACAATTAGTAAACTTAATTACATTGGGAAAGTACCCCCT
TCGAGCTGGGTGTANGTANGTACAGCTTTAACCCTAGCACTTAGGAGGCA
CAGGCATGTATATCTCTAATCTTGGGGACTAGGCAGTTCTACATAGAGAA
TTCCAGGACAGCCAGTTCCAGGACTCTCCTGCACAGAGAAACACTGTTTA
AAAAAAGAAAGAAAAGTTTCCTTTTCTATGTATAGCAGTGTATAGACTGT
CCAGACTAGCACACCGATCTTTACCAGAAATGCACCCCGCCATGTGTGCA
AATGCACACGCATGCTGTATGATCCTAATGAACCTTGTTCTCCCAGTCGT
TTTTTTTGTTTAATGTACCAATTCACCCCCCCCTGCTCCCTTTTTTTATT
TCATACAACCTACTAATCCCCCCCCACCACCCCCCCCCCCCTTCCCTTTA
TCTTTATCCATTCCCTCCCCCCCC
| TTTCATAGCATTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATAATTTGTAAACTCAGCGGAG
TGGCTTTTACTGAGGCATGTCGGGAAGTGATAAACAATATCTTGGATAGA
TTTACAGAGCCTCTGAGTGCCTGCATCTCACTGACTCCTGCTTTCTCTAA
GAGCCACATGCGGCCGAAGTACAGGACCAAGAAGGCTTTTGTGGCTGACA
GCCAGGGCCTTTCATGGGTTTTTATAAGACAGGTTTACTGCGTGGAGGAG
CCTGGGGATACGGGGAGGTATTTATTTGTCTCAGTCTGGCACTCAGGCAA
GAAGAAGAAAGCAGCTCAGATGCATAGGTGGCCCTGCCCCTCCCGGGCCC
CGCCCCTTCCTCTAGGTCCCTTCCCTCCTTCAGAGTCCCATCCTTTCCAG
GGCCTCATAGGGTATTTCCAGGCCAGGGCCAGGAATTGAAGTCCTGCATT
CTGACTTGTTTCCCGACCCCAAGGAACAATGTTTCCGTTTCCTTTTACCT
GCCGACCCAGCTTCCCCCTTTTTTTCTTCCCATAAACCCTTTCTTTTTTC
TTCTTATCCCCCACCTCCCTCCCACCCGCCTATAATTTTATCCACCTCTT
ACTTTTGTCCCTATCAGGTTTTTAAAAATATATCCCACTTCTTGGCGCTC
CTTATCTCGCGAATCATTTTGATCTTATATTTTTCTCCCCCCATTTTTCC
CCCCTCTTAATTTTTAATN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 9 9 10 10 19 18 23 30 30 30 25 23 29 24 10 10 8 7 9 9 6 8 10 12 8 6 6 9 7 7 6 8 9 8 8 8 8 8 15 17 35 18 11
8 8 8 19 19 13 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 13 12 12 12 18 22 28 37 37 53 53 57 57 57 57 59 59 57 57 43 43 32 39 42 48 48 42 42 42 48 59 59 59 59
48 57 57 57 57 68 59 44 27 27 12 12 12 13 28 30 36 43 32 32 36 32 41 42 57 57 57 57 57 57 59 59 43 43 43 47 47 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57
57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
59 43 44 29 44 44 68 51 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 47 47 57 57 57 57 43 43 44 44 57 44 57 48 48 26 26 15 12 14 14 34
34 57 57 57 43 43 43 43 43 43 43 43 46 47 54 59 59 43 42 35 37 39 59 46 47 48 59 59 59 57 57 48 48 43 42 39 35 35 35 40 40 47 47 57 57 57 53 59 59 59
59 48 59 59 59 59 36 28 19 11 9 9 6 3 0 3 6 3 0 3 9 12 12 28 30 40 46 46 48 48 48 50 50 50 57 57 57 48 57 59 59 59 40 40 40 47 47 47 47 47
47 30 22 12 9 9 12 12 12 12 12 28 28 20 20 20 21 21 22 24 37 41 59 59 39 36 36 43 43 43 43 33 33 32 32 36 32 32 28 26 25 29 22 31 23 41 41 33 33 39
37 39 32 32 32 39 39 43 39 42 39 47 32 32 18 15 11 21 21 28 24 24 18 18 18 41 34 43 39 34 34 34 39 39 32 32 30 39 31 32 28 28 28 15 23 14 28 22 32 25
23 28 23 21 21 21 23 27 30 28 28 24 24 24 28 30 30 33 33 33 36 32 29 27 30 28 24 19 19 15 10 9 6 8 10 8 8 8 9 15 19 21 22 12 10 10 12 17 18 20
16 15 11 12 12 13 13 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 16 15 14 17 10 8 8 8 8 8 8 9 13 13 12 11 11 11 12 10 10 10 10 10 13 10 10 9 9 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 12 12 10 11 10 12 10 8 8 8 8 8 9 10 11 10 10 9 8 8 8 8 8
10 11 17 15 11 8 6 6 7 10 11 10 10 11 9 9 8 8 8 8 10 10 8 8 9 11 12 12 14 19 22 15 12 8 8 8 8 9 12 12 14 11 11 9 8 10 6 6 6 8
9 9 9 9 11 9 13 14 8 8 6 8 8 9 9 10 10 12 14 12 9 9 9 10 9 8 8 8 11 8 10 13 19 12 10 10 9 9 9 9 9 9 10 9 19 15 13 11 14 10
10 10 10 10 9 10 8 8 6 6 8 6 9 9 9 12 14 16 14 12 9 9 9 9 | Open.Hide. 7 11 8 8 8 6 6 6 6 10 10 11 9 8 8 7 7 7 11 14 25 25 29 19 13 3 0 3 23 23 21 23 11 10 9 9 9 11 9 11 11 11 11 13 13 17 19 19 33 33
33 33 33 33 33 33 33 33 33 25 23 11 9 9 9 9 10 9 9 9 12 10 11 16 18 30 30 28 28 28 29 47 40 43 39 35 30 25 28 39 37 37 37 30 30 30 30 37 37 43
43 40 40 40 59 41 34 27 20 11 11 11 23 25 39 39 39 28 34 34 19 19 25 17 15 21 24 28 28 34 33 34 39 43 43 43 43 36 36 39 42 43 57 42 42 34 42 34 41 41
48 42 42 46 40 40 46 43 43 43 48 44 57 25 25 13 13 13 29 32 47 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 44 43 28
28 24 32 24 29 33 29 44 44 50 38 28 24 24 36 43 57 52 52 52 57 57 52 50 50 50 50 37 43 35 43 43 43 43 43 50 59 44 44 44 37 32 32 37 42 32 44 40 57 57
57 47 42 35 33 33 33 36 31 42 42 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 57 57 43 30 28 15 13 13 24 28 36 35 35 35 39 43 46 46 43 39 31 22 16 11 12 15 25 21 25
21 26 24 12 12 15 19 17 26 26 19 25 15 15 15 12 18 16 11 11 11 8 6 6 6 11 8 8 8 10 19 17 17 17 19 30 31 23 23 20 32 32 59 47 39 30 30 28 19 19
11 11 11 12 18 18 13 12 22 22 24 24 8 8 6 6 8 8 12 12 19 19 15 15 12 12 12 15 25 32 28 28 13 18 18 32 32 48 47 42 43 36 29 22 19 11 11 13 21 20
17 10 11 12 23 28 43 43 39 36 28 19 19 19 21 24 37 32 25 22 17 17 17 21 25 32 37 22 22 12 12 11 11 11 11 12 11 12 13 14 26 30 20 23 12 11 9 8 8 9
18 16 15 17 11 12 11 12 11 8 8 8 8 8 11 14 22 21 22 14 17 12 15 11 11 11 11 12 15 12 11 11 12 12 15 12 10 10 13 6 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8
9 10 12 13 10 7 6 6 6 7 15 12 11 11 12 19 17 15 13 8 8 8 8 11 11 11 11 10 11 13 13 10 10 14 10 10 10 14 12 18 20 21 18 18 15 16 16 12 10 10
8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 11 11 12 12 20 13 16 12 14 18 20 28 19 17 10 8 8 8 8 8 11 12 15 10 10 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 9 14 14
14 10 10 10 8 8 8 13 19 13 13 12 10 10 11 11 11 13 14 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 11 8 6 6 6 8 7 7 7 6 10 6 6 8 6 7 8 10 12
12 13 26 20 10 8 6 6 10 10 9 6 6 8 8 8 6 8 8 11 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 16 12 9 8 8 8 8 8 8 9 14
15 8 8 6 6 8 6 6 8 8 7 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 10 12 8 6 6 6 6 8 6 14 15 8 6 6 13 11 9 7 7 6 7 14 15 9 9 9 9
13 15 13 7 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 3 0 |