| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-446L17.T7 (MSMg01no446_l17.b1) | MSMg01-446L17.TJ (MSMg01no446_l17.g1) |
|---|
| ACC | AG535357 | AG535358 |
|---|
| length | 1,361 | 782 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 246 (63 - 308) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_l17.b1 PHD_FILE: MSMg01no446_l17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_l17.g1 PHD_FILE: MSMg01no446_l17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:21 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | GCCTGTGTATGTATCACACCCCACCTCTTATCTCCCAAAAGAGAGAGGGG
TCGTTAACGCTTAAATGGATTTTTTACTCTCCACTCCATACCTGACACCT
ACTACGAGGATGTCTGTTCGCGCGCAACAGCCGCTTTGCCGCACATCACC
AGACGTATGCACGCTGCTTTGGGTTCTTCTTTCTAATCCAGTTCTATCCC
ACGTCCTACCGCACTGATGCTACCCCAGTCAGTGATATTACACAAGCAAC
TGCGCAAGGCAAAGAGTGTGGTCAAGACCATTGACTCTGGTCTCGCTCGC
ACTCTTAGATATGACTAGGGCAATGAGAGTGTCGCATGAGGATCCGTCAA
GTCGCCGCAGTGCATGGAGCTACGCATAGAATTAGAGAGAGACGCCTGGG
TAGAAGTAAGCCCCCACTTACTATGGGAACTCACTCGTCGTGGTGGGCAC
TGTTTGCGCGCGTAACCGAACGCCCGAGAAGTAAGTGGATTAAATGAGTA
CGCGCTGTTTAAGGACCGTCGCGCGAGTTCGCCCTCGTCCGAATGGTCAC
CACCGCCTCTGTTGTGTCGCTCGGATAACGTCCCCATGGGCAGATAGCTA
CACCTCGTCCTGCAAGGTCTCTAGGCGCTCATACTACTGTCACATTACGT
GGAGTCGTCCGAATAACTCGCGACACTCCCAATGCAATGCCCGCGCAATC
ATGTAGACGAGCCACCCACGGTGCAGCCCGTATTATGACGCACGCGTTCC
GCACTTATATGATCCTTATAATATCTGTACCGCTTAGAATCCCATATAAC
CGCCACTACACGCAAGATAAGGAGCAGCCTGCACGCGCCGCGGATACACC
GTGAGCGAGATACGCATCGCACTCTAGAGAGATCAATAACTGCTGCGCTT
GTACTAGAGTAGCCACATGTNCCATAGTTAGAACGGCGCGAACTACAATA
CGCTGTGTTAGACCGTCTCGTGTTACCCACATACATAGCGACCATCTCGT
GTTCATGAAGCTTCTCTTCTATCGATTGCACGACAGCCGATAAGCCTGTA
TCTACGCAGCACACGACCCTTAACACTATTACCGTGCTTAATGCATCTCT
TATCTCTCTCGTATCGTGTCCGCCATGCACATGCATACATGAATGCAACA
TGCTGCAGNCTATGATACGTACCCCATTAATGCCCGGCACCGCGCTGTTC
TCCCACCTACTTTATTAATATTTACCCGGGTGACGCGCTGCTGGACTCTA
CACTAGCGCGTAATTCCCAATGTGGGTGTTACAAGCCGCGCCTTGACTGT
ACAGCTGTCCGTAGATGANGTTAACAGCGACATTACGGTTACGCGCTCCA
TAGTGTAAAAG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTC
CCGAAAAACTCTTCATGTTCAGAGCCTTAACGAAGATGGTGGCAGTTTGT
ATGTGGCTCATGGGGTCGATGGCTGAGCGAACAGATGCTTAAATTCAGAA
CTCCTTGGCACAATTTCTCGCTCCAGGAGTAGGAATGGGCCAAGACAGCA
GCAGCTTCCACTGTGCAAGCCAGAGAGGATATTCTGGATTTCTCATTCTA
TTAGCCCTAGGAGCAATGAGTATTATTTATGTTTCTATTTTTATAGATTT
AGAATAAGNNCTGNGTGTTGATGTTTTTCTCTTCATGGATACTTTTTGGT
CATTATAATGGCGGTGCTGGGAGGTGGGGTGAGTGCATATTTTTTTTTGT
AAGAAACCATTTACATGCCTTGTTTCTTTTCATTCTCTCAAACATCATTT
TAAGAAGGCATTTACAAATTTAATAGCTGGGCACACTGACTCTCATAGCG
ATGTTACACACTGCTGAGGTCAGGTTGGGCATATCAATCCGTAATGAAGA
AACGTTGAACTCTCTGCCGGGTAGTTGCTGCTACTTGCCTGGCGTCTGTC
AAGGACATATGTCTTCTCGTCCTTATCACTGTTTCCCCCCTCACCATGGA
TTTTTTGTTTTTTTTTTGTTCTCCCTTTATCAGTGCGCGCGGTACCTCTT
CCATGGGCCCTCATATCTTTCTATCGTCTTTACGGTTCTCATACCACTTT
TCGCTTCTCTCTACATTTTTCTCTTTTTTCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 7 8 8 8 8 6 6 7 7 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 10 6
7 8 8 13 7 9 9 8 7 6 8 8 8 8 10 11 12 11 10 10 11 11 11 14 12 11 8 8 8 8 8 8 10 10 13 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 7 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 13 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8
7 7 6 6 8 8 8 8 6 6 7 6 8 6 8 8 10 7 7 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 13 12 10 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10
9 10 9 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 16 16 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6
8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 12 10 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 11 11 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 11 11 8 8 6
6 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 14 13 14 21 20 20 13 13 14 16 10 10 8 8 8 8 10 6 6 8 6 11 10 9 10 10 10 8 8 6 8 8 6 8 6 6 8 8
13 11 15 15 15 15 11 12 10 8 8 8 8 6 9 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 8 6 8 8 8 6 6
8 6 6 10 8 6 6 6 8 8 9 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 9 9 8 8 6 6 6 8 10 10 10 12 10 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 10 10 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 11 10 10 10 8 8 8 8 9 9 7
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8
8 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 8 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 10 8 6 6 7 8 8 11 11 15 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 9 9 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 6 8 8 11 11 8 8 6 6 7 6 8 8 9 8 10 10 9 9 9 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 12 8 10
9 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 11 10 8 7 6 6 8 6 8 8 6 8 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 12 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 9 8 8
6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 8 13 13 12 10 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 6 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 12 8 8 8 10 7 7 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8
8 8 8 8 7 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 18 10 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 11 10 6 6
6 6 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 10 9 11 11 11 11 11 11 10 10 11 11 11 10 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6
6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 9 9 11 10 10 10 10 9 9 7 7 8 8 8 8 8
8 10 10 10 11 11 11 12 8 10 8 8 8 7 8 6 6 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 10 10 8 8
8 8 8 10 12 11 10 3 0 3 9 9 9 9 9 12 11 10 10 8 6 6 10 10 6 6 8 8 9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13
14 15 8 8 8 7 7 6 6 6 6 10 11 7 6 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 9 9 11 9 6 8 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 7 8 9 6 6 8 8 8 10 8 8 9 8 10 10 10 10 10 12 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 7 8 6 8 8 8 10 10 10 8
8 9 8 10 10 10 9 8 9 8 8 | Open.Hide.11 11 23 23 37 39 39 34 34 23 20 20 36 36 34 27 22 9 6 6 7 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 10 10 10 26 26 50 50 50 47 33 27 12 9 7 7 8 6
6 6 7 7 7 15 12 12 12 15 21 18 19 22 23 33 33 35 35 35 35 35 36 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 34 34 28 23 20 19 22 15 15 15 17 21 34 44 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 37 37 37 57
57 57 57 57 57 57 50 43 37 37 43 44 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 36 36 36 36 36 41 41 59 37 36 36 25 22 10 8 8 10 10 13 30 41 50 50
50 50 53 53 57 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 53 53 50 48 47
47 47 37 27 22 11 9 3 0 0 3 9 3 0 3 9 9 9 19 27 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43 30 17 10 10
10 15 19 37 41 47 47 43 24 24 11 11 11 21 21 39 44 57 57 57 59 59 59 54 54 54 54 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 48 57 57 57 48 48 48 48 41 33 24 24
17 20 16 12 13 9 9 9 10 15 22 32 28 20 20 20 32 34 39 32 28 20 20 23 32 36 43 36 36 43 39 43 43 43 43 43 36 33 33 30 28 28 29 21 24 18 23 23 22 22
30 27 21 16 13 15 13 21 13 13 12 15 15 19 21 30 24 24 13 15 21 21 26 31 17 17 17 17 17 16 15 15 10 10 11 15 13 10 10 8 8 8 10 16 16 15 15 15 20 24
21 11 11 11 11 10 8 8 8 8 15 10 10 10 19 13 12 12 11 11 10 10 12 13 11 11 10 11 11 18 21 19 22 11 10 8 8 8 8 6 6 10 10 12 10 18 15 13 9 9
6 10 6 6 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 9 10 11 10 6 7 6 7 8 8 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 18 11 10 8 10 8 8 6 8 7 6 8 8
9 12 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13 13 10 10 12 12 12 12 12 12 13 6 6 8 8 8 8 10 10 11 12 12 12 11 11 12 12 8 8 8 8 8 6 7 10 10 10 10
11 9 9 9 8 7 7 10 11 17 32 32 24 20 8 13 6 6 6 6 9 10 16 13 15 16 13 11 11 11 9 9 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 11 17 18 12 9 9
9 11 11 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12 14 11 11 10 11 10 9 9 8 8 8 15 8 8 8 8 8 9 12 12 16
12 8 7 7 8 8 8 8 9 7 10 8 9 9 9 9 10 9 14 13 10 8 6 6 7 8 10 11 12 8 8 8 |
|---|
